生化名词解释与简答题.docx
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1、生化名词解释与简答题生物化学名词解释及简答 第一章 蛋白质的结构与功能 名词解释1. 肽键 2. 结构域 3. 蛋白质的等电点 4. 蛋白质的沉淀5. 蛋白质的凝固 问答题1. 何谓蛋白质变性?影响变性的因素有哪些?2. 蛋白质变性后,为什么水溶性会降低? 3. 举例说明一级结构决定构象。 答案 (一)1肽键:一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合所形成的结合键,称为肽键。 2构域:蛋白质在形成三级结构时,肽链中某些局部的二级结构汇集在一起,形成发挥生物学功能的特定区域称为结构域。 3蛋白质的等电点:蛋白质分子净电荷为零时溶液的pH值称为该蛋白质的等电点。 4蛋白质的沉淀:蛋白质分子
2、从溶液中析出的现象称为蛋白质的沉淀。 5蛋白质的凝固:蛋白质经强酸、强碱作用发生变性后,仍能溶解于强酸或强碱中,若将pH调至等电点,则蛋白质立即结成絮状的不溶解物,此絮状物仍可溶解于强酸或强碱中。如再加热则絮状物可变成比较坚固的凝块,此凝块不再溶于强酸或强 问答题 1. 蛋白质在某些物理因素或化学因素的作用下,蛋白质分子内部的非共价键断裂,天然构象被破坏,从而引起理化性质改变,生物活性丧失,这种现象称为蛋白质变性。蛋白质变性的实质是维系蛋白质分子空间结构的次级键断开,使其空间结构松解,但肽键并未断开。引起蛋白质变性的因素有两方面:一是物理因素,如紫外线照射等,一是化学因素如强酸、强碱、重金属盐
3、、有机溶剂等。 2. 三级结构以上的蛋白质的空间结构稳定主要靠疏水键和其它副键,当蛋白质在某些理化因素作用下变性后,维持蛋白质空间结构稳定的疏水键、二硫键以及其它次级键断裂,空间结构松解,蛋白质分子变为伸展的长肽链,大量的疏水基团外露,导致蛋白质水溶性降低。 3. 牛胰核糖核酸酶溶液加入尿素和巯基乙醇后变性失活,其一级结构没有改变。当用透析法去除尿素和巯基乙醇后,牛胰核糖核酸酶自发恢复原有的空间结构与功能,此例充分说明一级结构决定构象。 碱中,这种现象称为蛋白质的凝固作用。 第二章 核酸结构、功能 名词解释1.核苷 2.核苷酸 3.磷酸二酯键 4.核酸一级结构 5.DNA二级结构6.碱基互补规
4、律 7.增色效应 8.Tm值 9.核小体10.反密码子环 11.核酶 12.分子杂交 问答题:1. DNA与RNA一级结构和二级结构有何异同?2. 细胞内有哪几类主要的RNA?其主要功能是什么? 3. 已知人类细胞基因组的大小约30亿bp,试计算一个二倍体细胞中DNA的总长度,这么长的DNA分子是如何装配到直径只有几微米的细胞核内的? 4. 叙述DNA双螺旋结构模式的要点。5. 简述真核生物mRNA的结构特点。6. 简述核酶的定义及其在医学发展中的意义。 答案 名词解释 1. 各种碱基与戊糖通过C-N糖苷键连接而成的化合物称为核苷。 2. 核苷与磷酸缩合生成的磷酸酯称为核苷酸。 3. 核酸分子
5、中核苷酸残基之间的磷酸酯键称为磷酸二酯键。 4. 在核酸分子中核苷酸的排列顺序就称为核酸的一级结构。由于脱氧核苷酸之间的差别仅是其碱基的不同,所以脱氧核糖核酸分子碱基的排列顺序就代表了核苷酸的排列顺序。 5. 两条反向平行DNA单链通过碱基互补配对的原则所形成的右手双螺旋结构称为DNA的二级结构。 6. 在形成DNA双螺旋结构的过程中,碱基位于双螺旋结构内侧,A-T之间形成两个氢键,G-C之间形成三个氢键,这种碱基配对的规律就称为碱基配对规律(互补规律) 7. 当核酸分子加热变性时,对260nm处的紫外吸收增加的现象称为增色效应。 8. 当核酸分子加热变性时,其在260nm处的紫外吸收会急剧增
