PubMed使用详解课件.ppt

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1、PubMed使用详解,PubMed使用详解,NCBI生物医学检索系统(Entrez),Pubmed：生物医学文献数据库；Nucleotide：核苷酸序列数据库；Protein：蛋白质序列数据库；Genome：完整的基因组汇编；Structure：大分子三维结构；PMC：数字化生物医学期刊存储与检索系统Taxonomy：分类学数据库；OMNI；孟德尔人类遗传学数据库；Books：生物医学网络版图书。,NCBI生物医学检索系统(Entrez)Pubmed：生物医,NCBI生物医学检索系统(Entrez),NCBI生物医学检索系统(Entrez),NCBI网站 (http:/www.ncbi.nlm

2、.nih.gov),NCBI网站 (http:/www.ncbi.nlm.n,PubMed主页,PubMed主页,1. Pubmed简介,NCBI于97年5月推出，Internet用户免费检索。检索全世界生物医学期刊论文的重要工具；学科覆盖范围： 临床医学、基础医学、护理学、牙科学、兽医学、药理学、环境和公共卫生。收录文献的时间范围： 1948- Update everyday (Tuesday - Saturday),1. Pubmed简介NCBI于97年5月推出，Inter,1. Pubmed简介,摘要型(Abstract)的数据库, 提供文献的线索；部分文献（约5%）提供免费全文(链接网

3、上免费资源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文。,1. Pubmed简介摘要型(Abstract)的数据库,1. Pubmed简介,来源期刊 5000多种 English 约4800 （约占85%) Chinese French Japanese Italy Germany,期刊论文发表时所用的语言,1. Pubmed简介来源期刊 5000多种 期刊论文发表,PubMed中的非英文文献,PubMed中的非英文文献,PubMed主页,基本检索,主题词检索,PubMed主页基本检索 主题词检索,3、PubMed检索,基本检索 简单检索 高级检索主题词检索智能检索,3、PubMed检

4、索基本检索,3.1 PubMed基本检索简单检索,检索词的输入形式：（1）单词、短语、缩写 如，interleukin；stomach cancer；AIDS（2）著者姓名：如，Smith W （3）期刊相关信息：刊名全称、缩写、ISSN 如，Cancer Research、JAMA、0741-5400,3.1 PubMed基本检索简单检索检索词的输入形式：,3.1 PubMed基本检索检索规则,逻辑运算 and(空格)、or、not词语检索 “single cell”；“liver cancer”截词检索 bacter*， disease? bacter disease bacteria d

5、iseases bacterium作者检索 smith ja; jones k julia s wong; wong julia s(2002年始）,3.1 PubMed基本检索检索规则逻辑运算 and,例: 肝癌的化学疗法,例: 肝癌的化学疗法,例: 肝癌的化学疗法,例: 肝癌的化学疗法,3.1 PubMed基本检索高级检索,3.1 PubMed基本检索高级检索,3.1 PubMed基本检索高级检索,字段限定检索,3.1 PubMed基本检索高级检索字段限定检索,PubMed检索字段,PubMed检索字段,3.1 PubMed基本检索 Limits功能,1)字段限定检索2)限定文献类型、语种

6、、出版日期、年龄、性别、研究对象等,3.1 PubMed基本检索 Limits功能1)字段,Limits功能 （限定检索）,Limits功能 （限定检索）,字段限定,字段限定,Limits：限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等,Limits：限定文献类型、语种、出版日期、,3.1 PubMed基本检索检索历史,3.1 PubMed基本检索检索历史,查看检索历史，进行逻辑运算,查看检索历史，进行逻辑运算,3.1 PubMed基本检索实例,1、哮喘治疗(限定题目字段)的英文综述文献2、近五年来中国研究者发表的有关Aids病研究的文献,3.1 PubMed基本检索实例1、哮喘治疗(限

7、定题目,3.2 PubMed主题词检索(MeSH）,3.2 PubMed主题词检索(MeSH）,什么是主题词(MeSH词)?,主题词是经人工规范化处理的最能表达文章主题概念的语词。所谓规范化处理，就是在文献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控制和规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。 主题词 关键词 Neoplasms neoplasm、tumors、tumor、cancer Aspirin aspirin、acetylsalicylic acid、 micristin、 solprin,什么是主题词(MeSH词)?主题词是经人工规范化处理的最能表,Medica

8、l Subject Headings, MeSH,字顺表(2万多个医学词汇) 如:aspirin,hepatitis,asthma等 树状结构表（分类表） 16大类副主题词表（80多个副主题词）,Medical Subject Headings, M,MeSH字顺表,MeSH字顺表,MeSH树状结构(Tree Structures),MeSH树状结构(Tree Structures),MeSH副主题词表(Subheadings),Abnormalities、Administration & Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy & Histology、

9、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.,MeSH副主题词表(Subheadings)Abnormal,MeSH的标引和检索,MeSH应用 PubMed（Medl

