artⅠRNA的转录.ppt

第7章 RNA的转录与转录后加工,Part RNA的转录,除了某些RNA病毒之外，所有RNA分子都来自于DNA。基因组DNA通过一个被称为转录的过程把贮存在双链DNA分子中的遗传信息转换到与模板DNA链相互补的RNA单链上。,在RNA聚合酶的催化下，以一段DNA链为模板合成RNA，从而将DNA所携带的遗传信息传递给RNA的过程称为转录。,RNA转录合成的特点一、转录的不对称性转录(transcription)的不对称性就是指以双链DNA中的一条链作为模板进行转录，从而将遗传信息由DNA传递给RNA。,对于不同的基因来说，其转录信息可以存在于两条不同的DNA链上。能够转录RNA的那条DNA链称为模板链,Watson（W）链(Watson strand)、负（-）链(minus strand)或反义链(antisense strand)，而与之互补的另一条DNA链称为编码链,Crick（C）链（Crick strand）、正（+）链(plus strand)，或有意义链(sense strand)。,有意义链,反意义链,5,5,3,3,5,5,转录单位,5,5,3,3,启动子,终止子,模板链，负链，反义链,正链，有义链,二、转录的连续性RNA转录合成时，以DNA作为模板，在RNA聚合酶的催化下，连续合成一段RNA链，各条RNA链之间无需再进行连接。合成的RNA中，如只含一个基因的遗传信息，称为单顺反子；如含有几个基因的遗传信息，则称为多顺反子。,三、转录的单向性RNA转录合成时，只能向一个方向进行聚合，所依赖的模板DNA链的方向为35，而RNA链的合成方向为53。,四、有特定的起始和终止位点RNA转录合成时，只能以DNA分子中的某一段作为模板，故存在特定的起始位点和特定的终止位点，特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一个转录单位，通常由转录区和有关的调节顺序构成。,RNA转录合成的条件一、底物四种核糖核苷酸，即ATP，GTP，CTP，UTP。二、模板以一段单链DNA作为模板。,三、RNA聚合酶（DNA dependent RNA polymerase,DDRP）这是一种不同于引物酶的依赖DNA的RNA聚合酶。该酶在单链DNA模板以及四种核糖核苷酸存在的条件下，不需要引物，即可从53聚合RNA。,1 原核生物RNA的转录,1.1 细菌RNA聚合酶,核心酶,亚基,coded by ropA,可能参与全酶的组装及全酶识别启动子，从而决定哪些基因可转录。亚基由ropB 基因编码，是酶的催化中心，与转录的起始和延伸有关。利福平和利笛链菌素的抑制。亚基与模板DNA结合。和亚基组成酶的活性中心，通过DNA的磷酸基团与核心酶的碱性基团间的非特异性吸附作用，核心酶能与模板DNA非特异性松驰结合。亚基的功能是识别启动子，辩认转录起始点，但不能单独与DNA模板结合，当它与核心酶结合时，可引起酶构象的改变，从而改变核心酶与DNA结合的性质，使全酶对转录起始点的亲和力比其他部位高4个数量级，在转录延长阶段，亚基与核心酶分离，仅由核心酶参与延长过程。因此，亚基实际上被认为是一种转录辅助因子，因而称为因子(factor)。,生物体在生命周期的不同阶段或在内、外环境有所变化时，其基因表达有一定的时、空顺序，以适应生长、发育及环境变化的需要。RNA聚合酶的活性是决定基因表达的重要一环。而因子是RNA聚合酶识别及结合启动子的亚基，原核生物中所有RNA的转录都由同一种RNA聚合酶催化，在生命周期的不同阶段或不同环境下，这个酶如何识别所有转录单位的启动子，是由识别启动子的因子来完成的。原核生物 RNA 聚合酶一般都含有因子，它在酶与启动子结合的过程中起着极其重要的作用：提高酶辨认启动子的能力，降低酶与 DNA 的非特异性结合，减少在单链 DNA 缺口处起始非特异性的转录，促进 DNA 开链，提高 RNA 链合成起始的速度，阻止酶分子的聚合。如热激蛋白为 32，rpoH编码，枯草杆菌(B.subtilis)为 55，被噬菌体 SP01 感染时噬菌体的早期/中期/晚期基因的因子不同(分别为 55/28/33，34)，B.subtilis 不同发育阶段基因表达亦通过因子的更替来控制噬菌体的基因时序表达。