超分子化学基础ppt课件.ppt
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1、超分子化学与分子识别,三位超分子化学研究方面的科学家获得1987年的Nobel化学奖,美国的C.J.Pederson、D.J.Cram教授法国的J.M.Lehn教授。,超分子化学的定义和范畴,Lehn在获奖演说中对超分子化学的定义:“Supramolecular Chemistry is the chemistry of the intermolecular bond,covering the structures and functions of the entities formed by associasion of two or more chemical species”。,超分子化
2、学是研究两种以上的化学物种通过分子间力相互作用缔结成为具有特定结构和功能的超分子体系的科学。简言之:超分子化学是研究多个分子通过非共价键作用而形成的功能体系的科学。,超分子化学是分析化学、有机化学、无机化学、物理化学和高分子化学等各个化学分支的重新结合得以实现的载体(vehicle).超分子化学已成为当前公认的化学理论与应用技术的前沿课题。,化学是在原子和分子水平上研究物质及其相互转化的科学。以共价键为基础的原子重组是分子化学的一大特征,这些工作可以形象地描述为:,在客观世界中人们面对的是分子所构成的聚集态,而且物质的性能也是通过这样的分子集合来表现的。从某种意义上讲,分子结构只是间接影响物质
3、的性能,而聚集态才是直接影响其性能的因素。,分子能够聚集在一起形成有用的材料,是由于分子间存在相互作用。人们在长期科学研究中也发现,分子间相互作用力对物质性能影响很大,如它们对物质熔点、沸点、溶解性和表面吸附等的影响。但就那一时期科学和技术的发展水平而言,还仅仅停留在证实其存在,以及它们对物质性质影响这一程度上。,进入20世纪70年代,由于大环化学、胶体化学、单分子膜和液晶等方面的研究,人们重新对分子间相互作用产生了兴趣。当然关心的不再是分子间相互作用的存在以及它们对材料性能的影响,而是利用存在于不同分子中的“信息”,即分子间相互作用,实现分子间的识别和自组装,形成具有一定功能的超分子。这些工
4、作可表示为:,超分子(supermolecule)这一术语是1937年Wolf提出来的,它是用来描述由配合物种所形成的高度组织的实体。一个超分子由分子受体和底物组成,底物一般是小分子化合物,与目的物相键合是超分子化学研究的最终目标。,从普遍的意义上讲,任何分子的集合都存在相互作用,所以人们常常将物质聚集态这一结构层次称为“超分子”,但这与超分子化学中的超分子存在区别。,在20世纪中,人们把大千世界内各种物质的运动都还原为原子、分子的运动和性质这一层面上。但是,在人们企图将现代科技再推进一步时,遇到了极大的障碍,这是因为人们的认识上存在盲区,或者说人类知识的大厦存在一个裂缝。在裂缝的一边是以原子
5、和分子为主体的微观世界,而另一边是人类活动的宏观世界。两个世界不是一般人们所想象的那样直接而简单的联系,而是存在一个过渡区,这个领域就是超分子科学。,超分子化学是分子间键合的化学,它包括两个或两个以上化学物种缔合所形成的实体的结构和功能。基于分子互补原理,受体和底物的键合在超分子中形了分子识别、催化、反应、转换和传递等功能。多分子组织、受体、载体和催化相结合,可导致分子和超分子器件。,从上面的关系式可以看出,如果仅有相互作用并不能形成结构确定的超分子,一方面是其作用力弱,其次是无选择性。由弱相互作用加和形成强相互作用,由各向同性通过定向组合(选择性)形成各向异性,这是分子化学和超分子化学的分界
6、线。,参考书目,1.纳米超分子化学:从合成受体到功能组装体 刘育等编著,化学工业出版社,北京,20042.超分子层状结构:组装与功能 沈家骢等著,科学出版社,北京,20043.超分子化学研究中的物理方法 童林荟,申宝剑著,科学出版社,北京,20044.生物超分子体系 李惟等编著,化学工业出版社现代生物技术与医药科技出版中心,北京,2003,参考书目,5.超分子化学:概念与展望(法)Jean-Marie Lehn著,北京大学化学科学译丛,北京大学出版社,北京,20026.超分子化学:合成受体的分子识别与组装 刘育,尤长城,张衡益编著,南开大学出版社,天津,20017.超分子液晶 晏华编著,科学出
