《医学遗传专题》PPT课件.ppt
第十四章 医学遗传学专题,医学细胞生物学和遗传学,普通高等教育国家级“十一五”规划教材,科学出版社卫生职业教育出版分社,科学出版社卫生职业教育出版分社,第一节肿瘤遗传学,肿瘤泛指由一群生长失去正常调控的细胞形成的新生物(neoplasm)。肿瘤细胞是一个累积了不同基因突变的体细胞。(这些突变共同导致了细胞增殖的失控,结果形成大量细胞的集合肿瘤)肿瘤遗传学是研究肿瘤与遗传关系以及肿瘤发病的遗传机理的一门学科。,科学出版社卫生职业教育出版分社,一、肿瘤的遗传基础,流行病学调查研究发现,环境因素对肿瘤的发生有重要的影响。环境因素只有改变遗传物质的结构或功能才能使正常细胞转变为癌细胞。从遗传基础来看,有单基因遗传的肿瘤、多基因遗传的肿瘤和染色体畸变引起的肿瘤。,科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)单基因遗传的肿瘤,在人类的全部肿瘤中,有一部分较少见的恶性肿瘤是按孟德尔方式遗传的,即为单基因遗传的肿瘤,遗传方式通常为常染色体显性遗传。这些恶性肿瘤在临床上可分为遗传型和非遗传型两类。,常见的遗传性肿瘤及其相关基因,科学出版社卫生职业教育出版分社,视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,RB),发病情况:是儿童中较多见的一种眼内恶性肿瘤,呈常染色体显性遗传,多见于幼儿,多数在4岁以前发病发病率约为1/21 0001/10 000,70%在2岁前确诊。临床症状:早期猫眼;后期失明。基因定位:13q14.1-q14.2。可分为遗传型和非遗传型。,科学出版社卫生职业教育出版分社,7,患儿最初瞳孔呈黄白色(黑朦猫眼),视力消失,发展可引起青光眼、眼球突出;肿瘤可蔓延至脑或随血液转移而致死。,科学出版社卫生职业教育出版分社,10,(二)多基因遗传的肿瘤,许多肿瘤有明显的家族聚集现象。如家族性癌(familial carcinoma)是指在一个家族内多个成员患同一类型的癌。如结肠癌病人12%15%有家族史。属多基因遗传的肿瘤大多是一些常见的恶性肿瘤。患者一级亲属发生同一种癌者比一般人群高3倍以上,出现明显的家族聚集现象,说明这些都是由多基因控制的肿瘤。,科学出版社卫生职业教育出版分社,11,3.胃癌 胃癌在我国占全部肿瘤死亡人数的1/4左右。患者亲属中胃癌的发病率较对照人群高24 倍,有明显家族倾向者占10%,单卵双生较双卵双生有较高的患癌一致性,也提示胃癌可能为多基因遗传。,1.乳腺癌 遗传型者多为闭经前型,患者常有良性乳腺病。患者一级亲属中的发病率为6.7%,而对照的一般人群女性乳腺癌的发病率为2.3%;如先证者是绝经前发病,并且是两侧发生,则一般亲属中的发病率为17%。,2.肺癌 吸烟是肺癌的祸首,但也与遗传有关。患者一级亲属发生肺癌危险率在不吸烟亲属中比一般人群增加4倍,而在吸烟的亲属中增加14倍。,科学出版社卫生职业教育出版分社,12,食管癌的遗传度为67.4%71.8%,大大超过60%,说明遗传因素起重要作用。以上说明在高发区人群中存在着食管癌遗传易感性的个体,也表明食管癌属多基因遗传。,4.食管癌 食管癌占所有癌瘤的5%以上。食管癌的发生与环境致癌因素有密切关系。但国内曾报道在高发区均存在有食管癌高发家族及易感性。,据河南林县普查935名食管癌患者,64.1%有家族史,这些家族从高发区迁入低发区,甚至在二代、三代后其食管癌发生率仍高于当地居民;山西阳城食管癌患者集中在全县8.19%的家族中,其中42%家族有多例患者。,科学出版社卫生职业教育出版分社,科学出版社卫生职业教育出版分社,(三)染色体异常与肿瘤,研究发现,染色体异常几乎在所有人类恶性肿瘤细胞中都可观察到,而在某些染色体病患者中,也可看到某些肿瘤的发生率要比一般人群高。肿瘤细胞中染色体异常,既可能是数目异常也可能是结构异常。,正常组织 众数细胞百分比:98%-100%恶性肿瘤.:20%-30%,1、肿瘤的染色体数目异常,科学出版社卫生职业教育出版分社,1、肿瘤的染色体数目异常,特 点:(1)肿瘤细胞的染色体数目变化大多是非整倍体变异;亚二倍体 超二倍体 亚三倍体 亚四倍体(2)实体瘤:染色体数目多为三倍体左右;(3)肿瘤细胞染色体的变化不是随机的;8、9、12、21 染色体增多 7、22、Y染色体减少(4)肿瘤组织中非整倍体细胞的比例与肿瘤的恶化程度、转移风险、治疗效果、复发率有相关性。