核酸代谢ppt课件.ppt
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1、1,第七章 核酸代谢,第一节 核酸降解和核苷酸代谢第二节 DNA的生物合成第三节 RNA的生物合成第四节 核酸代谢的调节,2,1,2,第一节 核酸降解和核苷酸代谢,一、核酸和核苷酸的分解代谢,二、核苷酸的合成代谢,3,一、核酸和核苷酸的分解代谢,1、核酸的解聚作用2、核苷酸的降解3、嘌呤的分解4、嘧啶的分解,4,1、核酸的解聚作用,核苷,核酸,核苷酸,碱基,许多个,戊糖,磷酸,5,1、核酸的解聚作用,核糖核酸酶与脱氧核糖核酸酶 核酸内切酶与核酸外切酶 限制性核酸内切酶,6,2、核苷酸的降解,核苷,碱基,戊糖,磷酸,各种单核苷酸受细胞内磷酸单酯酶或核苷酸酶的水解作用成为核苷和磷酸,7,2、核苷酸
2、的降解,核苷,碱基,戊糖,磷酸,非特异性的磷酸单酯酶,其水解位点可以是核苷的2、3或5 特异性强的磷酸单酯酶只能水解3-或5-核苷酸磷酸,8,2、核苷酸的降解,碱基,戊糖,核苷酶按底物不同可分为嘌呤核苷酶和嘧啶核苷酶 按催化反应的不同可以分为核苷磷酸化酶和核苷水解酶,9,2、核苷酸的降解,碱基,戊糖,10,腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)H2O H2O NH3 NH3 次黄嘌呤 黄嘌呤(Xan)H2O+O2 H2O2 H2O+O2 H2O2 尿囊素 尿酸 H2O CO2+H2O2 2H2O+O2 尿囊酸 尿素+乙醛酸 H2O 2H2O 4NH3+2CO2,(人类和灵长类动物、爬虫、鸟类),(灵长类以外
3、的哺乳动物),(植物),(鱼类、两栖类),(海洋无脊椎动物),腺嘌呤脱氨酶,鸟嘌呤脱氨酶,黄嘌呤氧化酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸氧化酶,尿囊素酶,尿囊酸酶,脲酶,3、嘌呤的分解,11,(1)鸟嘌呤的分解,鸟嘌呤酶,黄嘌呤氧化酶,鸟嘌呤,黄嘌呤,尿酸,(2)腺嘌呤的分解,腺苷脱氨酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸,腺苷,黄嘌呤,腺苷酸脱氨酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸,腺苷酸,黄嘌呤,3、嘌呤的分解,12,腺嘌呤,鸟嘌呤,次黄嘌呤,黄嘌呤,3、嘌呤的分解,13,腺苷,肌(次黄)苷,腺苷脱氨酶,H2O,NH3,嘌呤核苷磷酸化酶,Pi,磷酸核糖,次黄嘌呤,3、嘌呤的分解,14,鸟苷,嘌呤核苷磷酸化酶,Pi,磷酸核糖,鸟嘌呤,
4、3、嘌呤的分解,15,腺嘌呤,鸟嘌呤,次黄嘌呤,黄嘌呤,腺嘌呤脱氨酶 H2O,NH3,鸟嘌呤脱氨酶 H2O,NH3,3、嘌呤的分解,16,黄嘌呤,黄嘌呤氧化酶,H2O O2,H2O2,尿酸,尿酸氧化酶,2H2O O2,H2O2CO2,尿囊素,3、嘌呤的分解,17,尿囊素酶 H2O,尿囊素,尿囊酸,尿囊酸酶 H2O,尿素,乙醛酸,尿酶2H2O,4NH3,2CO2,3、嘌呤的分解,18,尿酸是人、猿及鸟类等体内嘌呤代谢的最终产物。尿酸因动物的种类而异可进一步分解,成为尿囊素、尿素、乙醛酸及NH3和CO2。,尿酸,尿囊素,尿素乙醛酸,NH3和CO2,尿酸酶,尿囊酶,(非灵长类的哺乳类),(鱼类、两栖
5、类),尿酶,H2O,(甲壳类),3、嘌呤的分解,19,尿素,乙醛酸,腺苷酸,次黄苷酸,腺苷,腺嘌呤,次黄苷,次黄嘌呤,黄嘌呤,尿酸,尿囊素,黄嘌呤,尿囊酸,鸟嘌呤,3、嘌呤的分解,20,胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)二氢尿嘧啶 H2O NH3 NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O-丙氨酸-脲基丙酸 H2O 胸腺嘧啶(T)二氢胸腺嘧啶 NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O-氨基异丁酸-脲基异丁酸 H2O,胞嘧啶脱氨酶,二氢尿嘧啶脱氢酶,二氢嘧啶酶,脲基丙酸酶,二氢尿嘧啶脱氢酶,二氢嘧啶酶,脲基丙酸酶,NH3+CO2+,NH3+CO2+,4、嘧啶的分解,21,尿嘧啶,胸腺嘧啶,胞嘧啶,4、嘧啶的