7、版社,北京,20008.超分子化学导论 孙小强,孟启,阎海波编,中国石化出版社,北京,1997,参考书目,9.Interfacial supramolecular assemblies Johannes G.Vos,Robert J.Forster,Tia E.Keyes,John Wiley New York:Springer,c2003.,参考书目,12.Supramolecular chemistry Jonathan W.Steed,Jerry L.Atwood,Chichester;New York:Wiley,c2000,13.Self-assembly in supramolec
8、ular systems Leonard F.Lindoy,Ian M.Atkinson,London:Royal Society of Chemistry,200014.Transition metals in supramolecular chemistry edited by Jean-Pierre Sauvage,Chichester;New York:Wiley,1999,分子识别可定义为这样一个过程,对于一个给定的受体或者一个特殊功能,底物选择性地与之键合。仅有键合并不是识别,因为识别和目的键合连在一起。,底物()和受体()键合形成超分子,它具有热力学和动力学的稳定性和选择性,这里
9、涉及到能量和信息。所以分子识别在本质上是一个在超分子水平上信息存贮和读出的问题。信息可能存贮在配合物的结构中或在其键合位置(包括性质、数目和排列),在包围键合底物的配合体中,以超分子的形成和缔合的速率来读出信息。对于给定的底物,分子识别相当于受体的最佳信息内容。这是一个延伸了的lock(锁)和key(钥匙)原理,即能量特征和几何特征的互补。由单一平衡步骤提供的识别可以通过多步识别和与一个不可逆过程耦合来实现。,为了获得高度的识别,要求和具有更大的接触面积。当能包含其客体,以建立许多非共价键相互作用,并对其分子尺寸、形状和结构等因素都十分敏感时,就产生了高度识别。如果受体分子所含分子内空穴对底物
10、适宜,就产生了配合,称为空穴配体(cryptate)。,球形识别:最简单的识别过程就是球型底物的识别,这些底物可以是带正电荷的金属阳离子(碱、碱土、稀土金属离子),也可以是带负电荷的卤素阴离子。,球型识别就是从具有相同电荷但半径大小不同的球的集合中选择一给定的球型离子。大双环空穴配体13(如图所示)能与空穴尺寸相匹配的离子形成稳定的空穴配合物,配体1,2,3分别与Li+,Na+,K+形成配合物,如4a所示。其他配体对碱金属离也显示高度的选择性,其识别特征等于或高于天然大环配体,其结构由晶体结构测定所证实,见4b,并表征了其稳定常数。球形大四环5对Cs+等大尺寸的球形阳离子表现出强的键合性和选择
11、性,见6。,四面体识别:选择性键合一个四面体底物要求构建一个具有四面体识别位置的受体分子,如大四环5,它在四面体和八面体的角上分别含有四个N和六个O的键合位置。由于在结构和能量上的高度互补,5与四面体NH4+离子形成具有稳定性和选择性的配位体9。NH4+的尺寸和形状与5的空穴相匹配,通过四个N形成+N-HN的氢键而成为四面体排列。由于键合能力强,NH4+配合物的pKa比游离的NH4+的pKa 高6个数量级,这意味着强的键合影响底物的性质。在酶活化位和生物底物-受体的键合中也存在相似的效应。,大双环3同样可以键合NH4+,形成配合物11。但从反映在受体-底物键合互补上看,11和9的动力学特征不同
12、:在9中NH4+被固定在空穴中,而在11中NH4+可以在内部旋转。,胺离子的识别 由于胺离子及其衍生物在化学和生物中所担负的重要角色,发展能识别这样底物的受体分子具有特殊意义。许多大环聚醚能与R-NH3+在结构和手性选择相键合。其中四羧酸12b显示出更强的键合能力,这是由于12b含有要求的基本18-O6环,增加了静电相互作用。所以形成任何大环聚醚的金属离子或铵的复合物后,其稳定性最高。,通过改变侧基X,可利用X和中心键合R-NH3+底物中R基团的特殊相互作用(静电、氢键、电荷转移、憎水效应)来调节配合物12的特征,导致侧面的识别效应。它也代表一种改变生物体受体-底物的相互作用的方法。如通过发生
