生物反硝化作用.doc
《生物反硝化作用.doc》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物反硝化作用.doc(22页珍藏版)》请在三一办公上搜索。
1、生物反硝化作用1引言反硝化作用是使固定的N由土壤返回大气的主要生物过程。反硝化作用在N循环过程中的中心作用虽然曾使它成为大量研究的主题,但从田间的定量水平到基本的微生物生物化学来说,该过程仍然是土壤N转化中很不了解的一个方面。农业土壤中因反硝化作用造成的N损失的定量估计有巨大的差异,其范围为施入肥料N的0-70%(Rolston等,1976,1979,Craswell,1978,Kisse1和Smith,1978;Kowalnko,1978)。Hauck(1981)在对采用15N的大田N研究进行评论时估计,肥料N的平均亏损在25-30%之间。这种估计出的肥料N损失可能主要是由于反硝化作用造成的
2、,但也会涉及到其它机制(第二十三章,Hauck和Tanji)。Ryden和Lund(1980)研究了一些加利福尼亚州的灌溉土壤,他们发现因反硝化作用损失的N总量范围为95-233千克/(公顷.年)。肥料或土壤有机质产生的N03-对地下水或供水污染的潜在威胁促进了人们在过去10年中对反硝化作用的研究。一氧化二氮(氧化亚氮,N2O)在平流层的化学反应中的作用也引起了对反硝化作用过程的兴趣(Johnston,1971,Crutzen,1970)。已经假设,随着在作物生产中应用的工业或生物固定的N量的增加,由于反硝化作用而产生的N2O将导致地球臭氧防护层的明显破坏(Crutzen和Ehhalt,197
3、7;McE1roy等,1977;Pratt等,1977;Sze和Rice,1976)和(或)将通过影响对流层的辐射平衡而造成地球表层的不断升温(Wang等,1976)。土壤中的反硝化作用既能产生N20,也能产生N2;因此该过程既可作为N2O的来源,又可成为N2O还原为N2时的贮库。反硝化作用在陆地N2O的收支中的重要意义还没有完全弄清楚,但这一问题可促进人们对反硝化作用的进一步研究,它不仅增加了对反硝化作用,而且也增加了对土壤一般的微生物N代谢的理解。2生物化学和微生物学基础2.1定义和途径在美国土壤学会出版的土壤科学名词小辞典(1979)中,反硝化作用被定义为“通过微生物的活动,将硝酸盐或亚
4、硝酸盐还原为气态分子氮或气态氮氧化物的过程”。但包括硝化作用和N03-还原为NH4+的某些微生物N代谢类型也可能通过NO2-的还原作用而导致气态N氧化物(N20,N0,或两者都有)的产生(Ritchie和Nicholas,1972,1974,Bo11ag和Tung,1972;Yoshida和Alexander,1970),为了避免混淆,似乎需要有一个更为明白无误的定义。大多数微生物学家认为,反硝化作用是存在于有限的一些微生物属中的一个呼吸过程。在该过程中N的氧化物可作为呼吸作用电子传递的末端电子受体,这种电子传递将底物提供的一个“还原”电子通过许多电子载体传递到一个氧化性更强的N氧化物上。在电
5、子传递到至少几种N氧化物的过程中,能量就通过电子传递的磷酸化作用而被保存下来。在反硝化细菌把NO3-或NO2-还原为N2和(或)N2O时,它可以在缺乏分子态氧的条件下生长。只能还原为气体产物(主要是N2和N2O)的阴离子的还原作用和产生的气体的数量都具有一些使反硝作用有别于其它类型的微生物N代谢的特点。在硝化作用的过程中,N2O产生的确切机制是不清楚的,N2O气体可能是羟胺氧化(Hooper和Terry,1979)或N02-被N02-还原酶(Ritchie和Nicholas,1972,1974)还原的产物。Blackmer等(1980)曾提出土壤中发生硝化作用时所产生的N2O来自N02-的还原
6、作用,而且,已经证明降低O2的有效性可增强培养物和土壤中NH4+氧化菌产生N2O(Blackmer等,1980;Goreau等,1980)。有人提出,当O2不足时,硝化微生物可转变为嫌气呼吸(或反硝化作用)的形式(Payne,1973),但尚未证明N氧化物可以作为化能自养NH4+氧化菌生长的唯一的末端电子受体。在N02-还原为NH4+的过程中,N2O产生的机制甚至比硝化作用过程中的机制更不清楚(Bollag和Tung,1972;Yoshida和Alexander,1970)。也有些报道表明,当肠细菌中的N2O-还原为NH4+时可产生N2O(Tiedje,1981)。在这些微生物中,至少有一种,