6、分解,22,二氢尿嘧啶脱氢酶,NADPH,NADP+H+,尿嘧啶,5,6二氢尿嘧啶,二氢嘧啶水化酶,H2O,-脲基丙酸,-丙氨酸,脲基丙酸酶,H2O,4、嘧啶的分解,23,二氢尿嘧啶脱氢酶,NADPH,NADP+H+,二氢嘧啶水化酶,H2O,脲基丙酸酶,H2O,胸腺嘧啶,5,6二氢胸腺嘧啶,-脲异丁酸,-氨基异丁酸,4、嘧啶的分解,24,尿嘧啶与胸腺嘧啶 二氢衍生物-脲基丙氨酸及-脲基异丁酸-丙氨酸及-异丁酸+CO2+NH3胞嘧啶具有氨基,所以要先在胞嘧啶脱氨酶的作用下水解脱氨基 胞嘧啶+H2O尿嘧啶+NH3,4、嘧啶的分解,25,二、核苷酸的合成代谢,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成2、嘧啶核糖
7、核苷酸的生物合成3、脱氧核糖核苷酸的生物合成4、核糖三磷酸和胸苷酸的生物合成,26,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,从头合成:以氨基酸等简单物质为原料从头合成核苷酸。补救途径:以现有的碱基和核苷为原料合成核苷酸。,27,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,N1,C2,N3,6C,5C,4C,N7,N9,C8,28,1、嘌呤核糖核苷酸的生物合成,(1)嘌呤核苷酸的从头合成(2)嘌呤核苷酸的补救合成(3)嘌呤核苷酸的相互转变,29,PRPP合成酶,5-磷酸核糖焦磷酸(PRPP)的合成,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,30,谷氨酰胺PRPP酰胺基转移酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,9,31,磷酸核糖甘氨酰胺合成
8、酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,4,5,7,9,32,磷酸核糖甘氨酰胺转甲酰基酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,8,9,4,5,7,33,磷酸核糖甲酰甘氨咪唑合成酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,34,磷酸核糖氨基咪唑合成酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,35,磷酸核糖氨基咪唑羧化酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,6,36,磷酸核糖氨基咪唑-琥珀酸-甲酰胺合成酶,3,8,9,4,5,7,1,6,37,腺苷酸-琥珀酸裂解酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,1,6,38,磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺转甲酰基酶,(1)嘌呤
9、核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,1,6,2,39,IMP-环化水解酶,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,3,8,9,4,5,7,1,6,2,40,AMP和GMP的合成,(1)嘌呤核苷酸的从头合成,41,(2)嘌呤核苷酸的补救合成,42,(3)嘌呤核苷酸的相互转变,43,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,44,2、嘧啶核糖核苷酸的生物合成,(1)嘧啶核苷酸的从头合成(2)嘧啶核苷酸的补救合成,45,嘧啶核苷酸的从头合成,氨甲酰磷酸合成酶,Asp-氨甲酰基转移酶,二氢乳清酸酶,乳清酸脱氢酶,(1)嘧啶核苷酸的从头合成,46,乳清酸磷酸核糖基转移酶,乳清核苷酸脱羧酶,(1)嘧啶核苷酸的从头合成,47
