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    scifinder的培训教程.ppt

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    scifinder的培训教程.ppt

    2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SciFinder是 CA网络版产品。美国化学文摘,Chemical Abstracts,简称CA,是世界最大的化学文摘库。也是目前世界上应用最广泛,最为重要的化学、化工及相关学科的检索工具。,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,收录范围与更新,收录9000余种期刊,来自47个国家和3个国际性专利组织的专利说明书、评论、技术报告、专题论文、会议录、讨论会文集等,涉及世界200多个国家和地区60多种文字的文献。到目前为止,CA已收文献量占全世界化工化学总文献量的98。网络版SciFinder更使用户可以查询到当天的最新记录,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SciFinder可检索数据库:,CAPLUSSM(2,430万条参考书目记录,摘自世界各地9000多种有影响的期刊杂志;每天更新3000条以上,始自1907年)CAS REGISTRYSM(7400万条物质记录,每天更新约7万条,每种化学物质有唯一对应的CAS注册号,始自1957年)CASREACT(800万条反应记录和403,000条文献记录,每周更新约700-1300条,始自1907年)CHEMCATS(740万条商业化学物质记录,来自655家供应商的793种目录)CHMLIST(22.8万种化合物的详细清单,来自13个国家和国际性组织,每周更新50条新记录)MEDLINE(National Library of Medicine数据库,1300万参考书目记录,来自4300多种期刊,始自1958年。每周更新4次),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SciFinder的功能,一站式的信息检索平台,可以检索全球最大的,有关生物化学,化学,化学工程,医药等化学相关学科的信息,包括来自专利,期刊的文献。查找特定化学物质的事实数据,包括理化常数,确定化学物质科学概念和特性查找化学反应,确定生产和合成化学物质的加工程序,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,客户端检索界面,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,检索主界面,开始新任务,参数设定,检索历史,任务种类,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,检索主界面,检索课题相关的反应、物质、文献,我们一般通过Explore检索,对于特定信息的检索,我们一般用Locate获取特定信息基本特性(登记号、分子式、频谱),浏览,可以让科研工作者浏览核心期刊的内容,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,一、Explore检索课题相关文献,文献检索,物质检索,反应检索,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,检索课题:获得有关阿司匹林纳米载体相关文献,存在问题:主要用于哪些方面的研究国际上哪些机构的研究处于领先水平获得和颗粒大小和形状有关的参考文献,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,确定检索语句:Nanoparticle for aspirin,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,确定检索语句:Nanoparticle for aspirin,“Closely associated with one another”表示在同一个句子当中出现,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,获取文摘,获取全文,分析/限定,所列文献中出现了Nanoparticles这样的词那是SciFinder能够自动识别同义词,近义词,缩写,并有截词,断词等功能,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,系统分类,分析,限定,分析与限定功能,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,一共11种分析手段,分析工具提供11种分析方法,包括索引词,作者名,机构名,文献类型,期刊名称,出版年限等。在这些分析工具中,索引词(Index Term):可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解学科分析(CA Section Title):可以帮助我们对文献进行学科分类,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,一共7种限定手段,限定工具提供7种限定方法,包括主题词,作者名,机构名,文献类型等。在这些限定工具中,主题词(Research Topics):可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献文献类型(Document Type):可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,答问题1:主要用于制药和药理方面的研究其他:高分子化学合成、生物化学,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,分析工具-组织机构名分析,答问题2:国际上主要的研究单位,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择一级分类,限定研究方面,二级目录,点击感兴趣的二级分类,在这里可以出现一些索引词条,系统分类工具Categorize,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择更细分类,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,答问题3:获得与颗粒大小、形状有关的文献,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,如果原文是专利,链接专利网站全文,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,文献检索小结,SciFinder 文献检索小结,向SciFinder 提一个最为广泛的问题可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来不断的修正我们 的检索思路可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵感尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用,会有更多的收益使用Categorize可以让系统来实现自动分类通过Get Related来获得更多的信息,可以实现从文献到物质,反应,引文的链接,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,二、Explore查找化学物质例:查找化学结构相关物质及反应过程,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,结构相关工具,铅笔,元素周期表,可变基团,重复基团工具,结构模版,橡皮,正电子,选择工具,原子锁定工具,碳链工具,常用基团,R基团定义工具,可变位置连接工具,多元环工具,旋转工具,负电子,环锁定工具,索套选择工具,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,用mapping tool键(原子绘图工具)标示O原子反应前后位置,用site marking tool(反应位置工具)键标示C=O键反应的位置。