,1.2 细菌的启动子,1.2.1 启动子,启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列，它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列。,N N N N N N N N N N C G T N N N N N N N N N N N N N N,+1,-1,-2,+2,-3,+3,启动子,20-200 bp,lac 85 bp,上游序列,下游序列,1.2.1 启动子,1.2.1.1 Pribnow框，10序列,T80A95T45A60A50T96,1.2.1.2 Sextama框，-35序列,T82T84G78A65C54A45,RNA聚合酶,T82T84G78A65C54A45,N17,RNA聚合酶,T80A95T45A60A50T96,研究表明，当-10区和-35区中心位置相距16-18bp时，该启动子的功能较强；相距较近或较远时，起始转录的功能都相应减弱。,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,RNA聚合酶,一旦RNA聚合酶启动了基因转录，它就会沿着模板53方向不停地移动，合成RNA链，直到遇到终止信号时才释放新生的RNA链，并与模板DNA脱离。研究RNA链终止时遇到最常见的问题是3端核苷酸的定位，因为活细胞内部根据终止信号正确终止的RNA与一个经过剪接的RNA在3端没有两样，都是-OH基团。模板DNA上都有终止转录的特殊信号-终止子，每个基因或操纵子都有一个启动子，一个终止子。在新生RNA中出现发卡式结构会导致RNA聚合酶的暂停，破坏RNA-DNA杂合链5端的正常结构。寡聚U的存在使杂合链的3端部分出现不稳定的rUdA区域。,1.2.1 终止子,因子是一个相对分子质量为2.0105的六聚体蛋白，它能水解各种核苷三磷酸，实际上是一种NTP酶。由于催化了NTP的水解，因子能促使新生的RNA链从三元转录复合物中解离出来，从而终止转录。有人认为，在RNA合成起始以后，因子即附着在新生的RNA链上，靠ATP水解产生的能量，沿着53方向朝RNA聚合酶移动，到达RNA的3-OH端后取代了暂停在终止位点上的RNA聚合酶，并从模板和酶上释放RNA，完成转录过程。终止过程需要消耗能量，所以，因子具有终止转录和核苷三磷酸酶两种功能。,依赖于因子的终止子,若终止点上游存在一个富含GC碱基的二重对称区，由这段DNA转录产生的RNA容易形成发卡式结构；在终止点前面有一段由4-8个A组成的序列，导致转录产物的3端为寡聚U。这两种结构特征的存在同样决定了转录的终止。在新生RNA中出现发卡式结构会导致RNA聚合酶的暂停，破坏RNA-DNA杂合链5端的正常结构。寡聚U的存在使杂合链的3端部分出现不稳定的rUdA区域。,1.2.1.2 不依赖于因子的终止子,1.3 细菌的转录过程,1.3 细菌的转录过程,1.转录的起始2.RNA链的延伸3.转录的终止,1.3.1 转录的起始1.封闭型转录起始复合物的形成：首先由因子辨认启动子的35区(识别位点)，全酶与该区结合，形成疏松的复合物，此时DNA双链未解开，因而称为封闭型转录起始复合物，2.开放型转录起始复合物的形成：继而RNA聚合酶移向10区及转录起始点，在20区处DNA发生局部解链，形成1217bp的单链区，RNA聚合酶与DNA结合更紧密，形成开放型转录起始复合物。3.起始延伸复合物的形成：以单链的模板链为模板，RNA聚合酶上的起始位点和延伸位点被相应的NTP占据，聚合酶的亚基催化第一个磷酸二酯键的生成，亚基从全酶解离，形成DNA-RNA聚合酶（核心酶）结合在一起的起始延伸复合物。,1.3.2.RNA链的延伸 1.因子解离：原核生物RNA聚合酶催化转录起始，即核苷酸链中的第一个磷酸二酯键形成后，因子从全酶中解离出来，核心酶就能沿DNA分子移动。2.5 3：转录起始复合物中，核苷酸之间第一个磷酸二酯键的形成是由第一个核苷酸的3-OH与第二个核苷酸的5-磷酸之间脱水而成。第一个核苷酸常为G，来自GTP的5-三磷酸仍保留，第二个核苷酸的3-OH仍然游离形成5pppGpN-OH3。在聚合酶沿模板链的35移动时，可按模板链碱基序列的指引，相应NTP上的-磷酸可与延长新链的3-OH相继形成磷酸二酯键，其、磷酸基脱落生成焦磷酸后迅速水解，释放的能量进一步推动转录，使新合成的RNA链沿着5 3方向逐步延长。