动物微生态基础知课件.ppt
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1、动物微生态基础知识,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,一个神秘的未知世界,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,RhinitisSinusitis,PeriodontopathyDental caries,DermatitisAcne,ArtherosclerosisEndocarditis,Bacterial vaginitisMycotic vaginitis,IBDIBSDiarrheaCo
2、nstipationMalabsorption syndrome,AsthmaAllergies,ObesityDiabetes,AutismDepression,10 x more bacterial cells in the human body than there are human tissue cells60% are unknown and 80% unculturable Gastrointestinal tract is largest immune organ in human body (80% of immune system),肠道菌群Bacteria in the
3、Gut,美国田纳西州立大学的 C.Savage教授2002年在日本东京召开的“肠内菌世界”国际学术会上指出:“正常微生物群是人体的一个特殊器官”,肠道微生物是人体提供营养,调控上皮发育和指导先天性免疫的不可缺少的“器官”,Paul Eckburg, Stanford UniversitySteven Gill, Karen Nelson, TIGR/VI,Science, June 2005,308: 1635-1638,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,它们已经被生命科学家称为动物的第十一大
4、系统,与动物的生长发育、新陈代谢、生老病死紧密相联,家禽嗉囊的电镜照片1500倍(粘膜层细菌),动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,家禽盲肠的电镜照片3000倍(粘膜层细菌),动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,家禽小肠的电镜照片10000倍(粘膜层细菌),动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,家禽小
5、肠的电镜照片40000倍(粘膜层细菌),动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,Legion of Little Helpers in the Gut Keeps Us Aliveby Rick Weiss, printed June 5, 2006, Washington Post. In fact, its time to stop thinking of yourself as a single living thing at all, say the scientists behind th
6、e new work. Better to see yourself as a super-organism, they say: a hybrid creature consisting of about 10 percent human cells and 90 percent bacterial cells.To ignore our microbial side would be to ignore an important contributor to our health and our biology, Gordon said.One question we need to ta
7、ckle is: Is there such a thing as a core microbiome, a set of organisms or bacterial genes you find in most or all individuals? Fraser-Liggett said. ,“破坏人体微生物的生态就是损害人类健康” Gordon, Washington University,华盛顿邮报,Steven Gill, Fraser-Liggett, TIGR/VI Paul Eckburg, Stanford University,ClaireFraser-Liggett,C
8、raig Venter,第一基因组:来自先天遗传,第二基因组:后天进入人体而获得的微生物组,又称“元基因组” 元基因组数量是自身基因组的100倍。是当今全球生命科学的研究热点。,肠道微生态的最新研究The last research on intestinal microecology,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,肠道的生理功能不仅是食物的消化和营养的吸收,而且也是体内最大的免疫器官,需氧菌 兼性厌氧菌 厌氧菌,猪肠道微生态的建立和演替 猪出生时,肠道是无菌的,不久就有数种微生物浸入肠道
