生物制药 第四章课件.ppt
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1、2010年6月生物制药,温州医学院生命科学学院王慧利,内容,第一章绪论第二章 生物药物概论 第三章 生物制药工艺学第四章 基因工程制药第五章抗体工程制药第六章 动物细胞制药 第七章 植物细胞制药第八章 酶工程制药 第九章 海洋生物制药 第十章 利用现代生物技术改造传统制药工业,第四章 基因工程制药,第一节 基因工程概念,历史和基本原理第二节 基因工程用到的酶,载体第三节 基因工程技术环节和常用技术 1目的基因获得 2目的基因与载体连接 3 外源DNA导入细胞 4 重组子的鉴定和筛选 5 常用技术 第四节 基因工程在制药中的应用 1 重组药物 2 转基因动(植)物,(一)基因工程(gene en
2、gineering)的概念 又称为遗传工程、重组DNA技术,是按着人们的科研或生产需要,在分子水平上,用人工方法提取或合成不同生物的遗传物质(DNA片段),在体外切割,拼接形成重组DNA,然后将重组DNA与载体重新组合,再将其引入到没有该DNA的受体细胞中,进行复制和表达,生产出符合人类需要的产品或创造出生物的新性状,并使之稳定地遗传给下一代。按目的基因的克隆和表达系统,分为原核生物基因工程,酵母基因工程,植物基因工程和动物基因工程。基因工程具有广泛的应用价值,为工农业生产和医药卫生事业开辟了新的应用途径,也为遗传病的诊断和治疗提供了有效方法。基因工程还可应用于基因的结构,功能与作用机制的研究
3、,有助于生命起源和生物进化等重大问题的探讨。,第一节 基因工程概念发展历史和基本原理,基因工程有两个重要的特征 第一是可把来自任何生物的基因转移到与其毫无关系的任何其他受体细胞中,因此可以实现按照人们的愿望,改造生物的遗传特性,创造出生物的新性状;第二是某一段DNA可在受体细胞内进行复制,为准备大量纯化的DNA片段提供了可能,拓宽了分子生物学的研究领域。,基因工程诞生的意义:基因工程的诞生打破了物种的界限,实现了物种间的基因交流;在实验室里对生物直接进行改造,为生命科学的研究开辟了 新的领域、注入了新的方法;为提高人类的生活质量和健康水平开辟了新的途径,在农业、工业、医药等领域有巨大的应用前景
4、.,1 基因工程诞生的理论基础(理论上的三大发现)(1)40年代确定了遗传信息的携带者,即基因的分子载体是DNA而不是蛋白质,从而明确了遗传的物质基础问题;(2)50年代揭示了DNA分子的双螺旋结构模型和半保留复制机制,解决了基因的自我复制和传递的问题;(3)50年代末期和60年初,相继提出了中心法则和操纵子学说,并成功的破译了遗传密码,从而阐明了遗传信息的流向和表达问题。,(二)基因工程发展历史,1)限制性内切酶和DNA连接酶的发现 1970年当时在Wisconsin大学的H.G.Khorana实验室的一个小组,发现T4DNA连接酶具有更高的连接活性,有时甚至能催化完全分离的两段DNA分子进
5、行末端的连接。1972年在旧金山H.W.Boyer实验室首先发现的EcoRI核酸内切限制酶具有特别重要的意义。Hind的发现打破了基因工程的禁锢,1967年在世界上有5个实验室几乎同时发现了DNA连接酶。2)载体的发现 因为多数重组DNA片段不具备自我复制的能力,需要一个运送重组DNA分子到细胞中去的车子载体(vector),载体是特定的能自我复制的DNA分子。3)逆转录酶的发现1970年,Baltimore和Temin等同时各自发现了逆转录酶,打破了中心法则,使真核基因的制备成为可能。,2 技术上的三大发明,DNA分子切割与连接技术的建立构成现代基因工程的技术核心!,(1)在70年代,将外源
6、DNA分子导入大肠杆菌的转化现象获得成功,1972年斯坦福大学的S.Cohen等人报道,经氯化钙处理的大肠杆菌细胞同样也能够摄取质粒的DNA,从此,大肠杆菌便成了分子克隆的良好的转化受体。不到四年,世界上第一家基因工程公司“Genetech”注册登记,意味着基因工程的实际应用已跨入商业运作的门槛。(2)1972年美国斯坦福大学的Berg获得了SV40和DNA重组的DNA分子,率先完成了世界上第一次成功的DNA体外重组实验,并因此与W.Gilbert,F.Sanger分享了1980年度的诺贝尔化学奖(3)1973年美国斯坦福大学的Cohen 等人,将大肠杆菌R6-5质粒DNA(含卡那霉素抗性基因