7、即肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella Pneumoniae),已报道表明,N2O的发生与利用N2O作为嫌气呼吸时唯一的末端电子受体有关(Hom等,1980)。Yoshinari(1980)最近报告过N2O可被一种能将N03-还原为NH4+的发酵微生物还原为N2。把反硝化作用与过去认为有着很大不同的其它代谢过程区分开来的困难是由于N代谢的知识日益增长所造成的。未来的研究结果才有可能更清楚地勾划出这些代谢过程的差异或者需要扩大反硝化作用的概念。这种论述将与这里所定义的反硝化作用有关。在过去的10年中,其它评论已涉及到本论题的内容,在某些方面还更为详细(Focht和Verstraete,1977,
8、Delwiche和Bryan,1976;Stouthamer,1976;Garch,1975;Payne,1973)。反硝化作用发生的总的要求是(1)存在具有代谢能力的细菌;(2)合适的电子供体,如有机C化合物、还原态S化合物或分子态氢(H2),(3)嫌气条件或限制O2的有效性,(4)N的氧化物,如NO3-,NO3-或N2O作为末端电子受件,反硝化作用过程中N氧化物还原的途径一般认为是:(+5)(+3)(+2)(1)(0)N03-NO2-NON2ON2这种假设的还原顺序已提出一段时间了,而且已积累了很多支持每种N氧化物在该途径中的作用的证据。应用同位素混合和交换的研究对两种更有“争议”的中间产
9、物,即NO和N2O进行了探索。St.John和Hollocher(1977)应用15N标记的N02-对铜绿假单孢菌(Pseudomonos aeruginosa)进行了研究,他们未能发现标记的15N与非标记的NO贮库具有交换作用,而且N2产物也未表现出同位素混合作用。这些工作者得出这样的结论:NO不是反硝化作用过程中的一种游离产物。Firestone等(1979a)报道了来自N02-的标记13N确实表现出能与加入的两种假单孢杆菌培养中的非标记的NO发生大量迅速的混合。这一工作表明,NO或者是一个主要的中间产物,或者是能与这样的一种中间产物迅速达成平衡。至于NO是否起着专一中间产物的作用,仍然存
10、在着许多不同的看法(Zumft和Cardenas,1979;Zumft和Vega,1979;St.Tohn和HolloCher,1977;Delwick和Bryan,1976)。产生这种分歧的原因将在有关N02-和NO还原酶的段落中作进一步的讨论。新近的同位素交换和动力学证据对还原途径中所涉及到的游离转次亚硝酸(transhyponitrite)(O-N=N-D)2-产生了争议(Hollocher等,1980)。用15N对铜绿假单孢菌(St.Tohn和Hollocher,1977)以及用15N对一些培养物和土壤(Firestone等,1980)的交换研究指出,N2O是在N02-还原为N过程中的
11、一种游离的专一中间产物。这些工作,以及在N2O还原酶抑制剂乙炔的存在下,一般所观察到的N2O的化学数量的积累作用似乎都证明N2O可以为反硝化作用的一种主要中间产物(Balderston等,1976;Yoshinari和Knowles,1976)。但是,Brgan(1980)新近所做的工作对这种结论提出了一些怀疑。把15N标记的N02-和14N-N2O加入处于稳定期的施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)的培养物中以后,Bryan测定了15N15N,15N 14N和14N 14N在产生N2时的方式。如果简单的还原顺序NO3-NO2-NON2ON2成立的话,那么将只能产生15N
12、15N。和14N 14N-N。但发现了二次类型的分布,其N2的主要形式为15N 14N。Bryan(1980)也曾报道过虽然铜绿假单胞菌能在形成N2的最后还原步骤中得到能量,但它不能在加有N2O的基质上生长。这些结果的意义并不都是清楚的,因此,N2O作为反硝化作用过程的中间产物的问题还不能得到圆满解答。2.2 有关的微生物据报道,约有23个属的细菌具有反硝化作用的能力。表8-1中所列出的反硝化细菌属包括了13个已经确证的或有广泛记录的细菌属。已报告在棒状杆菌属(Corynebacterium)、黄单胞菌属(Xanthomonas )、不动细菌属(Acineobacter)和葡萄菌属(Glueo
