【医药健康】光合细菌分类、鉴定及保存精选文档.ppt

,光合细菌应用中存在的问题光合细菌分类学进展宁波大学在光合细菌方面的研究第二届分子微生物生态研讨班,光合细菌应用中存在的问题菌种不纯菌种鉴定不准实验环境因子复杂,实验数据缺乏统计学分析应用效果评价困难光合细菌分类学进展宁波大学在光合细菌方面的研究中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地,光合细菌分类鉴定研究进展,伯杰细菌鉴定手册Bergeys Manual of Determinative Bacteriology1923年第1版1974年第8版1994年第9版都停留在对光合细菌的形态生理描述上,所有的光合细菌都被单独放到红螺菌目1个目中,红螺菌目红螺菌科外硫红螺菌科绿硫菌科绿色丝状细菌,伯杰氏系统细菌学手册,近年的分子系统学研究表明,紫色非硫细菌的系统发育是多起源的,分散在变形菌门和两个纲的多个科中,与非光合细菌的系统发育混杂在一起。现在认为,光合器官的性质对种的鉴定还是重要的,但对较高分类阶元,如科、目等则没有太大意义。伯杰氏系统细菌学手册Bergeys Manual of Systematic Bacteriology1989年,第1版2001年,第1版以后的国际分类学权威书籍中,光合细菌的分类采用了完全不同的分类系统。,产氧光合细菌 蓝细菌门(产氧光养细菌)光合细菌,所有的紫色非硫细菌分属于变形菌门的、两个纲的5个目8个科中,共21个属:,红假单胞菌属(Rhodopseudomonas):沼泽红假单胞菌(Rps.palustris)荚膜红假单胞菌(Rps.capsulata)球形红假单胞菌(Rps.sphaeroides)胶质红假单胞菌(Rps.geletinosa)绿色红假单胞菌(Rps.viridis)嗜酸红假单胞菌(Rps.acidophila)粪红假单胞菌(Rps.faecalis)Rps.Rhenobacensis,红长命菌属(Rubrivivax),红细菌属(Rhodobacter),红芽生菌属(Rhodoblastus),芽生绿菌属(Blastochloris),红螺菌属(Rhodospirillum)深红红螺菌(Rsp.rubrum)度光红螺菌(Rsp.photometricum)黄褐红螺菌(Rsp.fulvum)莫氏红螺菌(Rsp.molischianum)中盐红螺菌(Rsp.mediosalina),Phaeospirillum(褐螺菌属),Roseospira(玫瑰螺菌属),1999.3.中国科学院微生物研究所博士论文:紫色非硫细菌资源分类学研究.2001.第一章,光合细菌.东秀珠、蔡妙英主编。常见细菌鉴定手册。2004.第一章,光合细菌的培养.成永旭主编,饵料培养学。2009.杨素萍。微生物学报。,宁波大学在光合细菌方面的研究,中国科学院微生物菌种保藏中心的绝大多数光合细菌菌种发表2个新种,有4个可能新种待发表应用DGGE跟踪确定单菌落的纯培养应用分子指纹技术标记重要光合细菌菌种应用分子指纹技术检测养殖水体种光合细菌群落演替光合细菌菌种质量及应用效果评价体系环境细菌菌种资源库养殖废水和河道废水处理菌剂开发,第二届分子微生物生态研讨班,中国生态学会微生物生态专业委员会宁波大学培训基地第二届分子微生物生态研讨班主要培训研讨内容:原位杂交(FISH)环境样品DNA提取及其杂质去除定量PCR技术及其应用,变形菌纲红螺菌目(Rhodospirillales)该目有2科7属。红螺菌科(Rhodospirillaceae)6个属醋酸杆菌科(Acetobacteraceae)1个属红细菌目(Rhodobacterales)有1科4属红细菌科,(Rhodobacteraceae)根瘤菌目(Rhizobiales)有3科7属慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)2个属生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)3个属红游动菌科(Rhodobiaceae)2个属变形菌纲(Betaproteobacteria)伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales)1科丛毛单胞菌科Comamonadaceae2个属红环菌目(Rhodocyclales)1科红环菌科Rhodocyclaceae,变形菌纲 3个目6个科(1)红螺菌目(Rhodospirillales)该目有2科7属。红螺菌科(Rhodospirillaceae)红螺菌属(Rhodospirillum)褐螺菌属(Phaeospirillum)红螺细菌属(Rhodospira)红弧菌属(Rhodovibrio)玫瑰螺菌属(Roseospira)红篓菌属(Rhodocista)醋酸杆菌科(Acetobacteraceae)只有红球形菌属(Rhodopila)1个属。,(2)红细菌目(Rhodobacterales)有1科(红细菌科,Rhodobacteraceae)4属:红细菌属(Rhodobacter)、红海菌属(Rhodothalassium)、小红卵菌属(Rhodovulum)和最近才发现的Rhodobaca。,(3)根瘤菌目(Rhizobiales)有3科7属。慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)有红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)、红芽生菌属(Rhodoblastus)2个属。生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)有芽生绿菌属(Blastochloris)、红微菌属(Rhodomicrobium)、红菌属(Rhodobium)3个属。红游动菌科(Rhodobiaceae)有红游动菌属(Rhodoplanes)和Roseospirillum 2个属。,2变形菌纲(Betaproteobacteria)(1)伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales)1科(丛毛单胞菌科Comamonadaceae)2个属:红长命菌属(Rubrivivax)、红育菌属(Rhodoferax)。(2)红环菌目(Rhodocyclales)1科(红环菌科Rhodocyclaceae)红环菌属(Rhodocyclus)。,西医学是最近三四百年来建立在解剖学、生物学及现代科学技术基础上、发展起来的一门以“解剖人、肉体人”为概念的、新兴的现代医学科学理论体系。主要采用科学实验方法，从宏观到微观，直至目前的分子基因层次水平，发展极为迅速，超过其它任何一门医学科学，成为世界医学史上的主流。可见中西医学，一个是以“功能人”为概念的独特的哲学医学理论体系，一个是以“解剖人、肉体人”为概念的新兴的现代医学科学理论体系，二者都不是以完整人为研究对象的科学，从理论讲二者都不是科学的，势必影响各自发展。事实也证明这一切，中医长期停滞不前、疗效也不确实。西医尽管发展到目前的基因分子层次，但疾病发病率居高不下，对绝大部分疾病发病原因认识不清、发病机理弄不明白，治疗受到制约，在小小SARS、禽流感面前竟束手无策，在糖尿病、癌症、心脑血管疾病、尿毒症等相当多疾病面前更是不得不求助或借助中医治疗。一个是疗效不确实，一个是有些甚至相当多疾病无法治疗，这就是中西医学结合的缘由。然而，由于二者是两套理论、两股道上跑的车，风马牛不相及，从理论上讲就没有结合的可能，只是形式上的融合罢了。故出现西医对治疗不了的疾病只好求助中医，而中医则往往采用西医诊断中医治疗，以及中西治疗法一块用的局面。至于循证医学、比较医学、后现代医学、行为医学等所谓“医学”，都称不上一门独立的医学科学，关于这一点在灵魂医学有关章节中将有相关点评。现今医学分为传统医学、基于“生物-医学模式”近代发展起来的西医，20世纪西医又发展到“社会-心理-生物医学”（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）或综合医学模式，后基因组时代系统生物学的兴起，（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）形成了系统医学在全球的迅速发展，成为继传统医学、西医学之后中、西医学汇通的未来医学。当代中国医学类专业比较优秀的学校有北京大学、（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）华中科技大学、郑州大学等学校。（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）中医即中国传统医药学，是形成于数千年前的中国，是建立在人们与疾病长期斗争的经验总结及阴阳五行、八纲脏腑辨证基础上，运用朴素辩证法及思辨推理方法，认识机体、自然、疾病三者关系，发展起来的（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）一门以“功能人”包括功能脏器为概念的独特的医学哲学理论体系。（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）在治疗上，除了药物外，还有针灸、推拿气功、（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）耳针等特殊疗法，它是世界传统医学中最完善的一种医学理论体系。它为人类尤其为中国人民（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）健康和民族繁衍做出了巨大贡献。（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）西医学是最近三四百年来建立在解剖学、生物学及现代科学技术基础上、发展起来的一门以“解剖人、肉体人”为概念的、新兴的现代医学科学理论体系。主要采用科学实验方法，从宏观到微观，直至目前的分子基因层次水平，发展极为迅速，超过其它任何一门医学科学，成为世界医学史上的主流。可见中西医学，一个是以“功能人”为概念的独特的哲学医学理论体系，一个是以“解剖人、肉体人”为概念的新兴的现代医学科学理论体系，二者都不是以完整人为研究对象的科学，从理论讲二者都不是科学的，势必影响各自发展。