,用Lock out ring tool(环锁定)键锁定环,对反应作出条件限定,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,启动绘图软件,点击环状化合物快捷键,点击碳链工具,常用基团选择,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,例:查找特定物质的合成方法Get Reactions,选择产品,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择精确反应位置,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,得到反应产品,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,限定研究方面,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,一共10种分析手段,分析工具提供反应中的催化剂(Catalyst),溶剂(Solvent),反应步数(Number of steps),产率(Product Yield)等的分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,一共4种限定手段,限定工具,可以根据进一步的条件去限定反应中出现的物质(Reaction Structure),以及反应类型(Reaction Classification)等,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择反应类型,光化学类,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,经限定检索后的结果及详细内容,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,三、分子式检索输入,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,分子式输入规则(Hill)对于不含C的物质,按照字母顺序书写。对于含C物质,先C后H写在前面,其他按照字母顺序,相同元素相加。对于多组分物质,用“.”将不同的组分分开聚合物括号表示,括号外用x表示起始物,用n表示终产物区分大小写,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,四、Locate检索特定文献和化学物质等信息,如:输入名称 Betaloc,期刊、专利名称、文章标题关键词输入,文献识别号输入,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,例:Betaloc 详细信息查询,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,例:检索专利文献的CA文摘号(CAN),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,在Locate by Document Identifier中输入专利号,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,检出CA相关文献,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,例:查找特定物质的基本定义及描述,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,查找特定物质的基本定义及描述,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,例:查找左氧氟沙星相关说明,输入检索词,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,左氧氟沙星详细说明:结构式、分子式、系统化学名、其他名,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,产物反应物反应催化剂溶解剂其它,相关反应,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,产品合成路线,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,分析和限定,分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,进一步分析(历史、著者、机构等),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,机构分析选择,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,研究机构排名,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,五、Browse浏览期刊,最新一期的论文,选择过刊,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SCIFinder(web版),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,网上注册(系统发回email后,48小时内激活才可使用),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,按规定输入(观看tip),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,主界面,相关文献检索,化学物质检索,化学反应检索,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,化学物质检索(Explore Substance),马库西结构检索,分子式检索,化学物质识别号检索,化学结构检索(默认)须安装JAVA,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,修改IE设置(启用脚本),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,下载JAVA,1.安装正确的JAVA程序,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择程序处,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择windows,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择完整版的JAVA下载,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择脱机版安装程序(非常重要),2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,点击结构绘制小图,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,即可进行结构绘制,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,获取帮助文献,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,选择帮助内容,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,启动帮助演示动画,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,化学结构绘制软件,苯环模板选择,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,演示苯环绘制,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,增加碳链,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,完成结构绘制,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,执行精确检索,2023/7/8,SCIFinder拓展思路检索(详见数据库用户培训指南),包含通式结构的物质:如R1,R2,R3=任意基团(Substructure