10、,(2)嘧啶核苷酸的补救合成,48,3、脱氧核糖核苷酸的生物合成,49,4、核糖三磷酸的生物合成,核苷酸不直接参加核酸的生物合成而是先转化成相应的核苷三磷酸后再参入DNA或RNA(d)NMP+ATP(d)NDP+ADP ATP作为磷酸的供体,催化酶为(脱氧)腺苷酸激酶,此酶对核糖没有专一性,而对碱基有专一性(d)NDP+ATP(d)NTP+ADP 催化酶为一种激酶,它没有专一性,50,1,2,第二节 DNA的生物合成,一、DNA的复制,二、DNA的损伤与修复,3,三、逆转录,51,一、DNA的复制,1、半保留复制2、复制的起点和方式3、参与DNA复制的酶和蛋白因子4、DNA的半不连续复制5、原
11、核生物DNA复制的特点6、真核生物DNA复制的特点,52,1、半保留复制,定义:由亲代DNA生成子代DNA时,每个新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的 实验证据:1958年Meselson和Stahl用同位素15N标记大肠杆菌DNA,首先证明了DNA的半保留复制,复制,53,亲代,第一代,第二代,15NDNA,14N-15NDNA,14NDNA,实验证明,54,2、复制的起点和方式,复制叉:DNA复制进行时,在复制眼中发生的DNA合成反应的分支点 复制子:在DNA复制原点的控制下能够独立进行DNA复制的单位。一个复制子可以有一个或两个复制叉 复制方向:单向和双向,
12、55,起点,起点,起点,起点,起点,未复制DNA,单向复制,双向复制,复制叉,复制叉,复制叉,56,2、复制的起点和方式,真核细胞染色体的复制,57,3、参与DNA复制的酶和蛋白因子,(1)DNA聚合酶(2)DNA连接酶(3)与解除DNA高级结构相关的酶及蛋白因子(4)引发体,58,以DNA为模板合成DNA的酶。催化DNA新链合成时需有4种dNTP作为底物,还需Mg2+、DNA模板及与模板DNA互补的一小段多核苷酸引物。有DNA聚合酶I、II、III、IV、V。,(1)DNA聚合酶,59,DNA聚合酶IDNA聚合酶IIDNA聚合酶III真核细胞的DNA聚合酶,(1)DNA聚合酶,60,1956
13、年,A.Kornberg发现 分子量为109,000,由一条单一多肽链组成,多肽链中含有一个锌原子 大肠杆菌有400个,DNA聚合酶I,61,53方向聚合作用 35核酸外切作用 53核酸外切作用,DNA聚合酶I,62,活性部位在肽段上的分布:,53外切,35外切,53聚合,蛋白酶,N,C,小片段,3500,Klenow片段,6800,DNA聚合酶I,63,由10个亚基组成的蛋白质,其中、组成的部分叫核心酶,核心酶与其它亚基组成全酶。亚基具有5-3 聚合酶作用 亚基3-5外切酶活性 亚基组建复制起始复合物,DNA聚合酶II,64,大肠杆菌有10个 聚合酶活性比DNA聚合酶I高15倍 现在认为它是
14、E.coli细胞内真正负责重新合成DNA的复制酶,DNA聚合酶III,65,DNA聚合酶全酶,DNA聚合酶二聚体,66,DNA聚合酶催化的链延长反应,子链,67,DNA聚合酶的校对功能,聚合酶,错配碱基,复制方向,正 确核苷酸,5,5,5,3,3,3,切除错配核苷酸,68,DNA聚合酶I、II 和III的不同点,69,真核细胞有5种DNA聚合酶:DNA聚合酶:引物酶活性DNA聚合酶:修饰作用DNA聚合酶:线粒体DNA的复制DNA聚合酶:具有5-3 聚合酶作用和3-5外切酶活性;合成前导链和滞后链DNA聚合酶:DNA修复,真核细胞的DNA聚合酶,70,是指催化双链DNA切口处的5-磷酸基和3-羟
15、基之间形成磷酸二酯键的酶,连接反应需要供给能量,主要以ATP作为能量来源。,DNA连接酶,(2)DNA连接酶,71,(2)DNA连接酶,3,P,T,A,OH,5,3,P,C,A,P,P,A,T,G,T,3,5,P,ATP,AMP+PPi,Mg2+,连接酶,P,T,A,5,3,P,C,A,P,P,A,T,G,T,3,5,P,72,DNA解旋酶:催化DNA双螺旋分开成为两条链的酶。DNA拓扑异构酶:能够催化DNA链的断裂和结合,从而控制DNA 的拓扑状态。SSBs(单链结合蛋白):稳定已被解开的DNA单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。,(3)与解除DNA高级结构相 关的酶及蛋白因子,73,引