13、nobacter)中存在着反硝化细菌的菌株,其中大部分还没有肯定的分类归属。Jeter和Ingraham(1981)编辑了更为完整的目录,并包括了对色杆菌属(Chromobacterium)、噬细胞菌属(Cytophaga)、奈瑟氏菌属(Neisseria)、西蒙斯氏菌属(Simonstella)、硫小螺菌属(Thiomicrospira)和热丝状菌属(Thermothrx)的反硝化细菌种的讨论。与Ha11所编撰的能把N03-异化还原为NO2-的73个细菌属的目录相比较,反硝化作用则似乎只有相对有限的代谢能力。对Payne(1976)以及Focht和Verstraete(1977)以前所编辑的
14、材料最明显的增补是根瘤菌属(Rhizobium)、黄杆菌属(Flavobacterium)和农杆菌属(Agrobacterium)(Zablotowicz等,1978;Pichinoty等,1976,1977)。一种表观上具有微需氧反硝化能力的磁性螺菌(Magnetic spirillum)的原始报道也是令人感到兴趣的(Escatamte-Semerena,1980)。在所研究的微生物中,大部分都具有把NO3-、NO2-或N2O作为唯一的末端电子受体而进行还原的能力。少数菌株,如气味产碱杆菌(Alcaligenes odorans),则不能利用NO3-(Pichinoty等,1976,1978
15、b;Vangai和Klein,1974)。其它少数菌株(一般是荧光假单孢杆菌)会产生N2O作为最终产物(Payne和Balderston,1978;Greenberg和Becker,1977;Renner和Becker,1970)或者在N2O培养基上生长得很差(St.John和Hollocher,1977,Bryan,1980)。极少见有关微生物能在NO培养基上生长的报告(Pichinoty等,1978a;Ishaque和Aleem,1973)。由于NO是固有毒性的化合物,所以能在其上生长不是非同寻常,就是很难证实。大部分的反硝化细菌是化能自养生物。这就是说,它们能利用化学能源(不是光源),它
16、们还能利用有机C化合物作为电子供体(还原剂)和作为细胞的碳源。有一种行光合作用的细菌红假单胞菌(Rhodopseudomonas sphaeroides)已证明是反硝化菌,但当进行反硝化作用时,它能以化能自养菌的方式生长(Satoh,1977)。一些反硝化细菌也能以无机营养菌的方式生长;脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)能利用还原的S化合物,脱氮副球菌(Paracoccus denitrificans)和产碱杆菌属的一些种都能利用H2用为电子供体(Thauer等1977;Buchanan和Gibbons,1974)。脱氮硫杆菌在进行反硝化作用时,也能以自养生物的
17、方式(利用CO2用为C源)进行生长。几乎所有的反硝化菌都是好气生物,只有当N氧化物存在时才能进行嫌气生长。利用O2作为一种电子受体所进行的呼吸和利用N氧化物作为电子受体所进行的呼吸都是相类似的过程,在该过程中,反硝化作用所利用的许多电子载体也可用于O2的呼吸作用(图8-1)。丙酸杆菌属(Propionibacterium)中的细菌似乎是目前仅知的能进行反硝化作用的专性嫌气发酵生物(Thauer等,1977;Payne,1976)。该属中的种已被证实至少拥有电子传递与NOX还原作用相偶合所必需的细胞色素(Stouthamer,1976),但有关这些微生物对N氧化物进行还原的实质性证据尚不完备。芽
18、孢杆菌属(Bacillus)的一些反硝化菌种是既能进行发酵作用又能进行呼吸作用的兼性微生物。(表:表8-1 能进行反硝化作用的细菌属 )属*一些种的重要特征产碱菌属通常能从土壤中得到分离(Alccligenes)土农杆菌属一些种是植物的病原菌(Agrobacterium)固氮螺菌属(拟)能进行N2固定作用,通常与禾本科植物结合在一起(Azospirillum)芽孢杆菌属已报道是高温反硝化菌(Bacillus)黄杆菌属新近分离的反硝化菌种(Flavobcaterium)适盐菌属(嗜盐细菌属)需要高浓度的盐才能生长(Haiobacterium)生丝霉菌属既能进行无机营养型又能进行异养型的生长(Hy
