C11核酸代谢与蛋白质生物合成课件.ppt
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1、,第十一章 核酸代谢与蛋白质生物合成,核酸:遗传物质蛋白质:生命活动执行者,核酸,磷酸,核苷酸,核苷,磷酸-戊糖,碱基,水解,何处去?,进入磷酸戊糖途径或重新合成核酸,分解合成,第一节:核酸的消化与吸收,核苷酸的生理功用,核酸合成的原料细胞内能量的利用形式:如ATP生理调节介质:cAMP、cGMP辅酶的构成成分:FAD、NAD+、NADP活化中间代谢物:UDPG、SAM酶的变构调节剂:ATP、ADP、AMP等,一、嘌呤核苷酸的分解代谢,核苷酸,核苷,1-磷酸核糖,碱基,核苷酸酶,核苷磷酸化酶,补救合成 或进一步分解,第二节 核酸的分解代谢,核糖,脱氨基酶,尿酸,AMP,次黄嘌呤,GMP,鸟嘌呤
2、,黄嘌呤,黄嘌呤氧化酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸,高嘌呤饮食体内核酸大量分解肾疾病嘌呤核苷酸代谢酶缺陷,血中尿酸含量升高,痛风,尿酸盐晶体沉积,血尿酸0.48mmol/L,痛风的治疗,次黄嘌呤,别嘌呤醇,别嘌呤醇,抑制黄嘌呤氧化酶,从而抑制尿酸的生成,与PRPP反应生成别嘌呤核苷酸,减少嘌呤核苷酸的生成,二、嘧啶核苷酸的分解代谢,胞嘧啶,NH3,尿嘧啶,二氢尿嘧啶,H2O,CO2+NH3,-丙氨酸,胸腺嘧啶,-脲基异丁酸,-氨基异丁酸,H2O,丙二酸单酰CoA,乙酰CoA,TAC,肝,尿素,甲基丙二酸单酰CoA,琥珀酰CoA,TAC,糖异生,嘌呤核苷酸合成,第三节 核酸的合成代谢,嘌呤核苷酸的从头合
3、成,(de novo synthsis)(1)原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、一碳单位、CO2,甘氨酸,(2)过程:两个阶段 第一阶段:次黄嘌呤核苷酸(IMP)的合成 第二阶段:腺嘌呤核苷酸(AMP)与鸟嘌呤 核苷酸(GMP)的生成,嘌呤核苷酸的从头合成,IMP的合成,R-5-P,PRPP,PRPP合成酶,PRA,酰胺转移酶,GAR,FGAR,FGAM,AIR,CAIR,SAICAR,AICAR,FAICAR,IMP,Gln,Gly,Gln,H2O,CO2,Asp,H2O,ATP,ATP,ATP,ATP,fumarate,CHO-FH4,CHO-FH4,AMP与GMP的生成,IMP,腺苷酸代
4、琥珀酸,黄嘌呤核苷酸(XMP),Asp,NADH+H+,NAD+,AMP,GTP,GMP,Gln,ATP,延胡索酸,(3)部位:以肝脏为主,其次是小肠粘膜及胸腺。并不是所有细胞都具有从头合成嘌呤核苷酸的能力。(4)特点:在磷酸核糖分子上逐步合成,而不是首先单独合成嘌呤碱再与磷酸核糖结合。,嘌呤核苷酸的从头合成,嘌呤核苷酸的补救合成途径,(salvage pathway)概念:细胞利用现成的嘌呤碱基或嘌呤核苷重新合成嘌呤核苷酸的过程,称为补救合成途径。,反应:,生理意义:(1)节省能量与氨基酸消耗(2)某些器官如脑、骨髓等,缺乏从头合成嘌呤核苷酸的酶体系,只能进行补救合成,在二磷酸核苷(NDP)
5、的水平上直接还原由核糖核苷酸还原酶催化脱氧嘧啶核苷酸(dUDP、dCDP)也是在二磷酸核苷的水平生成(dTMP除外),脱氧(核糖)核苷酸的生成,碱基,碱基,NADPH+H+,NADP+H2O,核糖核苷酸还原酶,从头合成途径补救合成途径,一、嘧啶核苷酸的合成代谢,(一)嘧啶核苷酸的从头合成,主要是肝细胞胞液,嘧啶核苷酸的从头合成是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘧啶核苷酸的途径。,定义,合成部位,嘧啶合成的元素来源,合成过程,1.尿嘧啶核苷酸的合成,2.胞嘧啶核苷酸的合成,UDP,UTP,3.dTMP或TMP的生成,dUMP,脱氧胸苷一磷酸dT
6、MP,(二)嘧啶核苷酸的补救合成,DNA的生物合成(复制)DNA Biosynthesis,Replication,第 三节,复制(replication)是指遗传物质的传代,以母链DNA为模板合成子链DNA的过程。,复制的方式半保留复制(semi-conservative replication)复制的高保真性(high fidelity)双向复制(bidirectional replication)半不连续复制(semi-discontinuous replication),一、半保留复制,DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱基配对规律,合成与模
7、板互补的子链。子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制。,半保留复制的概念,AGGTACTGCCACTGG,TCCATGACGGTGACC,CCACTGG,GGTGACC,AGGTACTG,TCCATGAC,TCCATGAC,AGGTACTG,AGGTACTGCCACTGG,TCCATGACGGTGACC,AGGTACTGCCACTGG,TCCATGACGGTGACC,+,母链DNA,复制过程中形成的复制叉,子代DNA,目 录,按半保留复制方式,子代DNA与亲代DNA的碱基序列一致,即子代
