MPICH2+Eclipse开发环境的配置小结.docx

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1、MPICH2Eclipse开发环境的配置小结烤鱼片(eii.dlmu)cleverysmMPICH2是MPI（Message-Passing Interface）的一个应用实现，支持C/C+和Fortran，同时有linux和windows版，因此，只要是程序里没有与系统相关的代码，同样的程序基本上就可以跨平台使用。我就是在windows下写程序，然后拿到linux下测试。因为还是觉得没有ide用的不爽，所以就在两个平台下都用了Eclipse+CDT。今天就总结一下两个平台下配置开发环境的方法。Windows 为了两个系统下保持一致，所以在windows平台下没有用VC，而是用的MinGW作为

2、编译器，MinGW的下载页面在PATH = C:MinGWbin;%PATH%LIBRARY_PATH = C:MinGWlibC_INCLUDE_PATH = C:MinGWincludeCPLUS_INCLUDE_PATH = C:MinGWincludec+3.4.2;C:MinGWincludec+3.4.2mingw32;C:MinGWincludec+3.4.2backward;C:MinGWinclude出现文件路径的地方根据MinGW安装的位置和具体版本号来修改即可。 为了能使用Eclipse，首先得安装JDK，这个没什么可说的，到下载一个安装程序，一路next就ok了。Ecl

3、ipse到http:/www.eclipse.org/下，解压开压缩包就能用。但要开发C/C+程序，还需要eclipse的插件CDT，还是到http:/www.eclipse.org/上下载，解开压缩包。把features和plugins里的东西拷贝到eclipse下的features和plugins里就可以，重新启动eclipse，如果能在新建项目里看到C和C+项目，就说明插件安装成功了，如果没有的话，就到eclipse的目录下的configuration目录里，把org.eclipse.update这个文件夹删掉，重启eclipse应该就能用。 Eclipse里的C/C+项目分两种，man

4、aged和standard。Managed不需要自己写makefile，而standard需要手动写makefile。因为感觉managed不如standard灵活，所以我是用的standard项目，可以根据需要来定制自己的makefile。现在我们来创建一个新的C+项目，从菜单Filenew里选择建立Standard MakeC+项目，一般除了项目名外只需要在binary parser里改为PE Windows Parser。 然后，添加一个源代码文件，main.cpp，在里面写上#include using namespace std;int main(int argc, char *ar

5、gv) coutHello World!= 0 # if _GNUC_MINOR_ 2 & 0 = 2 # error Please use the same version of GCC for compiling MPICH2 and user MPI programs# endif# endif #endif另外还要在#include 之前加上#undef SEEK_SET#undef SEEK_END#undef SEEK_CUR以避免MPI-2中的一个bug，不然的话编译器会报错，或者在编译命令的命令行里加上-DMPICH_IGNORE_CXX_SEEK。Linux Linux下Ec

6、lipse的使用方法基本与windows下一致，只是JDK的安装有点不同。到上下载jdk的bin文件，如jdk-1_5_0_07-linux-i586.bin，添加这个文件的可执行属性，chmod a+x jdk-1_5_0_07-linux-i586.bin，然后就可以执行这个文件./jdk-1_5_0_07-linux-i586.bin，这样JDK就会将文件解压缩到bin文件存放的当前目录，目录名应为jdk-1_5_0_07，然后将这个文件夹拷贝到作为JDK目录的位置，比如我就是放在/usr/java下。这样JDK的安装目录就是/usr/java/jdk-1_5_0_07,再就是添加环境变

7、量，以root用户编辑/etc/profile,在文件中添加如下三行，保存并重启export JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.5.0_07export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/tools.jarexport PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH这样JDK就安装好了，不出意外的话eclipse就能正常使用了。 关于include路径和lib链接的问题也与windows下类似，linux下需要链接的库是-lmpich，如g+ -lmpich main.cpp -o main.exe。 Linux下开发MPI的时候可能会遇到几个问题。第一

8、个也是#undef SEEK_SET#undef SEEK_END#undef SEEK_CUR的问题，把这几行放到#include 之前就行。第二个可能会在编译链接的时候提示诸如undefined reference to pthread_getspecific的错误，这是MPI用到了线程功能，解决方法是编译的时候添加-lpthread，如g+ -lpthread main.cpp -o main.exe第三个问题是可能会遇到诸如./libmpich.a(ad_iwrite.o)(.text+0x155): In function ADIOI_GEN_aio: undefined reference to aio_write64的错误，这是我在使用MPIP-2的并行I/O功能的时候碰到的，也是在链接的时候缺一个库/usr/liblibrt.so。librt.so是glibc中对real-time部分的支持库。用于提升系统的I/O性能。解决方法是编译指令中加-lrt，如g+ -lrt main.cpp -o main.exe。