医学信息检索与利用ppt课件.ppt

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1、医学信息检索与利用总 论,中山大学医学文献检索教研室罗淑莲,一、学习医学信息检索课的目的和意义,（一） 提高信息素质与信息检索 （二） 科技创新与信息检索,（一）信息素质教育与信息检索,信息素质(Information Literacy) 人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的能力。,信息素质的构成要素： （1）信息意识 （2）信息能力 信息检索力:指熟悉各种信息源，掌握信息检索的基础理论和基本技术，熟练地利用各种手工检索工具和计算机检索系统查找所需信息的能力 （3）信息道德,信息素质能力的评价标准,“美国高等教育中学生信息素质能力标准”：能确定信息资源的特点和范围；能有效地获

2、取所需信息；能评价信息及其来源，利用其知识基础和价值系统选择适当的信息；能有效利用所获得的信息实现特定的目标；在信息获取和利用时自觉遵守道德规范和有关的法律。,（二）科技创新与信息检索,科技信息是知识创新的源泉： 世界上任何一项科研成果或创新都是在吸取和借鉴前人或他人研究成果的基础上，再加上自己的钻研和创新所获得的。科技信息是科研的先决条件。,科研选题与信息检索 科研选题就是形成、选择和确定所要研究和解决的课题。 科研选题是科学研究的起始步骤。它关系到科学研究的方向、目标和内容，直接影响科研的途径和方法，决定着科研成果的水平，价值和发展前途。,1、科研选题的步骤一般是： 文献调研和实际考察提出

3、选题初步论证评议和确定课题。 2、选题的过程是一个不断反馈调整的过程，常常需要反复文献调研和多次论证，要继承已有的研究成果，并防止低水平重复。,3、科研选题应遵循的基本原则 科学性原则 创造性原则 需要性原则 可行性原则http:/,（1）科学性原则： 科研选题既要尊重所依据的科学理论和科学事实，同时还要随着基础事实和背景理论的改变而对选择的课题进行调整。,（2）创造性原则： 概念、理论、方法、或应用上的创新 创造性原则实质上是要求做到：在选题时熟悉别人已经进行过的工作，避免重复劳动；课题论证时恰当估计课题的意义和可能包含创造性成份。,二、医学信息检索的基本概念,（一）信息知识文献信息： 对现

4、实世界事物的反映。 在自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在，是物质存在方式及其运动的规律、特点的外在表现。知识：人们通过信息对世界的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。文献：记录有知识的一切载体。,（二）信息检索与文献检索,信息资源： 可供人类开发利用的各类信息的集合。分为非文献信息资源和文献信息资源两大类。,信息检索： 收集、组织、存储一定范畴的信息，并可供用户按需要查询信息的技术和过程。 信息组织的方法即信息加工、标引等（主题词、分类.） 信息检索可分为三类 ： 事实型信息检索 数据型信息检索 文献型信息检索,文献检索： 以某些特定的文献信息资源为检索对象，以获

5、取文献信息为目的的信息检索。 检索结果是切题文献或相关文献的文献线索或具体的文献。 根据检出内容的祥略，文献检索又可以分为书目检索和全文检索。,（三）文献信息资源的分类,1、按文献的出版形式分 图书 期刊 报纸 特种文献：科技报告、会议文献、专利文献、学位论文、档案资料、产品资料等。,期 刊,核心期刊：刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。评价期刊的常用工具： 医学核心期刊指南 中文核心期刊要目总览 JCR（Journal Cition Report，期刊引用报告）。,确定核心期刊和评价期刊质量的常用方法：载文率法和引文法。IF（影响因子）

6、= 某年内SCI来源刊引用该刊前二年发表论文总次数 / 该刊前二年发表论文篇数II（当年被引率）=某刊当年发表的论文被SCI来源刊引用的次数 / 该刊当年发表论文篇数,2、按文献的载体形式 印刷型文献 缩微型文献 声像资料 机读型电子出版物 电子期刊,电子期刊的定义： 指从投稿、编辑、出版、发行、订购、阅读乃至读者意见反馈的全过程都是在网上进行，任何阶段都不需用纸的新型出版物，称网络电子期刊。电子期刊的特点： 信息速发性高、信息量大、信息共享性强、交互性强、可读性强、易检索、良好的信息扩展性、内容、形式多样,从网络获取电子期刊的方式： 出版商、代理商、搜索引擎、其它网站的友好链接、专门收集期刊

