染色体和连锁群课件.ppt
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1、第六章 染色体和连锁群,第一节 连锁与交换第二节 交换值及其测定第三节 基因定位与连锁遗传图第四节 真菌的遗传分析(教材第二节)第五节 人类染色体作图(教材第三节)第五节 染色体遗传机制在理论上和实践上的意义.(教材第四节),第一节 连锁与交换Section 3.1 Linkage and Crossing Over,一、连锁遗传现象二、连锁遗传的解释三、完全连锁与不完全连锁四、交换与不完全连锁的形成五、重组型配子的比例六、交换的细胞学证据,一、连锁遗传现象,1906年,英国学者贝特森(Bateson)和潘耐特(Pannett):花的颜色和花粉粒的形状。(一)、香豌豆(Lathyrus odo
2、ratus)两对相对性状杂交试验.花色: 紫花(P) 对 红花(p) 为显性;花粉粒形状: 长花粉粒(L) 对 圆花粉粒(l) 为显性。1. 紫花、长花粉粒红花、圆花粉粒.2. 紫花、圆花粉粒红花、长花粉粒.,组合一:紫花、长花粉粒红花、圆花粉粒,组合一:紫花、长花粉粒红花、圆花粉粒,结果:F1两对相对性状均表现为显性,F2出现四种表现型;F2四种表现型个体数的比例与9:3:3:1相差很大,并且两亲本性状组合类型(紫长和红圆)的实际数高于理论数,而两种新性状组合类型(紫圆和红长)的实际数少于理论数。,组合二:紫花、圆花粉粒红花、长花粉粒,组合二:紫花、圆花粉粒红花、长花粉粒,结果:F1两对相对
3、性状均表现为显性,F2出现四种表现型;F2四种表现型个体数的比例与9:3:3:1相差很大,并且两亲本性状组合类型(紫圆和红长)的实际数高于理论数,而两种新性状组合类型(紫长和红圆)的实际数少于理论数。,(二)、连锁遗传现象.杂交试验中,原来为同一亲本所具有的两个性状在F2中不符合独立分配规律,而常有连在一起遗传的倾向,这种现象叫做连锁(linkage)遗传现象。相引相(coupling phase)与相斥相(repulsion phase).,二、连锁遗传的解释,为什么F2不表现9:3:3:1的表现型分离比例。(一) .每对相对性状是否符合分离规律?(二) .非等位基因间是否符合独立分配规律?
4、(三) .摩尔根等的果蝇遗传试验;(四) .连锁遗传现象的解释。,(一)、每对相对性状是否符合分离规律?,(二)、两对相对性状自由组合?,测交法:测定杂种F1产生配子的种类和比例赫钦森(C. B. Hutchinson, 1922)玉米测交试验(P149) 用玉米研究基因连锁的好处籽粒颜色: 有色(C)、无色(c)籽粒饱满程度:饱满(Sh)、凹陷(sh)相引相测交试验;相斥相测交试验。试验结果分析:F1产生的四种类型配子比例不等于1:1:1:1;亲本型配子比例高于50,重组型配子比例低于50;亲本型配子数基本相等,重组型配子数也基本相等。,测交:相引相,测交:相斥相,(三)、摩尔根等的果蝇遗传
5、试验,1926年发表基因论(The Theory of the Gene)专著,提出基因在染色体上呈直线排列。果蝇(Drosophila melanogaster)眼色与翅长的连锁遗传:眼色:红眼(pr+)对紫眼(pr)为显性;翅长:长翅(vg+)对残翅(vg)为显性。相引相杂交与测交相斥相杂交与测交结果:F1形成四种类型的配子;但比例显然不符合1:1:1:1,且亲本类型配子明显多于重组型配子;两种亲本型配子数大致相等,两种重组型配子数也大致相等。,果蝇眼色与翅长连锁遗传:相引相,Ppr+pr+vg+vg+prprvgvgF1pr+prvg+vgprprvgvg(测交)Ftpr+prvg+vg
