第五部分光生物物理学ppt课件.ppt
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1、第六讲 光生物物理学,主要内容: 1)光生物学过程的特征; 2)生物分子水平的发光原初过程; 3)光对生物大分子的作用; 4)生物发光与化学发光作用,内容介绍,紫外光和可见光的特征:,1) 都属于电磁光谱,以光子为单位。2)光子的能量:E=h=h c/h, 普朗克常数= 6.62610-34 J s, 是频率, c是光速,波长,10nm200nm,200nm 380nm,380nm 780nm,780 nm 2.5 m,2.5 m 50 m,50 m 300 m,2、研究内容:,1)光的原初过程光化反应实际是包括两个步骤:第一是光量子的吸收,此过程是在光作用下直接产生的反应,叫做光反应。第二是
2、化学反应,它是光反应后的继发反应,所以叫暗反应 包括: 光吸收后的激发和激发态; 荧光和磷光的发射和衰减; 激发能的转栘; 光生电子的转移; 质子转栘; 自由基与单线态氧的形成以及瞬变产物的形成与转化等等,暗反应。,光反应,2)对光能转换过程的研究:光对机体的作用中,所有的过程都有感受光的生色团参与。这些生色团处在生物膜上,在光生物物理学中又叫光感受体,它们往往是色素与蛋白质的复合物。研究这些光感受体的结构与功能之间的关系,特别是瞬变产物的特点,是光能转换中的关键问题。,3、光生物学过程的特征(与辐射生物学的不同之处):,1)辐射生物学是研究高能辐射,如x射线与射线等对机体的作用;而光生物学是
3、研究低能辐射(可见光、紫外光等)对机体的作用高能辐射因其能量大,与物质的相互作用会引起电离与激发,而主要是引起电离作用,从而启动一系列的原初与继发的复杂反应; 可见光、紫外光与物质的相互作用主要是引起激发,激发的分子由于比原来的分子有较高的能量所以不稳定,会发生一系列的弛豫过程,将多余能量以不同形式释放,分子本身又回到稳定的基态。这些激发分子的各种弛豫过程,就是光生物物理所要研究的一些基本的原初光反应及其规律。,2)光生物物理还有一特征,就是光对机体的照射,机体中必须有能吸收这些波长光的物质分子存在才能发生反应。这些能吸收相应可见光和紫外光波长的物质分子就叫做生色团(chromophore)。
4、生色团又叫光感受体,如光合作用中的叶绿素,植物光形态建成中的光敏色素,嗜盐菌的菌紫质,视觉过程中的视紫质等等。在高能辐射作用中,因为辐射能量大,只要撞击物质分子都会发生电离,无需机体中有特殊结构的物质分子来吸收。,传递途径,荧光,延迟荧光,磷光,辐射跃迁,无辐射跃迁,系间跨越,内转移,外转移,振动弛豫,S0,S1,T1,1、基态 一个分子在未吸收光能前所处的最低能量状态,叫基态。2、激发态 当吸收光能后分子就会使一个电子提高到高能量轨道,这种能量提高的状态叫做电子激发态,简称激发态。有最低的电子激发态叫第一激发态;有较高的电子激发态分别叫做第二、第三激发态等等。第二、第三激发态可将多余能量以热
5、能释放并降到第一激发态。,3、单线态 当吸收光子处于激发态时,虽然能量提高了,但电子自旋方向并没有改变,这时的激发态仍然是单线态。4、三重态 指分子中电子自旋量子数S=1,即原来两个配对的自旋方向相反的电子之一自旋方向改变,以至电子自旋之和不为0的情况。,驰豫过程:吸收光能后分子处于激发态,处于激发态的分子可以通过多种途径,将多余的能量释放,使分子又回到稳定的基态,这些释放多余能量的过程就是驰豫过程。,5、驰豫过程,内转换:当两个电子能级非常靠近以至其振动能级有重叠时,如第一激发单重态的较高能级与第二激发态单重态的某一较低能级位能相同会发生电子由高电子能级以无辐射跃迁的方式跃迁至低能级上,称为
6、内转换,转换速度10-1310-11 S(快)。,5、驰豫过程,系间跨越:指激发单重态与三重态之间的无辐射跃迁,原因:激发态电子自旋反转,造成多重复改变,可能单重态(S1)低振动能级与三重态T1的较高振动能量有重叠。,5、驰豫过程,外转换(猝灭):激发分子与溶剂分子或其它溶液分子相互作用,发生能量转移,使荧光或磷光强度减弱甚至消失现象称为猝灭。,5、驰豫过程,荧光:处于电子激发态的分子回到基态时发射的光称为荧光。 磷光:某种物质被某种波长的光照射以后能在较长的时间内发生波长比荧光波长更长的光,则称这种光为磷光。,5、驰豫过程,荧光:处于电子激发态的分子回到基态时发射的光。 磷光:某种物质被某种