10、ine） 中国生物医学文献数据库(CBMdisc) 医学搜索引擎标引人员根据文章的内容，给出多个MeSH词，以确切描述一篇文章内容的重点。检索人员根据检索需求，选择相关MeSH词进行检索。,MeSH的标引和检索MeSH应用,例:肝癌的手术治疗,例:肝癌的手术治疗,例:肝癌的手术治疗,例:肝癌的手术治疗,PubMed使用详解课件,PubMed使用详解课件,PubMed使用详解课件,MeSH词检索的特点,不必考虑自由词的各种变化形式，提高检索效率。可以很容易地检索宽广的概念，提高查全率；MeSH词一般都反映了记录较为重要的内容，具有较高的检准率；可以选用相关的副主题词进行组配，对检索进行限定。,M

11、eSH词检索的特点不必考虑自由词的各种变化形式，提高检索效,举例:消化系统疾病的CT诊断,扩展主要主题,举例:消化系统疾病的CT诊断扩展,3.3 PubMed的智能检索,3.3 PubMed的智能检索,词语自动匹配，优化检索策略,自由词和MeSH词联合,词语自动匹配，优化检索策略自由词和MeSH词联合,PubMed智能检索原理,对于输入检索框中的非限定检索词，系统将依次到MeSH词转换表、刊名转换表、短语表以及作者索引表中进行词语匹配查找。检索词加入有些限定（如字段限止, 引号等），自动匹配检索功能关闭。 例： heart diseaseti“liver cancer”,PubMed智能检索原

12、理对于输入检索框中的非限定检索词，系统,自动匹配检索功能关闭,自动匹配检索功能关闭,4. PubMed检索结果处理,Display(显示)Send to(输出),4. PubMed检索结果处理Display(显示),Display(检索结果显示),Display(检索结果显示),Send to(检索结果输出),Send to(检索结果输出),Clipboard,剪贴板可集中存放一次或多次检索结果当中的选定记录，方便用户集中打印、下载文献。剪贴板中可存的最多记录为500条，如果八小时内无作何操作，记录将自动消失。,Clipboard剪贴板可集中存放一次或多次检索结果当中的选,5. PubMed链

13、接,Related ArticlesFull Text,5. PubMed链接Related Articles,Related Articles(相关文献链接),Related Articles(相关文献链接),Full Text(全文链接),网上免费资源 或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文,Full Text(全文链接)网上免费资源 或者自己的图书馆,6. My NCBI(个性化功能),6. My NCBI(个性化功能),6. My NCBI(个性化功能),6. My NCBI(个性化功能),6. My NCBIMy Saved Data,6. My NCBIMy Save

14、d Data,6. My NCBI Save Search,6. My NCBI Save Search,6. My NCBI Save Search,Email发送新文献跟踪专题最新文献,6. My NCBI Save SearchEmail发,通过My NCBI查看新文献,通过My NCBI查看新文献,6. My NCBISearch Filters,6. My NCBISearch Filters,6. My NCBISearch Filters,6. My NCBISearch Filters,PubMed使用详解课件,6. My NCBIPreferences,6. My NCBIP

15、references,7. 其他辅助工具,7. 其他辅助工具,7.1 Journal Database,可以从期刊的名称(全称或缩写)、ISSN号、刊名中的任意词来查找期刊信息。,7.1 Journal Database可以从期刊的名称(,PubMed使用详解课件,专为临床医生设计的查找有关某一疾病的治疗、诊断、病因、预后等与临床密切相关问题的文献。,7.2 Clinical Queries,检索系统评价(循证医学证据),专为临床医生设计的查找有关某一疾病的治疗、诊断、病因、预后等,7.3 Citation Matcher 引文匹配器,引文匹配器可通过已知的刊名、日期、卷、期、论文首页码、作者

16、名等任一项信息查找论文的详细信息。 经常用于核对参考文献,7.3 Citation Matcher 引文匹配器引文匹配,查找引文信息,1、Gene Therapy, 1999, and the title words, mitochondrial gene therapy. 2、Arthritis Rheum, 1982, page 1271 3、V. Lee, Biochemical Pharmacology, vol. 29, issue 14 4、A powder formulation of measles vaccine for aerosol delivery,查找引文信息 1、G

17、ene Therapy, 1999, a,PubMed使用详解课件,PubMed使用详解课件,Tutorial和Help,Tutorial和Help,PubMed使用详解课件,PubMed使用详解课件,小结Pubmed特点,免费(Internet用户)全科文献数据库，5000多种期刊(主流期刊)数据更新及时（每日更新）界面动态更新词汇自动转换功能（智能检索）广泛的链接功能（NCBI数据库和整个互联网）个性化功能(My NCBI),小结Pubmed特点免费(Internet用户),Thanks!,Thanks!,此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！感谢您的支持，我们努力做得更好！谢谢,此课件下载可自行编辑修改，仅供参考！感谢您的支持，我们努力,