,科学出版社卫生职业教育出版分社,标记染色体(marker chromosome):染色体断裂、重排 形成的某种结构异常的染色体。,特异性标志染色体:经常出现在同一种肿瘤内的标志染色 体,对该肿瘤具有代表性。,非特异性标志染色体:同一染色体异常出现在不同类型的 肿瘤内或同一肿瘤出现不同的染色体异常。,特异性标志染色体:,费城染色体,14q+染色体,2、肿瘤的染色体结构异常,科学出版社卫生职业教育出版分社,1960年,在美国费城的慢性粒细胞白血病患者骨髓和外周血淋巴细胞中,发现一个很小的近端着丝粒染色体,小于G组染色体,被称为Ph染色体。,3、费城染色体(Philadelphia chromosome,Ph),科学出版社卫生职业教育出版分社,t(9;22)(q34;q11.2)9q+和 22q-(Ph)(95%),科学出版社卫生职业教育出版分社,(1)作为慢性粒细胞白血病的鉴别诊断依据;(2)用于慢性粒细胞白血病早期诊断依据;(3)可作为慢性粒细胞白血病愈后判断依据。,Ph 染色体的临床意义:,科学出版社卫生职业教育出版分社,90%长臂增长的14号染色体(14q+)原因:der(14)t(8;14)(q24;q32)易位 形成8q-和14q+染色体;同时伴有15号染色体的长臂末端缺 del(15)(q13q15),4、Burkitt淋巴瘤(Burkitt Lymphoma),科学出版社卫生职业教育出版分社,肿瘤中其他特异性标记染色体,科学出版社卫生职业教育出版分社,科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)癌基因,二、癌基因与抑癌基因,癌基因又名转化基因,通常是指能够使细胞发生癌变的DNA片段,是由原癌基因突变而来的。原癌基因是人类细胞、其他动物细胞及致癌病毒中固有的一类基因,在细胞增殖、分化和胚胎发育中具有重要的功能,在进化上高度保守。通常情况下处于不表达或低表达水平,本身并无致癌作用,但这些基因具有转化的潜能,可被激活成为癌基因,并诱导易感细胞出现肿瘤表型。,癌基因的发现与识别,1910年,Rous发现鸡肉瘤病毒(RSV),提示病毒中存 在着病毒癌基因(v-oncogene),1970年,Martin分析野生型和变异株RSV病毒基因,证 实其基因组中src病毒癌基因的存在。,20世纪初,患白血病家禽细胞提取物注入正常家禽体内可 引发白血病,提示肿瘤细胞中含有病毒。,1969年,Huebner&Hodaro提出癌基因假说,提示所有 细胞中都含有致癌基因。,科学出版社卫生职业教育出版分社,80年代初,Weinberg 等几个实验室通过转染实验证明人 体细胞中的原癌基因之一H-ras的存在。,1975年,Evarmus&Bishop证明正常细胞中存在与v-src 同源序列,称原癌基因(pro-oncogene)或细 胞癌基因(c-oncogene),1971年,Duesberg分析野生型和变异株RSV病毒基因 组,提示src基因在基因组RNA的3端,且与生 长和增殖无关。,科学出版社卫生职业教育出版分社,通过转染实验证明人体细胞中的癌基因H-ras。,科学出版社卫生职业教育出版分社,正常细胞内存在细胞癌基因,病毒通过转导作用从正常细胞中复制细胞癌基因,并纳入病毒基因组中,使其转变为使靶细胞发生恶性转化的病毒癌基因。,序列上高度同源 c-onc有内含子,v-onc无内含子 v-onc有致癌能力,而c-onc无,但突变后可能致癌,科学出版社卫生职业教育出版分社,癌基因特点:,1.广泛存在于生物界中,从酵母到人的细胞普遍存在。2.在进化过程中,基因序列高度保守。3.它们存在对维持细胞正常生理功能、调控细胞生长、增殖和分化起重要作用。4.在机体生长发育过程完成后多处于关闭状态,即不表 达或低表达。5.在某些因素(逆转录病毒、射线、化学诱变剂等)作 用下,发生数量上或结构上的变化时,一旦被激活,就会转变为癌基因,使细胞癌变。,科学出版社卫生职业教育出版分社,(二)、原癌基因的功能和分类,1.生长因子 通过与特异的细胞膜受体结合,刺激细胞生长活性等多效应的多肽类物质。sis家族=人血小板源生长因子 间叶组织细胞分裂生殖 2.生长因子受体 具有酪氨酶激酶活性,与生长因子结合可启动细胞核内的有关基因,从而促进细胞分裂增殖。src家族,表皮生长因子受体,依其编码产物功能及生化特性的不同分类:,科学出版社卫生职业教育出版分社,4.