植物与病原物互作的相关基因汇总课件.ppt
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1、植物免疫学,第八章 植物与病原物互 作的相关基因,Contents 目录,8.1 基因对基因假说8.2 植物抗病基因和防卫反应基因8.3 病原物致病性相关基因,寄主一病原物相互关系中主要问题的研究渊源(数字为发表年份或研究兴起的大致年代),8.1.1 Flor的基因对基因假说(geng-for-gene hypothesis)“在具有一个抗病基因(抗不含毒性基因的小种)的亚麻品种上,病菌小种杂种F2中出现一对因子的分离比;在具有2个、3个或4个抗病基因的品种上,病菌小种杂种F2中相应出现2对、3对或4对因子的分离比。这说明:对应于寄主方面的每一个决定抗病性的基因,病菌方面也存在一个决定致病性的
2、基因。”寄主寄生物体系中,“任何一方的每个基因,都只有在另一方相对应的基因的作用下才能被鉴定出来。”,8.1 基因对基因假说,亚麻锈菌小种22号小种24号的F1在Ottawa770B,Bombay两品种上的致病性分离比(两对因子)(据Flor,1956),符号说明:L和N为两个不同的抗病基因;aL为对L的隐性毒性基因,AL为其显性无毒性基因;aN为对N的隐性毒性基因,AN为其显性无毒性基因,OttawaBombay1 F2对亚麻锈菌小种22号和24号的反应的分离比(据Flor,1956),该学说认为:植物对某种病原物的特异抗性取决于它是否具有相应抗性基因,而同时病原物的专一致病性取决于病原物是
3、否具有无毒基因也就是说寄主分别含有感病基因(r)和抗病基因(R),病原物分别含有毒性基因(Vir)和无毒基因(Avr)只有当具有相应抗病基因的植物与具有无毒基因的病原物相遇时,才会激发植物的抗病反应,其他情况下二者表现亲和,即寄主感病,寄主植物与病原菌之间“基因对基因”关系的简要模型A.通用模式 B.一种特殊模式,小麦小麦锈菌系统“基因对基因”关系的简要模型“”表示不亲和反应(抗病);“+”表示亲和反应(感病)(1)抗病基因Hx和非毒性基因Px为显性基因,这是最普通的模式(2)病菌显性逆转,Hx表示抗病基因,Px表示毒性基因(3)寄主显性逆转,Hx表示感病基因,Px表示非毒性基因(4)病菌和寄
4、主双方发生显性逆转,Hx表示感病基因,Px表示毒性基因,8.1.2 其它作物中基因对基因关系的证明,已证实或已推证出有基因对基因关系存在的寄主一寄生物系统(选录自Flor 1971 和Day 1974),8.1.3 基因对基因学说的作用和意义小种鉴定中鉴别寄主的改进新小种可以预见品种抗病基因型和病原物毒性基因型的鉴定抗病性机制研究寄主和寄生物共同进化的理论研究,8.1.4 抗病性基因和致病性基因间的相互作用专化性(specificity)识别(recognition)亲和性(Compatible),8.1.5 抗病基因和感病基因的本质R基因和r基因一样,是植物正常代谢所需基因原生功能是一样的,
5、只是次生功能相反当无毒菌系入侵后,R植株表现抗病,r植株感病无毒性基因不是一个病菌的自杀基因,而有其与毒性基因相同的原生功能,为病菌正常代谢所需,8.2 植物抗病基因和防卫反应基因,抗病基因(resistance gene,R gene):侦知病原物的侵犯,发出抵抗指令防卫反应基因(defence response gene):执行和完成防卫反应在植物抗病性研究和利用中,都以小种专化性抗病性,即以HR反应为特征的主动抗病性为主要对象,抗病性相关基因的探讨亦不例外,8.2.1 植物已知抗病基因植物的抗病基因是指与病原物无毒基因匹配,而启动不亲和互作的基因,也称为识别基因抗病基因编码的蛋白质有两个
6、基本作用:识别相应的Avr衍生信号;激活下游信号传导,引发复杂的防御反应,抗病基因在染色体上的组织和排列一个座位仅有单个R基因,称为简单基因座(simple locus)。简单位点可能有多个复等位基因亚麻的L座位有13个等位基因,分别对抗亚麻锈菌的不同小种拟南芥的Rpp13也是简单座位,具有功能不同的等位基因拟南芥的Rpm1和Rps2等位点,除了一个抗病基因外,也有功能不明的等位基因。拟南芥不同生态型之间,该两基因的等位基因有相当大的序列差异复合座位(complex locus),R基因在染色体上成簇(cluster)存在。有些以串联方式构成基因家族(gene family),基因间距离因物种