8、保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性。,半保留复制的意义,遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的。,原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。,二、双向复制,A.环状双链DNA及复制起始点B.复制中的两个复制叉C.复制接近终止点(termination,ter),真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个复制子(replicon)。复制子是独立完成复制的功能单位。,三、复制的半不连续性,领头链(leading strand),随从链(lagging strand)
9、,顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链。复制中的不连续片段称为岡崎片段(okazaki fragment)。领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。,参与DNA复制的物质,底物(substrate):dATP,dGTP,dCTP,dTTP聚合酶(polymerase):依赖DNA的DNA聚合酶,简写 为 DNA-pol模板(template):解开成单链的DNA母链引物(primer):提供3-OH末端使dNTP可以依次聚合 其他的酶和蛋白质因子,一、复制的化学反
10、应,(dNMP)n+dNTP(dNMP)n+1+PPi,目 录,聚合反应的特点,DNA 新链生成需引物和模板;新链的延长只可沿5 3方向进行。,一、DNA聚合酶,全称:依赖DNA的DNA聚合酶(DNA-dependent DNA polymerase)简称:DNA-pol,活性:催化磷酸二酯键形成,3 5外切酶活性,5 3外切酶活性,?,能切除突变的 DNA片段。,能辨认错配的碱基对,并将其水解。,核酸外切酶活性,目 录,(一)原核生物的DNA聚合酶,DNA-pol DNA-pol DNA-pol,(一)原核生物的DNA聚合酶,DNA-pol:与修复有关DNA-pol DNA-pol:复制主要
11、酶,(二)真核生物的DNA聚合酶,DNA-pol,起始引发,有引物酶活性。,延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。,参与低保真度的复制。,在复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用。,在线粒体DNA复制中起催化作用。,DNA-pol,DNA-pol,DNA-pol,DNA-pol,二、复制中的分子解链及DNA 分子拓扑学变化,DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有把DNA解成单链,它才能起模板作用。,(一)解螺旋酶、引物酶和单链DNA结合蛋白,解螺旋酶(helicase)利用ATP供能,作用于氢键,使DNA双链解开成为两条单链引物酶(primase)复制起始时催化生成RNA引物的酶单链DNA结合蛋白(
12、single stranded DNA binding protein,SSB)在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整,(二)DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase),解链过程中正超螺旋的形成,目 录,拓扑异构酶作用特点既能水解、又能连接磷酸二酯键,拓扑异构酶 拓扑异构酶,分 类,拓扑异构酶,切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。反应不需ATP。,拓扑异构酶,切断DNA分子两股链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。利用ATP供能,连接断端,DNA分子进入负超螺旋状态。,作用机制,三、DNA连接酶,连接DNA链3-OH末端和相邻D
13、NA链5-P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链。,DNA连接酶(DNA ligase)作用方式,HO,5,3,3,5,DNA连接酶,ATP,ADP,5,3,5,3,目 录,DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。也是基因工程的重要工具酶之一。,功能,DNA生物合成过程The Process of DNA Replication,(一)复制的起始,需要解决两个问题:,1.DNA解开成单链,提供模板。,2.合成引物,提供3-OH末端。,一、原核生物的DNA生物合成,Dna A,Dna B、Dna C,DNA拓扑异构酶
14、,引物酶,SSB,3,5,3,5,含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA复制起始区域的复合结构称为引发体。,3,5,3,5,引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。,引物,引物酶,(二)复制的延长,复制的延长指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上,其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。,OH 3,3,目 录,目 录,复制过程简图,目 录,原核生物基因是环状DNA,双向复制的复制片段在复制的终止点(ter)处汇合。,(三)复制的终止,随从链上不连续性片段的连接,DNA损伤(突变)与修复DNA Damage(Mutation)and Repair,遗传物质的
