双向电泳蛋白样品的制备.ppt
双向电泳样本制备,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,一、蛋白质提取原则:二、样本裂解方式:三、2D蛋白裂解液组成及作用:1:裂解液组成及作用 2:常见裂解液四、蛋白质提取步骤:五、蛋白质样本制备实例:1:动物组织样本制备 2:植物组织样本制备六、样本制备试剂:,双向电泳样品制备:,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,1:蛋白质制备主要目的:(1):细胞,组织的破碎裂解(2):蛋白质溶解以及破坏蛋白质与蛋白质分子之间,蛋白质与 非蛋白质之间的共价与非共价相互作用,2:蛋白质制备主要遵循的原则:(1):尽可能溶解全部蛋白质,打断蛋白质之间的共价结合,使 蛋白质以分离的多肽形式存在。(2):避免蛋白质的修饰作用与蛋白质的降解作用。(3):避免脂类、核酸、盐等物质的干扰作用。(4):去除高丰度蛋白对低分度蛋白的掩盖作用。(5):防止样品在聚焦时发生蛋白质的聚集和沉淀。(6):蛋白质样品与第一向电泳的相容性。,一、双向电泳样本制备原则,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,二、双向电泳样本裂解方式温和裂解方式,二、双向电泳样本裂解方式剧烈裂解方式,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,三、双向电泳样本制备裂解液组成及作用,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,1、变性剂:(1)作用:改变或破坏氢键等次级键的结构,使蛋白质的肽链伸展 开来,充分暴露疏水中心。(2)分类:脲,硫脲,或两者的混合物可以增加蛋白质的溶解性,特 别是膜蛋白。必须避免将含有尿素的溶液加热到30度以上,因为这样会使其水解为氰酸盐,修饰蛋白质,改变蛋白质的 电荷。,三、双向电泳样本制备裂解液组成及作用,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,2、去垢剂:(1)作用:破坏蛋白质分子间的疏水相互作用。(2)种类:a:非离子去垢剂:triton X-100,NP-40 b:两性离子去垢剂:CHAPS,CHAPSO SB3-10(不溶于浓度高于5mol/L的脲中)ASB(具有比CHAPS更强的膜蛋白溶解力)c:阴离子去垢剂:SDS(小于0.25%,同时确保其他去垢剂与SDS的比例至少为8:1),三、双向电泳样本制备裂解液组成及作用,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,3、还原剂:(1)作用:断裂蛋白质中的二硫键,以利于肽链的分离。(2)分类:-巯基乙醇,二硫苏糖醇(DTT),二硫赤藓糖(DTE)a:其中DTT带有电荷,在等点聚焦时,常常会迁移到PH范围 以外,从而使某些蛋白质的二硫键重新配对,使溶解度降低而重新沉淀下来。使用浓度范围10100 mmol/L.b:采用非离子还原剂三丁基膦TBP可以大大增加蛋白质的溶解性,并利于蛋白从第一向转移到第二向。但是TBP在水溶液中的不稳定性和不溶性,使其在第一向IEF中维持蛋白质还原状态是相对无效的。因此在IEF时建议最好使用巯基还原剂。,三、双向电泳样本制备裂解液组成及作用,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,4、蛋白酶抑制剂的种类及作用:,三、双向电泳样本制备裂解液组成及作用,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,1、提取前准备:(1):提取总蛋白,亚细胞蛋白;(2):裂解细胞的方式选择;(3):裂解液的选择。2、加入裂解液,冰上放置一段时间。3、离心去沉淀,收集上清蛋白。4、用于二维电泳时,考虑是否有必要除去干扰物质,如核酸,脂类,盐等。,三、双向电泳样本制备简要实验步骤,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,五、双向电泳样本制备实例动物样本,(1)将组织切细后置于研钵中,迅速加入液氮进行研磨,直至组织变成粉末,均匀而没有明显颗粒即可。(2)在研钵中加入800LB(使用前加入1 PMSF),充分溶解(收集)粉末后转移至1.5mLEP管中,4,12000r/min,离心20min,收集上清液。(3)超声处理,破碎核酸。每个EP管超声3次,每次58下,然后进行离心,4,12000r/min,离心20min,收集上清液。(4)将上清液分装成3管,每管约250L,每管再加入1mL丙酮-20沉淀过夜。沉淀完的蛋白质于4,12000r/min,离心20min,倒去上清液后,平放于干净的纸巾上自然干燥,即可得到处理后的蛋白质团块,-80保存备用。(5)在干燥后的蛋白质团块中加入相应量的RB(具体加入量视蛋白团块大小而定),用枪头将蛋白质团块戳小后反复吹打直至蛋白质完全溶解。对于太过干燥的蛋白质团块(呈透明状),可用50L移液器调至10L刻度处,吸上一点RB封住枪头,然后反复的将蛋白质团块戳小,再用超声仪处理,直至看不到明显的蛋白质团块为止。4,12000r/min,离心20min,吸出上清液,转移至新的EP管中。,五、双向电泳样本制备实例植物样本,(1)植物样本置于研钵中,迅速加入液氮进行研磨,直至组织变成粉末,均匀而没有明显颗粒即可,在研钵中加入一小勺PVPP(用于吸附植物组织破碎后释放出的酚类物质),用药勺将粉末转移至50mL离心管中。(2)在50mL离心管中加入8mL提取液混匀,再加入8mLTris饱和酚,充分振荡后放置于冰上,每隔5min振荡一次,总共6次,45000r/min,离30min,此时溶液会分层,下层为水相,上层为酚相,吸出上层液体,转移到15mL离心管中。(3)加入与酚相同体积的提取液,充分振荡后放置于冰上,每隔5min振荡一次,总共6次,4,5000r/min,离心30min,吸出上层酚相,转移至新的15mL离心管中。重复一次苯酚抽提。(4)加入最后得到的酚的5倍体积的醋酸铵甲醇溶液对蛋白进行沉淀,充分振荡后置于冰上保温每隔5min振荡一次,总共6次,于-20沉淀过夜。(5)对沉淀过夜的蛋白质4,5000r/min,离心30min,倒掉上清液,加入5mL甲醇对蛋白进行洗涤,反复吹打均匀后,4,5000r/min,离心30min。重复一次。,五、双向电泳样本制备实例:,(6)加入4mL丙酮对蛋白进行洗涤,反复吹打均匀后,4,5000r/min,离心30min。重复一次操作。加入3mL丙酮,吹打均匀后将蛋白质平均分到3支1.5mLEP管中,4,12000r/min,离心20min。倒去上清液后,平放于干净的纸巾上自然干燥,即可得到处理后的蛋白质团块,-80保存备用。(7)在干燥后的蛋白质团块中加入相应量的RB(具体加入量视蛋白团块大小而定),用枪头将蛋白质团块戳小后反复吹打直至蛋白质完全溶解。对于太过干燥的蛋白质团块(呈透明状),可用50L移液器调至10L刻度处,吸上一点RB封住枪头,然后反复的将蛋白质团块戳小,再用超声仪处理,直至看不到明显的蛋白质团块为止。4,12000r/min,离心20min,吸出上清液,转移至新的EP管中。,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,六、双向电泳样本制备试剂,Alklysis buffer(LB),Phenol extraction buffer,醋酸铵甲醇溶液Ammonium acetate in methanol,用甲醇配制0.1M的醋酸铵,辉骏生物:http:/免费服务热线:400-699-1663,THANKS!,