微生物ppt课件 第7章.ppt
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1、第7章 微生物遗传变异和育种,遗传(inheritance):,上一代生物将自身的一整套遗传信息传给下一代。,遗传物质结构或数量的改变,即遗传型的改变。,变异(variation) :,遗传和变异:生命的最本质特性之一,遗传型(genotype):基因型,表型(表现型)(phenotype):,生物个体的全部遗传因子所携带的遗传信息,具有一定遗传型的个体,在特定环境条件下通过生长发育所表现出来的形态等生物学特征的总和。,表型是由遗传型所决定,但也和环境有关。,不涉及遗传物质结构改变只发生在转录翻译水平上的变化,外表的修饰性改变,特点:只与环境有关、暂时性、不可遗传性、表现为全部个体的行为,粘质
2、沙雷氏菌(Serratia marcescens),表型饰变(modification):,微生物是遗传学研究的模式生物:,细胞结构简单,营养体一般为单倍体,方便建立纯系。易于人工培养,快速、大量生长繁殖。对环境因素的作用敏感,易于获得各类突变株,操作性强。,第一节 遗传变异的物质基础,一、三个经典的实验:经典转化实验噬菌体感染实验植物病毒重建实验,F.Griffith,1928 肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae ):有荚膜S型(有致病性),无荚膜R型(无致病性) 证明: 细胞内存在遗传物质,1、经典转化实验,1944年,Avery精确重复了转化实验,确定了转化因子
3、,实验证明,将R菌转化为S菌的转化因子是DNA,A.D.Hershey,M.Chase, 1952放射性32PO43- 磷源,放射性35SO42-硫源标记的T2噬菌体,感染大肠杆菌证明:DNA是遗传物质,2. 噬菌体感染实验,H.Fraekel-Conrat,1956烟草花叶病毒( TMV)霍氏车前花叶病毒(HRV)证明:核酸(RNA)是遗传物质,3.植物病毒重建实验(RNA作为遗传物质),二、遗传物质在微生物细胞内存在的部位和方式(一)遗传物质在7个水平上的形式1、细胞水平2、细胞核水平3、染色体水平4、核酸水平5、基因水平6、密码子水平7、核苷酸水平,1、细胞水平真核微生物:细胞核原核微生
4、物:核区,2、细胞核水平真核生物:细胞核 核染色体原核生物 :核 区 DNA链,核基因组,核外遗传物质,3、染色体水平染色体:由组蛋白与DNA构成多环结构,一般讲细菌只有一条染色体,双链,环状结构,在细菌细胞中盘绕、扭曲、形成许多环(LOOP)。处于超卷绕(Supercoilng)状态,有些细菌有2条染色体:布鲁氏菌(Brucella sp):大染色体2.1Mb,小染色体1.15Mkb。霍乱弧菌(Vibrio cholerae):大染色体2.961Mb,小染色体1.073Mb。土壤杆菌属(Agrobacterium sp),布氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)的染色体是线状
5、的,细菌染色体大小:0.5813Mb之间;生殖道衣原体0.58Mb,蓝细菌13Mb(脉冲场凝胶电泳(PFGE)测定)。,单倍体(heploid):一个细胞中只有一套染色体,二倍体(diploid):一个细胞中含有两套功能相同的染色体,真核微生物,多条染色体,例如啤酒酵母有16条染色体。,4、核酸水平核酸种类:DNA,RNA核酸结构:双链、单链;环状,线状,超螺旋状DNA长度:因种而异,基因组(genome): 一个物种的单倍体的所有染色体及其所含的遗传信息的总称。碱基对(base pair,bp),千碱基对(kb)百万或兆碱基对(Mb),5、基因水平,基因(gene):生物体内具有自主复制能力
6、的最小功能单位,是一段具有特定功能和结构的连续的序列。基因大小1000-1500bp基因名称:hisG、lacZ编码蛋白质: HisG抗性基因:strR,鳗弧菌(Vibrio anguillarum)金属蛋白酶基因序列,6、密码子水平,Condon: 密码子,7、核苷酸水平核苷酸是最小突变单位和交换单位:A、G、 T、 C,被选择进行全基因组测序的微生物:,1)人类基因组计划中的模式生物,2)与人类生活关系密切的微生物,3)对阐明生物学基本问题有价值的微生物,Methanococcus jannaschii (詹氏甲烷球菌):古菌,(二)微生物基因组结构特点,174噬菌体基因组:1977年,S