7、波长的光照射以后能在较长的时间内发生波长比荧光波长更长的光。 荧光与磷光的产生过程:激发态基态的能量传递途径: 荧光:10-710-9 s,第一激发单重态的最低振动能级基态; 磷光:10-410s,第一激发三重态的最低振动能级基态;,磷光,磷光产生的机制与荧光是不同的,磷光是从某种能量低于第一电子激发态最低振动能级的另一种亚稳能级三重态向基态的各振动能级以辐射方式产生跃迁时发出的光。,所谓三重态或三线态,是指处于第一电子激发态最低振动能级的分子,可能通过无辐射跃迁消耗部分能量,其中一个电子的自旋方向倒转,使分子中原来两个配对的自旋方向相反的电子之一自旋方向改变,以至电子自旋之和不为0的情况。从
8、而处于三线态。,由于三线态能量低于第一电子激发态最低振动能级,因此磷光的波长比荧光长。,光是一种电磁波,具有一定的能量,波长越短,能量越高。,光谱红移:任一物质的荧光光谱及其峰位的波长总是比它的吸收光谱及峰位波长要长,这现象称为光谱红移。 镜像规则:通常荧光发射光谱与它的吸收光谱(与激发光谱形状一样)成镜像对称关系。,1、荧光光谱,2、荧光光谱与吸收光谱,镜像规则 基态上的各振动能级分布与第一激发态上的各振动能级分布类似; 基态上的零振动能级与第一激发态的二振动能级之间的跃迁几率最大,相反跃迁也然。,4、生物分子水平的发光原初过程(分子的激发和激发态及各种弛豫过程),1)分子的基态和激发态基态
9、:一个分子在未吸收能量前是处于最低能量状态,叫基态(groud state)激发态:当吸收一定能量后,分子就会使一个电子提高到高能量轨道。这种能量提高的状态叫做电子激发态,简称激发态(excited state)。由于有不同的能量状态,可以分为第一激发态,第二激发态例如:在植物光合作用最初的光反应中就包含叶绿素分子对光能的吸收。吸收光能后分子处于激发状态处于激发态的分子可通过多种途径,将多余的能量释放使分子又回到稳定的基态,这些释放多余能量的过程就是弛豫过程(relaxation process), 它包括释放热能,发光以及进行能量转移与光化学反应等。,弛豫过程,每一种激发态内还具有不同的振动
10、能级与转动能级。由于转动能级能量变化化范围小通常不予考虑。 振动动能像电子能级一样愈高愈不稳定,往往要通过内转换释放热能降到较低的振动能级。在激发态分子的弛豫包括:1)释放热能(即内转换和系间交叉)2)可以释放光即辐射弛豫,这种光辐射就是荧光、磷光释放荧光的是最低激发态(即第一激发态)磷光,第一激发态-外力作用释放部分能量-间稳态(三重态)-发出磷光返回基态。,激发态与电子能级的关系,通常用分子轨道来描述分子的能级。当一个电子发生跃迁时,它会从一个分子轨道转移到另一个分子轨道。原子中参与成键的电子组成新的分子轨道,这种成键电子和整个分子相联系而不属于某一原子核。两个成键原子的原子轨道组成一个能
11、量较低的成键分子轨道和一能量较高的反键分子轨道。由电子对组成的共价键可以分成键或键。当原子轨道头与头重叠时,形成 键;平行重叠时,形成 键. 一个成键 轨道必定有一个相应的*反键轨道,一个成键的轨道必定有一个相应的*反键轨道。分子中没有参与成键的电子称为非键电子或n电子。,有机化合物分子吸收紫外-可见光后产生的两种最主要的电子跃迁类型为:(1) 成键轨道与反键轨道之间的跃迁。(2) 非键电子激发到反键轨道。,生物荧光的一些特性,叶绿素a与b的吸收与荧光光峰,荧光光谱是用适合的波长做为激发光照射样品,将得到的不同波长的荧光强度记录下来。,1)任何物质的荧光波长总比其吸收波长长;这是因为荧光是发自
12、于最低激发态的最低振动能级,而(吸光)激发往往使分子处于较高的激发态或较高的振动能级,它们总要通过内转换释放多余能量,所以发荧光的能量总比吸收的能量低,波长长。,2)吸收与荧光两个光谱是镜像对称的。 分子受激发从基态跃迁到激发态,只有一种跃迁即从基态的最低振动能级跃迁到激发态的最低振动能级,这时吸收与荧光的波长才是重合的。3)任一物质的荧光光谱不决定与激发光的波长但是荧光强度是与激发光波长有关的,非辐射共振能量转移,激发态将能量转移给与其相互作用的分子,回到基态,接受能量的受体分子则被激发,这种能量转移叫做非辐射共振能量转移(non-radiative resonance energy tra