6、加,当紫外吸收达到最大变化的半数值时,此时所对应的温度称为熔解温度,用Tm值表示 - 1 - 生物化学名词解释及简答 9核小体由DNA和组蛋白共同构成。组蛋白分子共有五种,分别称为H1,H2A,H2B,H3和H4。各两分子的H2A,H2B,H3和H4共同构成了核小体的核心,DNA双螺旋分子缠绕在这一核心上构成了核小体。 10. 反密码子环是tRNA的茎环结构之一,因环中含有与mRNA三联体密码互补的碱基而得名。 11. 具有催化功能的RNA分子称为核酶,RNA分子发挥催化作用时不需要任何蛋白质的参与。 12. 不同来源的DNA或RNA链,当DNA链之间、RNA链之间或DNA与RNA之间存在互补
7、顺序时,在一定条件下可以发生互补配对形成双螺旋分子,这种分子称为杂交分子。形成杂交分子的过程称为分子杂交。问答题 1 一级结构相同点: DNA RNA 1.以单核苷酸作为基本结构单位 2.单核苷酸间以3,5磷酸二酯键相连接 3.都有腺嘌呤,鸟嘌呤,胞嘧啶 一级结构不同点: 1.基本结构单位 2.核苷酸残基数目 3.碱基 4.碱基互补 二级结构不同点: 脱氧核苷酸 几千至几千万 胸腺嘧啶 AT,GC 双链 右手螺旋 核苷酸 几十至几千 尿嘧啶 AU,GC 单链 茎环结构 2. 动物细胞内主要含有的RNA种类及功能 核糖体RNA 信使RNA 转运RNA 不均一核RNA 小核RNA 细胞核与胞液 r
8、RNA mRNA tRNA hnRNA snRNA 功 能 核糖体的组成成分 蛋白质合成的模板 转运氨基酸 成熟mRNA的前体 参与hnRNA的剪接、转运 3. 0.34 nm3.010922米(1bp的高度为0.34nm,二倍体)。在真核生物内DNA以非常致密的形式存在于细胞核内,在细胞生活周期的大部分时间里以染色质的形式出现,在细胞分裂期形成染色体。染色体是由DNA和蛋白质构成的。染色体的基本单位是核小体。核小体由DNA和组蛋白共同构成。组蛋白分子构成核小体的核心,DNA双螺旋分子缠绕在这一核心上构成了核小体的核心颗粒。核小体的核心颗粒之间再由DNA和组蛋白H1构成的连接区连接起来形成串珠
9、样的结构。在此基础上,核小体又进一步旋转折叠,经过形成30nm纤维状结构、300nm襻环结构、最后形成棒状的染色体。将存在人的体细胞中的23对染色体,共计2m长的DNA分子容纳于直径只有数微米的细胞核中。 4. DNA双螺旋结构模型的要点是:DNA是一平行反向的双链结构,脱氧核糖基和磷酸骨架位于双链的外侧,碱基位于内侧,两条链的碱基之间以氢键相接触。腺嘌呤始终与胸腺嘧啶配对存在,形成两个氢键(A=T),鸟嘌呤始终与胞嘧啶配对存在,形成三个氢键(CC)。碱基平面与线性分子结构的长轴相垂直。一条链的走向是53,另一条链的走向就一定是35。DNA是一右手螺旋结构。螺旋每旋转一周包含了10对碱基,每个