15、结构改变而引起的遗传信息改变,均可称为突变。,在复制过程中发生的DNA突变称为DNA损伤(DNA damage)。,从分子水平来看,突变就是DNA分子上碱基的改变。,一、突变的意义,(一)突变是进化、分化的分子基础(二)突变导致基因型改变(三)突变导致死亡(四)突变是某些疾病的发病基础,二、引发突变的因素,物理因素 紫外线(ultra violet,UV)、各种辐射,化学因素,目 录,三、突变的分子改变类型,错配(mismatch)缺失(deletion)插入(insertion)重排(rearrangement),DNA分子上的碱基错配称点突变(point mutation)。,(一)错配,
16、镰形红细胞贫血病人Hb(HbS)亚基,正常成人Hb(HbA)亚基,(二)缺失、插入和框移,缺失:一个碱基或一段核苷酸链从DNA大分子上消失。,插入:原来没有的一个碱基或一段核苷酸链插入到DNA大分子中间。,框移突变是指三联体密码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变。,缺失或插入都可导致框移突变。,缺失引起框移突变,(三)重排,DNA分子内较大片段的交换,称为重组或重排。,由基因重排引起的两种地中海贫血基因型,目 录,四、DNA损伤的修复,修复(repairing)是对已发生分子改变的补偿措施,使其回复为原有的天然状态。,光修复(light repairing)切除修复(excisi
17、on repairing)丢失碱基和去碱基部位的修复:DNA糖苷酶甲基化指导的不配对修复,修复的主要类型,(一)光修复,光修复酶(photolyase),UV,(二)切除修复,是细胞内最重要和有效的修复机制,主要由DNA-pol和连接酶完成。,E.coli的切除修复机制,目 录,(转录),RNA的生物合成,转录(transcription)生物体以DNA为模板合成RNA的过程,转录,参 与 转 录 的 物 质:,原料:4种NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白质因子,转录与复制的区别:,复制,转录,模板:两条链均作为 模板复制,一条链作为模板转录,原料:d
18、NTP NTP配对:AT,GC AU,TA,GC聚合酶:DNA聚合酶 RNA聚合酶 DDDP DDRP(转录酶)产物:半保留复制得两条 子代DNA引物 需要 不需要,mRNA、tRNA、rRNA,模板 和 酶,一 模 板,结构基因(structural gene),不对称转录,(asymmetric transcription),*在DNA分子双链上某一区段,一股 链可转录,另一股链不转录;,*模板链并非永远在同一单链上。,二 RNA 聚合酶,1 原核生物的 RNA聚合酶:,核心酶 core enzyme,全酶 holoenzyme,2 真核生物的RNA聚合酶,种类,对鹅膏蕈碱 的反应,45S
19、-rRNA,hnRNA,5S-rRNAtRNA、snRNA,耐受,极敏感,中度敏感,转录产物,三 模板和酶的辨认、结合,一个转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子(operon,包括 若干个结构基因及其上游的调控序列。,启动子的研究:(RNA聚合酶保护法),保守序列(一致性序列),转录过程,一 转录起始,转录起始需解决两个问题:1、RNA聚合酶必须准确地结合在 转录模板的起始区域 2、DNA双链解开,使其中的一条 链作为转录的模板,(一)原核生物的转录起始,2 DNA双链解开,形成转录空泡,1 RNA聚合酶全酶(2)与模板结合,3 在RNA聚合酶作用下 发生第一次聚合反应,5-pppGpN O
20、H+ppi,RNApol-DNA-pppGpN-OH,pppG,NTP,pppGpN-OH,起始复合物:,5-pppG-OH+NTP,(二)真核生物的转录起始,也需要RNA聚合酶辨认、结合转录起点上游的DNA序列,生成起始复合物。,顺式作用元件-真核生物结构基因上游的调控区存 在的相似或一致性的DNA序列。,-GCGC-CAAT-TATA,转录起始,TATA 盒,CAAT 盒,G C 盒,结 构 基 因,增强子,顺式作用元件,D,TATA,A,B,F,E,反式作用因子-直接或间接辨认、结合顺式 作用元 件并影响其功能的蛋白质。,RNA聚合酶与模板DNA的结合需一系列转录因子(TF)的参与。,R
21、NA聚合酶,二 转录延长,1、亚基脱落,RNA pol 聚合酶核心酶变 构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;,2、在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链 不 断延长。,(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi,5,3,原核生物转录过程中的现象,三 转录终止,-RNA聚合酶在DNA模板 上停止前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来,(一)原核生物的转录终止,1、依赖 因子(Rho)的转录终止,2、不依赖 因子的转录终止,DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。,A T P,5pppG,5 3,35,茎环结构使转录终止:,1,
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