事实也证明这一切，（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）中医长期停滞不前、（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）疗效也不确实。西医尽管发展到目前的基因分子层次，但疾病发病率居高不下，对绝大部分疾病发病原因认识不清、发病机理弄不明白，治疗受到制约，在小小SARS、禽流感面前竟束手无策，在糖尿病、癌症、心脑血管疾病、尿毒症等相当多疾病面前更是不得不求助或借助中医治疗。一个是疗效不确实，一个是有些甚至相当多疾病无法治疗，这就是中西医学结合的缘由。然而，由于二者是两套理论、两股道上跑的车（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2），风马牛不相及，从理论上讲就没有结合的可能，只是形式上的融合罢了。（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）故出现西医对治疗不了的疾病只好求助中医，而中医则往往采用西医诊断中医治疗，以及中西治疗法一块用的局面。（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）至于（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）循证医学、比较医学、后现代医学、行为医学等所谓“医学”，都称不上一门独立的医学科学，关于这一点在灵魂医学有关章节中将有相关点评。总之，目前以中西医学为主的世界各种医学科学都存在不完整性的瑕疵，即都是以不完整的人为研究对象的医学科学，故不能解决目前存在于中西医学甚至人文社会科学史上一切疑难模糊问题，成为阻碍医学科学前进的羁绊。的确，要解决目前存在于中西医学甚至人文社会科学上一切疑难模糊问题，显然已完全超出了中（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）西医学所涉及的范畴，我们必须跳出中西医学的理论框架，建立起一个新的医学理论体系-东方医学和西方医学（即西医）的融合形成现代系统医学。该体系所涉及的一切问题不管从广度上，还是从深度上，（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）都应该远远超过现有的中西医学理论，并将现有中西医学理论纳入自己的理论框架范围之内。为了肩负起这一历史使命，原创人生、医学理论体系（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）灵魂医学 soul medicine应运而生，她不但从宏观上或战略上圆满解释并解决了存在于人类医学及人文社会科学史上的一切疑难模糊问题，而且还能够使人们得以启迪人生（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh），不得不重新认识人类自身、不得不重新认识人类赖以生存的这个多维世界。（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）医学化验医学定义（medicine），是处理人健康定义中人的生理处于良好状态相关问题的一种科学，以治疗预防生理疾病和提高人体生理机体健康为目的（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）狭义的医学只（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）是疾病的治疗和机体有效功能的极限恢复，广义的医学还包括中国养生学和由此衍生的西方的营养学。现在世界上医学主要有西方微观西医学和东方宏观中医学两大系统体系。（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）医学的科学性在与应用基础医学的理论不断完善和实践的验证，（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）例如生化、生理、微生物学、解剖、病理学、药理学、统计学、流行病学，中医学及中医技能等，来治疗疾病与促进健康。虽然东西方由于思维方式的不同导致研究人体健康与外界联系及病理机制的宏观微观顺序不同，但在不远的将来中西医实践的丰富经验的积累和理论的（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）形成必将诞生新的医学-人类医学。不同于现代医学，（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）不同于传统中医，金水医学诞生了，金水医学是以驱除病理，恢复生理为主张的全新医学，走出了人类医学的误区，（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）治疗疾病的特色鲜明，不论是任何疾病都能做到从危为安，由重到轻的恢复办法。金水医学认识到人体是生命体，（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）生命体有自己的强大的生理自我愈合功能，帮助生命体恢复自主作用才是治疗疾病的根本。