7、anger F,Maxam A等发明了快速DNA测序,第一个全长5387bp的174噬菌体基因组测序;,流感嗜血杆菌(Heamophilus influenza): 由诺贝尔奖金获得者Smith H O领导的John Hopkins大学小组和Venter J C领导的基因组研究所(The Institute for Genomic Research, TIGR)完成的,结果发表于1995年7月28日的Science,整个基因组有1.8Mb包含1743个基因,啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) 有上百个实验室的600余位科学家参与仅欧共体国家就有80余个实验室参加。至1
8、996年6月,已全部完成15Mb,l 6条染色体,5885个基因的核基因组序列分析,历时十年。,大肠杆菌:基因组全序列测定于 1997 年由 Wisconsin 大学的 Blattner 等人完成,基因组中87.8的DNA编码蛋白质,0.8%编码RNA,0.7%是非编码的重复序列,约11%左右参与调节和其它功能。在大肠杆菌基因组中共有4288个基因,其中1853个是以前以报道过的基因,还有一大部分是功能未知的基因。大肠杆菌总共有 2584 个操纵子。,霍乱弧菌(Vibrio cholerae):2000年,有2条染色体,大染色体由2961146bp组成,小染色体由1072314bp组成,大肠杆
9、菌基因分类,1、原核生物(细菌)基因组结构特点,基因数基本接近由它的基因组大小所估计的基因数一般不含内含子。,1)染色体为双链环状的DNA分子(单倍体);,2)遗传信息具有连续性、基因组的重复序列少而短,个别细菌(鼠伤寒沙门氏菌和犬螺杆菌)和古生菌的rRNA和tRNA中也发现有内含子或间插序列,3)结构基因的单拷贝及rRNA基因的多拷贝,大肠杆菌总共有2584个操纵子,基因组测序推测出2192个。其中73%只含一个基因、16.6%含有2个基因、4.6%含有3个基因、6%含有4个或4个以上基因。,4)功能相关的结构基因组成操纵子结构;,在原核细胞中,几个功能相近或相关的结构基因经常有序地排列在一
10、起,并被转录在同一个RNA分子上;这种由一个转录控制区和1至多个结构基因组成的一个完整的转录单元称为操纵子,啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) 有上百个实验室的600余位科学家参与仅欧共体国家就有80余个实验室参加。至1996年6月,已全部完成15Mb,l 6条染色体,5885个基因的核基因组序列分析,历时十年。,2、真核微生物(啤酒酵母)的基因组结构特点,3)重复序列多,1)典型的真核染色体结构;,啤酒酵母基因组大小为13.5106bp,分布在16条染色体中,2)无明显的操纵子结构,4)有间隔区(即非编码区)和内含子序列,原核生物和真核生物的基因组比较,国家人类基因
11、组南方研究中心国家人类基因组北方研究中心中国科学院基因组信息学中心暨华大基因中心上海国家基因研究中心卫生部致病微生物基因组研究中心深圳华大基因研究院: 2007年10月11日完成第一个完整中国人基因组图谱(“炎黄一号”),我国的国家级基因组研究基地:,我国已完成多个微生物基因组的测序:痘苗病毒天坛株(预防医学科学院病毒研究所)对虾白斑杆状病毒基因组(国家海洋局第三海洋研究所)志贺氏痢疾杆菌全序列测定(卫生部基因组中心)钩端螺旋体和表皮葡萄球菌、黄单胞菌(国家人类基因组南方研究中心)腾冲嗜热菌 (中国科学院遗传研究所)工业菌株:葡萄糖酸杆菌、青霉菌、维生素 C生产菌株,(三)原核生物的质粒(pl
12、asmid):,1、定义:一种独立于染色体外,能进行自主复制的细胞质遗传因子,质粒所含基因对宿主细胞一般是非必需的;在某些特殊条件下,质粒有时能赋予宿主细胞特殊机能,使宿主得到生长优势。,2、结构特点共价闭合环状的超螺旋双链DNA分子(covalently closed circle,简称CCC) ;个别:线性双链DNA质粒和RNA质粒;大小:1kb-1000kb;( 细菌质粒多在10kb以内),3、质粒的检测,提取所有胞内DNA后电镜或琼脂糖凝胶电泳,超速离心后琼脂糖凝胶电泳,质粒所带的某些特点,如抗药性,1)质粒的普遍性,2) 质粒的不亲和性,3)质粒的可消除性,4)质粒的变异性,5)质粒
13、的可传递性,6)质粒的复制及复制调控: 质粒复制受其自身和宿主的双重控制,4、质粒的性质,5、质粒的类型,窄宿主范围质粒,广宿主范围质粒,只能在一种特定的宿主细胞中复制,可以在许多种细菌中复制,宿主范围,复制行为与核染色体的复制不同步,高拷贝数,严谨型质粒:,松弛型质粒:,复制行为与核染色体的复制同步,低拷贝数,拷贝数,编码的功能和赋予宿主的表型效应:,致育因子(Fertility factor,F因子)抗性因子(Resistance factor,R因子)产细菌素质粒(Bacteriocin production plasmid)毒性质粒(virulence plasmid)代谢质粒(Met