7、)和大肠杆菌pSC101质粒DNA(含四环素素抗性基因)重组后转化大肠杆菌,产生同时表现出两种抗性的细菌。(4)Cohen与Boyer等合作,将非洲爪蟾编码核糖体的基因同pSC101质粒构成重组DNA分子,并导入大肠杆菌,证实动物基因进入了细菌细胞,并在细菌细胞中增殖和转录产生相应的mRNA。(5)Berg P、Cohen和Boyer等人的工作在世界上最早实现了DNA体外重组,建立了第一个基因克隆系统(质粒大肠杆菌),导致了一个全新的生物技术学科和产业基因工程的诞生。,3 基因工程技术的建立,4 DNA测序技术的建立进一步促进了基因工程的发展,在分子生物学研究中,DNA的序列分析是进一步研究和
8、改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger(1977)发明的双脱氧核糖核酸链末端终止法,目前Sanger测序法得到了广泛的应用。Sanger法是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,并且在每个碱基后面进行荧光标记,产生以A、T、C、G结束的四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得可见的DNA碱基序列。Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)使之扩增,并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)使之终止。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G
9、、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几个至千以上个,相差一个碱基一系列片断。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。,(三)基因工程基本原理和流程,按设计的蓝图,从供体中提取或人工合成目的基因,利用限制性内切核酸酶和连接酶的性质,对基因片段和载体质粒进行切割和连接,建成重组DNA,再转移到受体细胞,目的基因在细胞中表达获得新的遗传性状,第二节基因工程中常用的工具酶和载体,一、限制性内切酶 基因工程中常用
10、作用于核酸的酶,包括水解酶、修饰酶、聚合酶等 水解酶分为内切酶和外切酶 内切酶在核酸链内部切割,生成寡核苷酸;外切酶从核酸链的末端开始,渐进式地水解核酸链,逐渐释放单核苷酸。,(一)基因工程中常用的工具酶,限制性内切核酸酶(restriction enzymes),能识别双链DNA分子中一段特异的核苷酸序列,在这一段序列内将双链DNA分子切断。功能:与甲基化酶一起降解外来DNA分子,以限制(restriction)或阻止病毒侵染,是细菌细胞为防御异源遗传物质进入的一种有效方式。,限制性内切酶分类,第类限制性酶:每隔一段DNA序列随机切割双链DNA分子,没有序列特异性第类限制性酶:能识别一段特异
11、的DNA序列,准确地酶切双链DNA的特异序列A:形成粘性末端产物:识别的序列是对称的,即在一条链中从5到3方向的序列,与其互补链从5到3方向的序列完全相同。这种从两个方向阅读而序列相同的序列称为回纹对称序列(palindrome)(EcoR)B:形成平端产物:另一类酶,如Sma,它们酶切DNA双链后,产生的DNA片段具有平齐末端(blunt ends),限制性酶EcoRI识别位点(粘性末端),EcoRI酶切不同来源的DNA及退火重组,平齐末端(Sma),限制性内切酶的命名,属名种名菌株类型发现的顺序,DNA聚合酶的特性,该酶的用途是将带匹配黏端的双链DNA或平端双链DNA片段的5-P 与另一也