7、的站点,3、按文献的内容加工级次 一次文献：原始文献 二次文献：对一次文献进行加工整序后衍生得到的文献。主要是揭示和报道一次文献，提供查找一次文献的线索。 三次文献：包括综述、评论、进展等。 零次文献：未经发表或进入社会交流、未经系统加工整理的原始文献记录。,三、文献信息检索语言,文献信息检索语言： 根据文献信息检索的需要而创制的人工语言。 检索语言分为描述文献外表特征的语言和描述文献内容特征的检索语言两大类。,描述文献外表特征的检索语言： 题名索引、著者索引、引文索引、序号索引等。描述文献内容特征的检索语言： 分类检索语言 主题检索语言 代码检索语言：用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。

8、（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等） 。,（一）分类语言及中图法,分类语言： 一种用分类号表达文献中的各种概念，按学科、专业对各种概念加以分类和系统排列的文献信息检索语言。 （美国国会图书馆图书分类法、杜威十进分类法、国际十进分类法、中国图书馆分类法、国际疾病分类等） 我国文献分类的主要依据是中国图书馆分类法（简称中图法）。,中图法,定义： 依一定的思想观点，以学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成的分类表。 以等级制为标记制度，依照从总分、一般特殊、低级高级、简单复杂的逻辑次序，逐层展开各门学科知识的类目等级体系，系统地组织文献。,中图法第四版将文献知识

9、分为5大部类，即马、列、毛泽东思想；哲学；社会科学；自然科学；综合性图书。下分22个基本大类。 例如 O：数理科学、化学 Q：生物科学 R：医药卫生 每个类目采用拉丁字母和阿拉伯数字相结合的混合号码,R 医药、卫生（17个二级类目） 1预防医学、卫生学 2中国医学 3基础医学 4临床医学 5内科学 6外科学 71 妇产科学 72 儿科学 73 肿瘤学 74 神经病学与精神病学 75 皮肤病学与性病学 76 耳鼻咽喉科学 77眼科学 78 口腔科学 79 外国民族医学 8 特种医学 9 药学,每个类目还可细分至六、七级类目，如 ： R6 外科学 R65 外科学各论 R655 胸部外科学 R655

10、.1 胸壁 R655.2 胸膜 R656 腹部外科学 R656.1 急腹症 R656.2 腹部疝 R656.3 腹壁 R656.31 腹壁炎症 R656.32 腹壁损伤,（二）文献标识码,文献标识码与中图法分类号不是一回事根据中国学术期刊检索与评价数据规范的规定，对文献标识码规定如下： A理论与应用研究学术论文（含综述） B实用性技术成果报告 C业务指导与技术管理性文章 D一般动态性信息（通讯、报导、会议活动、专访等） E文件、资料,（三）主题语言,主题检索语言：一种采用描述文献主题内容的词语标识并按照字顺排检文献的检索语言。主要包括主题词和关键词两种。叙词法：严格规范化、可进行概念组配、具有

11、完善参照系统、具有范畴索引等。关键词法：以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识。,1、主题语言主题词,主题词： 又称叙词，是以规范化的词汇来表达文献内容的主题。 规范化也就是对文献中的同义词、近义词、多义词等加以规范，同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。采用参照系统间接反映主题概念之间的关系,如：“肾功能衰竭” renal failure 或 Kidney failureMESH: renal failure see Kidney failure 采用主题词检索，能实现较高的查全率和查准率。,2、主题语言关键词,关键词： 非规范化（未经严格

12、规范化处理）检索语言，属于自然语言范畴。能够及时反映文献的最新信息，用法简便。 如：Apoptosis 但对同义词、近义词未经严格规范，因此同一主题概念的文献标引相对分散，容易导致漏检和误检。,3、医学主题词词表MeSH,Medical Subject Headings（MeSH）美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。规范化的可扩充的动态性叙词表。汇集约18,000多个医学主题词。,MeSH 附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。 MeSH引入范畴表(树形结构,Tree Structure)，将主题词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别划为15大类，其中有9