9、,经过生长、繁殖,逐渐形成一个微生物群体。仔猪出生24小时内在空肠、回肠、盲肠和直肠就定植了双歧杆菌、大肠杆菌、乳杆菌、消化球菌、肠球菌、小梭菌、拟杆菌和酵母菌。到8-22日龄达最高峰并形成一个定型的菌群,以双歧杆菌、拟杆菌、乳杆菌、大肠杆菌和消化球菌占优势。42日龄后随着年龄增长各个菌群的数量略有下降,其原因可能与猪的营养与饲料结构的变化有关,如粗纤维等成分的增多。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,家禽肠道微生态的建立与作用鸡在胚胎期一般是无菌的,但在出壳时,雏鸡受到外界环境细菌的污染,在
10、消化道内很快就有大量细菌生长繁殖,逐渐适应定植下来,形成一个微生物群体。研究雏鸡、育成鸡和成年鸡肠道后段菌群的变化,发现雏鸡随日龄增长,双岐杆菌与大肠杆菌明显增加,肠球菌与厌氧弯曲杆菌逐渐减少,而乳杆菌、消化球菌、类杆菌、葡萄球菌、芽孢杆菌的变化不大。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,菌群平衡动物健康,菌群失调,细菌比例紊乱,导致疾病。,动物微生态基础知识K
11、nowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物的微生态平衡与失调 正常情况下动物的微生态菌群保持在一种合理的动态平衡中,需氧菌与厌氧菌、阳性菌和阴性菌,微生物的种群与数量都保持一定的比例。如健康仔猪小肠的需氧菌与厌氧菌之比为1:100,即99%以上是厌氧菌;在大场内两者的比例为1:1000。当仔猪出现腹泻时,它们的比例发生严重失调,在仔猪小肠表现为1:1,在大肠表现为1:100。环境变化、动物生病、应激、饲料改变、抗生素等都可能带来微生态失调。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microe
12、cology,Baolai-leelai Bio-Tech,大肠杆菌是肠道条件性致病菌,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,原籍菌群、外籍菌群和定植、粘附 美国哈佛大学杜鲍教授率先提出了这两个概念。原籍菌群是在长期历史进化过程中形成的,与宿主的共生关系极为密切,对宿主是有益菌,因而也称为固有菌群。而外籍菌群在其非特异性宿主体内,必须要适应环境,耐受免疫屏障和生物拮抗等才能生存和发展,否则将被排除。 原籍菌群都具有定植能力,具有在宿主生长、繁殖和延续后代的能力。动物出生后几个小时至几天,就会出现各
13、部位的特异性微生物定植,哪个部位定植哪种微生物都是一定的,是微生物与宿主两方面共同的遗传学机制决定的。定植则依靠微生物对宿主的粘附,而这种粘附是有特异性的。如大肠杆菌的I型菌毛末端的蛋白质配体仅特异性的与上皮细胞、真皮细胞和红细胞等表面的D-甘露糖受体相结合。 微生物定植后就是繁殖与尽快形成一定的优势种群地位,还要抵抗其他微生物的竞争,以及耐受宿主的免疫屏障作用。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Bao
14、lai-leelai Bio-Tech,肠道肠道菌群多样性及菌群演替,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物和人的消化道微生物群落极具多样性,一般有1000-4000个种群,每克肠道内容物含有多达100亿个活菌体。动物体患病或者使用抗生素导致微生物群落多样性降低,而种群的多少,决定菌群平衡的稳定性。 动物消化道从前端到后端,分别分布着需氧菌、兼性厌氧菌和专性厌氧菌,其中兼性厌氧菌起到很大的缓冲作用,在有氧时起作用,无氧时也起作用。 微生态演替是指正常微生物群,受自然或人为因素的影响,在微生态空
15、间中发生、发展和消亡的过程。临床上使用抗生素,往往伴有正常微生物群的演替过程。正常的生理性演替如出生动物首先定居的多是需氧菌和兼性厌氧菌,在生长过程中消耗了氧气,创造了厌氧环境,随后厌氧菌开始生长,成为先定植菌的竞争对手,并占据了优势,而先定植的需氧菌则降为第二位。动物的食物结构发生变化,也导致生理性演替。 抗生素、激素、同位素、疾病状态、外部环境变化、运输、感染、应激等则导致病理性演替。在菌群正常时,感染是不易成功的,如果感染成功,必须首先破坏正常菌群的生态平衡。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-T
16、ech,定位转移与抗生素引发内源性感染,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,定位转移是指微生物群离开其原籍,游动到其他部位或环境且定植下来,在一个生态区域内,有外籍菌定植,就意味着生态失调。如临床大量应用抗生素的白痢病仔猪,常常看到耐药性的大肠杆菌向呼吸道转移引起肺炎或胸部感染,也可定植于泌尿道引起肾炎、膀胱炎,或定植于阴道引起阴道炎。正常情况这种定位转移不容易发生。 定位转移的诱因包括物理因素、化学因素、抗生素、疾病和免疫力下降。如抗生素的使用消灭了敏感的正常菌群成员,其位置被耐药性菌群占领,
17、表现出定位转移。大肠杆菌是肠道原籍菌,当呼吸道正常菌群因使用抗生素而受到抑制后,大肠杆菌便可转移到呼吸道,引起感染。 抗生素往往会促进耐药性的少数过路菌或外籍菌生长繁殖,如全身性白色念珠菌、绿脓杆菌或肺炎杆菌的感染。 定位转移从浅入深又分为体表阶段、上皮细胞阶段、淋巴组织阶段、网状内皮细胞系统阶段,直至浸染本无微生物定植的部位和组织,如血行感染,浸染内脏组织、器官等。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,B