16、发体:是DNA复制开始所必须的,由多种蛋白质及酶组成的复合物 DnaA:能结合于DNA复制起始部位 DnaB:具有解链酶的作用 DnaC:能结合于DNA复制起始部位,解开DNA双链 引物酶:DNA合成时候所需的引物,(4)引发体,74,4、DNA的半不连续复制,定义:两条DNA链同时作为模板进行复制时,一条链(35)的复制是连续的,另一条链(53)的复制是不连续的。前导链和滞后链:DNA聚合酶只能催化DNA链从53方向合成,因此新生DNA链先按53方向连续合成一条链,这一条链叫前导链,不连续合成的另一条链叫滞后链。Okazaki(冈崎)片断:半不连续复制过程中出现的1000个左右核苷酸的DNA
17、小片段。,75,4、DNA的半不连续复制,复制叉,76,4、DNA的半不连续复制,77,4、DNA的半不连续复制,RNA引物:DNA复制时,除了需要DNA聚合酶、模板和4种核苷酸底物及其它所需的小分子外,还需要一段RNA作为引物,在其3末端合成DNA新链。RNA引物的合成:是在DNA模板链的一定部位合成并互补于DNA链,合成方向也是53。催化该反应的酶称为引物合成酶。引物的长度通常为1530个核苷酸。,78,4、DNA的半不连续复制,Arthur Kornberg wonthe 1959 Nobel Prizein Medicine for hisdiscovery of the mechan
18、ism in the biological synthesis of deoxyribonucleic acid(before Watson and Crick won theirs!)The biologic synthesis of deoxyribonucleic acid,79,4、DNA的半不连续复制,在多种蛋白质和酶的参与下,双链解开形成复制叉在一系列酶的作用下,DNA双螺旋解开形成两股单链进行复制两股单链分别在复制叉处按碱基配对原则进行反向平行复制,一条沿53方向连续进行复制,而另一条则经形成冈崎片段进行不连续复制冈崎片段经DNA连接酶形成一条连续的DNA链,DNA的复制步骤,8
19、0,4、DNA的半不连续复制,81,5,3,复制叉的移动方向,ATP,ADPPi,DNA旋转酶,解旋酶,SSB,引物体,RNA引物,DNA聚合酶III复合物,DNA聚合酶III在RNA引物上开始作用,DNA聚合酶I,RNA引物的去处和被脱氧核苷酸取代,被DNA连接酶拼接,3,5,3,5,前导链,滞后链,SSB,82,5、原核生物DNA复制的特点,方式(或Cairns方式):大肠杆菌 滚动环式:病毒 取代环或D-环式:线粒体DNA的复制 单个复制起始点,单个复制子,复制方式,83,6、真核生物DNA复制的特点,真核生物有多个复制起始点和复制子 真核生物的复制子从开始复制后一直复制到结束,期间不再
20、重新开始 真核和原核生物DNA聚合酶不一样 真核生物复制时,首先DNA与组蛋白解开,复制完成后重新组装核小体 引物及冈崎片段的长度均比原核细胞短,84,真核细胞DNA复制的特点,多个起点复制,85,PCR,聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火(复性)及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增。PCR又称无细胞分子克隆或特异性DNA序列体外引物定向酶促扩增技术。特点:特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等。应用范围:不仅可用于基因分离、克隆和核酸序列分析等基础研究,还可用于疾病的诊
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