13、在烟酰胺和色氨酸之间的缔合,可以将其连在12的氨基酸残基、核酸或核苷、糖类上。,通过NHO的相互作用,可将金属-氨配合物M(NH3)3M+结合到大环聚醚,由二级球型缔合导致“超复合类型”的超分子物种。可以将R-NH3+底物键合到氧杂-氮杂或聚氮杂大环上,如13。具有负电荷的大环(如12b或14)强的配合作用可诱导中心键合金属-胺和在12侧基团X上的不同过程(能量和电子转移、化学反应等)。,阴离子底物的识别,虽然阴离子在化学和生物中起着重要作用,但阴离子配位化学与金属离子和阳离子分子配合物相比,没有得到充分的重视。阴离子配位化学有希望产生一些在化学和生物上具有新颖结构和性质的化合物。已设计的阴离
14、子受体分子和针对阴离子功能基团的键合亚单元,使阴离子配位化学得到长足的发展。,正电荷或中性少电子基团可以作为阴离子的相互作用键合位。铵和胍单元形成+N-HX键,而中性极化氢键(如一NHCO或一COOH),少电子中心(硼、锡等)以及在配合物中的金属离子中心也能与阴离子发生相互作用。作为阴离子受体分子的聚铵大环和大多环已研究得相当深入。由于静电和结构上的有效性,它们与许多阴离子(无机阳离子、羧酸盐、磷酸盐等)结合,并且有稳定性和选择性。用诸如5的质子化形式(见8)和双-三氨乙基胺(15)等化合物作为受体,大双环和球型大四环聚铵能与球型卤素阴离子形成强而稳定的配合物。,六质子化型态的双-三氨乙基胺(
15、15-6H+)能与不同单原子和多原子离子配合。球型卤素离子与椭圆形受体空穴不相匹配,使结构扭曲,F通过+NHF 键键合,以四面体排列,C1 和Br 具有八面体配位排列。线性三原子阴离子N3 与15-6H+空穴互补,通过三个氢键键合在空穴中,形成空穴配合物16。15-6H+是一种分子受体,能识别线性三原子底物,这种键合比单电荷离子的强。,不同阴离子与其他类型大环配体的配位也见报道,特别是环苯型化合物。大多环的质子化形式描述了这两类确定键合几何形态的受体,见17,18。,共受体和多体识别,一旦对特殊基团的键合单元确定,就可考虑在相同大多环结构中与多个底物相结合。这就形成了具有几个独立的键合亚单元的
16、多体共受体,它们可以发生协同效应,几个底物或多键合官能团能自发形成配合物。适当的改性可产生共催化剂和共载体,在键合底物上实施反应和转变。由于它们能实现多体识别和键合位的相互影响,这样的共受体为更高的分子行为提供了条件,这些行为包括协同作用、改变构象、调整,如果它们释放和接受信号,还能实现通信或信号传递。,含有两个或两个以上键合金属离子的亚单元,可形成双核和多核空穴配体,其中金属离子的排列是由大多环结构决定,这样的配合物呈现功能多样性,如阳离子间相互作用,电化学和光化学过程,以及桥联底物的固定。这些过程在生物无机模型化,多中心-多电子反应和催化上都具有重要意义。轴向大双环配体给出双核空穴配体,如
17、Cu2()的配合物,见19。19是由经过一步多体缩合反应而得到的六胺结构,其晶体结构如20。,簇型空穴配体(cluster cryptate)由金属离子和桥联化合物在多体受体的分子空穴中组装而成,在Cu3()的配合物22中(晶体结构如23,一个双-3-羟三铜()官能团被键合在三体大环的空穴中。生物铁磺簇位置的模型化合物可用来嵌入适当的大环空穴。,位于结构的两端具有两个键合亚单元,这样的受体分子将与在两端具有适当官能团的受体相配合,这种距离互补类似于底物的分子长度被受体识别,称为线性识别。这样的双阴离子和阳离子底物的键合线性识别模型见24,25。,NH3+圆柱大三环和大四环结构中的大环亚单元,组
18、成的双体共受体,它能与端双氨基阳离子+H3N一(CH2)n-NH3+形成分子空穴配合物26。在这个超分子中,底物位于分子空穴中心,并由两个NH3+在大环键合位上锚定,晶体结构如27。改变桥长,就可修饰键合选择性,以适应不同互补长度的底物。双阴离子底物,如烷基双羧酸盐O2C(CH2)nCO2与双体大环28相结合。这些受体含有两个三氨基团作为键合亚位,与端羧基官能团发生相互作用形成29。重要的生物物种,如像聚胺、氨基酸、肽双胺和二元羧酸盐,也可以被选择性地键合。,不同类型的键合亚单元结合就产生了杂共受体,利用静电、范德华力和溶剂化效应,通过阳离子和阴离子中性位置的相互作用,可自发地与底物键合。天然
19、环糊精是第一个能键合有机分子的受体分子,它对有机分子的键合特性使分子配合物的物理和化学性质产生了许多有价值的结果。在近几年中含有不同有机基团和极性官能团的合成大环受体得到发展,它们能与带电或不带电的有机底物配合,虽然许多结果仅仅是描述键合而不是识别,但它们提供了大量的数据,使分析分子配合的基本特征和结构的性质成为可能,这些可用于受体设计。,静电和憎水效应的协同作用可发生在双亲性受体中,它们具有电极化位点和有机基团,它能屏蔽溶剂的影响,增加静电力。这种含有由非极性化合物所维持的极性键合亚单元的大多环结构叫洞穴配体,通过键合底物产生洞穴配合物(spleands)。大环30有四个羧基和两个联苯基,它