3.转录泡的形成：在转录延长过程中，DNA双链需解开1020 bp，形成的局部单链区象一个小泡，故形象地称为转录泡（transcription bubble）。转录泡是指RNA聚合酶-DNA模板-转录产物RNA结合在一起形成的转录复合物。为了保持局部的转录泡状态，在RNA聚合酶下游的DNA需不断解链，可使其下游的DNA（未解开双链部分）越缠越紧，形成正超螺旋，而其上游DNA变得松驰，产生负超螺旋，需要解旋酶（gyrase）和拓扑异构酶来消除这些现象。,1.3.3.转录的终止1.依赖因子的转录终止：2不依赖因子的转录终止：,2.真核生物RNA的转录,2.1 真核生物的RNA聚合酶,2.2真核生物的启动子,2.2.1 型启动子,2.2.2 型启动子,2.2.3 启动子,由RNA聚合酶I负责转录的rRNA基因，启动子（I类）比较单一，由转录起始位点附近的两部分序列构成。第一部分是核心启动子（core promoter），由-45+20位核苷酸组成，单独存在时就足以起始转录。另一部分由-170-107位序列组成，称为上游调控元件，能有效地增强转录效率。UBF和SL1两种转录因子识别启动子。,2.2.1 型启动子,上游结合因子（upstream binding factor,UBF）和选择性因子1（selective factor1,SL1）。功能:SL1初步功能可能是保证RNA聚合酶能位于起始位点的合适位置上。构成：含有4个亚基，一个是TATA盒结合蛋白（TATA-binding protein,TBP），另3个是TBP相关因子（TBP-associated factors,TAF）。UBF与DNA结合令模板DNA发生弯曲，使相距上百bp的UCE和核心元件靠拢，接着SL1和pol I相继结合到UBF-DNA复合物上，完成起始复合物的组建,开始转录。,由RNA聚合酶负责转录的是5SrRNA、tRNA和某些核内小分子RNA（snRNA），其启动子（类）组成较复杂，又可被分为两类。一类5S rRNA和tRNA基因的启动子是内部启动子（internal promoter），位于转录起始位点的下游，都由两部分组成。第二类启动子由三个部分组成，位于转录起始位点上游（snRNA基因)。,2.2.2 型启动子,由RNA聚合酶负责转录的II类基因包括所有蛋白质编码基因和部分snRNA基因，后者的启动子结构与III类基因启动子中的第三种类型相似，编码蛋白质的II类基因启动子在结构上有共同的保守序列。基本启动子（basal promoter)、起始子(initiator)、上游元件(upstream element)、应答元件(response element)2.2.3.1.核心元件(基本启动子）多数II类启动子有一个被称为TATA盒的共有序列，通常处于-30区，相对于转录起始位点的位置比较固定。TATA盒存在于多数真核生物中，TATA盒是一个保守的七碱基对，其序列为：,2.2.3 启动子,也有一些II类启动子不含有TATA盒，这样的启动子称为无TATA盒启动子。末端脱氧核酸转移酶TdT基因。,2.2.3 启动子,(1)选择正确的转录起始位点，保证精确起始，故也称为选择子（selector），当有的基因缺少TATA框时，可能由Inr来替代它的这一作用，如鼠的末端脱氧核苷转移酶（Tdt）基因就没有TATA框，但有17bp的Inr；(2)影响转录的速率。TATA框的8bp的保守序列一般都是由A.T对组成，少数情况在其中的两个位点上由G.C对取代了A.T，可见它是较容易打开。当它的序列因发生突变和缺失而改变时就会影响它和酶的结合能力，从而影响转录的能力。在伴清蛋白基因中，当TATA框突变为TAGA后，转录效率大大降低。兔的珠蛋白基因当TATA框的保守序列ATAAAA人工突变为ATGTAA时转录效率会下降80%。人的珠蛋白基因的ATAAA序列变为ATGAAA或ATAG/CAA时珠蛋白产量也会大大降低而出现地中海贫血症。,起始子转录起始位点没有广泛的序列同源性，但第一个碱基为腺嘌呤，而两侧是嘧啶碱基。这个区域被称为起始子（initiator，Inr），序列可表示为PyPyANT(A）Py。Inr元件位于-3+5。仅由Inr元件组成的启动子是具有可被RNA聚合酶II识别的最简单启动子形式。,2.2.3.3.