第一章医学信息标准化课件.ppt

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1、医学信息标准化,主要内容,医学信息的特点分类编码主要的 医学标准,临床医学信息特点,临床专科信息 患者数据采集患者基本情况，临床症状、体格检查，检查结果 患者数据的处理、存储 、格式化，如电子病历 决策支持：如诊断、治疗计划 管理 ：如医疗护理、保险经费管理、患者管理 监测评估 ：如手术、药物疗效评估 生成报表 ：如体温单、医嘱单 科研教学 ：珍贵的原始资料,临床医学信息特点,内科的信息很多，有心脏、消化、肾脏、呼吸、肿瘤等，以下以心脏内科为例来阐述，如何使用计算机信息技术收集、传输、存储和解释患者的临床数据，支持正确诊断和有效的治疗。,以检查为例,心脏大小：医生可以通过叩诊心脏的浊音界而描绘

2、心脏大小和形态。,心浊音界的各数据是以前正中线为纵轴，II-V肋为横轴形成坐标点，各坐标点与前正中线的垂直距离构成了正常值数据。当我们将这些坐标点相联，便显示正常心脏外形和大小。,以检查为例,听诊： 心跳频率（每二次心跳间的时间）心跳节律(心跳之间的间隔规律)心音高低（音频赫兹数）以及异常心音产生的阶段，这些数据都易于规范化定义。,以检查为例,心脏实验室检查的数据特点 临床生化检查 全自动生化分析仪可提供数据。 心电图 使用计算机化处理的结果 冠状动脉造影 高度数字化 超声心动图 使用计算机化处理的图像,图 动态心电图Holter对心律失常的自动分析,图 冠状动脉造影,图 二维B型超声波显示,

3、心脏内科的电子病历,电子病历组成: 文字型数据 检测图像数据（超声波、冠脉造影） 生物信号检测数据（心电图） 描述性自然语言（病史、病程记录） 心脏治疗 介入性治疗计算机系统处理,外科信息特点,外科疾病以手术或手法治疗为主，外科信息化管理除常规的文本资料采集、整理、储存外，图象信息的采集、储存更是重要的环节，这也是外科数据的特征。对病变部位的准确定位及周围解剖结构的熟练掌握，直接关系到疗效。从最初的诊断到手术方案的选择到术后复查，图象信息的采集贯穿了外科诊断治疗的全过程。,普通外科信息特点,肝脏外科： 肝肿瘤是肝脏外科疾病的重要部分，肝肿瘤分良性和恶性两种，良性肿瘤少见，恶性肿瘤中原发性肝癌是

4、我国常见的恶性肿瘤之一。 肝肿瘤的诊断信息可来自数字化检查结果： 定性检测、B超、CT、MRI、 放射性核素肝扫描 选择性腹腔动脉或肝动脉造影,其他学科的信息特点,医院管理的信息特点 社区卫生信息的特点 公共卫生信息的特点 医疗保险信息的特点 ,医学信息标准化,1 信息标准化涉及: 信息的分类和编码、名词术语标准化、信息交换格式标准化、信息结构化2 信息处理标准化涉及: 硬件与软件的标准化、接口标准化、 文档编制标准化,医学信息标准化, 医学信息的分类和编码 （代码预先设定） 医学术语和医学专业词汇汇编 （自由进行代码的复合） 医学信息硬件与软件的标准化 软件产品的标准化（HIS规范） 生产和

5、管理软件工程的标准化 软件开发环境的标准化,信息分类,分类定义： 是某一领域内概念的序化和原理的序化。 分类准则取决于应用目的 分类概念根据属性关系有序化 属性关系表现为甲包含了乙和丙 分类本质反映某种原理的有序化,主要的几类医学标准,1 国际疾病分类ICD,ICD 概念 国际疾病与相关健康问题分类表 （International Classification of Disease, ICD ） 是根据疾病的某些特征，按照规则将疾病分 门别类，并用编码的方法来表示的系统。 ICD已有110年发展历史 1891年第1版，1975年ICD-9，1994年ICD10。,国际疾病分类ICD,ICD-1

6、0由世界卫生组织维护，包含词量为13505条，依据疾病的某些特征，按照规则将疾病分门别类，并用编码的方法来表示的系统，记录多种新型诊断及预测。北京协和医院世界卫生组织疾病分类合作中心负责有关疾病分类的中文事宜,国际疾病分类ICD,请 同学阅读维基百科和百度百科的解释：http:/zh.wikipedia.org/wiki/ICD-10http:/,举例：ICD国际疾病分类,“某些传染病和寄生虫病” 1 以疾病为分类目的 2 以病因为轴心进行分类 A00为霍乱，A01为伤寒， A06为阿米巴感染 3 依据属性（病情和病理）进一步分目 A06.0为急性阿米巴痢疾，A06.1为慢性肠道 阿米巴病，