12、带相应缺口的DNA片段的3-OH 连接起来,三、DNA连接酶,3,5,5,3,OH,P,P,OH,3,5,5,3,O,P,P,O,DNA连接酶,不匹配黏端的连接 先补平或修平后再连接,3,5,5,3,补平,修平,Klenow,(S1或Klenow),(二)基因工程载体,载体是指将外源DNA片段运送进宿主细胞进行扩增或表达的运载工具 克隆载体克隆了外源DNA后,转入宿主细胞中进行繁殖,使克隆的DNA片段数量大大增加 表达载体将外源基因或DNA片段在宿主细胞中表达蛋白质 插入型载体将外源基因或DNA插入其中 置换型载体切除载体部分DNA,代之以外源基因或DNA。,载体必须具备的条件,1、能自我复制
13、:能在宿主细胞中大量复制,得到大量的重组DNA分子 2、多克隆位点:载体上的内切酶位点对于一种酶来说只能有一个(置换型载体上被置换片段的两侧各有一个内切酶位点)3、克隆载体要有复制起点,表达载体要有启动子 4、载体上要有报告基因或选择标记基因,以便进行重 组体筛选和鉴定 5、在细胞内稳定性高且多拷贝。保证重组体稳定,高效传代而不丢失,一、质粒载体 质粒是一种存在于细菌细胞质中,独立于细菌染色体而自然存在的,在细菌体内能进行自我复制、易分离和导入的DNA环状双链分子 质粒大小相差很大(从小于1Kb到大于500Kb),都有一个复制起点。亲缘关系密切的两种质粒不能在同一宿主细胞中稳定地共存,称为质粒
14、的不亲和性。只能在特定宿主细胞中复制的称为窄宿主范围质粒;可以在多种宿主细胞中复制的称为广宿主范围质粒。,严谨型质粒每个细胞中有1-2个拷贝,具有自身传递能力,分子量大。松弛型质粒每个细胞中有10-100个拷贝,不具有自身传递能力,分子量小。基因工程常用此类质粒。常用的质粒有:pBR322、Psc101、ColE1、Psc134等。质粒载体一般能克隆10Kb左右的DNA片段。,克隆载体,表达载体,基因工程制药的关键技术,获得目的基因,构建重组质粒,产物分离纯化,构建基因工程菌或细胞,培养工程菌,半成品和成品鉴定及包装,除菌过滤,基因工程制药流程:,上游技术,下游技术,上游DNA重组设计,下游的
15、操作工艺和设备,原则,简化,一、基因工程菌的上游构建包括外源基因重组、克隆、表达的设计与构建,(一)PCR的原理和应用,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR),1原理,特点:在体外模拟细胞内进行的DNA复制过程,(Mullis,1984),第三节基因工程技术环节和常用技术,(一)PCR的原理和应用,(1)变性(denaturation):模板DNA经热变性,双链被解开,成为两条单链。,(2)退火(annealing):温度下降,变性DNA复姓,使寡核苷酸引物即与模板DNA中所要扩增序列两端的碱基配对。,1原理,(3)延伸(extension):在适宜条件下
16、(包括DNA聚合酶和核苷酸单体),引物3 端向前延伸,合成与模板碱基序列完全互补的DNA链。,(4)重复变性、退火和延伸三步操作:DNA片段呈2的指数增长,在12小时内重复2530次循环,扩增的DNA片段拷贝数可增加至106107倍。,2.PCR技术的关键酶-DNA聚合酶,(1)Klenow聚合酶(大肠杆菌DNA聚合酶片段),(2)Taq DNA聚合酶(水生栖热菌(Thermus aquaticus)中分离,1988年萨奇(R.K.SaiKi),(3)pfu DNA聚合酶(火球菌(Pyrococcus Furiosus)中分离),(4)Vent DNA聚合酶(Thermococcus lito
17、ralis),(二)目的基因的获取,利用PCR克隆目的基因1、常规的PCR2、反向PCR(inverse PCR,I-PCR)克隆基因组DNA片段,I-PCR是根据已知序列扩增其旁侧序列的方法。所用的引物与正常的PCR引物方向相反 3、反转录PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)合成cDNA RT-PCR是以mRNA为模板,在逆转录酶作用下合成cDNA,再复制成双链DNA,基因的人工合成 如果已知某基因的核苷酸序列,或者通过基因产物的氨基酸序列推导出基因的核苷酸序列,就可将单核苷酸或寡核苷酸一个一个缩合起来,成为一个基因的核苷酸序列。连接的两个分子各有一端被