18、aolai-leelai Bio-Tech,协同、拮抗 微生态系统中的各种微生物个体间和种群间会发生各种不同的相互关系,微生物种群内个体间的正性相互关系叫做协同,是微生物间互相提供必要的营养物质或生长因子而产生的。而两种微生物共同生存时为获得能源、空间、生长因子而发生的争夺现象,叫做拮抗。 协同又细分为单利协同:一方受益,另一方不受影响;中立:相互间不发生任何影响;互惠互利:共同生活,互相受益。 拮抗又细分为竞争共存:虽然竞争,但和平相处;相互排斥:一方必须战胜另一方,失败者将被排除出这个环境。此外还有单害共生、寄生、吞噬等。,动物微生态基础知识Knowleage about animel m
19、icroecology,Baolai-leelai Bio-Tech,微生态失调 微生态失调是指正常微生物群之间,及其与宿主之间的微生态平衡,在外环境影响下,由生理性组合转变为病理性组合的状态。它包括两个方面的内容:一方面是正常微生物群的种类、数量和定位的变化,另一方面是宿主表现出患病,这两方面互为因果。 微生态失调可以分为以下四类情形: 菌群失调:一度失调是正常菌群在组成和数量的变化,没有临床表现可以自然恢复。二度失调由生理波动转为病理波动,在临床有慢性病表现,是不可逆的。三度失调临床表现为急性症状,引发二重感染。 定位转移:病原微生物开始出现定位转移。 血行感染:血行感染既是原籍菌易位传播
20、的一种途径,又是一种易位感染。血性感染分为菌血症和脓毒败血症。 易位病灶:正常微生物群因其他诱因所致,在远隔的脏器或组织形成病灶,例如脑、肝、肾、腹腔、盆腔等的脓肿。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,菌群失调,定位转移,易位病灶,血行感染,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,感染的概念 在传染病学中,感染指病原微生物侵入动物体并在体内生长、繁殖,对动物体引起一系列病理过程。而在微生态学中,感染
21、是指一定条件下动物体内原籍菌群发生易位、数量发生增减或易主,而动物体从生态平衡转化为生态失调。 感染是一种自然现象,并非全是坏事。如果感染引起了免疫,控制了宿主不再受侵犯和更大的感染,那么感染就是制止感染的最后措施。如疫苗的预防接种,就是用人工感染来代替自然感染来达到预防感染的目的。所以说,感染是普遍的,而发病是偶然的,死亡更是偶然的。 感染共分为内源性感染、外源性感染。内源性感染是指动物体自身的正常微生物成员引起的感染,如耐药性大肠杆菌在一定条件下引起宿主的自身感染。外源性感染就是外源致病性微生物引起的感染。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecol
22、ogy,Baolai-leelai Bio-Tech,肠道粘膜感染的发生过程和机体免疫反应,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,抗生素疗法 感染发生以后,传统思维模式就是选择抗生素进行干预治疗。那么这种方法是否真正科学合理呢?事
23、实上是抗生素不仅没有解决感染问题,而是带来越来越严重的感染。 首先是抗生素破坏了正常的微生物生态平衡,摧毁了动物体内所拥有的正常微生物屏障,使那些原来被菌群屏障所抑制的内源性原因菌和外源性原因菌得以大量繁殖。先给小鼠服用链霉素扰乱其肠道正常菌群,再口服感染沙门氏菌,实验小鼠最低只需10个沙门氏菌就可腹泻,而未经链霉素处理的对照组则至少需要100万个沙门氏菌才能出现腹泻症状。 抗生素带来耐药性和耐药菌株的增加,而且耐药性可以通过质粒在细菌中传递,在所以肠道细菌中,大肠杆菌和绿脓杆菌的传递作用最强。大肠杆菌可将耐药性质粒传递给金黄色葡萄球菌、假单胞杆菌、变形杆菌、伤寒杆菌、痢疾杆菌等不同种属的细菌
24、。 统计表明,各国各地区治病菌出现的频率与抗生素呈现正相关,一般来说,抗生素使用愈广、种类愈多,发生菌群失调和感染的频率愈高,而耐药性愈强的菌愈会占优势。,动物微生态基础知识Knowleage about animel microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,滥用“抗生素”带来那些严重危害?,抗生素不仅没有解决感染问题, 反而造成越来越严重的感染。,滥用抗生素的后果是选育出一批致病性更强,危害更大的耐药性微生物,广泛的流行。这个问题业已构成一个严重的流行病学及公共卫生问题,其深远影响是不可估量的。,动物微生态基础知识Knowleage about animel
25、microecology,Baolai-leelai Bio-Tech,抗生素带来严重的副作用 感染发生以后,传统思维模式就是选择抗生素进行干预治疗。那么这种方法是否真正科学合理呢?事实上是抗生素不仅没有解决感染问题,而是带来越来越严重的感染。 首先是抗生素破坏了正常的微生物生态平衡,摧毁了动物体内所拥有的正常微生物屏障,使那些原来被菌群屏障所抑制的内源性原因菌和外源性原因菌得以大量繁殖。 抗生素带来耐药性和耐药菌株的增加,而且耐药性可以通过质粒在细菌中传递,在肠道细菌中,大肠杆菌和绿脓杆菌的传递作用最强。大肠杆菌可将耐药性质粒传递给金黄色葡萄球菌、假单胞杆菌、变形杆菌、伤寒杆菌、痢疾杆菌等不
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