核转录因子 调控目的基因或基因家族表达的核蛋白,是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。c-myc myb fos jun 5.细胞凋亡调控因子 调节正常细胞增殖与程序性死亡之间平衡的因子。bcl-2,3.信号转导因子 一系列胞内信息传递体系,将接受到的生长信号由胞内传至核内,促进细胞生长。ras家族,(二)、原癌基因的功能和分类,科学出版社卫生职业教育出版分社,肿瘤抑制基因(tumor suppressor gene,TSG):正常细胞 中存在的一类具有抑制肿瘤发生基因。,抑癌基因与原癌基因区别:原癌基因是显性基因,一个等位基因突变即可显示致癌效应;抑癌基因是隐性基因,一个抑癌等位基因发生突变,不会发生致癌效应。即只有当一对等位基因突变形成隐性纯合,才丧失功能,失去抑制肿瘤发生的作用,故亦称隐性癌基因。,(三)、抑癌基因,科学出版社卫生职业教育出版分社,体细胞杂交实验,证实:特定的正常染色体可抑制各种癌细胞的致瘤性生长。推测:在正常细胞中可能存在另一种抑制肿瘤的基因。,肿瘤抑制基因的发现,克隆第一个TSG RB,1976年,Francke 检测多个视网膜母细胞瘤(RB)患者 Chr缺失情况,最后确定于13q14,1985年,Cavanee 证明在RB肿瘤细胞中存在13q14的杂合性丢失,且丢失的是正常等位基因。,杂合性丢失:肿瘤细胞中杂合性等位基因中的一个丢失的现象。,科学出版社卫生职业教育出版分社,1983年,Cavanee 用13q12-q14片段为探针,经杂交实验确 证存在此区域存在一个4.7kb的基因,1986年,Friend 首先分离一cDNA 克隆;Lee WH进行了RB基因测序。1988年,Su Huang HJ用反转录酶为载体将RB基因导入 RB细胞系,基因表达并抑制肿瘤特征,证实RB 是一个肿瘤抑制基因。,克隆第一个TSG RB,科学出版社卫生职业教育出版分社,视网膜母细胞瘤基因(retinoblastoma gene,RB),部分重要的肿瘤抑制基因,科学出版社卫生职业教育出版分社,Rb与细胞周期:,G1,S,G2,M,Cyclin/cdk,磷酸化,P16、P21、P27等,Rb及其产物在细胞周期的G1期发挥调控,Rb蛋白质是细胞周期G1/S期的调节因子,起DNA复制阻断的作用,它能与转录因子E2F结合,抑制DNA复制。Rb的突变使其蛋白质失活,E2F被释放,诱导DNA不断复制,使细胞无休止地分裂。,科学出版社卫生职业教育出版分社,p53 基因,393,17,50的肿瘤细胞中,可以检测到p53发生了突变 与RB作用相似,亦为隐性纯合性致癌,部分重要的肿瘤抑制基因,P53与细胞周期,参与:细胞周期调控DNA修复细胞凋亡,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、肿瘤的发生机制,(一)、原癌基因恶性激活理论正常的原癌基因受不同的因素影响后可发生突变,成为导致细胞恶性转化的癌基因。这种变化,就称为原癌基因的激活,亦称为恶变性激活。原癌基因被活化成为癌基因后便大量地转录,或者发生突变后便转录出异常的产物,这两种情况都会导致细胞癌变。,42,1.基因插入(gene insertion),20世纪80年代初,有人提出了启动子插入模型(promoter insertion model),他们认为人和其它脊椎动物正常细胞存在着原癌基因,但无活性,不能表达为癌。原癌基因附近插入了病毒或其它基因启动子而被激活从而表达。激活的癌基因虽无质的变化,但由于产生过量的与肿瘤形成有关的蛋白质可导致细胞的恶性转化,这种激活方式称为量变模型(quantitative model),也称为“遗传物质易位激活模型”。,科学出版社卫生职业教育出版分社,43,Burkitts lymphoma,如Burkitt淋巴瘤的t(8;14),即c-myc瘤基因由8号染色体易位到14号的Ig重链基因附近。,易位使c-myc置于免疫球蛋白H链基因的启动子控制之下,由于Ig基因是一个十分活跃的基因,其启动子特别活跃,因而易位的c-myc基因转录活性明显增高。,增多的myc蛋白质使一些控制生长的基因活化,导致细胞恶化。,科学出版社卫生职业教育出版分社,44,在肿瘤细胞中有时会见到中期染色体的匀染区(homogeneous strain region,HSR)和非常小的成双的无着丝粒染色体,后者称为双微体(doublet minutes),这是扩增的基因在细胞水平上的表现。