第三章酶蛋白的化学修饰课件.ppt
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1、1,第三章,酶蛋白的修饰,2,概述,酶分子修饰:通过各种方法使酶分子结构发生某些改变,从而改变酶的某些的特性和功能的技术过程。作用:提高酶的活力;增强酶的稳定性;降低或消除酶的抗原性;研究和了解酶分子中主链、侧链、组成单位、金属离子和各种物理因素对酶分子空间构象的影响。方法:酶分子的主链修饰、侧链基团修饰、组成单位置换修饰、金属离子置换修饰、物理修饰等。,3,第一节 酶的化学修饰,从广义上来说,凡通过化学基团的引入或除去使酶的共价结构发生改变,都称为酶的化学修饰影响酶蛋白化学修饰反应进程的因素主要有两个:1.酶蛋白功能基的反应性;2.修饰剂的反应性。影响酶蛋白功能基反应性的因素1.微区的极性2
2、.氢键效应3.静电效应4.位阻效应蛋白质功能基的超反应性:蛋白质的某个侧链基团与个别试剂能发生非常迅速的反应,4,影响超反应性的因素,改变蛋白质功能基的pK值蛋白质功能基具有较大的亲核性通过静电相互作用吸引试剂,并使其有适当取向试剂与靠近修饰部位的蛋白质区域之间的立体化学适应性试剂的结合等,5,二、修饰剂反应性的决定因素,选择吸附修饰剂根据各自的特点选择性地吸附在低或高极性区静电相互作用带电的修饰剂能被选择性地吸引到蛋白质表面带相反电荷的部位位阻因素蛋白质表面的位阻因素或者底物、辅因子、抑制剂所产生的位阻因素都可能阻止修饰剂与功能基的正常反应催化因素修饰部位的其他功能基如果起一般的酸碱催化作用
3、,也能影响修饰反应局部环境的极性有些有机反应的速度与溶剂的极性有关,6,酶化学修饰的局限性,某种修饰剂对某一氨基酸侧链的化学修饰专一性是相对的,很少有对某一氨基酸侧链是绝对专一的化学修饰剂化学修饰后酶的构象或多或少都有一些改变,这种构象的变化将妨碍对修饰结果的解释酶的化学修饰只能在具有极性的氨基酸残基侧链上进行,但是X-射线衍射结构分析结果表明,其他氨基酸侧链在维持酶的空间构象方面也有重要作用,而且从种属差异的比较分析,它们在进化中是比较保守的。目前还不能用化学修饰的方法研究这些氨基酸残基在酶结构与功能关系中的作用酶化学修饰的结果对于研究酶结构与功能的关系能提供一些信息,如某一氨基酸被修饰后,
4、酶活力完全丧失,说明该残基是酶活性“必需”的,为什么是必需的,还得用X-射线和其他方法来确定,因此化学修饰法研究酶结构与功能关系尚缺乏准确性和系统性,7,第二节酶分子的主链修饰,利用酶分子主链的切断和连接,使酶分子的化学结构及其空间结构发生某些改变,从而改变酶的特性和功能的方法。作用:提高酶的催化活性降低或消除酶的抗原性确认酶活性中心在主链上的位置了解主链的不同位置对酶的催化功能的贡献,8,一、主链的切断修饰,酶分子的主链包括肽链和核苷酸链,主链被切断后,可能出现下列三种情况:酶活性中心被破坏,丧失催化功能,用于探测酶活性中心的位置仍维持酶活性中心的空间构象,保持催化功能,但抗原性等特性发生改
5、变,可以提高某些酶(尤其是药用酶)的使用价值。例如:肽链有限水解修饰:采用适当的方法使酶分子的肽链在特定的位点断裂,其分子质量减少,可以在基本保持酶活力的同时使酶的抗原性降低或消失。有利于酶活性中心的形成,可使酶分子显示其催化功能或使酶活力提高。例如:生物合成的不显示催化活性的酶原,经过适当的修饰,可以转化为具有催化活性的酶主链的切断修饰通常使用某些专一性较高的酶作为修饰剂,也可采用其它方法使酶的主链部分水解。,9,二、主链的连接修饰,将两种或两种以上的酶通过主链连接在一起,形成一个酶分子具有两种或者多种催化活性的修饰方法在一个酶分子上具有两种或者多种催化活性的酶称为多酶融合体多酶融合体往往是
