ISSR 引物序列 UBC 加拿大哥伦比亚大学设计.docx

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1、ISSR 引物序列 UBC 加拿大哥伦比亚大学设计UBC Primer Set #9 (Microsatellite) 引物名称 序列5-3 801 ATA TAT ATA TAT ATA TT 802 ATA TAT ATA TAT ATA TG 803 ATA TAT ATA TAT ATA TC 804 TAT ATA TAT ATA TAT AA 805 TAT ATA TAT ATA TAT AC 806 TAT ATA TAT ATA TAT AG 807 AGA GAG AGA GAG AGA GT 808 AGA GAG AGA GAG AGA GC 809 AGA GAG A

2、GA GAG AGA GG 810 GAG AGA GAG AGA GAG AT 811 GAG AGA GAG AGA GAG AC 812 GAG AGA GAG AGA GAG AA 813 CTC TCT CTC TCT CTC TT 814 CTC TCT CTC TCT CTC TA 815 CTC TCT CTC TCT CTC TG 816 CAC ACA CAC ACA CAC AT 817 CAC ACA CAC ACA CAC AA 818 CAC ACA CAC ACA CAC AG 819 GTG TGT GTG TGT GTG TA 820 GTG TGT GTG

3、TGT GTG TC 821 GTG TGT GTG TGT GTG TT 822 TCT CTC TCT CTC TCT CA 823 TCT CTC TCT CTC TCT CC 824 TCT CTC TCT CTC TCT CG 825 ACA CAC ACA CAC ACA CT 826 ACA CAC ACA CAC ACA CC 827 ACA CAC ACA CAC ACA CG 828 TGT GTG TGT GTG TGT GA 829 TGT GTG TGT GTG TGT GC 830 TGT GTG TGT GTG TGT GG 831 ATA TAT ATA TAT

4、 ATA TYA 832 ATA TAT ATA TAT ATA TYC 833 ATA TAT ATA TAT ATA TYG 834 AGA GAG AGA GAG AGA GYT 835 AGA GAG AGA GAG AGA GYC 836 AGA GAG AGA GAG AGA GYA 837 TAT ATA TAT ATA TAT ART 838 TAT ATA TAT ATA TAT ARC 839 TAT ATA TAT ATA TAT ARG 840 GAG AGA GAG AGA GAG AYT 841 GAG AGA GAG AGA GAG AYC 842 GAG AGA

5、 GAG AGA GAG AYG 843 CTC TCT CTC TCT CTC TRA 844 CTC TCT CTC TCT CTC TRC 845 CTC TCT CTC TCT CTC TRG 846 CAC ACA CAC ACA CAC ART 847 CAC ACA CAC ACA CAC ARC 848 CAC ACA CAC ACA CAC ARG 849 GTG TGT GTG TGT GTG TYA 850 GTG TGT GTG TGT GTG TYC 851 GTG TGT GTG TGT GTG TYG 852 TCT CTC TCT CTC TCT CRA 853

6、 TCT CTC TCT CTC TCT CRT 854 TCT CTC TCT CTC TCT CRG 855 ACA CAC ACA CAC ACA CYT 856 ACA CAC ACA CAC ACA CYA 857 ACA CAC ACA CAC ACA CYG 858 TGT GTG TGT GTG TGT GRT 859 TGT GTG TGT GTG TGT GRC 860 TGT GTG TGT GTG TGT GRA 861 ACC ACC ACC ACC ACC ACC 862 AGC AGC AGC AGC AGC AGC 863 AGT AGT AGT AGT AGT

7、 AGT 864 ATG ATG ATG ATG ATG ATG 865 CCG CCG CCG CCG CCG CCG 866 CTC CTC CTC CTC CTC CTC 867 GGC GGC GGC GGC GGC GGC 868 GAA GAA GAA GAA GAA GAA 869 GTT GTT GTT GTT GTT GTT 870 TGC TGC TGC TGC TGC TGC 871 TAT TAT TAT TAT TAT TAT 872 GAT AGA TAG ATA GAT A 873 GAC AGA CAG ACA GAC A 874 CCC TCC CTC CCT

8、 CCC T 875 CTA GCT AGC TAG CTA G 876 GAT AGA TAG ACA GAC A 877 TGC ATG CAT GCA TGC A 878 GGA TGG ATG GAT GGA T 879 CTT CAC TTC ACT TCA 880 GGA GAG GAG AGG AGA 881 GGG TGG GGT GGG GTG 882 VBV ATA TAT ATA TAT AT 883 BVB TAT ATA TAT ATA TA 884 HBH AGA GAG AGA GAG AG 885 BHB GAG AGA GAG AGA GA 886 VDV C

9、TC TCT CTC TCT CT 887 DVD TCT CTC TCT CTC TC 888 BDB CAC ACA CAC ACA CA 889 DBD ACA CAC ACA CAC AC 890 VHV GTG TGT GTG TGT GT 891 HVH TGT GTG TGT GTG TG 892 TAG ATC TGA TAT CTG AAT TCC C 893 NNN NNN NNN NNN NNN 894 TGG TAG CTC TTG ATC ANN NNN 895 AGA GTT GGT AGC TCT TGA TC 896 AGG TCG CGG CCG CNN NN

10、N NAT G 897 CCG ACT CGA GNN NNN NAT GTG G 898 GAT CAA GCT TNN NNN NAT GTG G 899 CAT GGT GTT GGT CAT TGT TCC A 900 ACT TCC CCA CAG GTT AAC ACA 其中：N = (A , G, C , T) , R = (A , G) ,Y = (C , T) ,B = (C , G, T) ( I. e. not A) ,D = (A , G, T) ( I. e. not C) ,H = (A , C , T) ( I. e. not G) ,V = (A , C , G) ( I. e. not T)