13、类又分若干子类目，子类目下面又分若干更小的类目。18,000多个主题词按其学科概念的性质分别列入各自所属的类目之下。,GASTROIN TESTINAL NEOPLASMS胃肠肿瘤 INTESTIINAL NEOPLASMS 肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤 COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉 . . . . DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤 . . . .,副主题词(Subheadings)又称限定词，与主题词进行

14、组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。 如：诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗（Drug Theray，DT）。MeSH有副主题词92个在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词/副主题词）须有逻辑关系。 如：阿司匹林治疗感冒 阿司匹林/治疗应用；感冒/药物疗法。,四、医学信息检索的方法、途径,检索途径 常用检索方法检索步骤及检索策略 检索效果评价指标 提高机检查全率、查准率的方法,1、常用的检索途径,（1）主题途径（2）著者途径（3）代码途径（4）题名途径（5）分类途径,2、常用的检索方法,顺查法 倒查法 抽查法 追溯法,3、医学信息检索的一般步骤,检索准备

15、阶段检索实施阶段,检索准备阶段分析课题，明确检索目的及要求（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等）；选择检索系统（包括检索工具或数据库）；确定检索方法；选择检索用词及检索途径。检索实施阶段 包括实际检索操作，检索策略优化与反馈，检索结果的筛选和整理，获取原始文献等。,4、检索效果评价指标,被检出相关文献量查全率：R = 相关文献总量 被检出相关文献量查准率：P = 被检出文献总量 未检出相关文献量漏检率：M = 相关文献总量 被检出非相关文献量误检率：N = 被检出文献总量,5、提高查全率、查准率的方法,提高查全率的方法： 用主题词检索； 主题词、关键词、同义词间用o

16、r 组配； 用上位词（扩展下位词）检索； 截词检索； 少用副主题词组配。,提高查准率的方法： 用主题词检索； 用下位词（专指度）检索 ； 检索词的字段限定 ； 副主题词组配限制 。,五、计算机检索基础,文献检索的技术手段 手工检索：利用各种印刷型检索工具，人工查找所需的文献信息。 计算机检索：根据信息特定的需求，利用计算机从相关数据库中检索所需要的文献信息。 网络信息检索：通过互联网上提供的网络信息查询工具，从网上获取文献信息。,计算机检索系统包括文献存储和文献检索两部分，分别对应数据库的建立和利用。计算机检索是目前广大医学临床与科研工作者获取医学文献信息最常用的方法和手段，具有信息量大、操作

17、技能容易掌握、方便快捷等特点。,（一）数据库基本概念,数据库的定义： 计算机把大量的数据项有机地集中起来存放在数据文件中，构成一个存放数据的整体，即数据库。数据库文件： 各项数据以二维表格形式存放于数据文件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的数据文件称为数据库文件（库文件）。,数据库文件示意（字段、记录、文档）,记录,字段,记录,（二）字段、记录、文档,字段： 计算机检索的最基本单位。计算机检索的重要字段包括篇名(Title)、作者(Author)、作者地址(Address)、刊名（Source,来源）、关键词(Keyword)、主题词(MeSH)、文摘(Abstract)等。记录： 在一个二

18、维表格中，每一栏称为一个字段(Field)，多个字段构成的一条完整信息称为一条记录(Record)。,文档(File)：数据库中一部分记录的集合。文档中的一条记录就是一篇文献的题录或文摘。一个数据库可以由一个文档组成，也可以由多个文档组成。,（三）计算机检索的布尔逻辑运算符,逻辑与 AND A AND B，要求检出文献中同时包含概念A和概念B，其作用是缩小检索范围，提高查准率。 逻辑或OR A OR B，要求检出文献中包含概念A或概念B或同时包含概念A和概念B，其作用是扩大检索范围，增加命中文献数。,逻辑非NOT A NOT B，要求在检出的包含概念A的文献中去掉含有概念B的文献，其作用是缩小检索范围。 其它运算符NEAR、WITH,布尔逻辑运算符示意,（四）关键词与主题词,关键词检索：也叫自由词检索，通过物理方式匹配主题词检索：根据内容进行匹配检索,