6、基因融合的产物,通过基因融合技术将两种或两种以上的酶的基因融合在一起形成融合基因,再经过克隆和表达,有可能获得各种多酶融合体,10,第三节酶的侧链基团修饰,采用一定的方法(一般为化学方法)使酶的侧链基团发生改变,从而改变酶分子的特性和功能的修饰方法作用:酶学方面:研究酶分子的结构和功能,如:了解酶分子的构象,研究各种基团在酶分子中的作用及其对酶的结构、特性和功能的影响,研究酶的活性中心中的必需基团,测定某一种基团在酶分子中的数量酶工程方面:提高酶的活力、增加酶的稳定性、降低酶的抗原性,引起酶催化特性和催化功能的改变,提高酶的使用价值,还可能获得自然界原来不存在的新酶种,11,侧链基团修饰方法,
7、酶有蛋白类酶和核酸类酶两大类,它们的侧链基团不同,修饰方法也有所区别。酶蛋白的侧链基团是指组成蛋白质的氨基酸残基上的功能团,酶RNA的侧链基团是指组成RNA的核苷酸残基上的功能团。酶的侧链基团修饰方法很多,主要有:氨基修饰、羧基修饰、巯基修饰、胍基修饰、酚基修饰、咪唑基修饰、吲哚基修饰、分子内交联修饰、大分子结合修饰等。,12,一、氨基修饰,采用某些化合物使酶分子侧链上的的氨基发生改变、从而改变酶蛋白的空间构象的方法凡能够作用于酶分子侧链上的氨基,产生脱氨基作用或与氨基共价结合将氨基屏蔽起来的化合物,称为氨基修饰剂。如:亚硝酸、2,4-二硝基氟苯(DNFB)、丹磺酰氯(DNS)、2,4,6-三
8、硝基苯磺酸(TNBS)、苯异硫氰酸酯(PITC)、醋酸酐、琥珀酸酐、二硫化碳、乙亚胺甲酯、O-甲基异脲、顺丁烯二酸酐等。,13,14,二、羧基修饰,采用各种羧基修饰剂与酶蛋白侧链的羧基进行酯化、酰基化等反应,使蛋白质的空间构象发生改变的方法可与蛋白质侧链上的羧基发生反应的化合称为羧基修饰剂。如:碳化二亚胺、重氮基乙酸盐、乙醇-盐酸试剂、异噁唑盐等,15,16,三、巯基修饰,采用巯基修饰剂与酶蛋白中半胱氨酸残基侧链上的巯基结合,使巯基发生改变、从而改变酶的空间构象、特性和功能的修饰方法。巯基在许多酶中是活性中心的催化基团,亲核性很强,是酶分子中最容易反应的基团之一,对稳定酶的结构和发挥催化功能有
9、重要作用。通过巯基修饰,可显著提高酶的稳定性。常用的巯基修饰剂有:酰化剂、烷基化剂(如碘乙酸等)、马来酰亚胺、二硫苏糖醇、巯基乙醇、硫代硫酸盐、硼氢化钠。,17,18,19,四、胍基修饰,采用二羰基化合物与精氨酸残基侧链上的胍基反应生成稳定的杂环,从而改变酶分子的空间构象的修饰方法。用作胍基修饰剂的二羰基化合物主要有:丁二酮1,2-环己二酮丙二酮苯乙二醛4羟基3硝基苯乙二醛对硝基苯乙二醛,20,21,五、酚基修饰,通过修饰剂使酪氨酸残基上的酚基发生改变,从而改变酶分子的空间构象的修饰方法。可以改变酶的某些动力学特性、提高酶的催化活性、增强酶的稳定性。包括酚羟基的修饰和苯环上的取代修饰,主要有碘
10、化法、硝化法、琥珀酰化法等,其中四硝基甲烷(TNM)可以高度专一地对酚羟基进行修饰。,22,23,六、咪唑基修饰,通过修饰剂与组氨酸残基上的咪唑基反应,使酶分子中的组氨酸残基发生改变,从而改变酶分子的空间构象的修饰方法常用的咪唑基修饰剂有:碘乙酸:在近中性pH下对组氨酸残基有较好的专一性,产物在240nm处有最大吸收,可跟踪反应和定量。焦碳酸二乙酯等 碘乙酸和焦碳酸二乙酯都能修饰咪唑环上的两个氮原子,碘乙酸修饰时,有可能将N1取代和N3取代的衍生物分开,观察修饰不同氮原子对酶活性的影响,24,25,七、吲哚基修饰,通过改变色氨酸残基上的吲哚基,从而改变酶分子的空间构象和特性的修饰方法。色氨酸残