14、abolic plasmid)隐秘质粒(cryptic plasmid),(1)致育因子(Fertility factor),又称F质粒,F因子,大小约100kb,最早发现的一种与大肠杆菌的有性生殖现象(接合作用)有关的质粒。,F+菌株:携带F质粒F-菌株:无F质粒,F因子上面有编码产生性菌毛及控制接合过程进行的20多个基因。,(2)抗性因子(Resistance factor,R因子),包括抗药性和抗重金属二大类,简称R质粒。89kb抗性转移因子(RTF):含转移和复制基因;抗性决定因子含抗性基因,成簇地存在于抗性质粒上,抗性基因:汞(mer)、四环素(tet )、链霉素(Str)、磺胺(S
15、u)、氯霉素(Cm)、夫西地酸(fus),(3)产细菌素的质粒,编码细菌素可以杀死同种但不携带该质粒的菌株。,细菌素一般根据产生菌的种类进行命名:大肠杆菌Col质粒:产生的细菌素为大肠杆菌素(colicins ),(4)毒性质粒(virulence plasmid),致病菌:毒性质粒具有编码毒素的基因,其产物对宿主(动物、植物)造成伤害。,产毒素大肠杆菌:许多菌株含有为一种或多种编码肠毒素的质粒。,苏云金杆菌:编码内毒素(伴孢晶体中)的质粒,根癌土壤杆菌:Ti质粒是引起双子叶植物冠瘿瘤的致病因子,Ti质粒中的T-DNA可携带任何外源基因整合到植物基因组中,是植物基因工程中有效的克隆载体,(5)
16、代谢质粒(Metabolic plasmid),质粒携带有利于微生物生存的基因,如能降解某些基质的酶,进行共生固氮,或产生抗生素(某些放线菌)等。,假单胞菌的降解质粒:有降解一些有毒化合物,如芳香簇化合物(苯)、农药、辛烷和樟脑等的能力。,根瘤菌属的巨大质粒(megaplasmid): 与共生固氮有关,分子量大2.0-3.0 108,(6)隐秘质粒(cryptic plasmid),不显示任何表型效应,它们的存在只有通过物理的方法,如用凝胶电泳。存在的生物学意义,目前几乎不了解。,改造后可作为基因工程的载体(一般加上抗性基因),可移动基因,跳跃基因(jumping gene)位于染色体或质粒上
17、的一段能改变自身位置的DNA序列,可从染色体的一个位点转移到另一个位点,或从两个复制子之间转移,广泛分布于原核和真核细胞中。,(四)转座因子(transposable element):,原核转坐因子:插入序列(insertion sequence,)、转坐子(transposon,)、某些特殊病毒(如噬菌体),转坐因子的转坐可引发多种遗传效应:插入突变、染色体畸变、基因的修饰和重排。,特点:1)带有转坐酶基因2)两端各有一段一定长度的末端重复序列3)转坐时,可将新形成的拷贝以非同源重组的方式转移到染色体的新部位上,转座子的插入和靶序列正向重复的产生过程。,转座作用,第二节 基因突变和诱变育种
18、,突变,基因突变(点突变):,野生型(原始性状),突变型(新性状),基因突变,突变率: 每一世代中发生某一性状突变的几率,一个基因内部遗传结构或DNA 序列的任何可遗传改变。包括碱基置换和移码突变。,缺失、重复、插入、易位、倒位,染色体畸变:,突变,自发突变,诱 变,环境因素,自身有害代谢产物、DNA复制过程的偶然错误,一般频率较低。,物理、化学因素对DNA直接作用,突变频率高。,1、突变的原因,一、突变的机制和原因,常见的诱变剂:碱基置换: 亚硝酸、羟胺、烷化剂 碱基类似物(如5-溴尿嘧啶等)移码突变:吖啶类染料(吖啶橙、吖啶黄等)染色体畸变:电离辐射(X射线等)、烷化 剂、亚硝酸,2、突变
19、机制,碱基置换引起的突变,移码突变:由于DNA序列中发生1-2个核苷酸的缺失或插入,使翻译的阅读框发生改变,从而导致从改变位置以后的氨基酸序列的完全变化。,同义突变:碱基的变化没有改变产物氨基酸序列的密码子变化。,错义突变:碱基序列的改变引起了产物氨基酸的改变。,无义突变:某个碱基的改变,使代表某种氨基酸的密码子变为蛋白质合成的终止密码子(UAA,UAG,UGA)。蛋白质的合成提前终止,产生截短的蛋白质。,举例:5-溴尿嘧啶(BU)引起的碱基置换:通常情况,以酮式结构存在,为胸腺嘧啶类似物,能与A配对,但有时以较低的频率以烯醇式结构存在,就不再与A配对而是与G配对,1)营养缺陷型(auxotr
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