微流控核酸及蛋白检测解决方案ppt课件.pptx

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1、MFT Product Introduction,李佳琦,20180710,MFT = MicroFluidic Lab-on-Chip Technology（微流控芯片技术）,什么是MFT？,定义：是把生物、化学、医学分析过程的样品制备、反应、分离、检测等基本操作单元集成到一块微米尺度的芯片上， 自动完成分析全过程。,MFT产品线有哪些产品？,LabChip GX Touch系列,LabChip DropletQuant,功能：1. 用于检测核酸、蛋白。2. 分析样本的片段大小、浓度等结果。,功能：通过OD值的方法检测核酸、蛋白的浓度和纯度。,What Is LabChip GX Touch

2、？,NGS 3K专为珍稀样本设计，业内最佳灵敏度0.2pg/ul条带，2.5pg/ul,LabChip GX Touch：核酸电泳,HT Protein Express14 kDa 200 kDa40 seconds per wellHT Low MW Protein Express 5 kDa- 80 kDa40 seconds per wellHT Protein Charge Variant KitDetermination of antibody charge heterogeneity pI range 7-9.568-110 seconds per wellHT Protein C

3、lear HR14 kDa- 250 kDa5.0 2000 ng/L48 seconds per well,HT Pico Protein Express Direct labeling of proteins40 seconds per wellProfilerPro Glycan Kit Release and labeling of glycans50 seconds per wellRelease and labeling in 96 well format,Protein电泳 LabChip GXII Touch方可实现,LabChip GX Touch 24只适用于核酸（DNA，

4、RNA）最大批处理通量24,LabChip GX Touch：型号,LabChip GX Touch HT只适用于核酸（DNA，RNA）最大批处理通量384,LabChip GXII Touch 24适用于核酸（DNA，RNA）及蛋白最大批处理通量24,LabChip GXII Touch HT适用于核酸（DNA，RNA）及蛋白最大批处理通量384,Who Will Buy LabChip GX Touch？For What Reason？,农林畜牧渔实验室/种业公司/种子站等LabChip GX HT为主打机型用于分子标记检测替代传统手工电泳，提高数据质量、重现性及效率质检/商检：基于多重P

5、CR的转基因检测，病原体检测CDC：基于PCR/多重PCR的病原体检测及assay研发合成生物学实验室：高通量克隆筛选其他有条件的分子生物学实验室NGS实验室LabChip GX Touch 24为主打机型中心实验室/NGS服务提供商及公司可推荐HT（日通量达到48-96时）用于NGS样品质控,LabChip GX Touch 主要目标市场,发现并利用分子标记进行育种、种资资源鉴定等不要求极限分辨率（up to 3-5bp）/辨识度How：抽提核酸-PCR-检测（大板儿胶，毛细管测序仪）繁忙的电泳实验室高通量，往往一天数百个样品跑电泳/测序痛点：实验进度还不够快每板胶之间数据难以比较开发好的标

6、记用于种子鉴定，硬件及运行成本太高解决方法：LabChip GX Touch HT一台仪器一天可以轻松搞定多达400-800个样品标准化的电子数据，高度可重复，批次间乃至实验室间可比相比测序，硬件及运行成本均低有利研究成果产业化,LabChip GX Touch HT目标市场：农林畜牧渔/分子标记,LabChip GX Touch 农业应用 & 卖点,多个Assay，多方面的应用SSR、RFLP（DNA 1K）大片段缺失/基因敲除（ DNA 12K ）高通量测序样品QC（smear分析，DNA 1K assay、pg级DNA assay）基因表达起始RNA样品QC（ng及pg级RNA assa

7、y，RNA完整性评分RNA QC的黄金标准）出色的实际表现，高质量的数据准确性重现性分辨率灵敏度,植物隐性不育基因SSR分析：红色：250bp阳性；蓝色：260bp阴性250bp与260bp的loci被非常清楚的分辨与自动标识,LabChip 应用于SSR分析,不同批次，乃至来自不同实验室的数据可以被平行比较、筛选,LabChip 应用于病原体检测,STD9,LabChip GX 的实际表现：SSR分析,LabChip GX在该领域的主要竞争对手,QIAxcel Advance by QIAGEN 12道毛细管电泳市场价约40-45KFragment Analyzer by AATI（Adva

8、nced Analytical）12/96道毛细管96道市场价约45KQsep100- BiOptic公司- 台湾光鼎公司Shimadzu MCE202/Multi NA市场价约35K,LabChip GX Touch HT：竞争比较,数据质量：GX的重现性很好分辨率与QIAxcel等相当，相比AATI略有不及灵敏度及定量能力GX更好功能全面覆盖基因组DNA、DNA片段、RNA且提供ng及pg双灵敏度检测强大而人性化的分析软件通量与速度GX的速度与QIAxcel差不多，快于Qsep100、MCE202，稍慢于AATI，Qsep400?但通量是最灵活的：1-384任意批处理通量 vs 12n（Q

