苯丙氨酸的紫外吸收峰为260nm课件.ppt
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1、第四章 蛋白质化学,蛋白质的分子组成,第一节,一、蛋白质的元素组成,含氮量,由于体内含氮物质以蛋白质为主,因此,通过测定含氮量即可大致推算出样本中蛋白质的含量,这是凯氏定氮法测定蛋白质含量的依据。,100g样品蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数100/16100 =每克样品含氮克数6.25100,蛋白质用酸、碱或酶水解均可得到含有不同氨基酸的混合液,因此氨基酸(amino acid)是蛋白质的基本结构单位。,二、蛋白质的基本结构单位,(一)氨基酸的结构,存在于自然界中的氨基酸有300余种,但组成蛋白质的氨基酸只有20种,称为基本氨基酸。这些氨基酸有相应的遗传密码,也称为编码氨基酸(codi
2、ng amino acid)或标准氨基酸(standard amino acid)。,L-氨基酸 D-氨基酸,(二)氨基酸的分类,根据R侧链理化性质不同可分为: 1. 非极性疏水氨基酸 2. 极性中性氨基酸 3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸,1.非极性疏水氨基酸,2.极性中性氨基酸,4. 碱性氨基酸,一般情况下,非极性疏水氨基酸在水溶液中的溶解度较极性中性氨基酸要小,酸性氨基酸的侧链含有羧基呈酸性电离,碱性氨基酸的侧链含有氨基、胍基和咪唑基呈碱性电离。 氨基酸还可根据其R侧链的化学结构进行分类,如芳香族氨基酸包括苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸;含硫氨基酸包括半胱氨酸和甲硫氨酸;含有羟基的氨基酸包括
3、苏氨酸、丝氨酸和酪氨酸。,(三)氨基酸的理化性质,1两性电离与等电点,2芳香族氨基酸具有紫外吸收特性,3茚三酮反应,当溶液为某一pH值时,氨基酸主要以兼性离子的形式存在,分子中所含的正负电荷数目相等,净电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点(pI)。 在pI时,氨基酸在电场中既不向正极也不向负极移动,即处于两性离子状态。,氨基酸的等电点,芳香族氨基酸因含苯环,具有共轭双键,可吸收一定波长的紫外光,其中酪氨酸和色氨酸的紫外吸收峰为280nm,苯丙氨酸的紫外吸收峰为260nm。其吸光度(A280)与氨基酸的浓度在一定范围内成正比关系。,芳香族氨基酸具有紫外吸收特性,三种芳香族氨基酸的紫外吸收峰,氨
4、基酸与茚三酮水合物共热时,氨基酸发生氧化脱氨、脱羧,而茚三酮水合物被还原,其还原物与氨结合,再与另一分子茚三酮缩合成为蓝紫色的化合物,后者最大吸收峰在570nm处。这一性质常被用于氨基酸的定性和定量分析。,茚三酮反应,三、肽键和肽,(一)肽键,一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基缩合脱去一分子水形成的化学键。,肽键的形成,肽键具有特殊性质。从键长看,肽键键长(0.132nm)介于CN单键(0.146nm)和双键(0.124nm)之间,具有部分双键的性质,不能自由旋转;从键角看,肽键中键与键的夹角均为120。因此,与肽键相连的6个原子(C、C、O、N、H、C)始终处在同一平面上,构成刚性的“肽键
5、平面”(peptide bond plane),又称“酰胺平面”或肽单元(peptide unit)。肽单元中,与C-N相连的氢和氧原子与两个碳原子呈反向分布。,肽键平面,(二)肽,多个氨基酸通过肽键相连形成的化合物称为肽。 由2个氨基酸形成的肽称为二肽。 3个氨基酸形成的肽称为三肽。 一般10个以下氨基酸形成的肽称为寡肽(oligopeptide),由10个以上氨基酸形成的肽称为多肽(polypeptide)。 组成多肽的氨基酸单元称为氨基酸残基。,多肽链,多肽链中形成肽键的原子和碳原子交替重复排列构成主链骨架,而伸展在主链两侧的R基被称为侧链。蛋白质分子结构可含有一条或多条共价主链和许多侧