20、能与1级胺离子形成稳定的配合物,还能与二级、三级和四级胺底物发生强烈的键合。更独特的是它能与乙酰胆碱配合,给出有关相互作用类型的信息,这些相互作用在生物乙酰胆碱受体中担负重要角色,例如憎水层与负电荷的结合。,CH3一NH3+阳离子与大多环的18-N3O3键合,形成选择性的洞穴配合物31。其中大多环是由环三藜芦烯形状分子所维持,紧密的分子内空穴对包含大尺寸的底物特别有效。,金属受体是杂多体共受体,它能通过特殊底物单元与金属离子和有机分子键合。,分子化学主要研究单个分子,而超分子化学分为两个领域:超分子是由各组分(,)的分子间基于分子识别的确定算法缔合导致的确定的分子物种,分子组织是多分子体系,由
21、不确定数量的组分自发缔合入一个相中形成的,根据其特性(层、膜、囊、液晶),这些相有确定的微观有序和宏观特征。在合成分子自组装的设计中取得了许多进展,它们依赖于对分子组分的特征(结构、分子间键合位),导致多分子自组织体的超分子性质及其相互关系的认识。,超分子化学或多或少地依赖严密组织的分子受体,从而影响分子识别、催化、传递。所谓自组装就是在一定条件下,受体和底物通过自组织自发地产生-个结构确定、具有一定功能的超分子的过程。与分子层、薄膜和生物膜的自发形成相比,自组装最大的特征是程序化。自组织要求键合,而自组装还意味着信息。对于这一过程的发生必不可少的信息和过程所遵守的算法必须贮存在化合物和操作过
22、程中,并通过选择性的分子相互作用表现出来。自组装是超分子化学的一个基本特征,因为它依赖于分子间相互作用,而在预组织中是通过共价键来实现的。自组装类似于在超分子水平上的复制过程。,组织化的超分子结构的构造特征和功能特征是由存贮在组分中的信息和它们具有的活性基团决定的。产生分子有序一个最简单和最普遍的方法是基于从互补分子组分的识别导向的自发组织,每个组分都具有不同的识别位置。两种这样的单元在溶液、液晶相、固态共结晶中相互作用,就可产生组织化高分子链。在固态共结晶中,基于识别的晶体分子工程允许设计有机固体的结构。相同类型的所有残基都能固定在链的同侧,在超分子排列中提供分子组分的自发分类和取向。,分子
23、器件可定义为结构有序,功能集成,具有超分子结构的化学系统,它们是基于以适当模式排列的组分集合。器件所表现的功能性源于各组分基本动作的集成。根据操作条件(光、电、离子),这些组分可以具有光活性、电活性和离子活性。分子识别过程在分子器件中担任重要的角色,如由组分构建器件,协同作用形成超分子排列,对给定物种实施选择性操作,对外界物理、化学刺激以响应(光、电、离子、分子),从而调节器件的操作,实现开关,信号产生和转换(质子质子、光电、电电、电子离子、离子离子)。依赖识别的器件可定义为具有信息的分子器件,这些分子和超分子实体可将分子识别转换成信息和信号。它要求将能对外界刺激作出响应的受体组分引入器件中。
24、,与孤立的组分相比较,拥有光活性组分的超分子实体显示了新的性质,称为超分子光化学。通过由组织化受体决定的键合位排列的调整,在这些光化学分子器件中可发生不同的过程,如光诱导能量传递,由电子或光子转换的电荷分裂,光转变和光极化的扰动,在基态和激发态氧化还原势的改性,键合性质的光调节,选择性光化学反应等。这些过程依赖于识别,并且只有在互补组分正确地选择性键合时才能发生,见图1-5。从原理上讲,分子器件要求各组分在空间、能量和时间上相互组织化和相互适应,以产生光、电、质子或离子的光信号。,在任何发光材料中,吸收光可转换成另一波长的发射光。采用对给定目的实现优化的不同组分,可分步实施全过程。由一个发射器
25、和吸收器的组合所形成的光接受器(天线)就构成了光转换分子器件,它能优化分解吸收和发射。为了实现这一功能,需要组分间进行能量传递。这样的器件按三步模式操作:吸收-能量传递-发射(A-ET-E),见图1-6。,在铕()和铽()大双环配体的空穴配合物中,这种配体能与不同杂双芳基基团(2,2-双吡啶、菲咯啉、联噻唑、联咪唑、联异喹啉、联嘧啶和它们的N,N-双氧化物)协同作用,基团作为光接受天线组分。由于发射物种和它们空穴配合物的特性,这些配合物呈现独特的性质,如保护嵌入的离子不受溶剂分子的影响,非常高的热力学稳定性和动力学惰性,适应能量转换的多体吸收基团,特征的长波长(对Eu()和长的发射寿命。有机基
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