6、1339prprvgvg1195pr+prvgvg 151prprvg+vg 154,果蝇眼色与翅长连锁遗传:相斥相,Ppr+pr+vgvgprprvg+vg+F1pr+prvg+vgprprvgvg(测交)Ftpr+prvg+vg 157prprvgvg 146pr+prvgvg 965prprvg+vg1067,(四)、连锁遗传现象的解释,连锁遗传规律:连锁遗传的相对性状是由位于同一对染色体上的非等位基因间控制,具有连锁关系,在形成配子时倾向于连在一起传递;交换型配子是由于非姊妹染色单体间交换形成的。控制果蝇眼色和翅长的两对非等位基因位于同一同源染色体上。即:相引相中,pr+vg+连锁在一
7、条染色体上,而prvg连锁在另一条染色体,杂种F1一对同源染色体分别具有pr+vg+和prvg。,三、 完全连锁和不完全连锁,完全连锁 (complete linkage):如果连锁基因的杂种F1(双杂合体)只产生两种亲本类型的配子,而不产生非亲本类型的配子,就称为完全连锁。是指杂种个体在形成配子时,没有发生非姊妹染色单体之间交换的连锁遗传例如雄果蝇(P157)和雌家蚕(P158)中通常不发生交换,连锁基因完全连锁,不发生重组。 不完全连锁 (incomplete linkage):指连锁基因的杂种F1不仅产生亲本类型的配子,还会产生重组型配子。 是指杂种个体的连锁基因,在配子形成过程中,同源
8、染色体非姊妹染色单体之间发生了互换的连锁遗传,完全连锁(complete linkage),完全连锁(complete linkage),A B,a b,不完全连锁(incomplete linkage),不完全连锁(incomplete linkage),不完全连锁(incomplete linkage),C-Sh基因间的连锁与交换,四、交换与不完全连锁的形成,重组合配子的产生是由于:减数分裂前期 I 同源染色体的非姊妹染色单体间发生了节段互换。(基因论的核心内容)1. 同一染色体上的各个非等位基因在染色体上各有一定的位置,呈线性排列;2. 染色体在间期进行复制后,每条染色体含两条姊妹染色单
9、体,基因也随之复制;3. 同源染色体联会、非姊妹染色单体节段互换,导致基因交换,产生交换型染色单体;4. 发生交换的性母细胞中四种染色单体分配到四个子细胞中,发育成四种配子(两种亲本型、两种重组合型/交换型)。5. 相邻两基因间发生断裂与交换的机会与基因间距离有关:基因间距离越大,断裂和交换的机会也越大。,连锁与交换的遗传机理,PF1(复制)同源染色体联会(偶线期)非姊妹染色单体交换(偶线期到双线期)终变期 四分体,连锁与交换的细胞学证据,连锁与交换的细胞学证据,连锁与交换的细胞学证据,五、重组型配子的比例,1. 尽管在发生交换的孢(性)母细胞所产生的配子中,亲本型和重组型配子各占一半,但是双
10、杂合体所产生的四种配子的比例并不相等,因为并不是所有的孢母细胞都发生两对基因间的交换。2. 重组型配子比例是发生交换的孢母细胞比例的一半,并且两种重组型配子的比例相等,两种亲本型配子的比例相等。,重组型配子的比例,六、交换的细胞学证据,第二节 交换值及其测定Section 3.2 Determining of Crossing-over Value,一、 交换值的概念二、 交换值的测定三、交换值与遗传距离四、影响交换值的因素,一、 交换值的概念 P156,交换值(cross-over value),也称重组率/重组值,是指重组型配子占总配子的百分率。即:,亲本型配子+重组型配子,用哪些方法可以
11、测定各种配子的数目?,二、 交换值的测定,(一)、测交法测交后代(Ft)的表现型的种类和比例直接反映被测个体(如F1)产生配子的种类和比例。相引相与相斥相的测交结果:C-Sh相引相的交换值为3.6%;C-Sh相斥相的交换值为3.0%。(二)、自交法测交法与自交法的应用比较;自交法的原理与过程:(以香豌豆花色与花粉粒形状两对相对性状,P-L交换值测定为例。),C-Sh基因间的连锁与交换,香豌豆P-L基因间交换值测定(1),设F1产生的四种配子PL, Pl*, pL*, pl的比例分别为:a, b, c, d;则有:a+b+c+d=1a=d, b=c,香豌豆P-L基因间交换值测定(2),F2的4种