例如在某些肿瘤细胞中c-myc癌基因可扩增数百至数千倍。,大多数正常细胞中的原癌基因只有12个拷贝,基因扩增将原癌基因扩增几十倍甚至几百倍,基因的扩增无疑会产生一种量变结果。,2.基因扩增(gene amplification),科学出版社卫生职业教育出版分社,45,人类恶性肿瘤中癌基因的扩增,科学出版社卫生职业教育出版分社,46,Chronic myelogenous leukemia-Philadelphia Ch.,不少恶性肿瘤出现染色体易位。导致原癌基因位置重排或融合,产生异常的蛋白而使细胞转化。,如CML的9/22易位,形成了一种结构和功能异常的bcr-abl融合基因,结果无害的原癌基因就会被激活而成为癌基因,其编码的蛋白质能促成细胞的恶性转化。,3.基因重组(gene recombination),科学出版社卫生职业教育出版分社,(二)、肿瘤的单克隆起源假说,肿瘤是由单个突变细胞增殖的后代,即为突变细胞的单克隆增殖细胞群。,科学出版社卫生职业教育出版分社,肿瘤克隆特性例证:,1.Burkitt淋巴瘤中的所有淋巴瘤细胞都发生相同的染色体重排。,t(8;14)(q24;q32)、t(2;8)(p12;q24)、t(8;22)(p24;p11),q32,8 2,(二)、肿瘤的单克隆起源假说,科学出版社卫生职业教育出版分社,肿瘤克隆特性例证:,X连锁基因:葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因G6PD活性染色体鉴定,2.女性恶性肿瘤,所有肿瘤细胞都含有相同失活的X染色体。,(二)、肿瘤的单克隆起源假说,科学出版社卫生职业教育出版分社,1971年,Knudson提出二次突变学说(two hits theory),用来解释肿瘤发生中遗传因素的作用方式。,(三)、肿瘤的二次突变学说,1.遗传性病例中,第一次突变发生于生殖细胞或由父母遗传而来,结果患儿出生时每一个细胞均带有一个突变,成为突变的杂合子;2.在此基础上,若在出生后体细胞发生第二次突变,两次突变累加,即可完成始动(initiation),而从良性细胞变成恶性细胞。,二次突变学说:,科学出版社卫生职业教育出版分社,3.恶性细胞在一定条件下,形成增殖优势,即可完成促进阶段,形成恶性细胞克隆。4.在非遗传性病例中,两次突变都是体细胞突变,而且必须在同一个体细胞中两次发生独立才能完成始动的过程。这种机会比较少,需要经过漫长过程的积累。,(三)、肿瘤的二次突变学说,科学出版社卫生职业教育出版分社,(三)、肿瘤的二次突变学说,科学出版社卫生职业教育出版分社,肿瘤的发生过程中,涉及多个基因的联合作用,每个基因的改变只完成其中的一个步骤。,(四)、肿瘤发生的多步骤损伤学说,科学出版社卫生职业教育出版分社,结肠癌形成模式图,APC-结肠癌基因 原癌基因DCC-结肠癌缺失的基因,抑癌基因,(四)、肿瘤发生的多步骤损伤学说,科学出版社卫生职业教育出版分社,多步骤损伤学说(multistep lesion theory):1.细胞癌变往往需要多个肿瘤相关基因的协调作用,经过多个阶段的演变,不同阶段涉及不同肿瘤相关基因 的激活与失活。2.基因的失活在时间上有先后顺序,在空间位置上也有一定的配合,这些基因共同作用,最终形成肿瘤的表型。,转录水平的改变:启动子插入 DNA扩增,转录产物结构的改变:基因突变 基因融合,癌基因活化形式,(四)、肿瘤发生的多步骤损伤学说,科学出版社卫生职业教育出版分社,引言:为什么要进行药物遗传学的研究?,病人为什么对于异烟肼具有不同的反应?,异烟肼是治疗结核病最重要的药物之一。此药吸收迅速,在体内失活后排出。有些病人排出很快,有些病人排出很慢,分别称为快失活者和慢失活者。,科学出版社卫生职业教育出版分社,第二节药物与遗传,药物反应个体差异性的原因?,对同一剂量的同种药物,不同个体表现出不同的反应称个体对药物的特应性。特应性的产生主要取决于个体的遗传背景。,遗传因素和环境因素共同导致了药物反应的个体差异。,科学出版社卫生职业教育出版分社,Archibald E.Garrod 1858-1936英国牛津大学医学教授加洛德,第一个研究基因如何影响表型的科学家 大约一百年前,他首次注意到代谢障碍与基因突变之间存在着确定的关系,基因缺陷是某些疾病的原因 他认为每一种化合物都是一种毒药,一种对大多数人都安全的药物剂量可能对少数人却是一种毒药 奠定了遗传变异是发生ADR的基础,1931年指出,个体对药物反应的差异是遗传结构的差异所致,科学出版社卫生职业教育出版分社,1959年,Vogel提出了药物遗传学概念,指出药物代谢与酶和受体的遗传学关系。