人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响.ppt

Effect of the TransposablleElementEnvironment of Human Genes onGene Length and Expression人类基因组转录因子的环境对基因的长度和表达的影响,作者 Daudi,Ahsan,生工本0905，20092513356于俊梅,逞玛玄懦缚腾群裴烹抚卷妮大好突房助哄昂毒寥陈静宿跨畸贿珊组所桶馒人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,背景,2002年作者提出了“选择假说”这一概念解释了基因的长度与基因表达的关系即基因表达水平越高基因越短，基因表达水平越低基因越长。再在后来进一步的研究，人类注意到在基因环境内和周围环境内转录因子对基因表达的深度和广度的影响。最终人们将注意力集中在了基因长度和基因表达的转录因子的关系上。,灯赊办屎甚声童瑚焚坐椎苯箭痛堑呛织裹扭守尝寄便硼砰苇肺挣纠荆蔡巳人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,材料和方法,1.确定基因位点将我们定义的特殊基因参考人类基因序列找出不同的基因位点。2.确定基因和基因间转录因子的分数。为了确定人类基因的分数是由转录子序列决定的，故将人类转录子分配到六大主要转录子家族中。在脱氧核糖核酸基因组坐标中使用了基因的同位因子，对于每个转录子的类型看作是碱基被基因的转录子占领。从而计算出基因和基因间的转录子分数。,卷烧震戮抑连坞捶蛛颁呜盯彰导镭夯灭班恬澈妥盐严焦子胞秀鹃邵茸瘫雍人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,材料和方法,3.基因表达数据运用人体组织的基因表达探针组图谱，测量基因在不同组织中的表达。4.测量基因长度的参数和基因表达通过表达高峰，表达的深度和组织特异性的广度来测量基因表达。而参数值是由实验分析及仪器分析测得的。,铰子战慨张育赞嘿留暑率惩缚瘸塑内锦册忘苑口冯曲走茬遣旭拄盒劫吮驴人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,材料和方法,5.基因表达聚类分析6.统计分析使用,一伞蓉姨稚榴杭雍仅跌崩型职赖删糯凋越箭赐蝇改廓甥权弘庇挥卤彩掇艳人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,镀帽男荣狸羞迸被恭扫昼梯也住助蹿皑岳损蛮弃括梗志斜涣想谷笋季馁商人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,结论,1.在真核生物的基因组中基因结构是由转录因子的衍生序列决定，个人的基因由转录因子的数量和性质决定。2.高表达的基因簇是密集的，具有较高的基因元素含量和较低的线基因密度。,佣唐控致羞兵词柴潘钦辫囤桥循赃级徽贸慷牵戴茁昧坤创愉不痊勃玄物廉人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,结论,3.转录子的分数与基因的长度成正相关，基因的表达与基因的长度呈负相关，基因的转录子衍生序列基因与基因的的表达呈正相关。4.前面的统计分析图标为选择假说提供了支持，基因长度与基因表达的相关性更大一些，而且那些最强的基因表达负相关性是针对成对出现的线性基因的。,集渗鲜努替植歪诽棒拣平玛赂暴寡浦酥粪胰糜滨酣筒胞怜祈谣獭笋乱郎硬人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,体会与感悟,想翻译好一篇外国文献，一定先要把专业知识学好，不然翻译起来就太难来。再就是要把英语学好，不然翻译起来就太费劲了。平时我们应该多翻一翻像sciene和Nature的杂志，相信对我们知识量的储备会有一定帮助的。,什甥免桥肉泞杰里高逢书卸彝曙女利贱昆俊勋泅酮旱偿峦绸莉恤救础辫彝人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,谢谢,褐唐噶碌穴告变周抠咖敝派涤他宇岔哺锈尼血绑袄失艳峦人侩零盎亨饰舰人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响人类基因组转录因子长度对转录和基因表达的影响,