7、而异亚麻M基因座是复合的,已鉴定的7个抗病基因以串联重复的方式簇集在该基因座上抗病基因Pto、Cf-2、Cf-9、N、Xa-21等都位于此类复合基因座位同一簇的不同基因甚至可以分别抵抗不同类群的病原物有的抗病基因簇在植物染色体上占据相当大的区段,超出了一个基因家族的范围。另一些抗病基因则在DNA某些特殊区域呈松散簇状分布,基因座相隔12 cM,复合基因座位中可能含有功能相似或相关的不同基因番茄Pto基因簇有5个编码蛋白激酶的基因,它们紧密连锁,还有对有机磷杀虫剂倍硫磷敏感基因Fen和Prf基因抗病基因Pto和丁香假单胞无毒基因avrPto的识别需要Prf基因的参与,后者编码含LRR和NBS的蛋
8、白质有的基因座位具有两个基因共同控制抗病专化性番茄的Cf-2/Cf-5基因座位和Cf-4/Cf-9基因座位另外,不同种的植物可能含有识别功能一致的R基因,同一R基因也可能识别相同病原菌不同小种的avr基因。同源程度较高的核苷酸序列的串联重复,有利于基因内和基因间的重组,导致较大基因区段的交换,或基因内精细结构的改变基因突变、重组、重复、缺失、核苷酸置换等都有利于抗病基因多样化和抗病专化性的分化。总之,这种成簇分布的抗病基因复合体在遗传上是不稳定的。,8.2.2 抗病基因产物的结构特点抗病基因的共同结构域富亮氨酸重复(leucine-rich repeats,LRRs)卷曲螺旋结构(coiled
9、-coil,CC)核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)跨膜结构域(trans-membrane domain,TM)丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶结构域(serine/threonine kinase,S/TK)亮氨酸拉链(leucine zipper,LZ)Toll/白介素-1同源区域(Toll-Interlenkin-1 like receptor,TIR),R基因编码R蛋白的结构特点,核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)抗病蛋白的NBS区有3个特征保守区,第1区域为磷酸结合环(P-loop),又称激酶la(Kinase l
10、a),其共有序列为GM(GPP)GNGKTT(aPT)第2区域为激酶2,共有序列为X(XPR)XaaaaDDV(WPD)第3区域为激酶3a,其保守区为SraaaT(TPS)RR基因编码产物中NBS的存在,表明R基因的功能之一是磷酸化,通过磷酸化识别配体,导致一系列抗性反应的发生NBS主要氨基酸的突变可导致抗性的降低或消失。,RPS4和RPS5中NBS结构域的结构,显示保守基序的位置蛋白质结构是带状图所示:P-loop(蓝色);RNBS-A(绿);kinase-2(品红);RNBS-B(green);RNBS-C(绿);GLPL(黄);RNBS-D(绿);MHDV(橘黄),富含亮氨酸重复(Leu
11、cine rich repeats,LRR)富含亮氨酸重复(LRR)因亮氨酸在这一结构中呈规律性重复而得名LRR 存在于多种不同的蛋白中,与蛋白质间相互作用及信号传导密切相关。在功能方面,LRR决定着与配体结合的专一性,即决定着寄主与病原的特异性识别抗病蛋白所含的LRR结构可大至分为2类:定位于胞外的 LRR,共有序列为“LXLXXLXXLXLXXNXLXGXIPXX”定位于胞质的 LRR,共有序列为“aXXXXXLXXLXLXX(XPC)XXXXXaXXX”可以看出所有LRR都具有“XLXXLXLXX”结构。,根据拟南芥抗病原菌假单胞菌丁香蛋白5(RPS5)中的LRR预测的LRR域结构一个代
12、表性的RPS5 LRR域的结构预测。-折叠形成凹脸的“马蹄形”由箭头所示在12个核心蛋白聚糖中富含亮氨酸重复的比对结果和在RPS5中13重复以及氨基端的9个氨基酸,亮氨酸拉链(Leucine zipper,LZ)LZ 存在于一些寡聚蛋白中,许多DNA结合蛋白就含有LZLZ 中每7 个氨基酸残基构成一个重复,第7 位置上的残基为(异)亮氨酸。这些(异)亮氨酸在蛋白质二级结构中形成-螺旋的疏水脊,在疏水交互作用下,两个LZ 中的(异)亮氨酸残基形似拉链,将其所在的亚基聚合成多聚体LZ在真核生物转录因子的同源及异源二聚体形成中起着重要作用,相似的卷曲螺旋结构域(Coiled-coil domains