13、nsfer)。不同于激发态分子与另一基态分子发生碰撞产生的能量转移;也不同于激发态分子释放光子、另一基态分子吸收光子而激发(重吸收)等形式的辐射能量转移。非辐射共振能量转移的产生原因:当两个分子具有相同的激发能量变化(或受体比供体激发能级稍低),达到一定的距离时,通过两个分子在空间产生的电磁相互作用,供体分子可以将其激发能转移给受体分子,即形成非辐射共振能量转移。,非辐射共振能量转移产生条件:,1)供体与受体的距离在50-100埃之间;2)供体的荧光必须与受体分子的吸收光谱要有重叠,重叠愈大转移效率愈高;3)供体必须是能发荧光的分子;,50埃是一般生物大分子的直径大小,也是生物膜的厚度大小,所
14、以在生物大分子和膜上可以进行能量转移,5、紫外光对生物大分子的作用,5.1 紫外光对生物大分子的物理作用主要是引起激发,继而引起一些其它反应,其作用大小决定于紫外光的波长与能量。 1)蛋白质的激发: 蛋白质发光决定于三种芳香氨基酸, 因为它们具有共扼结构易于激发. 芳香氨基酸的吸收与发光特征,蛋白质吸收280nm左右的紫外光,从而引起激发并发光核酸发光较弱。,蛋白质中的荧光生色团,5.2 紫外光对蛋白质与核酸的光化学作用1) 紫外光对蛋白质的化学作用:蛋白质的变性, 肽键的断裂, 氢键的断裂;蛋白质的氧化, 包括由氨基酸的氨基羰基化损伤;2)紫外光对核酸的化学作用:碱基的氧化损伤;DNA单链断
15、裂;DNA链间的交联等;嘧啶碱基比嘌呤碱基敏感,6、可见光的光敏化作用(光动力作用),1) 光敏化作用(photosensitization): 是指用可见光照射含有光敏化剂(sensitizer)的基质,在氧的参与下发生的光化学反应。它是通过光敏剂的三重态转移能量实现的.2) 光敏化剂的种类: 最有效的敏化剂是那些三重态寿命较长而量子效率又高的物质染料:亚甲基兰,玫瑰红,曙红等色素类: 如卟啉, 黄素等芳香碳氢化物: 如红烯以及一些蒽类化合物,3) 光敏化作用的类型光敏化剂吸收光能后,先激发到单线态, 通过系间交连形成三重态, 然后产生型反应和型反应:,sensitizer,吸收光能,1se
16、nsitizer,系间交连,3sensitizer,型反应,与基质作用, 产生氢原子或电子转移,自由基,型反应(是体外合成产生1O2的常用方法),将能量转移给O2, 产生单线态氧(1O2),与其它基质作用,单线态,三重态,4) 光敏化作用的生物学效应: 分子水平来讲,受作用的基质是蛋白质与核酸这些大分子。在细胞成分中生物膜是首当其冲的光敏化作用基质, 单线态氧等活性氧主要是破坏膜脂,使脂肪酸氧化从而使膜变得脆弱。过氧化物诱发的氧化作用则造成整个膜的破坏。对光敏化作用敏感的蛋白质是含有巯基的氨基酸(如半胱氨酸)与芳香氨基酸。核酸对光最敏感的组分是鸟嘌呤5) 光敏化作用(光敏化自动氧化作用)的治疗
17、作用新型光敏化剂的发现, 如卟啉衍生物等.,光动力作用的治疗机制 因特异亲和作用潴留于癌细胞里的血卟啉(HPD),在吸收光能后发生如下的变化过程:HPD吸收光子后被激发到三重态 3(HPD),再将能量转移给原来处于三重态基态氧分子3O2,使之激发成活泼的单态氧1O2。这种单态氧是瞬时存在的强氧化剂,它可与其所亲和的癌细胞的基质A结合,使之强烈氧化为AOX(AOX :Adsorbable organohalogens, a group of halogenated organic substances that are able to adsorb onto activated carbon )
18、,癌细胞因此遭破坏,而达到治疗癌症的目的。光敏反应过程为HPDhv3(HPD)3(HPD)3O21O2HPD1O2AAOX3O2单态氧是在光敏化反应中能量转移过程的由三重激发态血卟啉衍生物所促成,而单态氧是使肿瘤细胞灭活的物质,在上述的一系列反应中,癌细胞膜的反应居于首要地位。,7、光合作用,光合作用是光能转化为化学能的一个典型的光能转换过程。叶绿素是执行光合作用的光感受体.光合作用的原初光反应包括: 叶绿素吸收光能,激发能的传递以及在反应中心产生电荷分离,这以后则是暗反应或一系列的生化反应,8、植物光形态建成,概念:植物光形态建成是指与光合作用无关的,由光信号对植物的生长、发育与分化的调控过