19、phomicrobium)副球菌属能在发酵罐中进行反硝化作用(Paracoccus)丙酸杆菌属通常能从土壤中得到分离(Propionibacterium)根瘤菌属能与豆科植物进行共生固氮(N2)作用(Rhizobium)红假单胞菌属光合细菌(Rhcaopseudomonas)硫杆菌属一般以化能自养型方式生长(Thiobacillus)注释:*这里涉及的许多属都要在教科书中找到。更详细的资料可参看Jeter 和Ingraham(1981),Focht和Verstraete(1977),Garcia(1975),Buchaman和Gibbons(1974)的材料。 少数固N2微生物,其中包括巴西固
20、氮螺菌(Azospirilum basilense)(从前认为是螺菌Spirilum lipoferum)和大豆根瘤菌(Rhizobium japonicum)时,它们也都是反硝化菌(Zablotowicz等,1978;Eskew等,1977,Neyra等,1977),Neyra和van Berkum(1977)以及Scott和Scott(1978)报道过固氮螺菌属的种能产生与反硝化作用相偶合的固N2作用。但是,Nelson和Know1es(1978)用O2和NO3-对巴西固气螺菌的两个过程进行控制的研究结果指出,在很大程度上固N2作用和反硝化作用是不会同时发生的。NO3-转化为NO2-的主动
21、还原作用(active reduction)已经显示出可以抑制这种微生物的固氮酶活性(Magalhaes等,1978)。在土壤中,固N2活性只有在加入的NO3-被反硝化作用耗尽之后才可以检测出来(Yoshinari等,1977)。要确定土壤中哪些反硝化微生物在功能上起着重要作用是十分困难的。Gamb1e等(1977)对19种土壤进行了研究,他们发现最经常被分离出来的细菌是假单孢杆菌属和产碱杆菌属的菌种。可以预期这些属的许多种可在实验室最经常采用的分离土壤微生物的加富培养基上良好地生长,在决定哪些细菌在土壤反硝化菌中起着重作用方面,至少存在着两个主要困难:培养基的固有选择性或者几乎无法实现的在培
22、养基中模拟复杂的土壤环境的工作,以及所有反硝化菌都具有的双重代谢能力。这就是说从可能发生反硝化作用的土壤中分离出来的菌株并不一定意味着该微生物在自然环境中是以反硝化菌的方式正常地生长的。Smith和Tiedje(1980)的研究清楚地证实了这两个问题的重要意义。在实验室培养基上能以反硝化菌方式生长良好的土壤分离体在没有加C的土壤上不会有多大的竞争性,而在NO3-肉汁上生长最缓慢的菌株则在饱和土壤上生长得最为迅速。这些工作者也发现,不同分离体生长或存活的能力主要取决于土壤是处于嫌气(水饱和的土壤)还是好气条件下。 Gamble等(1977)在其对土壤的研究中发现,荧光假单胞菌(Pseudomin
23、as fluorescens)包括有已分离到的大型单种。但对该微生物的研究在深度上还很不够。最普通选作生理研究的反硝化菌是脱氮副球菌、Pseudomonas perfectomarinus以及铜绿假单胞菌。在这些种中,只有铜绿假单胞菌能在Gamb1e等(1977)所研究的土壤中找到。本章所讨论的有关反硝化作用的生物化学知识有可能是利用土壤环境中不甚重要的微生物进行研究而获得的。种之间的酶学特性和控制方面的类似性都很可能存在,但将这些研究结果推广至大田土壤上则需要有条件地进行。2.3 细胞控制在任何代谢过程中,都可在两个基础水平上进行控制,即酶的合成或实际存在的酶的活性。就反硝化作用而言,一些参
24、数(例如O2和NO3-)都可在两个水平上控制其过程。本节要讨论的是反硝化作用的遗传学,控制基因发生或随后酶合成的条件,以及最后还要讨论影响酶活性的参数。将可以非常明显地看出,NO3-还原为NO2-的还原作用的研究比随后发生的还原步骤的研究要深入得多。这可部分归因于这样的事实,即呼吸时NO3-还原为NO2-的过程普遍存在于许多细菌中而不只是存在于反硝化菌中(Hall,1978)。硝化菌中存在的异化作用硝酸还原酶(DNR)的特性与NO3-呼吸菌(respirer)中所发现的那些特性十分相似。因此,从NO3-呼吸菌得到的信息可普遍外推用于反硝化作用。2.3.1 遗传学关于控制N氧化物还原酶合成的基因
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物 硝化作用
链接地址:https://www.31ppt.com/p-2825431.html