,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物遗传学(pharmcogenetics):是药理学与遗传学相结合发展起来的边缘学科,属于生化遗传学范畴。研究由于遗传背景的不同导致其对药物反应差异的学科称为药物遗传学。,研究群体间遗传变异所导致的药物反应的差异。,研究与药物副作用相关的基因及其表达。,了解个体遗传组成如何决定药物在其体内的功效及 其副作用。,为不同的民族的所有个体建立有效的个体化治疗。,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物代谢的一般途径:摄入、吸收、分布、转化、排泄,在药物代谢过程中,每一步反应都受到特定的酶、受体或蛋白质的作用和影响。而蛋白质的结构和表达又是由基因控制的,一旦基因发生变异,就会影响蛋白质的结构和表达量,从而影响药物的代谢,最终产生药物的反应异常。,一、药物代谢的遗传控制,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物的代谢过程(Pharmacokinetics),药物 膜蛋白转运吸收 与血清蛋白结合运输与靶细胞(受体)相互结合 一系列酶促反应生物转化(降解、解毒-)排泄,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物代谢差异的个体分布,研究一种药物的代谢及其效应,通常给予一份标准剂量,经适当时间间隔后测定血液中药物水平或其他表示药物代谢速率的参数。,科学出版社卫生职业教育出版分社,1、异烟肼(isoniazid,INH)快失活者和慢失活者,异烟肼是治疗结核病最重要的药物之一。快失活按常染色体显性性状传递;慢失活者为隐性基因纯合子,杂合子的失活速度居中。涉及的酶为肝中的乙酰转移酶。,二、药物代谢的遗传变异,科学出版社卫生职业教育出版分社,异烟酸+乙酰肼,对肝脏有毒害,可以产生肝坏死。,在体内与VB6 发生反应,使V B6 失活,导致VB6 缺乏引起神经损害(多神经炎),异烟肼的体内灭活,科学出版社卫生职业教育出版分社,2.N-乙酰基转移酶,NAT2,分布在肝上;NAT1,分布在红细胞,基因定位:8p23.1-21.3,AD遗传 AA快失活者,Aa中失活者;aa慢失活者。15种突变类型。,快灭活:半衰期45110分钟;肝内乙酰基转移酶的活性高。慢灭活:半衰期24.5小时;肝内乙酰基转移酶的活性较低。,欧美人群50%为慢失活者;东方人20%,科学出版社卫生职业教育出版分社,3.无过氧化氢酶症,1959年由Takahara首次报道,患者缺乏过氧化氢酶,不能分解过氧化氢,伤口渗出的血被氧化成棕黑色的高铁血红蛋白。,本症为常染色体隐性遗传,过氧化氢酶基因位于11p13。我国此症发病率1以下:华北0.65,华中为0.55%,华南为0.23%,台湾为0.29%。,科学出版社卫生职业教育出版分社,4.伯氨喹啉敏感,症状:服药(伯氨喹啉)头几天并无反应,随后尿液变为暗黑色,出现黄疸;红细胞计数和血红蛋白浓度下降。受累者在进食蚕豆或蚕豆制品时亦可引发溶血现象,故又称蚕豆病。,病因:患者缺乏葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PD)。G-6-PD涉及到红细胞酵解过程中的旁路代谢,借以维持红细胞还原型谷胱甘肽的浓度,只是维持红细胞稳定所必需的。,科学出版社卫生职业教育出版分社,红细胞 G,维持红细胞稳定,具体的生化过程,科学出版社卫生职业教育出版分社,G6PD基因(Xq28):X连锁不完全显性,女性杂合子具不同的临床表现度:酶活性2070%X染色体随机失活,或,女性杂合子酶活性约70%,女性杂合子酶活性约30%,科学出版社卫生职业教育出版分社,G6PD缺乏症的系谱,11,3,7,6,4,5,10,12,8,13,1,1,2,6,3,4,2,1,5,10,11,12,13,14,?,9,有蚕豆史,科学出版社卫生职业教育出版分社,G6PD变异型分类,类:酶活性严重缺乏(活性10%),伴有非代偿性慢性溶血 