6、链。,多肽链的结构具有方向性。一条多肽链有两个末端,有自由-氨基的一端称为氨基末端或N端;有自由-羧基的一端称为羧基末端或C端。肽链中的氨基酸因形成肽键而分子不完整被称为氨基酸残基。,(三)生物活性肽,体内存在着许多具有生物活性的低分子量肽,有三肽,有寡肽或多肽,如谷胱甘肽、抗利尿激素、血管紧张素II、-内啡肽、催产素及表皮生长因子等。这些活性肽在代谢调节、神经传导等方面起着重要作用。,体内重要的生物活性肽,体内重要的生物活性肽,第 二 节蛋白质的分子结构与分类,蛋白质是生物大分子,由许多氨基酸通过肽键连接形成。具有生理功能的蛋白质都具有有序的三维空间结构。蛋白质的分子结构分为一级结构和空间结
7、构,空间结构又称高级结构,包括二级、三级和四级结构等。一级结构是基础,决定蛋白质的空间结构。,一、蛋白质的一级结构,蛋白质的一级结构(primary structure)是指多肽链中氨基酸残基的组成和排列顺序。蛋白质分子中氨基酸排列顺序是由遗传密码决定的,是蛋白质作用的特异性、空间结构的差异性和生物学功能多样性的基础。蛋白质一级结构中除肽键外,有些还含有少量的二硫键,是由两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢而生成的,可存在于肽链内,也可存在于肽链间。,例如人的胰岛素是由两条多肽链共51个氨基酸残基构成,其中A链包括21个氨基酸残基,B链包括30个氨基酸残基。A链和B链之间有两个二硫键连接。在A链第6位
8、与第11位的两个半胱氨酸残基之间还有一个链内二硫键。,人胰岛素的一级结构,二、 蛋白质的空间结构,蛋白质分子的空间结构又称立体结构、高级结构和三维构象等。天然蛋白质的多肽链由于分子内单键的旋转形成复杂的卷曲和折叠,构成蛋白质特定的三维空间结构,包括二级结构、三级结构和四级结构。蛋白质分子的空间结构是决定蛋白质性质和功能的结构基础。,(一)蛋白质二级结构,蛋白质的二级结构是指肽链的主链骨架原子若干肽单位各自沿一定的轴折叠而形成的有规则的构象。只涉及主链构象及链内/间形成的氢键。主要有螺旋、 折叠、转角、无规卷曲。,1. 螺旋,螺距0.54nm,含3.6个AA残基,链内形成氢键与轴平行,多为右手螺
9、旋。,螺旋,由两/多条几乎完全伸展的肽链平行排列,通过链间的氢键交联而形成。肽链主链呈锯齿状折叠构象。,2. 折叠,3. 转角,肽链主链骨架180的回折结构。 特点:由4个连续的氨基酸残基组成。第一个残基C=O第四个残基NH,形成氢键,O ( 氢 键 ) H C(NHCHCO)2N R,泛指没有规律性的多肽片段。,4. 无规卷曲(random coil),(二) 蛋白质的超二级结构,蛋白质的超二级结构是指两个或两个以上的二级结构在空间折叠中彼此靠近,相互作用形成有规则的二级结构的聚集体,完成特定的生物学功能。,蛋白质的的结构域是指位于超二级结构和三级结构间的一个层次。是蛋白质分子空间结构内独立
10、折叠单元,通常是几个超二级结构单元的组合。 结构域存在的原因: 1.局域分别折叠比整条肽链折叠在动力学上更为合理。 2.结构域之间由肽链连接,有利于结构的调整。,(三)蛋白质的结构域,30k 40k 20k 75k,60k,35k 30k,肝素纤维蛋白肌动蛋白,细胞,胶原蛋白,纤维蛋白,肝素,纤维蛋白,(四)蛋白质的三级结构,蛋白质的三级结构是指在二级结构、超二级结构或结构域的基础上,由于侧链R基的相互作用,进一步盘曲折叠构成的特定空间结构,包括整条肽链中全部氨基酸残基的所有原子在三维空间的排布位置。 维系力有氢键、疏水作用、离子键、范德华力。,(五)蛋白质的四级结构,蛋白质的四级结构是指由两
11、条或两条以上的具有独立三级结构的多肽链相互作用,经非共价键连接成特定空间构象。 亚基:指四级结构中每条具有完整三级结构的多肽链。 维持力:是离子键、氢键,不包括共价键。,(一)按化学组成分类 1. 单纯蛋白质 2. 结合蛋白质 (二)按分子形状分类 1. 纤维状蛋白质 2. 球状蛋白质,三、蛋白质的分类,第 三 节蛋白质结构与功能的关系,一、蛋白质的一级结构与功能的关系,(一)一级结构是空间结构的基础 一级结构决定多肽链中氨基酸残基的种类、数量及排列顺序,也决定多肽链中氨基酸残基R侧链的位置,R侧链的大小、性质决定着肽链如何盘曲折叠形成空间结构。(二)一级结构与空间结构及功能的关系 一级结构相
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