19、程。 植物光形态建成有几个主要特性: 植物在形状和结构上的变化需要的能量是来自于代谢,而不来自于光信号。所以这种光信号实际上是一种触发机制。 光合作用需要大量的光子,以化学能形式把日光能贮存起来。光形态建成正好相反,只需要很少的光量子就能完成其作用这就说明光信号在植物体内,需要一系列的放大作用,最后才能表现为形态上的变化和产物的积累。 光形态建成可根据对光谱的反应分几种不同类型。如叶片扩展是对红光的反应;有些真菌中诱导色素形成是对蓝光和近紫外光的反应。 光形态建成的光信号往往要与体内的一些因素相互作用,从而影响反应大小。,8.1 植物的光敏色素,Flint等人研究了光对莴苣种子发芽的作用, 发
20、现当种子放在黑暗中很少会萌发, 但是给一些光照, 萌发就进行得很快。 进一步研究发现,发现红光(波长650680nm)促进种子发芽,而远红光(波长710740nm)逆转这个过程,对发芽有显著的抑制作用。,Borthwick等提出接收光的色素是一种具有两种不同形式的色素,即在红光区(660nm)具有最大吸收的 Pr,在远红光(730nm)区具有最大吸收的Pfr。两者是可以相互转换的。将感光的物质提取并纯化。这种物质是一种色素蛋白,称为植物光敏色素(phytochrome),又叫植物色素或简称光敏色索。,植物光敏色素的发色团(辅基),某些有机化合物分子中存在含有不饱和键的基团,能够在紫外及可见光区
21、域内(200800nm)产生吸收,且吸收系数较大,这种吸收具有波长选择性,吸收某种波长(颜色)的光,而不吸收另外波长(颜色)的光,从而使物质显现颜色,所以称为生色团,又称发色团(chromophore)。,8.2 光敏色素的感受机制,Song等人提出的模型: Pr与Pfr发色团具有相似的构像; Pr比Pfr与蛋白质结合得更牢固,后者更加暴露和易变; Pfr的蛋白表面是疏水性,易与疏水受体相互作用。,X 是Pfr的受体,细菌光敏色素(Bacteriophytochrome)的研究进展,Domain structure of various phytochrome sequences. Br Bp
22、hP, from Bradyrhizobium ORS278; RpBphP, from Rps. palustris; Cph1, from Synechocystis PCC6803; Dr BphP, from D. radiodurans; Ppr, from R. centenum; and At phyB, phytochrome B from Arabidopsis thaliana. CBD, chromophore binding domain; PAS, Per/Arnt/Sim repeats; PYP, photoactive yellow protein domain
23、. (引自NATURE,2002,417 :202-205),Proposed scheme for the function of BphPs in light perception. Active BphP cross phosphorylates the conserved histidine in the dimer and then transfers this phosphate to an aspartate residue (D) on an response regulator RR1. The RR1 then transfers the phosphate to a co
24、nserved histidine on a HPT(histidine phosphotransferase), which donates the phosphate to a RR2. RR2 is fused to a DNA-binding domain (DBD) and serves as a transcription factor to affect gene expression. (引自CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY,2000,11: 511521),Crystal structure of RpBphP3-CBD. (a) Domain str
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