园艺植物生物技术与生物信息学.ppt

第十三章 园艺植物生物技术与生物信息学,产生背景,人类基因组计划带来了海量的核酸和蛋白质序列，为了收集、存储这些序列，从这些序列中获取有用的生物学信息，探索其蕴藏的生命意义，生物信息学（bioinformatics）应运而生科技界一颗耀眼的新星将给生命科学带来 变革性的变化,第一节 生物信息学基本知识,生物信息学是由生命科学、计算机科学、数学、物理学和化学等学科相互渗透而形成的一门新型交叉学科，也是一门研究生物学系统和生物学过程中信息流的综合系统科学，通过其独特的桥梁作用和整合作用，人们能够从各生物学科众多分散的观测资料中获得对生物学系统和生物学过程运作机制的理解，最终达到应用于实践的目的。,一、生物信息学的研究任务与内容,科学基础：发达的、复杂的、可相互交流的数据库系统；强有力的创新算法和软件；自动化的大规模高通量的生物学研究方法和平台技术本质：利用计算机科学和网络技术来解决生物学问题,研究内容：生物信息的收集、存储和管理基因组序列信息的提取和分析开发快速功能强大的信息检索工具及搜索后信息的自动化处理技术功能基因组相关信息分析，强调用发展和整合的实验方法分析基因组序列信息来阐明基因的功能生物大分子结构模拟生物信息分析的技术和方法研究，发展有效的能支持大尺度作图与测序需要的软件，数据库以及数据库分析工具，创建适用于基因组信息分析的新技术、新方法等,二、生物信息学常用数据库,基本数据库：包括原始数据，如，DNA序列、蛋白质序列和蛋白质结构等二级数据库：对基本数据库进行分析、提炼加 工后形成，以便于用户直接使用,（一）DNA数据库,最重要、最初级的数据库 主要有3大数据库：三大数据库每天交换数据,