12、表现型(9种基因型)及其理论比例为:P_L_ (PPLL, PPLl, PpLL, PpLl):a2+2ab+2ac+2bc+2adP_ll (PPll, Ppll) :b2+2bdppL_ (ppLL, ppLl) :c2+2cdppll : d2,d2,香豌豆P-L基因间交换值测定(3),而F2中双隐性个体(ppll)的实际数目是可出直接观测得到的(本例中为1338),其比例也可出直接计算得到(1338/6952),因此有:,香豌豆P-L基因间交换值测定(4),相斥相的分析:,三、交换值与遗传距离,1. 非姊妹染色单体间交换数目及位置是随机的;2. 两个连锁基因间交换值的变化范围是0, 5
13、0%,其变化反映基因间的连锁强度、基因间的相对距离;两基因间的距离越远,基因间的连锁强度越小,交换值就越大;反之,基因间的距离越近,基因间的连锁强度越大,交换值就越小。3. 通常用交换值/重组率来度量基因间的相对距离,也称为遗传距离(genetic distance)。通常以1%的重组率作为一个遗传距离单位/遗传单位。,四、影响交换值的因素,1. 年龄对交换值的影响老龄雌果蝇的重组率明显下降。2. 性别对交换值的影响雄果蝇和雌家蚕的进行减数分裂时很少发生交换。3. 环境条件对交换值的影响高等植物的干旱条件下重组率会下降,而的温度过高或过低的情况下,其重组率会增加。4. 交换值的遗传控制交换的发
14、生也受遗传控制,如在大肠杆菌中:recA+ recA-RecA(重组酶),第三节 基因定位与连锁遗传图,一、连锁分析的方法二、干扰和符合三、连锁遗传图,基因定位,基因定位(gene location/localization):确定基因在染色体上的相对位置和排列次序。根据两个基因位点间的交换值能够确定两个基因间的相对距离,但并不能确定基因间的排列次序。例:玉米糊粉层有色C/无色c基因、籽粒饱满Sh/凹陷sh基因均位于第九染色体上;且C-Sh基因间的交换值为3.6%。因此,一次基因定位工作常涉及三对或三对以上基因位置及相互关系。,两对基因间的排列次序,根据上述信息可知:C-Sh间遗传距离为3.6
15、个遗传单位;但不能确定它们在染色体上的排列次序,因而有两种可能的排列方向,如下图所示:,一、 连锁分析的方法,基因连锁分析的主要方法:(一)、两点测验(two-point testcross)通过三次测验,获得三对基因两两间交换值、估计其遗传距离;每次测验两对基因间交换值;根据三个遗传距离推断三对基因间的排列次序。(二)、三点测验(three-point testcross)一次测验就考虑三对基因的差异,从而通过一次测验获得三对基因间的距离并确定其排列次序。,两点测验:步骤(1/3),1. 通过三次亲本间两两杂交,杂种F1与双隐性亲本测交,考察测交子代的类型与比例。例:玉米第9染色体上三对基因
16、间连锁分析:子粒颜色:有色(C)对无色(c)为显性;饱满程度:饱满(SH)对凹陷(sh)为显性;淀粉粒:非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性.(1).(CCShShccshsh)F1ccshsh(2).(wxwxShShWxWxshsh)F1wxwxshsh(3).(wxwxCCWxWxcc)F1wxwxcc,两点测验的3个测交结果,两点测验:步骤(2/3),2. 计算三对基因两两间的交换值估计基因间的遗传距离。,两点测验:步骤(3/3),3. 根据基因间的遗传距离确定基因间的排列次序并作连锁遗传图谱。C-Sh: 3.6Wx-Sh: 20Wx-C: 22,两点测验:局限性,1. 工作量大,需要作