10、碱基的旋转角度为36,螺距为3.4nm,每个碱基平面之间的距离为0.34nm。DNA双螺旋分子存在一个大沟和一个小沟。(3)DNA双螺旋结构稳定的维系横向靠两条链间互补碱基的氢键维系,纵向则靠碱基平面间的疏水性堆积力维持。 5. 成熟的真核生物mRNA的结构特点是:大多数的真核mRNA在5-端以7-甲基鸟嘌呤及三磷酸鸟苷为分子的起始结构。这种结构称为帽子结构。帽子结构在mRNA作为模板翻译成蛋白质的过程中具有促进核糖体与mRNA的结合,加速翻译起始速度的作用,同时可以增强mRNA的稳定性。在真核mRNA - 2 - 生物化学名词解释及简答 的3末端,大多数有一段长短不一的多聚腺苷酸结构,通常称
11、为多聚A尾。一般由数十个至一百几十个腺苷酸连接而成。因为在基因内没有找到它相应的结构,因此认为它是在RNA生成后才加进去的。随着mRNA存在的时间延续,这段聚A尾巴慢慢变短。因此,目前认为这种3-末端结构可能与mRNA从核内向胞质的转位及mRNA的稳定性有关。 6具有催化作用的RNA被称为核酶。核酶的发现一方面推动了对生命活动多样性的理解,另一方面在医学上有其特殊的用途。锤头核酶结构的发现促使人们设计并合成出许多种核酶,用以剪切破坏一些有害基因转录出的mRNA或其前体、病毒RNA,现已被试用于治疗肿瘤、病毒性疾病和基因治疗研究。 第三章 酶 名词解释 1酶 5必需基团 9同工酶 13可逆抑制
12、17激活剂 2辅酶 6酶的活性中心 10全酶 14Km值 18抑制剂 3辅基 7酶原 11变构调节 15最适温度 19酶的竞争抑制 4酶的特异性 8酶原激活 12酶的化学修饰 16最适pH 20非竞争性抑 问答题1以酶原的激活为例说明蛋白质结构与功能的关系。2说明维生素和辅酶的关系。 3举例说明竞争性抑制的特点是什么?4简述诱导契合学说。5试述影响酶活性的因素及它们是如何影响酶的催化活性?6酶与非酶催化剂的主要异同点是什么?7酶促反应高效率的机制是什么?8举例说明可逆性抑制作用,并说明其特点。9举例说明竞争性抑制作用在临床上的应用。10什么是同工酶、同工酶的生物学意义是什么? 答案 名词解释
13、1由活细胞合成的、对其特异底物具有高效催化作用的特殊蛋白质。 2与酶蛋白结合疏松,用透析或超滤方法可将其与酶蛋白分开的辅助因子。 3与酶蛋白结合紧密,不能通过透析或超滤方法将其除去的辅助因子。 4一种酶只能作用于一种或一类底物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物,常将酶的这种特性称为酶的特异性。 5与酶活性密切相关的基团称为必需基团。 6酶分子中的必需基团在空间结构中彼此靠近,形成一个能与底物特异性结合并催化底物转化为产物的特定空间区域。这一区域称为酶的活性中心。 7无活性的酶的前身物质称为酶原。 8酶原受某种因素作用后,转变成具有活性的酶的过程。 9是指催化相同的化学反应,但
14、酶蛋白的分子结构、理化性质乃至免疫学特性不同的一组酶。 10由酶蛋白和辅助因子结合形成的复合物称为全酶 11体内一些代谢物与酶分子活性中心外的调节部位可逆地结合,使酶发生构象变化并改变其催化活性,对酶催化活性的这种调节方式称为变构调节。 12酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,以调节代谢途径,这一过程称为酶的化学修饰。 13抑制剂以非共价键与酶可逆性结合,使酶活性降低或丧失,此种抑制采用透析或超滤等方法可将抑制剂除去,恢复酶的活性。这种抑制称为可逆性抑制。 14是酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度,是酶的特征性常数。 15使酶促反应速度达到最快时