13、)促进了蛋白之间的相互作用,并导致许多其他功能的产生,亮氨酸拉链,丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶(SPT protein kinase)SPT 蛋白质激酶是植物的受体类蛋白激酶(Receptor-like kinase,RLX)的主要形式,其功能主要有以下几点:与一些信号分子如激酶、生长因子、性因子等相互作用的传导信号 参与防御反应。如B细胞中的抗体和T细胞中的受体通过识别外来分子启动下游激酶产生一系列级联反应,最终产生免疫作用;在细胞分裂过程中控制分裂时期对一些自然逆境如缺乏关键元素产生反应SPT蛋白激酶的2个特征保守区分别为DaKXXN 和 GTaGYXAPCNPE,白细胞介素-1受体相似的区域
14、(TIR)果蝇的Toll 蛋白及哺乳动物的白介素-1受体,在各自的免疫系统信号传导中起重要作用通过对病原物的结合,将信号传导给传导因子。如果蝇的Dif 因子和哺乳动物的NF-KB 因子。这些传导因子获得由细胞质向细胞核内运输的能力,并与各免疫反应基因的启动子相结合,引起免疫反应基因的表达,从而对病原物产生抗性。越来越多的证据表明,植物中可能也存在与哺乳动物和昆虫自然免疫系统相似的抗病途径。,抗病基因产物的类别,1.NBS-LRR类蛋白大多数R基因属NBS-LRR类,其共同特点是:在它们编码蛋白的近N端有核苷酸结合位点(NBS),而在近C端有富亮氨酸重复序列(LRR)这类蛋白一般存在于细胞质中。
15、NBS结构暗示它们在发挥功能时可能要结合ATP或GTP,而LRR结构则表明它们可能作为受体,结合病原物产生的某种配体,从而启动细胞信号传递过程和产生防卫反应对亚麻R基因的研究表明,LRR可能决定着R基因的专化性,它的改变将会引起R基因抗病谱的改变。LRR不仅有感应信号的作用,而且在下游信号传递中也起作用,NBS-LRR类蛋白(1)TIR-NBS-LRR亚类烟草的N,亚麻的L6、M,拟南芥的RPP5等基因产物N端有一个较大的TIR结构域,用于信号传递烟草N基因产物是一个胞质内定位的蛋白,其N末端结构与哺乳动物白细胞介素1受体(IL-1R)的胞质域以及果蝇Toll蛋白的胞质域具有高度相似性。IL-
16、1R的胞质域在病原物信号的作用下,可引起转录因子NF-kB活化以及从细胞质到细胞核的位移,进而激活防卫基因的转录和表达。烟草的N蛋白可能也有类似的机制。TIR结构也可能参与了对病原物的识别。对亚麻抗锈病基因L的13个等位基因的研究发现,TIR域的变异导致了病原物识别的变化。总之,TIR和LRR结构都可能在病原物识别中起作用。,(2)LZ-NBS-LRR亚类在N端连接有亮氨酸拉链(LZ),拟南芥的RPS2、RPM1,大麦的Mla1等基因的产物都具有LZ结构。LZ在正常情况下参与形成蛋白二聚体,可能与病原物配体的特异性结合有关。进一步的研究发现,本亚类的显著特征是NBS之间具有卷曲螺旋序列(coi
17、led-coil,CC),也可据此命名为CC-NB-LRR亚类。在拟南芥中,具有TIR的蛋白是通过含EDS1基因途径传递信号,而LZ类蛋白传递的信号则需要NDR1基因。如前所述,LRR结构域参与蛋白质蛋白质互作,促进基因产物与其他信号蛋白质的作用。LRR结构中单个氨基酸的改变,就可导致寄主植物HR反应能力的丧失。R蛋白中的NBS结构域具有高度保守性,这说明核苷酸结合对R基因发挥功能是必不可少的。,(3)NBS-LRR亚类辣椒Bs2、莴苣Dm3、番茄I2等基因的产物属于此亚类,仅有NBS和LRR结构域。(4)TIR-NBS-LRR-NLS-WRKY亚类仅有拟南芥抗青枯病的RPS1基因产物,在NB
18、S-LRR蛋白的C端有一个WRKY结构域。WRKY蛋白是植物特异性锌指转录因子(plant-specific zinc-finger transcription factors),常在防卫反应中被诱导,与多个病原菌诱导的启动子顺式作用元件结合。这就意味着基因编码产物可结合DNA,从而激活其他抗病相关基因。(5)水稻Pi-ta蛋白亚类该蛋白有NBS-LRD结构,LRD为富亮氨酸结构域(leucine-rich domain),不是典型的LRR。,2.eLRR-TM类R蛋白没有NBS位点,仅有胞外LRR结构域(eLRR)和跨膜结构(TM)。番茄对叶霉病菌不同生理小种有若干抗病基因,其中Cf-9、C