上游启动子元件（UPE）上游元件包括CAAT box、GC box、等，它们的保守序列和结合的蛋白质因子也各不相 CAAT box的保守序列是GGC（T）CAATCT，一般位于上游-75bp左右紧靠-80，其功能是控制转录起始活性。能和CTF（识别CATT的转录因子）相结合。GC box的保守序列是GTGGGCGGGGCAAT，常以多拷贝形式存在-90处。在真生物和病毒的一些启动子中常存在GC框，如鼠二氢酸叶酸还原酶启动子，猴基因组中的双向启动子，SV40，疱疹病毒等基因的启动子中，可被转录因子SPI所识别。它的作用也是控制转录效率。还有其它的一些UPE，如八聚体（Octamer）,2.2.3.3.应答元件(response element)Yap1p is a positive regulator of gene expression and recognizes a binding site called a Yap1p-response element(YRE)that is located in the promoter of target genes.TRX2Previous work suggested the presence of two YREs in the 5-noncoding region of TRX2 located at positions 218 and 181 upstream of the ATG codon,增强子增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。作为基因表达的重要调节元件，增强子通常具有下列性质：1、增强效应十分明显，一般能使基因转录频率增加10-200倍。经人巨大细胞病毒增强子增强后的珠蛋白基因表达频率比该基因正常转录高600-1000倍!2、增强效应与其位置和取向无关，不论增强子以什么方向排列（53或35），甚至和基因相距3 kp，或在基因下游，均表现出增强效应；,远端调控区,3、大多为重复序列，一般长约50bp，适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列：（G）TGGA/TA/TA/T（G），是产生增强效应时所必需的；4、增强效应有严密的组织和细胞特异性，说明只有特定的蛋白质（转录因子）参与才能发挥其功能；5、没有基因专一性，可以在不同的基因组合上表现增强效应；6、许多增强子还受外部信号的调控，如金属硫蛋白的基因启动区上游所带的增强子，就可以对环境中的锌、镉浓度做出反应。,增强子的作用原理是什么呢？一种观点认为，增强子为转录因子提供进入启动子区的位点。第二种认为，增强子能改变染色质的构象。因为增强子区域容易发生从B-DNA到Z-DNA的构象变化。,增强子的功能是可以累加的。SV40增强子序列可以被分为两半，每一半序列本身作为增强子功能很弱，但合在一起，即使其中间插入一些别的序列，仍然是一个有效的增强子。因此，要使一个增强子失活必须在多个位点上造成突变。对SV40增强子而言，没有任何单个的突变可以使其活力降低10倍。,减弱子（dehancer）在某些基因的上游远端或下游远端具有负调节序列，其作用不受距离和方向的影响，叫做减弱子。如C-mos基因上游0.8或1.8Kb处有一序列，使C-mos不易被反转录病毒的长末端重复序列（LTR）所激活。在C-myc基因的3端也存在着减弱子。,静息子（sisencer）在酵母交配型转换的盒式模型中，左右两个沉默框（HML和HMR）都不表达，此是由于在这两个框盒上游1.5Kb处都有一个E片段，它可和阻遏沉默框盒表达的蛋白SIR（1-4）（silent mating tyne information regulation）结合，起抑制作用，故称静息子，可作用2.5Kb远的启动子。,上游激活序列（upstream activating seguences UASs）UASs是酵母中远上游序列类似于增强子。它仅影响转录程度，对位点选择不起作用。和增强子不同的是它有方向性，不能在启动子的下游起作用。它结合的转录因子是GCN4和GAL4，识别位点为ATGACTCAT。,由RNA聚合酶负责转录的是5SrRNA、tRNA和某些核内小分子RNA（snRNA），其启动子（类）组成较复杂，又可被分为两类。