15、的环境温度称为酶促反应的最适温度。 16使酶催化活性最大时的环境pH称为酶促反应的最适pH。 17使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质称为酶的激活剂。 18凡能有选择地使酶活性降低或丧失但不使酶蛋白变性的物质统称做酶的抑制剂。 - 3 - 生物化学名词解释及简答 19抑制剂与酶的正常底物结构相似,抑制剂与底物分子竞争地结合酶的活性中心,从而阻碍酶与底物结合形成中间产物,这种抑制作用称为竞争性抑制作用。 20抑制剂与酶活性中心外的其他位点可逆地结合,使酶的空间结构改变,使酶催化活性降低。此种结合不影响酶与底物分子的结合,同时酶与底物的结合也不影响酶与抑制剂的结合。底物与抑制剂之间无竞争关系
16、。这种抑制作用称为非竞争性抑制作用。问答题 1在一定条件下,酶原受某种因素作用后,分子结构发生变化,暴露或形成活性中心,转变成具有活性的酶,这一过程叫做酶原的激活。 酶原激活过程说明了蛋白质结构与功能密切相关,功能基于结构,结构改变,功能也随之发生变化,结构破坏,功能丧失。 2.B族维生素与辅助因子的关系 维生素 维生素B1 维生素B2 化学本质 硫胺素 核黄素 辅助因子形式 焦磷酸硫胺素 黄素腺嘌呤单核苷酸 黄素腺嘌呤二核苷酸 维生素PP 尼克酸或 尼克酰胺 维生素B6 泛酸 生物素 叶酸 维生素B12 吡哆醇或 吡哆醛或 吡哆胺 钴胺素 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸 尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
17、磷酸吡哆醛 或磷酸吡哆胺 辅酶A 生物素 四氢叶酸 甲基B12 转氨基 氨基酸脱羧 酰基转移 羧化 一碳单位转移 甲基转移 递氢 递氢 主要功能 脱羧 3酶的竞争性抑制作用是指抑制剂与酶的正常底物结构相似,因此抑制剂与底物分子竞争地结合酶的活性中心,从而阻碍酶与底物结合形成中间产物,这种抑制作用称为竞争性抑制作用。竞争性抑制作用具有以下特点:抑制剂在化学结构上与底物分子相似,两者竞相争夺同一酶的活性中心;抑制剂与酶的活性中心结合后,酶分子失去催化作用;竞争性抑制作用的强弱取决于抑制剂与底物之间的相对浓度,抑制剂浓度不变时,通过增加底物浓度可以减弱甚至解除竞争性抑制作用;酶既可以结合底物分子也可
18、以结合抑制剂,但不能与两者同时结合。例:丙二酸是二羧酸化合物,与琥珀酸结构很相似,丙二酸能与琥珀酸脱氢酶的底物琥珀酸竞争与酶的活性中心结合。由于丙二酸与酶的亲和力远大于琥珀酸的亲和力,当丙二酸的浓度为琥珀酸浓度1/50时,酶的活性可被抑制50%。若增加琥珀酸的浓度,此种抑制作用可被减弱。 4诱导契合学说认,酶在发挥催化作用之前,首先酶与底物相互接近,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合,生成酶-底物复合物,而后使底物转变成产物并释放出酶。这过程称为诱导契合学说。 5影响酶催化活性的因素主要包括底物浓度、酶浓度、pH、温度、激活剂和抑制剂等。 底物浓度:在酶浓度及其它条件不变的情况下