18、封闭。先合成分别属于双链序列的8-12碱基的片段,两个片段的对应部分配对后留有粘性末端,第三个片段再连接上去,不断延伸直至全部合成,(二)载体与基因的连接 常用的连接方式有:粘性末端连接法、平头末端连接法、人工接头连接法、同聚物加尾连接法。(一)粘性末端连接法 相同限制酶切位点连接法同一的限制酶切割不同DNA会产生相同的粘性末端,在连接酶的作用下,不同DNA相同的粘性末端形成磷酸二酯键而连接起来,平头末端连接法、人工接头连接法、同聚物加尾连接法。,RT-PCR,反向-PCR,化学转化法 利用氯化钙诱导细胞(原核)进入感受态,外源DNA直接与感受态细胞混合,处于感受态的细胞可以吸收外来的DNA。
19、电转移法 受体细胞与外源DNA按一定比例混合后,放入电脉冲槽中,经用脉冲电压刺激,外源DNA即可进入细胞,(三)外源DNA转入细胞(基因转移),不需载体的基因转移,脂质体介导法 脂质体是磷脂在水中形成的一种由脂类双分子层围成的囊状结构 形成囊状结构可将DNA包在其中 带有外源DNA的脂质体通过细胞的内吞作用进入受体细胞,达到基因转移的目的 血影细胞介导法 血影细胞:哺乳动物细胞溶血,使血红蛋白大量逸出,最后成为仅有被细胞膜包被的细胞核结构 血红蛋白大量逸出时,外源DNA也容易进入。让血影细胞与受体细胞在适当条件下发生细胞融合,从而使外源DNA导入受体细胞 磷酸钙沉淀法 细胞具有摄取磷酸钙沉淀的
20、双链DNA的能力 将待转移的DNA加入氯化钙和磷酸盐,生成DNA-磷酸钙沉淀,加入培养液中 由于细胞的吞噬作用,DNA-磷酸钙沉淀物进入细胞,DNA释出后先进入细胞质、再进入细胞核,整合到受体细胞的染色体上,Polyethylenimine-based non-viral gene delivery systems,化学试剂介导基因进入细胞,非病毒载体,聚次乙亚胺,脂质体包埋法,非病毒载体,主要是以重组的动物病毒和逆转录病毒直接感染受体细胞,把外源DNA引入 转导作用:通过噬菌体和病毒的感染作用将一个细胞的遗传信息传递到另一个细胞的过程。逆转录病毒的特点:病毒基因组为单链RNA,感染期间为双链
21、DNA DNA能整合进细胞并复制 DNA在动物通过生殖细胞传递到下一代;带有对复制有重要意义的基因:gag(结构蛋白)、pol(DNA聚合酶)、env(被膜糖蛋白),借助于载体的基因转移,腺相关病毒,3 其中最被看好的是腺相关病毒 病毒基因组很小,如2型腺相关病毒是由4681个核苷酸组成的单链DNA,AAV可感染分裂期及静止期细胞,当辅助病毒不存在时,AAV能整合到宿主细胞基因组的特定区域,无致病性,免疫原性弱,因此,它无毒高效,是目前理想的基因治疗载体。,(四)重组体的鉴定与筛选一、根据重组子遗传重组表性改变检测法 1、抗性筛选法 利用载体上的抗性基因对阳性克隆作初步的筛选。如pUC19质粒
22、中有Ampr 基因,为宿主细胞提供氨苄青霉素抗性。将转化后的细胞涂布在含氨苄青霉素的培养基中培养 大部分受体细胞没有外源DNA导入,其本身又没有Ampr 基因,所以在培养基中不能生长。在含有外源DNA的受体细胞中,只有含有质粒自连或者质粒与目的DNA形成重组子的受体细胞由于含Ampr 基因,能在培养基中生长。,2、根据报告基因筛选克隆子对于那些不宜采用克隆载体选择标记筛选克隆子的宿主细胞,往往在目的基因连入载体之前,先在目的基因的上下游连接一个报告基因,这样导入宿主细胞后可根据报告基因的表达产物筛选克隆子。,3、插入失活选择法 当外源DNA插入到载体的某一基因中间时,该基因就不能表达,这种现象
23、称为插入失活。例如,pBR322有四环素抗性基因(Tetr)和氨苄青霉素抗性基因(Ampr),在Tetr基因内有BamH和Sal两种限制酶位点,如果在这两个位点中有外源DNA插入,都会导致Tetr基因失活。将转化后的细胞分别培养在含氨苄青霉素和四环素的培养基中,便可检出转化子细胞。例如,a-互补使菌产生颜色来筛选,(五)转化子-核酸分子鉴定法1)琼脂糖凝胶电泳法:根据重组DNA分子的大小,其迁移率的差别进行鉴定,2)限制性内切酶分析法:根据片段的大小和酶谱特征与预计的重组DNA酶谱特征比较。,3)印迹杂交法 Southern blot(Southern印迹试验)原理利用硝酸纤维薄膜(或滤纸、尼
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