Bioedit序列比对和Mega制作系统发育树 更新.docx
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1、Bioedit序列比对和Mega制作系统发育树 更新Bioedit程序操作 1、将序列粘贴到记事本中。 每行以“”为行头,后面可写上属种名称、模式菌株编号、序列登录号等等,回车,另起一行粘贴序列。 2、打开Bioedit程序,点击“File”,选择“Open”,在打开的对话框中选择文件类型为“All Files”,打开序列TXT文件,然后点击菜单栏的“Accessory Application”,在弹出菜单中选择“ClustalW Multiple alignment”,点击“Run ClustalW”,开始进行序列比对。比对结束后,中间数据区的序列发生变化,头尾出现长短不一,这时在“mode
2、”框里选择“edit”,然后点击序列上方的标尺,选择前端最短序列处,然后点击菜单栏“Edit”,弹出菜单中选择“Select to Begining”,这时序列前端不整齐的部分被选中,然后按“delete”删除;然后选择后端最短序列处,点击菜单栏“Edit”,弹出菜单中选择“Select to End”,删除,然后保存为Fasta格式文件。 Mega程序操作 1、打开Mega程序,点击“File”,选择“Convert To MEGA Format”,选择上步保存的Fasta格式文件,点击“OK”,完成格式转换,然后点击保存,生成.meg格式文件。 2、然后点击“File”,选择“Open D
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