细菌的分类命名.ppt
第七章 细菌的分类与命名,微生物分类鉴定目的,分类是人类认识微生物，进而利用和改造微生物的一种手段，微生物工作者只有在掌握了分类学知识的基础上，才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用微生物资源提供依据,第一节 微 生 物 分 类 学,微生物分类学(Taxonomy)是一门按微生物类群的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（Taxon）的科学 分类学的任务 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称 鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。,一、微生物的分类单位,界（Kingdom）门（Phylum or Division）纲（Class）目（Order）科（Family）属（Genus）种（Species）种是最基本的分类单位。但分类单元之间科加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等,微生物种与亚种的概念,种(Species)凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（Species），即是以某个“典型菌株”为代表、十分类似的菌株的总称。1987年，国际细菌分类委员会颁布，DNA同源 70%，而且其Tm5oC的菌群为一个种 亚种（Subspecies)在种内，有些菌株在遗传学上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分成2个或2个以上的分类单位，即为亚种,微生物亚种以下的变型分类,亚种以下 生物变型表示特殊的生化或生理特征 血清变型表示抗原结构不同 致病变型表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型表示对噬菌体的特异性反应 形态变型表示特殊的形态特征,微 生 物 的 菌 株,菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以数字、字母、人命或地名等表示 分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的后代即为分离物 群(Group)为工作方便而将近似的种或介于种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归为1,二、微 生 物 的 命 名,微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创立的“双名法”每一种微生物都用属与种命名，由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。属名和种名用斜体表达 属名在前，用拉丁名词表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大写 种名在后，第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，附上命名者的姓和命名年份,第二节 原核微生物分类系统,一、原核微生物伯杰氏分类系统 伯杰氏细菌鉴定手册 伯杰氏系统细菌学手册,细 菌 分 类 系 统,最有代表性和最有影响的细菌分类系统 伯杰氏细菌鉴定手册（Bergeys Manual of DeterminativeBacteriology)1923年,1925年,1930年,1934年,1939年,1948年,1957年,1974年分别出版了第一至第八版，1994年出了第九版 以形态、生理生化、G+C mol%、生态分布等特征为主,微生物的分类技术水平,微生物分类中使用的技术水平 细胞形态水平 细胞组分水平 蛋白质水平 基因组水平,伯杰氏系统细菌学手册,Bergeys Manual of Systematic Bacteriology)second edition 2001 以生理生化、G+C mol%、系统发育地位等为主体现了现代分子生物学的研究成果 尚未出齐,细菌的分类一、细菌在生物中分类地位目前公认“四界分类系统”动物界 植物界 原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、生物 原生生物界 霉形体、立克次氏体、衣原体 真核生物：真菌、藻类、原虫 病毒界：病毒,二、细菌分类的特征1形态学特性：形状、大小，排列、结构、染色特性，有无细胞壁2培养特性：培养基上的表现，菌落特征3生活方式：自主生活，共生，寄生4生理生化特征：化学组成，营养类型，营养需要，繁殖方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。5抗原构造：O、K、H6对噬菌体的敏感性7对抗生素及其他化学物质的敏感性8病原性,9遗传学特征转化和转导试验。与细菌之间亲缘关系密切相关，发生在亲缘关系相近的细菌种类G+C%。G+C含量对一个种一般是恒定的，但G+C相同并不一定是同一种。DNA-DNA杂合试验。将待检菌的DNA变性，其双链解为单链，而后与标记的参考菌株单链DNA或rRNA杂交，形成杂交DNA-DNA或DNA-rRNA，两种细菌DNA中共同的核苷酸序列愈多，杂交互补区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关系就愈近。,第三节 细菌的命名采用林奈氏双名法：1将一个细菌定一个学名，用属名和种名表示，属名在前，用拉丁文或拉丁化的名词表示，且第一个字母要大写，种名在后，用拉丁文或拉丁化的形容词或名词所有格表示，第一个字母小写。中文译名与此相反，种名在前，属名在后。2在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。,3转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，再在括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。Salmonella choleraesuis(Smith)Weldin,1927沙氏菌 猪霍乱（猪）(原命名人)(新命名人)年代（属名）（种名）翻译：猪霍乱沙门氏菌。,