针对当今现代文明病，现代疑难病，现代慢性病，亚健康，一体多病，取得了巨大的成功，治疗法则为“胃肠洁，气血流，玄府开，营卫昌”人生命体运动符合自然节律，最终达到人体生理增强，消灭疾病的目的。编辑本段医学的分类 医学研究医学可分为现代医学（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）（即通常说的西医学）和传统医学（包括中医学、藏医学、蒙医学等）多种医学体系。（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）不同地区和民族都有相应的一些医学体系，宗旨和目的不相同。印度传统医学系统也被认为很发达。（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）研究领域大方向包括基础医学、临床医学、检验医学、预防医学、保健医学、康复医学等。（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）基础医学包括：医学生物数学,医学生物化学,医学生物物理学,人体解剖学,医学细胞生物学,人体生理学,人体组织学,人体胚胎学,医学遗传学,人体免疫学,医学寄生虫学,医学微生物学,医学病毒学,人体病理学,病理生理学,药理学,医学实验动物学,医学心理学,生物医学工程学,医学信息学,急救学,护病学,新中心法则。临床医学包括：临床诊断学 实验诊断学.影像诊断学+放射诊断学+超声诊断学（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）+核医诊断学*临床治疗学 职能治疗学 化学治疗学 生物治疗学 血液治疗学 组织器官治疗学 饮食治疗学 物理治疗学（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）语言治疗学 心理治疗学 内科学 外科学 泌尿科学 妇产科学（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）儿科学 老年医学 眼科学 耳鼻喉科学 口腔医学 传染病学 皮肤医学 神经医学 精神病学 肿瘤医学 急诊医学 麻醉学 护理学 家庭医学 性医学 临终关怀学（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）康复医学 保健医学 听力学。编辑本段医学的起源 手术治疗中、西医学的起源大致相同。主要包括：救护、求食的本能行为。如动物受伤会舐其伤口、遇热会避入水中，人与动物一样有着本能救护。（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）人类的求食本能在寻找食物时，逐渐发现了葱、姜、蒜、粳米、薏米等虽为食物（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）或调味品，却具有治病作用；生活经验创造了医学。先古人类通过劳动制造出利器，从而产生了砭石、骨针等医疗器具，逐渐掌握了运用工具治疗疾病的经验。与此同时，人们发现活动肢体（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）可以舒筋活络，强身健体，“导引术”、“五禽戏”的形成，也是古代人们积累生活经验后产生的保健养生观；医、巫的合与分。由于原始人受制于智力尚未开化，对自然界的变化以及宇宙间的一切反常现象，心存恐惧，难以做科学、合理的解释，（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）因而误以为有超自然的力量主宰其中。故巫、医合流曾是中、西医学共有的一段历史。在中医学的历史进程中，“祝由”术沿袭数千年，属于元明临床“十三”科之一，但以医学为目的的解剖可追溯到公元11年（4f肿瘤fbb癌症yuw3胃癌d65io肠癌.f2tr肺癌65ff）(西汉王莽新朝三年)，是中国古老的实证医学萌芽。由于儒、释、道三教合流所形成的中国文化格局，“重道轻器”（45传染病q566丙肝964jo乙肝28jgsx甲肝gh）衍生出的务虚倾向，重体悟而疏实证，必然缺少逻辑推理，致使中国的实证医学成就在日后难以与西方医学同日而语。古埃及医师运用念咒、画符和草药治病，前二者就是巫医。（df高血压958心脏病983u6糖尿病87fr）西医在古希腊时期就开始医巫分家，亚里士多德曾详细描述了动物的内脏和器官，古希腊医学最高成就的代表人物希波克拉底将唯物主义哲学运用于医学之中，在论圣病中说：“被人们称为神圣的疾病(指癫痫和一些精神患者)，在我看来一点也不比其他病症更神、更圣，与其他任何疾病一样起源于自然的原因。只因这些病症状奇异，而人们对它们又一无所知，充满疑惑，故而将其原因和性质归之于神灵。”亚里士多德所创立的唯物主义医学体系，加快了医学科学化的进程；（df4肺炎88gdg青霉素d25f肝炎df6）（df肺25s血液f369血小板t5172红血球gdf55m白血球fd2）轴心时代中、西医学的峰巅之作。雅斯贝而斯曾说：“如果历史有一个轴心，那么我们就必须将这轴心作为一系列对全部人类都有意义的事件，发生于公元前800至200年间的这种精神历程似乎构成了这样一个轴心。,医学健康系列精品课件,本文档下载后可以修改编辑，欢迎下载收藏。,