特点:无诱因,反复出现慢性溶血,类:酶活性中度或显著缺乏(活性60%),表现代偿性溶血性贫血 特点:在诱因作用(伯氨喹啉、磺胺类药物或进食蚕豆)下,才诱发急性溶血,类:酶活性轻度降低或升高(活性60150%,或150%)表型基本正常,科学出版社卫生职业教育出版分社,抗疟药:伯氨喹啉、扑疟母星、氯喹磺胺类:磺胺、乙酰磺胺、磺胺吡啶、TMP-SMZ 等砜类药:氨苯砜、普洛明止痛药:阿司匹林、非拉西丁杀虫药:萘酚、锑波酚、来锐达唑(nitridazole)抗菌药:硝基呋喃类、氯霉素、对氨水杨酸其 他:蚕豆、丙磺舒、bal、大量的 Vk 等,G6PD 缺乏症患者禁用的药物,科学出版社卫生职业教育出版分社,本病呈现世界性分布,但是比较集中于热带及亚热带。据估计全球患者达2亿人以上。我国主要分布在黄河流域以南各省,尤其是以广东、广西、海南、贵州、云南、四川的发生率较高。,G6PD 缺乏症的分布,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、药物基因组学,1997年药物基因组学诞生,是以药物效应安全性为目标,研究多种基因变异与药效及安全性之间的关系。,药物的总的药理作用是由多基因控制的,药物代谢途径中的一系列蛋白和酶的基因都会对药物的作用产生影响。,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物基因组学(Pharmacogenomics):从基因水平揭示这些差异的遗传特征,鉴别基因序列中的差异,在基因水平研究药效的差异,并以药物效应及安全性为目标,研究各种基因突变与药效及安全性之间的关系。,药物遗传多态性:药物代谢酶的多态性 药物受体的多态性 药物靶标的多态性,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物基因组学的研究方法,候选基因研究,1:根据药物代谢途径或者疾病病理机制确定一组候选基因2:候选基因的SNP位点是否与病人对药物的反应差异相关,科学出版社卫生职业教育出版分社,全基因组连锁不平衡分析 全基因组连锁不平衡作图就是利用LD(Linkage disequilibrium,LD)作用进行随机SNPs的全基因组分析。它依赖于LD或临近SNPs的随机关联,这就需要鉴定成百上千的匿名SNPs并将其定位于已作图的基因组。LD指的是不同遗传标记见存在着的非随机组合。我们可以利用疾病相关基因位点和某些SNPs间存在着不同程度的连锁不平衡,计算疾病相关位点临近SNPs间的相互关联,从而对治病基因进行初步定位。,药物基因组学研究进展,1.药物代谢酶的遗传变异2.药物转运体的基因多态性3.药物靶分子的遗传变异,科学出版社卫生职业教育出版分社,药物遗传学与药物基因组学的应用,(一)合理和安全用药(二)指导新药研发,科学出版社卫生职业教育出版分社,科学出版社卫生职业教育出版分社,第三节 线粒体遗传病,线粒体是真核细胞的氧化中心和动力工厂。同时,线粒体有相对的独立性,含有自己的DNA和蛋白质合成系统,线粒体内的DNA称为线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)。线粒体遗传为母系遗传。1987年研究者通过mtDNA突变和Leber病之间关系的研究,明确地提出线粒体DNA突变可导致人类疾病即线粒体遗传病。,一、线粒体DNA的结构和功能特征,人mtDNA是一个长为16,569 bp的双链闭合环状分子,外环为重链(H链),富含G,内环为轻链(L链),富含C。,科学出版社卫生职业教育出版分社,mtDNA结构紧凑,没有内含子,唯一的非编码区是D环区,长约1,000 bp左右。D环区包括mtDNA重链复制起始点,轻重链转录的启动子 及4个高度保守序列和终止区。,科学出版社卫生职业教育出版分社,人类的mtDNA含37个基因,编码13条多肽链、22种tRNA和2种rRNA。13种蛋白质均是呼吸链酶复合物的亚单位。H链编码12种多肽链和14种tRNA和12srRNA和16srRNA;L链仅编码1种多肽链和8种tRNA。,科学出版社卫生职业教育出版分社,半自主性:mtDNA能够独立地复制、转录和翻译,但主要大分子复合物和大多数氧化磷酸化酶蛋白亚单位是由核DNA编码,故其功能又受核基因的影响。2.基因排列紧密:mtDNA没有内含子,排列紧密;mtDNA上基因缺少非翻译区,很多基因没有完整的终止密码,仅以T或TA结尾;具有基因重叠现象。