19、f-2、Cf-4和Cf-5等基因的产物有eLRR-TM-sCT结构,俱为锚定于细胞膜上的糖蛋白受体,具有N端信号肽。在细胞膜外存在着一个巨大的LRR构成的受体结构域,占据了蛋白质分子的大部分。这类蛋白具有跨膜区,但在胞质内的部分仅有单一胞质尾(single cytoplasmic tail,sCT),包含数十个氨基酸残基。进一步分析表明,各Cf基因产物的LRR结构比NBS-LRR类蛋白的LRR更为均匀一致,它们之间的高度同源,尤其是后面9个LRR几乎一样,这可能是由于所抵抗的对象是同一病原菌的不同小种。拥有LRR结构的蛋白不仅可以接受病原菌配体信号,而且还可能与其他蛋白结合。Cf-9蛋白拥有巨
20、大的LRR结构域,这可能使它除与Avr9多肽结合外,仍可与其他种类的蛋白相互作用,共同参与植物防卫反应信号传递。比较Cf-2、Cf-4、Cf-5和Cf-9等四种基因编码的蛋白,显示出C端保守性强,而N端差异较大的特点。这说明C端可能与共同信号传递有关,而N端则与特异性的识别有关。,3.S/TK类R蛋白番茄对丁香假单胞番茄致病变种的抗病基因Pto,编码产物为位于胞质内的丝氨酸苏氨酸激酶(S/TK),没有NBS和LRR结构域对Pto-avrPto基因互作的研究,发现病原细菌AvrPto蛋白进入植物细胞后,可与胞内的Pto激酶直接作用。但Pto和avrPto基因的识别还需要另一基因Prf的参与。Pr
21、f基因与Pto基因紧密连锁,编码含有LRR和NBS结构的蛋白。Pto和Prf蛋白分别类似于水稻Xa-21蛋白的胞外域和胞内域,因此推测Pto和Prf蛋白很可能构成了一个受体系统,在功能上相当于Xa-21的酪氨酸受体激酶Pto蛋白具有蛋白激酶的代谢活性,在接受avrPto信号后,Pto激酶活性被激活,自动磷酸化,使Pti1基因和类似基因编码的蛋白磷酸化,进而引发了信号传递下游蛋白的一系列磷酸化级联反应,4.eLRR-TM-S/TK类蛋白水稻抗白叶枯病基因Xa-21编码的蛋白是由1025个氨基酸组成的受体蛋白激酶。Xa-21蛋白包含胞外富亮氨酸重复(eLRR)结构域和胞内丝氨酸苏氨酸激酶(S/TK
22、)结构域两部分,通过一个跨膜区域连在一起。LRR结构是由23个不完全的重复单位组成,参与蛋白质蛋白质的相互作用,与病原菌的识别有关。S/TK结构域含15个保守氨基酸,是典型的信号分子。从整体上看,Xa-21蛋白是一个具有激酶活性的跨膜受体。,5.病原菌毒素降解酶玉米抗圆斑病基因Hm1的产物是依赖于NADPH的HC毒素还原酶,属于病原菌毒素降解酶(detoxifying enzyme),该基因抵抗玉米圆斑病菌1号生理小种的侵染病原菌的HC-毒素缺陷菌株对不含Hm1的玉米无致病性Hm1与HC-毒素基因间的互作没有“基因对基因”关系,6.G蛋白偶联受体大麦的mlo基因是控制大麦对白粉病广谱抗病性的隐
23、性基因,位于大麦4号染色体的长臂上。具Mlo基因的感病大麦品种诱导突变后,突变株缺失Mlo或变成隐性mlo基因,也获得广谱抗病性。该基因与病原菌匹配基因的互作也不符合基因对基因关系。Mlo基因家族大约有35个成员。在水稻、拟南芥、棉花、西瓜等多种植物中都存在Mlo的同源基因或同源序列。mlo基因编码60ku的蛋白,有7个跨膜螺旋(TM),其N端位于胞外,有糖基化位点,C端位于胞内,具有一个推测的核定位位点(nuclear locatization site,NLS)和两个位于核定位信号下游的酪氨酸激酶II位点,NLS和激酶之间通常相隔1030个氨基酸。含有核定位信号表明Mlo可能会被转运至细胞
24、核。对拟南芥中发现的25个Mlo家族成员的比较表明,它们有着相同的基因结构和蛋白质空间构象。进一步研究表明,Mlo基因编码的蛋白,类似于哺乳动物的G蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptors,GPCRs)。这类受体通过与配体结合,传递胞外信号并激活异源G蛋白亚基而转化为放大的胞内信号。,7.其他类型拟南芥对白粉病的广谱抗病基因RPW8,编码较小的具CC结构域的蛋白质,其N端有一个推测的信号锚定(signal anchor,SA)结构域,可能是一种膜蛋白。大麦对秆锈病的抗病基因可能编码受体蛋白,接受病原菌信号,但不连接于细胞膜,其C端有两个蛋白激酶结构。Hs1pro-1
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