11、基疏水性较强,通常位于酶分子的内部,而且比较不活泼,反应性较差。N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)可以对吲哚基进行修饰,但也可以与酪氨酸反应产生干扰。2-羟基-5-硝基苄溴(HNBB)和4-硝基苯硫氯可以比较专一地对吲哚基进行修饰,但也可以与巯基反应,因此用于吲哚基修饰时,要对巯基进行保护。,26,27,八、分子内交联修饰,含有双功能基团的化合物(即双功能试剂),如戊二醛、己二胺、葡聚糖二乙醛等,可以在酶分子中相距较近的两个侧链基团之间形成共价交联,使酶分子的空间构象更为稳定,从而提高酶的稳定性根据双功能试剂的功能基团的特点,可以分为两端具有相同的功能基团的同型双功能基团化合物两端所含的功能基团不相
12、同的异型双功能基团化合物,可以与酶分子上不同的侧链基团反应,如一端与氨基作用,一端与巯基或羧基作用等交联剂种类繁多,不同的交联剂具有不同的分子长度,其交联基团、交联速度和交联效果与各不相同,需通过实验选择适宜的交联剂进行分子内交联修饰,28,29,九、大分子结合修饰,采用水溶性大分子与酶蛋白的侧链基才共价结合,使酶分子的空间构象发生改变,从而改变酶的特性和功能的方法,是目前应用最广泛的酶分子修饰方法。采用的修饰剂是水溶性大分子,如聚乙二醇(PEG)、右旋糖酐、蔗糖聚合物(Ficoll)、葡聚糖、环糊精、肝素、羧甲基纤维素、聚氨基酸等,在使用前一般需要经过活化。作用:提高酶活力、增强酶的稳定性、
13、降低或消除酶的抗原性。,30,十、亲和修饰,又名专一位点修饰,是指修饰剂只专一地与酶分子某一个位点上的某一个基团发生反应,而与此位点以外的同一种或不同种基团都不发生作用的修饰方法。为对某一个特定位点的基团进行选择性的修饰,根据酶的底物结构特点和酶的催化机制,研究开发了亲和试剂。亲和试剂又称为亲和标记试剂,具有与酶作用底物相类似的结构,可以专一性地与酶的活性部位结合,而引起酶活性的不可逆抑制,故又称为专一性不可逆抑制剂。结合型(Ks型)不可逆抑制剂催化型(Kcat型)不可逆抑制剂,31,32,33,34,第四节酶的组成单位置换修饰,酶分子的基本组成单位包括氨基酸和核苷酸,是酶的化学结构和空间结构
14、的基础。酶分子组成单位的改变将引起酶的化学结构和空间构象的改变,从而改变酶的某些特性和功能。酶蛋白的基本组成单位是氨基酸,将酶分子肽链上的某一个氨基酸换成另一个氨基酸的修饰方法,称为氨基酸置换修饰。酶RNA的基本组成单位是核苷酸,将酶分子核苷酸链上的某一个核苷酸换成另一个核苷酸的修饰方法,称为核苷酸置换修饰 。,35,一、组成单位置换修饰的作用,提高酶活力增强酶的稳定性使酶的专一性发生改变,二、定点突变技术,定点突变(site directed mutagenesis)是指在DNA序列中的某一特定位点上进行碱基的改变从而获得突变基因的操作技术。20世纪80年代发展起来,常用于蛋白质工程(Pro