9、)）vs 96n（A）GX无人值守通量最高：单机情况下可达384样品，高于QIAxcel及MCE202的96，AATI的288GX是唯一兼容96及384孔板的也是可以通过整合微孔板处理器或自动化工作站提升产出、提高自动化程度的产品,16,QIAxcel (capillary based like FA),LabChip GX Touch,Assay种类多且全，含gDNA质控（ vs Qiaxcel仅有4种）灵敏度远高于Qiaxcel (20-500倍)HT型号可达384无人值守通量（vs. 96 on Qiaxcel），运行成本随通量升高而降低无需石蜡油以及氮气瓶GX可比QiaXcel耐受10

10、倍以上盐浓度,市场价一般在35-45万元运行成本比GX略低Qiaxcel单个样本大概在5-10块钱左右市场定位为“12通道快速毛细管电泳”，3分钟/12样本 - “fast analysis kit”PCR/多重PCR样本的检测足够 (not serious in NGS) 如AFLP, RFLP, RAPD等不用制胶，操作看起来简单对于96孔板/8排管型号的要求很低,QIAxcel Advanced,AATI Fragment Analyzer仪器,LabChip GX Touch vs. Fragment Analyzer,Qsep100 & Qsep400,Qsep100&400为台湾B

11、iOptic（光鼎生物科技）公司产品国内总代理商：杭州厚泽生物科技有限公司与QIAxcel非常相似，不过Qsep100为单道毛细管胶卡夹有医疗注册证（深圳亚能），但几乎没怎么卖（速度慢：5-10分钟/样本；不稳定；分辨率不如说的那么好）系统软件为Q-Analyzer，与QIAxcel类似有license限制，需要搭配软件密钥才能使用表明两者业内地位悬殊，Qsep市场认可度低只提供毛细管胶卡夹和部分试剂，类似“琼脂糖电泳风格”,Qsep100及BiOptic简介,LabChip GXII Touch在蛋白领域能做什么？,LabChip GXII Touch：为BioTx用户提供价值,一个平台，可

12、以检测多个关键质量指证Titer 滴度Purity 纯度Degree of Glycosylation 糖基化程度Fragmentation 片段化Aggregation 聚合N-Glycan profiling 糖谱分析Charge Heterogeneity 荷电异质性分析以70倍于现行最先进检测技术自动化毛细管电泳（Beckman PA800）的速度，提供同等的数据质量传统手工胶电泳（SDS-PAGE）无可比拟的数据质量尤其可重复性，及速度有助于：尽早开发出高质量的、且质量可控的药物,目标市场 治疗性抗体研发机构第一梯队：跨国药企GXII已为各主流跨国药企普遍采用和认可北京诺和诺德、GS

13、K、强生第二梯队：CRO/CMO药明康德、Bohringer Ingelheim第三梯队：本土药企药典/中检所认可的瓶颈，已有很大改善中信国健、百济神州、东阳光第四梯队：科研机构重组蛋白/生物制品研发机构 蛋白组中心,LabChip GXII: 目标客户,Analytical DevelopmentBiogen IdecEli LillyGSKAmgenGenzymeSeronoBMS,QCBiogen IdecEli LillyCovancePPDGSK,Protein BiochemistryAbbottNovartis,所有国际及国内顶尖BioTx研发机构均使用GXII,中国：诺和诺德跨

14、国药企药明康德No.1 CROBI上海No.1 CMO中信国健No.1本土生物药企百济神州No.1本土生物药研中检院东阳光、信达生物、凤凰中心、军科 华仞、GSK、强生、金赛药业、舒泰神,LabChip GXII Touch：竞争,Competitor & challenge？手工SDS-PAGEBeckman PA 800 plus、Agilent 7100Protein Simple新产品Maurice其他同类低通量产品（Agilent 2100等）Why LabChip GXII？准确、高重复性的数字化数据+可比的运行成本+glycan profiling vs手工SDS-PAGE“Pe

15、rformace可比而速度快40-70倍”vs PA 800、7100、Maurice同样的技术，更高的通量、更低的cost、glycan profling及Charge Variant assay等vs 2100/Experion,LabChip GX Touch在NGS领域能做什么？,质控！,样本提取（DNA或RNA或游离DNA）,文库构建,文库检测,上机测序,LabChip GX Touch检测样本完整性,样本完整性的直接体现GQS评分,RQS评分,gDNA降解模拟图,RNA降解模拟图,LabChip GX Touch做文库片段大小、浓度检测,简单、直观！,LabChip GX Touc