Search),对所得结果再次使用真实原子附属性分析检索只具备一定条件的结构信息:(环骨架分析,可变基团分析,R基团分析)相似结构检索:(给出相似度在60分以上的物质)某些官能团之间变化的反应某些特定物质类似物的合成路线结构中包含某些特殊结构要求的反应,2023/7/8,但是有的时候我们需要获得一些通式结构信息,查找包含以下通式结构的物质,R1,R2,R3=任意基团,2023/7/8,亚结构检索,亚结构检索,2023/7/8,得到物质的修饰信息,33246种修饰信息,2023/7/8,选择真实原子附属性分析,2023/7/8,修正结构,2023/7/8,对所得结果再次使用真实原子附属性分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,有的时候,我们对我们关心的结构只有一定的了解,不确定的信息太多我们来看我们所要找的结构:,结构中含有苯环,苯环上含有一个杂环杂环为5元环,6元环或7元环,且杂原子不能直接接在苯环上杂环上原子必须是O或者S苯环上与杂环相邻的位置接个Br苯环上某2个处于间位的C必须有1个C接卤素,但是接什么卤素不确定该2个位置之间的C必须接一个基团,该基团可以是H,OH,X,SciFinder中的结构设计,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,得到具备一定条件的结构信息,问题:存在多少种环结构X=F,Cl,Br,I 分别有多少种物质R2=H,OH,X分别有多少物质,R1=O,SR2=H,OH,X,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,环骨架分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,可变基团分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,R基团分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,相似结构检索,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,得到相似结构信息,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SciFinder 的3种结构检索包容关系,精确结构检索:得到的是物质的盐,本身,聚合物,混合物亚结构检索:画出来的结构必须存在相似结构检索:给出相似度在60分以上的物质,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,有的时候,我们对我们关心的结构只有一定的了解,不确定的信息太多我们来看我们所要找的结构:,结构中含有苯环,苯环上含有一个杂环杂环为5元环,6元环或7元环,且杂原子不能直接接在苯环上杂环上原子必须是O或者S苯环上与杂环相邻的位置接个Br苯环上某2个处于间位的C必须有1个C接卤素,但是接什么卤素不确定该2个位置之间的C必须接一个基团,该基团可以是H,OH,X,SciFinder中的结构设计,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,得到具备一定条件的结构信息,问题:存在多少种环结构X=F,Cl,Br,I 分别有多少种物质R2=H,OH,X分别有多少物质,R1=O,SR2=H,OH,X,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,环骨架分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,可变基团分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,R基团分析,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,相似结构检索,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,得到相似结构信息,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,SciFinder 的3种结构检索包容关系,精确结构检索:得到的是物质的盐,本身,聚合物,混合物亚结构检索:画出来的结构必须存在相似结构检索:给出相似度在60分以上的物质,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,官能团之间的反应,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,假如我们只想得到一步反应,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,假如我们规定反应物必须是乙酰氯,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,那么如何获得不是从乙酰氯出发的反应呢?让我们先返回初次检索到的683条反应。,2023/7/8,再按照上面的检索获得从乙酰氯出发的反应,一共16条,2023/7/8,运用Combine功能将不需要的答案集排除,2023/7/8,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,检索思路回顾,获得1步从酰卤到醛的反应,限定反应物获得反应物是乙酰氯的反应,运用Combine功能将乙酰氯是产物的反应去除,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,COMBINE-组合答案集功能,可以对于任意两个同类型的集合进行AND,OR,NOT的操作,2023/7/8,*.SFR格式保存-书签格式保存功能,将结果保存成书签,可以使用SFS再次打开,继续进行检索,也可以对同类的书签进行COMBINE操作,2023/7/8,获得某些物质的类似合成路线,想获得1步合成该物质的反应,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,亚结构反应检索,必须的条件:羟基接的C必须是CH2整个C链不允许是某个环结构的部分结构其余的3个C原子链接什么基团对反应没有影响,据此,我们修改我们的检索方式,2023/7/8,亚结构反应检索,用环锁定功能,锁定C链,保证其不成为环结构的一部分,用原子锁定功能,锁定C原子,保证C 原子上两个H不被取代,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,对反应位置和原子有特定要求的反应,O原子反应前后必须配对C=O键必须发生反应除已有的环外,不能成环,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,用mapping tool键标示O原子反应前后位置,用site marking tool键标示C=O键反应的位置。,用Lock out ring tool键锁定环,对反应作出条件限定,2023/7/8,复旦大学图书馆文献检索教研室,2023/7/8,SciFinder 反应检索小结,多用Analyze/Refine,来获得催化剂,溶剂,产率等信息如果反应只涉及基团之间的变化,用官能团反应可以获得更多的参考 信息当无法找到具体反应,或者检索结果并不满意,尝试用亚结构反应查 询,可以获得更多的参考信息,

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