3.遗传密码和通用密码不完全相同:在线粒体遗传密码中,有4个密码子与核基因的通用密码不同。,科学出版社卫生职业教育出版分社,一、线粒体DNA的结构和功能特征,1、母系遗传母亲将她的mtDNA传给她的所有子女,她的女儿又将其mtDNA传给下一代。,mtDNA的遗传特征,科学出版社卫生职业教育出版分社,科学出版社卫生职业教育出版分社,2、同质性与异质性 同质性(homoplasmy):同一细胞或同一组织中所有的mtDNA分子都是一致的。异质性(heteroplasmy):同一细胞或同一组织中有两种或两种以上mtDNA共存,一种为野生型,另一种为突变型。3、阈值效应 突变的mtDNA数量达到一定程度时,才引起某种组织或器官的功能异常,这称为阈值效应。能引起特定组织器官功能障碍的突变mtDNA的最少数量称阈值。,科学出版社卫生职业教育出版分社,4、突变率高,原因:mtDNA的特殊结构:缺乏组蛋白和其他DNA结合蛋白的保护;无损伤复系统;没有内含子,任何突变都可能会影响到其基因组内的某一重要功能区域。独特的复制方式:“D-环”复制形式特别易受ROS和自由基袭击。处于高度氧化性的环境:mtDNA与线粒体内膜相连,呼吸链不断产生反应性活性氧(ROS)和自由基。,科学出版社卫生职业教育出版分社,5、mtDNA可以稳定地整合到核基因组中 在特定的条件下,核DNA序列和mtDNA序列可以在细胞内游走,从而造成mtDNA对核基因组的插入。6、mtDNA在有丝分裂和减数分裂期间复制分离的瓶颈现象 线粒体数目从100000个锐减到少于100个的过程称为遗传瓶颈。如果通过遗传瓶颈留下的线粒体带有一种突变基因,会导致随后形成的组织细胞带有高比例的突变线粒体。,科学出版社卫生职业教育出版分社,mtDNA编码基因的点突变:这些突变主要与脑、脊髓及神经性疾病有关,通常为母系遗传。mtDNA的大片段缺失和重复:这类突变存在于许多神经肌肉性疾病及一些退化性疾病、肾病和肝病中,甚至衰老也与之有关。mtDNA数量的减少:见于一些致死性婴儿呼吸障碍、乳酸中毒或肌肉、肝、肾衰竭的病例。,线粒体基因组突变类型,科学出版社卫生职业教育出版分社,二、基因突变与线粒体,三、常见线粒体遗传病,广义的线粒体遗传病:指以线粒体功能异常为病因学核心的一大类疾病,包括线粒体基因组、核基因组的遗传缺陷以及二者之间的通讯缺陷。狭义线粒体遗传病:指mtDNA突变(自发或遗传)所致的线粒体功能异常。通常所指的线粒体遗传病为狭义的线粒体遗传病。根据线粒体所处的细胞不同可将mtDNA突变分为体细胞突变和生殖细胞突变。,(一)Leber遗传性视神经病Leber遗传性视神经病(LHON)是以德国眼科医师Theodor Leber的名字命名的。该病是人类发现的第一种母系遗传的疾病。本病起病为急性或亚急性眼球后神经炎,导致双侧视神经萎缩和大片中心暗点而突然丧失视力,周围视力通常无损害。,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,科学出版社卫生职业教育出版分社,现已发现mtDNA上许多位点的突变与LHON有关。约50%LHON病例存在mtDNA第11778位点的G转换成了A,使NADH脱氢酶亚单位4(ND4)蛋白质中第340位精氨酸变成了组氨酸,从而影响了线粒体能量的产生。除此之外有10多个点突变存在于该病中,他们分布于ND1、ND2、ND3、ND4、ND6、细胞色素C基因位点内。,Leber遗传性视神经病(LHON),科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)Leber遗传性视神经病(二)mtDNA突变与氨基糖甙类抗生素致聋mtDNA12SrRNA基因1555位点AG的突变与这类耳聋有关,随后国内外的一些研究证实该突变导致机体对氨基糖甙类抗生素感性升高。AAID的发生是遗传因素和环境因素共同作用的结果。耳聋基因携带者仅在接触氨基甙类抗生素后才出现听力下降。,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,(一)Leber遗传性视神经病(二)mtDNA突变与氨基糖甙类抗生素致聋(三)MELAS综合征MELAS综合征又称为线粒体肌病脑病伴乳酸中毒及中风样发作综合征。本病系母系遗传,但散发患者多见。特征性病理变化:在脑和肌肉的小动脉和毛细血管管壁中有大量形态异常的线粒体集聚。