16、h：为NGS用户提供价值,提供全面样品质控：起始DNA/RNA，样品处理（建库）过程各个环节，直至文库上机前高质量数据：全球金标准技术，专利持有者不增加整个流程的复杂性：快速、自动化标准化经济：芯片可重复使用,LabChip GX Touch：真有那么好？,深圳华大：全球最大NGS“工厂”，国家批准的第一批7家NGS临床应用试点单位之一2010年进行了为期一个月，1000个数据点的测试评估当年10月引入第一台目前已有8-9台装机，覆盖深圳、香港、武汉、天津、上海持续增加中诺禾致源北中国区最大的NGS科研服务供应商之一安诺优达国家批准的第一批7家NGS临床应用试点单位之一燃石、百迈客、鹍远、诺唯

17、赞、泛生子、优迅、吉因加等均为GX HT,LabChip GX Touch 目标市场：NGS质控,同一平台，实现：从起始样品（gDNA、Total RNA）到ready-to-use library的全面质控比2100更全面的质控能力（2100不能做gDNA质控，而起始样本质量对实验结果至关重要，尤其涉及一些特殊样本如临床常见的FFPE时）常规（ng级）及痕量（pg级）灵敏度的QC中低通量（24-48 data point/天）到高通量（384+ dada point/天）可重复使用的芯片 = 更低的运行成本对高通量NGS实验室而言，HT的运行成本是无敌的自动上样 = 避免手动点样误差 = 更

18、准确的定量提供RNA完整性指数（RQS）及基因组DNA完整性指数（GQS）高质量的在用用户群体：深圳华大诺禾致源安诺优达,完胜的灵敏度带给客户的价值,可以只消耗1ul样品，做cfDNA（微量、起始样品）的质控超低浓度测序文库（e.g. PCR free文库）的质控对关注肿瘤Panel及液态活检的NGS用户尤具价值,LabChip GX Touch vs. Agilent 2100,高质量的数据：基于PKI专利的、完全相同的技术平台，样品质控金标准更全面的功能：可以做2100能够做的所有质控实验，还可做2100不能做的基因组DNA质控（从源头上保证测序成功及数据质量，避免浪费及不必要的风险） 以

19、及超高灵敏度NGS 3K assay，尤其适合肿瘤和液态活检等低浓度样本GX的运行成本远低于2100（且随着通量提高，运行成本进一步下降）更灵活而广泛的通量操作更简单、自动化（自动Priming，自动Sample loading）大量ref sites，如华大、诺禾致源、安诺优达、燃石等等 NGS样品前期制备、质控及下游数据分析管理的完整解决方案,LabChip GX Touch vs. Agilent 4200 TapesStation,4200 TapeStation,操作简单整体performance不如LabChip，但gDNA performance not bad与2100不是同一

20、技术机器价格比24贵，比HT便宜运行成本不低，且有多种耗材一次性独立检测通道（无交叉污染）有2100/2200用户基础,“Yes, the TapeStation running cost is expensive and the data is not as good, but still we use it because its quick and easy.”,What Is LabChip DQ？,DropQuant：高通量全波长微孔板检测仪,特点：230-750nm光谱分析微升级样本检测OD值1-96个样本主要应用蛋白直接定量荧光标记蛋白检测核酸浓度测定核酸纯度计算基因芯片样品染色

21、效率测定显色反应测定(e.g. Bradford)常规紫外/可见分光光度测量,DropletQuant,DropletQuant 特点,96个样品检测时间 5-8分钟仅需微量样品体积1-3ul灵活的高通量: 1-96超宽的定量线性范围: 0.03-200 mg/ml for Protein，1.5-10,000ng/ul for dsDNA可分辨样品中的杂质，如区分DNA样品中的RNA，或抽提时残留的苯酚等两种检测模式：指定波长检测及全光谱扫描可手工/自动化加样即使高通量情况下，也能实现最少的挥发可与其他仪器整合使用,DropQuant 应用及目标客户,核酸总浓度测定、纯度计算和杂质区分大的基因组中心，如测序服务提供商，NGS/芯片中心Biobanks，如收集病人样品的样品库等总蛋白直接定量、纯度分析等蛋白研发实验室；生物制药公司研发部；抗体生产部门等荧光标记效率检测适合于Micro Array研发相关机构显色反应测定(e.g. Bradford)常规紫外/可见分光光度测量,You Will Never Walk Alone！,