一类5S rRNA和tRNA基因的启动子是内部启动子（internal promoter），位于转录起始位点的下游，都由两部分组成。第二类启动子由三个部分组成，位于转录起始位点上游（snRNA基因)。,2.2.2 型启动子,内部启动子型内部启动子含有两个分开的boxA（T G G C N N A G T G G）和boxC（C G G T C G A N N C C）序列。而型内部启动子含有两个分开的boxA和boxB。,2.2.2.2 RNA pol 启动子的转录因子的结构和功能,转录因子：RNA聚合酶起始转录需要的辅助因子（主要是蛋白质）功能：DNA的顺式作用位点RNA聚合酶其他因子,2.2.2.2 RNA pol 启动子的转录因子的结构和功能,2.3 真核生物的转录转录的组装2.转录的起始3.RNA链的延伸4.转录的终止,转录的组装及起始,转录因子：RNA聚合酶起始转录需要的辅助因子（主要是蛋白质）分类：通用因子（General factor)上游因子（Upstream factor)可诱导因子（Inducible factor),1.通用因子（General factor)：作用于基本启动子上的辅助因子。TFD：TATA结合蛋白（TBP)、多种TBP连接因子（TAF）TBP：帮助DNA解链；TAF：帮助TFD识别、结合不同的启动子TFD可与RNA聚合酶C端结构域直接作用，使其定位于转录起点TFA：稳定TFD与启动子的复合物TFF：TFFRNA聚合酶复合体RAP74：具有依赖ATP的解螺旋酶活性，参与起点的解链RAP38：结合RNA聚合酶(DNA损伤的切除修复）TFB：结合TBP，引入TFF/RNA聚合酶TFE：在RNA聚合酶帮助下进入结合位点，引入TFDH已提高其活性TFH：ATP酶、解螺旋酶、激酶激酶活性：磷酸化RNA聚合酶最大亚基羧基端的多个位点，促使复合物构象的改变，促进转录,TATA box,TFH,TFE,转录的组装及起始,2.3 真核生物的转录2.3.2 RNA链的延伸及终止,3 转录的抑制作用（一）作用于模板DNA的转录抑制剂如放线菌素D（actinomycin D），能插入至DNA双链中两对dGdC之间，低浓度时，阻止RNA链的延长，高浓度时可抑制RNA的起始，也抑制DNA复制。（二）作用于RNA聚合酶的转录抑制剂如利福平或利福霉素，能与原核细胞RNA聚合酶的亚基非共价结合，阻止RNA转录的起始，对真核生物RNA聚合酶无作用。该药临床用于治疗结核杆菌引起的疾病。鹅膏蕈碱则是真核生物RNA聚合酶的抑制剂。,Thank You,真核生物启动子和增强子是由若干可以区分的DNA序列组成的，由于它们和特定的功能基因连锁在一起，因此称为顺式作用元件。真核生物转录调控大多是通过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用而实现的，下面介绍的是与顺式作用成分专一性结合的一些转录因子。一般认为，如果某个蛋白是体外转录系统中起始RNA合成所必需的，它就是转录复合体的一部分。根据各个蛋白质成分在转录中的作用，能将整个复合体分为3部分：,2.3 反式作用因子对转录的影响,参与所有或某些转录阶段的RNA聚合酶亚基，不具有基因特异性。与转录的起始或终止有关的辅助因子，也不具有基因特异性。与特异调控序列结合的转录因子。它们中有些被认为是转录复合体的一部分，因为所有或大部分基因的启动子区含有这一特异序列，如TATA区，更多的则是基因或启动子特异性结合调控蛋白，它们是起始某个（类）基因转录所必需的。,a.Helix-turn-helix（螺旋-转角-螺旋）。是最早发现于原核生物中的一个关键因子，该结构域长约20个aa，主要是两个-螺旋区和将其隔开的转角。其中的一个被称为识别螺旋区，因为它常常带有数个直接与DNA序列相识别的氨基酸。,DNA结合结构域基序,b.Zinc finger（锌指）。长约30个aa，其中4个氨基酸（4个Cys或2个Cys，两个His）与一个Zinc原子相结合。与Zinc结合后锌指结构较稳定。,c.Leucine zippers（亮氨酸拉链）是亲脂性（amphipathic）的螺旋，包含有许多集中在螺旋一边的疏水氨基酸，两条多肽链以此形成二聚体。每隔6个残基出现一个亮氨酸。由赖氨酸（Lys）和精氨酸（Arg）组成DNA结合区。,d.