线粒体肌病脑病伴乳酸中毒及脑卒中样发作综合征临床表现:突发呕吐、乳酸中毒、肌肉组织病变、有碎红纤维。少数患者伴痴呆、周围性偏头痛、眼外肌无力或麻痹等。,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,80%MELAS病例mtDNA编码的tRNA基因3243位点有AG。,一些少见的突变还可能出现在该基因的3291、3271、3256和3252等位点。这些突变改变了tRNAleu基因的结构,并使该tRNA基因和rRNA基因下游紧密结合的转录终止子失活,因此MELAS突变可能降低转录活性并改变线粒体rRNA和mRNA转录的比例。,科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)Leber遗传性视神经病(二)mtDNA突变与氨基糖甙类抗生素致聋(三)MELAS综合征(四)MERRF综合征 又称为肌阵挛性癫痫伴碎红纤维病,是一种线粒体肌病,它除了具有破碎的肌红纤维和形态异常的线粒体外,还伴有失调的阵挛性癫痫(周期性抽搐)。本病有明显的母系遗传特点,患者的母系亲属常表现一定症状如脑电图异常、扩张性心肌病等。,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,80%90%的患者的mtDNA的tRNALys基因8344 bp AG突变;小部分病人是该基因的8356位存在TC突变。突变使tRNA结构改变,线粒体蛋白质合成受阻,产生了一系列MERRF特定的翻译产物,而几乎所有氧化磷酸化成分含量都减少。,科学出版社卫生职业教育出版分社,MERRF综合征家族成员mtDNA通常为杂质性,氧化磷酸化酶水平会随年龄的增大而迅速降低。20岁以下的个体,其mtDNA突变达95%时才会出现MERRF症状,突变85%时表型仍正常;60-70岁的人mtDNA突变在63%时就表现中度异常,突变为85%时则表现严重症状。,科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)Leber遗传性视神经病(二)mtDNA突变与氨基糖甙类抗生素致聋(三)MELAS综合征(四)MERRF综合征(五)Kearns-Sayre 综合征 Kearns-Sayre 综合征(KSS)又称为慢性进行性眼外肌麻痹。常见临床表现是进行性眼外肌麻痹和视网膜色素变性。还包括心肌传导功能异常、共济失调、耳聋、痴呆和糖尿病。,科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,KSS mtDNA的结构改变主要是大片段的缺失。缺失大多发生在重链与轻链的两个复制起始点之间。由于缺失丢掉了许多基因,尤其是tRNA基因,因此患者都有不同程度的mtDNA蛋白合成缺陷。有约三分之一的KSS患者缺失发生在4977bp区域,该缺失在ATP酶亚单位8和ND5基因存在断裂点。,科学出版社卫生职业教育出版分社,(一)Leber遗传性视神经病(二)mtDNA突变与氨基糖甙类抗生素致聋(三)MELAS综合征(四)MERRF综合征(五)Kearns-Sayre 综合征(六)非胰岛素依赖性糖尿病(NIDDM),科学出版社卫生职业教育出版分社,三、常见线粒体遗传病,已发现与糖尿病相关的20余种线粒体基因突变。常见的突变为mtDNA中tRNA基因3243bpAG的突变。伴3243bpAG突变的糖尿病患者呈不同程度的杂质性,突变的mtDNA在32%63%不等。在糖尿病人群中,有2-4%带有ND1基因中3316bpGC的点突变。,科学出版社卫生职业教育出版分社,线粒体产生自由基对线粒体的损伤,在衰老的发展过程中起促进作用。与年龄相关的线粒体4977bp缺失在脑和肌肉呈高水平聚集,多种导致线粒体病的碱基置换也随年龄增加而出现聚集,这种突变线粒体的聚集将导致与年龄相关的氧化磷酸化能力降低。此外,呼吸链能力下降随着年龄增长而增加。mtDNA突变与细胞死亡进程的调控及衰老的进程有密切关系。,线粒体基因突变与衰老,科学出版社卫生职业教育出版分社,1、mtDNA和核DNA的相互作用 线粒体的遗传自主性要受核基因一定限制,若编码这些酶的核基因 发生突变也可能导致线粒体功能障碍,产生类似线粒体遗传病的症状。2、核基因突变引起的线粒体疾病 这类疾病主要表现为线粒体功能障碍,但呈孟德尔遗传。,mtDNA-核DNA与疾病,科学出版社卫生职业教育出版分社,