15、tein Engineering)和酶分子组成单位置换修饰。,36,定点突变技术用于酶分子修饰的过程,新的酶分子结构的设计突变基因碱基序列的确定突变基因的获得根据设计,用DNA合成仪合成有1-2个碱基被置换了的寡核苷酸,再以此为引物通过聚合酶链反应(PCR)或M13质粒等定位突变技术获得所需的大量突变基因。聚合酶链反应技术简称PCR(polyme rase chain reaction)技术,是一种DNA扩增技术,其基本过程包括:双链DNA的热变性(解链),引物与单链DNA的退火结合,引物的延伸等3个步骤。新酶的获得,37,金属离子置换修饰,把酶分子中的金属离子换成另一种金属离子,使酶的功能和
16、特性发生改变的修饰方法作用:了解各种金属离子在酶催化过程中的作用,有利于阐述酶的催化作用机制,并可能提高酶活力,增强酶的稳定性,甚至改变酶的某些动力学性质。,38,1.提高酶活力例如,-淀粉酶分子中大多数含有钙离子,有些则含有镁离子或锌离子等其他离子,所以一般的-淀粉酶是杂离子型的。如果将其他杂离子都换成钙离子,则可以提高酶活力并显著增强酶的稳定性。结晶的钙型-淀粉酶的活力比一般结晶的杂离子型-淀粉酶的活力提高3倍以上,而且稳定性大大增加。再如,将锌型蛋白酶的锌离子除去,添加一定量的钙离子,置换成钙型蛋白酶,其活力可以提高20-30%。2.增强酶的稳定性例如,铁型超氧化物歧化酶(Fe-SOD)
17、分子中的铁离子被锰离子置换,成为锰型超氧化物歧化酶(Mn-SOD)后,其对过氧化氢的稳定性显著增强,对叠氮钠(NaN3)的敏感性显著降低。3.改变酶的动力学特性例如,酰基化氨基酸水解酶的活性中心含有锌离子,用钴离子置换后,其催化N-氯-乙酰丙氨酸水解的最适pH值从8.5降低为7.0,同时该酶对N-氯-乙酰蛋氨酸的米氏常数Km增大,亲和力降低。,39,金属离子修饰的过程:,在经过分离纯化的酶液中加入一定量的金属螯合剂,如乙二胺四乙酸(EDTA)等,使酶分子中的金属离子与EDTA等形成螯合物。通过透析、超滤、分子筛层析等方法,将EDTA-金属螯合物从酶液中除去。用一定量的另一种金属离子加到酶液中酶
18、蛋白与新加入的金属离子结合,得到经过金属离子置换后的酶。,40,第五节酶分子的物理修饰,通过各种物理方法使酶分子的空间构象发生某些改变,从而改变酶的某些特性和功能的方法称为酶分子的物理修饰。,41,物理修饰的作用,了解在不同物理条件下,特别是在高温、高压、高盐、低温、真空、失重、极端pH值、有毒环境等极端条件下,由于酶分子空间构象的改变而引起的酶的特性和功能的变化情况。极端条件下酶催化特性的研究对于探索太空、深海、地壳深处以及其他极端环境中,生物的生存可能性及其潜力有重要的意义。有可能获得在通常条件下无法得到的各种酶的催化产物。酶分子的物理修饰同样可能提高酶的催化活性、增强酶的稳定性,或者改变
19、酶的催化动力学特性。,42,酶分子物理修饰的特点,1.不改变酶的组成单位及其基团,酶分子中的共价键不发生改变,只是在物理因素的作用下,副键发生某些变化和重排,使酶分子的空间构象发生改变。例如,羧肽酶经过高压处理,底物特异性发生改变,其水解能力降低,而有利于催化多肽合成反应;用高压方法处理纤维素酶,该酶的最适温度有所降低,在3040的条件下,高压修饰的纤维素酶比天然酶的活力提高10%。,43,酶分子物理修饰的特点,2.在某些变性剂的作用下,首先使酶分子原有的空间构象破坏,然后在不同的物理条件下,使酶分子重新构建新的空间构象。例如,先用盐酸胍使胰蛋白酶的原有空间构象破坏,通过透析除去变性剂后,再在
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