17、三次杂交,三次测交;2. 不能排除双交换的影响,准确性不够高。当两基因位点间超过五个遗传单位时,两点测验的准确性就不够高。,三点测验:步骤(1/7-2/7),仍以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三对基因连锁分析为例,在描述时用“+”代表各基因对应的显性基因。1. 用三对性状差异的两个纯系作亲本进行杂交、测交:P:凹陷、非糯性、有色 饱满、糯性、无色shsh + + + wxwx cc F1及测交: 饱满、非糯性、有色凹陷、糯性、无色 +sh +wx +c shsh wxwx cc 2. 考察测交后代的表现型、进行分类统计。,在不完全连锁的情况下测交后代有多少种表现型?,3. 按各类表现型的个
18、体数,对测交后代进行分组;4. 进一步确定两种亲本类型和两种双交换类型;,三点测验:步骤(3/7-4/7),三点测验:步骤(5/7),5. 确定三对基因在染色体上的排列顺序。用两种亲本型配子与两种双交换型配子比较:双交换配子与亲本型配子中不同的基因位点位于中间。如:+ wx c与sh wx c相比只有sh位点不同,因此可以断定sh位点位于wx和c之间;同理,sh + +与+ + +相比也只有sh位点不同,也表明sh位点位于wx和c之间。,基因间排列顺序确定,三点测验:步骤(6/7),6. 计算基因间的交换值。由于双交换实际上在两个区域均发生交换,所以在估算每个区域交换值时,都应加上双交换值,才
19、能够正确地反映实际发生的交换频率。,三点测验:步骤(7/7),7. 绘制连锁遗传图。Sh位于wx与c之间;wx-sh: 18.4sh-c: 3.5wx-c:21.9。,*两个思考问题:1.三点测验考虑到了wx与c之间的双交换值,应该比两点测验得到的遗传距离更大。但事实上变小了,为什么?2.各种方法在各次试验中测定的交换值-遗传距离都不相同,倒底哪一个最能反映基因间的遗传距离?如何选择?,二、 干扰和符合(并发率和干涉P170),1. 理论双交换值连锁与互换的机理表明:染色体上除着丝粒外,任何一点均有可能发生非姊妹染色单体间的交换。但是相邻两个交换是否会发生相互影响呢?如果相邻两交换间互不影响,
20、即交换独立发生,那么根据乘法定理,双交换发生的理论频率(理论双交换值)应该是两个区域交换频率(交换值)的乘积。例:wxshc三点测验中,wx和c基因间理论双交换值应为:0.1840.035=0.64%。,二、 干扰和符合,2. 干扰(interference)(P170):测交试验的结果表明:wx和c基因间的实际双交换值为0.09,低于理论双交换值,这是由于wx-sh间或sh-c间一旦发生一次交换后就会影响另一个区域交换的发生,使双交换的频率下降。这种现象称为干扰(interference),或干涉:一个交换发生后,它往往会影响其邻近交换的发生。其结果是使实际双交换值不等于理论双交换值。为了度
21、量两次交换间相互影响的程度,提出了符合系数的概念。,符合系数(coefficient of coincidence),符合系数也称为并发系数(P170):用以衡量两次交换间相互影响的性质和程度。例如前述中:符合系数=0.09/0.64=0.14.,符合系数的性质:真核生物:0, 1正干扰;*某些微生物中往往大于1,称为负干扰。,三、 连锁遗传图(linkage map) (P171),连锁遗传图(linkage map),遗传图谱(genetic map)。定义: 存在于同一染色体上的基因,组成一个连锁群(linkage group)。把一个连锁群的各个基因之间的距离和顺序标志出来,就能形成(
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