7、A06.3为肠道阿米巴 4 按序化关系逐个编码,编 码,编码定义 将一个表示对象或事物信息的某种符号 （常见的是文字）转换成便于人或计算识别 和处理的另一种符号体系（代码）的过程。 例如 急性阿米巴痢疾，代码A06.0,编 码,编码的基本构件: 代码 常见代码类型： 1 数字代码 2 记忆代码 ECG（electro cardiogram） 3 分级代码 父类在上层，子类在下层 S82小腿骨折,S82.0 髌骨骨折, S82.01髌骨开放性骨,医学信息分类编码的方法,分类方法 (以药品分类为例),药品分类,西药字典的分类代码如图,ICD分类的原理,依据疾病的四个主要特性，即病因、部位、 病理和

8、临床表现 ，形成一个多轴心的分类系统 ICD分类的基础是对疾病的命名 疾病的本质和表现特性正是分类的依据 分类与命名之间存在一种内在的对应关系 编码是唯一的 表示了特指疾病的本质和特性 疾病在分类里的上下左右关系,ICD分类的方法, 有三个层次：类目、亚目、细目，各围绕一个轴心 类目：三位数编码，如S80 亚目：四位数编码，如S82.0 细目：五位数编码，如S82.01 双重分类：剑号与星号 (病因与临床表现)， 如A18.8I32.0* 索引排列方法：按汉语拼音英文字母顺序排列， 第一层次是主导词，其下包括若干个修饰词 逐层依序排列,聋 传导性 单侧 双侧 和感音神经性, 混合性 单侧 双侧

9、,ICD的应用和意义,标准化：医学信息化的基础 共享性：疾病信息得到最大范围的共享 有利医疗管理：医疗统计的基础 有利费用管理：医疗经费控制的重要 依据之一,2人类与兽类医学系统术语SNOMED,概述 用于人、兽医学的结构化术语集和术语的分类 第一版发布于1975年 人类与兽类医学系统术语 也称国际医学规范术语全集 第三版（SNOMED INTERNATIONAL）,SNOMED的结构,索引排列是按照编码顺序,T-00000 皮肤系统 T-01000 皮肤 T-01200 真皮 T-01220 真皮乳头 T-01221 网状真皮,SNOMED,是当前国际上广为使用的一种临床医学术语标准，涵盖大

10、多数方面的临床信息，如疾病、所见、操作、微生物、药物等，可以协调一致地在不同的学科、专业和照护地点之间实现对于临床数据的标引、存储、检索和聚合，便于计算机处理。包含词量为1166529条。,SNOMED的应用,将人、兽医学术语进行结构化的分类和编码，使得原有的医学术语标准化，为计算机处理奠定了基础 有利于医学信息共享和提高医疗质量 术语代码拥有医学知识表达的许多特征 具开放式的数据结构 可灵活地进行搭配、组装、合成 适用于电子病历，并支持专家系统,基因本体GO,美国基因本体协会创建与维护的基因本体GO（gene ontology）在生物信息学领域中广泛使用的本体，用于创建共享的生物信息资源，允

11、许业界利用公共词汇和语义描述基因产品，提供在不同数据库中的基因产品的一致性描述。,基因本体GO,GO主要包括三大独立的本体: 生物过程（biological process）、分子功能（molecular function）和细胞组件（cellular component）。,基因本体GO,Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系。在基因表达谱分析中，GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点，旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。,基因本体GO,GO的思想大概如下：对于一个基因产品（蛋

12、白质或RNA），用某些词汇来描述它是干什么的或位于细胞哪里、或者参与了哪个生物过程，而这些词汇就是来自GO的Term。,Term是GO里面的基本描述单元,结构如下：Accession： GO:0005515 Ontology： molecular function Synonyms： related: alpha-2 macroglobulin receptor-associated protein activity related: protein degradation tagging activity related: protein tagging activity exact: pr

13、otein amino acid binding alt_id: GO:0045308 Definition： Interacting selectively with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). source: GOC:go_curators Comment： None Subset：,UMLS,UMLS (Unified Medical Language System)是美国国家医学图书馆建立的关

14、于生物医学和健康的知识组织体系。,UMLS,UMLS共有三个知识源数据库，它们是Metathesaurus、语义网络（Semantic Network）和专家词典（SPECIALIST lexicon）。UMLS知识源数据库被设计为多种用途，能用于多种类型的信息系统，如病例、科学文献、索引和公共健康数据。,UMLS,Metathesaurus是一个非常大的、多用途、多语言词汇库，来源于各种叙词表、分类表、编码集、用于病人护理的可控词汇表、健康服务表、公共健康统计、生物医学文献目录和索引以及基础医学、临床医学和健康服务的研究文献等。,UMLS,语义网络（Semantic Network）的目的是

15、提供Metathesaurus中所有概念的统一分类和一系列概念之间的关系。语义网络由两部分组成：一组较为宽泛的主题类目，也称语义类型；一组语义类型之间的关系，或称语义关系。,UMLS,专家词典（Specialist Lexicon）是NLM建立的三个知识源数据库之一，是UMLS项目的组成部分。专家词典的作用是为自然语言处理系统提供词汇信息。专家词典的词汇包括通用英语词汇和生物医学专业词汇。,生物信号和医学图像处理,病历中含有大量与人体生物信号和医学图像相关的信息，如心电图、X线片、造影录像等。纸质病历只能以纸质介质保存相关的曲线、图像，而不得不抛弃了录音、录象等信息。 数字化仪器设备所提供的信