碱性螺旋-环-螺旋（basic helix-loop-helix）该调控区长约50个aa残基，同时具有DNA结合和形成蛋白质二聚体的功能，其主要特点是可形成两个亲脂性-螺旋，两个螺旋之间由环状结构相连，其DNA结合功能是由一个较短的富碱性氨基酸区所决定的。,2.3.2 DNA结合蛋白主要转录激活结构域,转录激活结构域（transcription activation domains）一般由20-100个氨基酸残基组成。如GAL4分子中有2个这种结构域，分别位于多肽链的第147-196位和第768-881位；GCN4的转录激活结构域位于多肽链的第106-125位。a.酸性-螺旋(acidic-helix)该结构域含有由酸性氨基酸残基组成的保守序列，多呈带负电荷的亲脂性-螺旋，包含这种结构域的转录因子有GAL4、GCN4、糖皮质激素受体和AP-1/Jun等。增加激活区的负电荷数能提高激活转录的水平。可能是通过非特异性的相互作用与转录起始复合物上的TFIID等因子结合生成稳定的转录复合物而促进转录。,b.谷氨酰胺丰富区(glutamine-rich domain)SP1的N末端含有2个主要的转录激活区，氨基酸组成中有25%的谷氨酰胺，很少有带电荷的氨基酸残基。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳动物的OCT-1、OCT-2、Jun、AP2和SRF也含有这种结构域。C.脯氨酸丰富区(proline-rich domain)CTF家族（包括CTF-1、CTF-2、CTF-3）的C末端与其转录激活功能有关，含有20%-30%的脯氨酸残基。,a.CAAT盒激活因子 CTF（CAAT box transcription factor）家族是能识别CAAT盒的一组转录因子。这一组因子是由单个基因通过可变换的剪接而形成的一组mRNA产生的。CTF家族成员对各种CAAT盒有相同的亲和力。另一组CAAT区结合蛋白被称为CP，它们是从人的HeLa细胞中得到的。CP1具有对-球蛋白和腺病毒晚期基因启动子CAAT区的高亲和力，CP2具有对-血纤蛋白原基因启动子CAAT区的高亲和力，而CP3能与腺病毒DNA相结合。CP族蛋白主要以异源多聚体的形式存在。,2.3.3.与已知DNA序列相结合的反式作用因子,除了CTF和CP族蛋白能与CAAT区结合外，科学家还从小鼠肝细胞里发现两个CAAT区结合蛋白。CBP对序列GCAAT有较强的亲和力，而ACF则对卵清蛋白基因启动子区的CCAAT有高亲和力。因此，在启动区发现某个保守序列，并不等于同一个蛋白因子参与了该基因的调控。对9个哺乳动物类-球蛋白基因和1个人-球蛋白基因5调控区的研究发现，几乎每个基因都具有CCAAT（-80位左右）区和TATA（-30左右）区。,b.TATA区结合蛋白 RNA聚合酶II需要与其他转录因子结合，才能顺利起始转录。通常把辅助因子需要量最小的启动子称为一般性启动子（generic promoter），具有组成型表达特性，这些启动子上游调控区及所需转录因子在绝大多数甚至全部基因中都是高度保守的。,TBP结合于DNA的小沟。TBP与DNA的结合在体外实验中保护了大约一圈双螺旋DNA免受核酸酶的降解，其覆盖的位置处于-37-25。TAFs的加入延伸了对DNA的覆盖，整个TFIID复合物可覆盖-45-10区域。,C.GC区结合因子 GC区结合蛋白SP1是1.0 x105的单体，能与DNA链上包括GGGCGG在内约20bp的序列特异结合。在SV40启动子区，从-70-110的6个GC区全部与SP1结合，所以这个区域的DNA不会被降解。在胸腺嘧啶激酶启动子区，SP1既与上游的CTF（CAAT区结合蛋白）相互作用，又与下游的TFIID紧密相关。GC区对SP1的结合是必需的，但该序列对于SP1亲和力却很不相同，证明GC区两翼序列同样在SP1的识别及结合过程中发挥作用。人们推测GC区、尤其是多次重复的GC区，与基因的永久型表达有关。,d.八碱基对元件激活蛋白 八碱基对元件也能被多个激活蛋白识别。Oct-1是非淋巴样细胞中结合八碱基对元件的转录激活因子，没有组织特异性。Oct-2则是组织特异的激活因子。一般说来，一个特定的共有序列元件能被相应的转录因子或一个转录因子家族的成员所识别，而相同的元件也能被不同的转录因子所识别。,