19、,底物浓度变化对酶促反应速度影响的作图呈矩形双曲线。在底物浓度较低时,反应速度随底物浓度的增加而增加,两者呈正比关系,;当底物浓度较高时,反应速度虽然也随底物的增加而加速,但反应速度不再呈正比例加速,反应速度增加的幅度不断下降;当底物浓度增高到一定程度时,反应速度趋于恒定,继续增加底物浓度,反应速度不再增加,达到极限,称为最大反应速度,说明酶的活性中心已被底物所饱和。 酶浓度:酶促反应体系中,在底物浓度足以使酶饱合的情况下,酶促反应速度与酶浓度呈正比关系。即酶浓度越高,反应速度越快。 pH:酶催化活性最大时的环境pH称酶促反应的最适pH。溶液的pH高于或低于最适pH,酶的活性降低,酶促反应速度
20、减慢,远离最适pH时甚至会导致酶的变性失活。 温度:温度对酶促反应速度具有双重影响。在较低温度范围内,随着温度升高,酶的活性逐步增加, - 4 - 生物化学名词解释及简答 以致达到最大反应速度。升高温度一方面可加快酶促反应速度,同时也增加酶的变性。温度升高到60以上时,大多数酶开始变性;80时,多数酶的变性不可逆转,反应速度则因酶变性而降低。综合这两种因素,将酶促反应速度达到最快时的环境温度称为酶促反应的最适温度。 激活剂:使酶由无活性变为有活性或使酶活性增加的物质称为酶的激活剂。 抑制剂:凡能有选择地使酶活性降低或丧失但不能使酶蛋白变性的物质统称做酶的抑制剂。无选择地引起酶蛋白变性使酶活性丧
21、失的理化因素不属于抑制剂范畴。抑制剂多与酶活性中心内、外必需基团结合,直接或间接地影响酶的活性中心,从而抑制酶的催化活性。 6酶与一般催化剂比较:共同点:微量的酶就能发挥巨大的催化作用,在反应前后没有质和量的改变;只能催化热力学上允许进行的反应;只能缩短反应达到平衡所需的时间,而不能改变反应的平衡点,即不能改变反应的平衡常数;对可逆反应的正反应和逆反应都具有催化作用。 不同点:高度的催化效率:酶具有极高的催化效率,一般而论,对于同一反应,酶催化反应的速率比非催化反应的速率高1081020倍,比一般催化剂催化的反应高1071013倍。高度的特异性:与一般催化剂不同,酶对其所催化的底物具有较严格的
22、选择性。即一种酶只能作用于一种或一类底物,或一定的化学键,催化一定的化学反应并生成一定的产物,常将酶的这种特性称为酶的特异性。包括:绝对特异性、相对特异性和立体异构特异性。酶催化活性的可调节性。酶活性的不稳定性:酶是蛋白质,酶促反应要求一定的pH、温度和压力等条件,强酸、强碱、有机溶剂、重金属盐、高温、紫外线、剧烈震荡等任何使蛋白质变性的理化因素都可使酶蛋白变性,而使其失去催化活性。 7酶高效率催化作用的机制可能与以下几种因素有关。 邻近效应与定向排列:在两个以上底物参与的反应中,底物之间必须以正确的方向相互碰撞,才有可能发生反应。酶在反应中将各底物结合到酶的活性中心,使它们相互接近并形成有利
23、于反应的正确定向关系,使酶活性部位的底物浓度远远大于溶液中的浓度,从而加快反应速度。 多元催化:酶分子中含有多种功能基团,它们具有不同的解离常数,它们既可以作为质子供体,也可以作为质子的受体,在特定的pH条件下发挥催化作用。因此,同一种酶兼有酸碱催化作用。这种多功能基团的协同作用可极大的提高酶的催化效率。 表面效应:酶活性中心内部多种疏水性氨基酸,常形成疏水性“口袋”以容纳并结合底物。疏水环可排除周围大量水分子对酶和底物功能基团的干扰性吸引或排斥,防止在底物与酶之间形成水化膜,有利于酶与底物的直接接触,使酶的活性基团对底物的催化反应更为有效和强烈。 应该指出的是,一种酶的催化反应不限于上述某一
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