16、息，应用PACS，LIS等医学信息系统的信息都可以通过不同的接口，将信息整合到电子病历中。,DICOM标准,产生背景： 医学图像设备产生的图像格式由生产厂商自定义，无统一标准。 随着医学图像技术的发展和PACS的出现，需要在同一终端上显示不同设备的图像，建立统一的图像显示和传输标准的需求由此提出。,DICOM标准,医学数字成像和通信标准(Digital Imaging and Communication in Medicine，DICOM) 目的是为推动与设备型号或生产厂家无关的、开放式的医疗数字影像的传输与交换。促使PACS的发展并和其他各种医院信息系统的整合，允许所产生的信息能广泛地经由不

17、同的设备来访问。,DICOM标准,医学DICOM是由美国放射学院（American College of Radiology ，ACR） 和美国国家电器制造学会（National Electrical Manufacturers Association ，NEMA）组成的联合委员会，于1982年开始研制，并逐渐完善和发展所形成的医学数字图像及传输标准。,DICOM标准,1985年公布1.0版(ACR-NEMA V1.0) 1988年公布2.0版，增加HIS/RIS联接后改为DICOM 1993年公布DICOM3.0版：内容从只提供点对点的通信标准，扩充到支持开放式系统互联以及TCP/IP等计算

18、机网络的工业标准，从只支持放射图像到支持内窥镜、病理等其他图像。,DICOM标准,医学数字成像设备的图像输出： 符合DICOM标准：PACS直接采集。 不符合DICOM标准：PACS转换为DICOM标准图像后采集。,DICOM标准,1985年公布1.0版(ACR-NEMA V1.0) 1988年公布2.0版，增加HIS/RIS联接后改为DICOM 1993年公布DICOM3.0版：内容从只提供点对点的通信标准，扩充到支持开放式系统互联以及TCP/IP等计算机网络的工业标准，从只支持放射图像到支持内窥镜、病理等其他图像。,DICOM 标准内容,第1部分 给出了标准的设计原则。 第2部分 介绍了D

19、ICOM标准的一致性概念。 第3部分 描述了信息对象的定义方法。 第4部分 服务类的说明。第5部分 数据结构及语意。 第6部分 数据字典。 第7部分 消息(message)交换。 第8部分 消息交换的网络通讯支持。 第9部分 说明DICOM如何支持点对点消息通信的服务和协议。第10、11、12部分 定义了DICOM文件的存储方式。第13部分 DICOM打印管理的点对点通信支持。第14部分 说明了灰度图像的标准显示功能。,HL7,不同系统的集成，必须建立在各方均 支持同样消息标准的基础上。 HL7为各个系统提供一套标准的统一 的接口。,HL7的数据组成,HL7数据由表(Table)和消息(Mes

20、sage)构成。 每个消息隶属于一种消息格式（v2.4有84种），消息由“区段”、“位”、“元素”、“副元素”组成。 例如“病人入院”讯息就包含了“病人身份证明（Patient IDentification, PID）”区段，PTD区段里又包含了病人姓名、年龄、住址、电话等“位”。HL7不仅包括组合消息的语法，而且允许定义所谓的触发事件。 HL7将现实中的各种医疗行为归纳为一些典型事件，例如“病人入院”就是一个事件。消息是根据触发事件被传输达接受方。,HL7实现方法,第一是采用点对点通讯方法以实现不同系统的对接； 第二种采用HL7 服务器（HL7 Server）的方法实现，HL7 Server

21、实际上是应用服务器，形成基于HL7接口的中心数据库，这样可以减少接口数量，提供系统的可靠性。,HL7的本土化,HL7数据结构是基于欧、美国情建立的 HL7应予以本土化 国家卫生部提出要完成 HL7和DICOM3的汉化和推广方法： 建立符合我国国情的HL7标准库 开发研制HL7消息的构造器/解析器 构造本土化的HL7消息,HL7的应用,现行HIS内部互连采用 直接打开数据库， 读写数据表的方法。 简捷方便，但很不安全。 不利于不同公司开发的子系统互连 产生错误难以确定修复， 甚而造成HIS瘫痪。,HL7是医院内信息交换的通用标准， 可整合HIS中不同子系统， 进行数据交换，减少数据重复， 提高交

22、互效率，避免重复采集。,XML（Extensible Markup Language） “可延伸标示语言”,XML是一种结构化的内容描述语言， 不仅可以描述内容，还可以定义所描述对象的结构。要使交换的内容为对方所“理解”和处理，还必须有交换双方约定一致的描述结构，即DTD（Document Type Definition,文件类型定义）。 1998年W3C组织将HL7与XML结合,以强化功能。,作用,ICD介绍(ICD基本知识 与 具体应用)SNOMED 介绍(基本知识 与 具体应用)GO介绍(基本知识 与 具体应用)UMLS介绍(基本知识 与 具体应用)DICOM介绍(基本知识 与 具体应用)HL7介绍(基本知识 与 具体应用),MeSHRxNorm生物信息资源UniProtMedline,