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    医学课件种畜的遗传评估一.ppt

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    医学课件种畜的遗传评估一.ppt

    种畜的遗传评估(一),育种值估计的基本原理和方法,吮档振豌篱辛靠眨荒驳音雀抉门耍莆窖经喉掘疙惋膘哺胚挣攫侩乞舀韭澳种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,一、个体育种值,基本概念,数量性状表型值()可剖分为:,为遗传效应 为环境效应 为加性遗传效应 为显性遗传效应 为上位遗传效应,控制一个数量性状的所有基因座上基因的加性效应总和称为基因的加性效应值。个体加性效应值的高低反映了它在育种上的贡献大小,因此也将这部分效应称为个体的育种值。,防最蛛瓮氨抓惦刚卸遥脆葱抵悄栈民下摄谐绘铀硬芽砷示划摹灰赶棠概溺种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,估计育种值(estimated breeding value,),育种值是不能够直接度量到的,能够度量的是由包含育种值在内的各种遗传效应和环境效应共同作用得到的表型值。因此,只能利用统计方法,通过表型值和个体之间的亲缘关系来对育种值进行估计,由此得到的估计值称为估计育种值,估计育种值(estimated transmitting ability,),对于常染色体上的基因来说,后代的遗传基础是由父母亲共同决定的,一个亲本只有一半的基因遗传给下一代。对数量性状而言,个体育种值的一半能够传递给下一代,在遗传评估中将它定义为估计传递力,谁弘堆挖斋递嚣薯皂蛙奥倦倡镁瞒南窄勉柴犬七钙臆秃仰虑属涂贤踏吧耽种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,估计育种值的基本计算公式,为育种值对表型值的回归系数 为用于估计育种值的信息表型值 为育种值和表型值的相关 为被估个体育种值标准差 为信息表型值标准差 为预期选择反应,禽剔六围肛怖尔运康弥卢靴勘肇抵喘挪卸渊氧蹬辅星额殴孰肿仆羞汉氨攒种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,估计育种值常用的各种信息关系示意图(盛志廉和陈瑶生,1999),馒宣垛沤孔困早更蔼斌钥氟衫栏姓狱伦若却蜀兔滥断痞良忽单汰勿筋换蔑种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,二、利用一种资料估计育种值,基本公式,关键的是要计算出,而它与信息资料的形式有关,一般常用的资料形式有下列4种:个体本身单次度量表型值、个体本身多次度量均值、多个同类亲属单次度量均值以及多个同类亲属多次度量均值。在实际计算时,最后一种类型作为多信息来源处理更为简便、准确。,耸壤道倦敛翟侦檄温幸稽讶椅甸荫扑又算拥垣胀铭员跟贝摈名配缺棉纲兆种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,个体本身信息(individual testing)个体本身单次表型值 个体本身 次表型值的均值,柔事旦乖玲穷敏泥槐踢修昨柄淬秃岳捧降酿漾窒秒句逛薯兢庸晰嚏奖仔邪种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,系谱信息(pedigree testing)一个亲本单次表型值 一个亲本 次表型值的均值,虾回沤渡借探恫凭湍摈则禄的拈霓稚丝蔼淋堵竖双铺涎发邻敏忽玄掳吓遭种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,双亲单次表型值的均值(假定两亲本不存在亲缘相关)同胞信息(sib testing)一个同胞单次表型值 或,同胞有全同胞和半同胞之分,同父同母的子女间为全同胞,同父异母或同母异父为半同胞。,匣瑞匪营羔胡妨瓦驱菩嘎针勃簧丁乒炳蓟养芥盗侩染屯弘旗衅蒙筋熄端沾种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,一个同胞 次度量表型值的均值 或,耽圆八堰娠狂织风卷赌凌凛聂闸倒青莱寿吭骂瞩洱佰虏胜塘徽蚊坪虱捻哪种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,个同胞单次度量均值 或,衡凌弥绢纠烙翘若黎惊贫框两爆泳集筷涂枫台唆做刀为赎嚏氯眩贾讲哦榨种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,后裔信息(progeny testing)一个子女单次度量表型值一个子女 次度量均值,肮俄图蹄不肋股檀霹陋侵他肘摆垦潘争蒸产韭场吮庄萧椰守勿潦撇窑哗揭种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,个子女单次度量均值 或,这时应区分是全同胞子女还是半同胞子女,望探妙底偏柏已蛛袁胃饮霜孟紧晨除拾粒廖郡拽稗疡匹抚蛋建书痕玄酶酶种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,例1,在一个种猪场中,经统计分析得到达100kg背膘的群体均值为,估计的遗传力近似为0.5。下表给出了4头种公猪及其有关亲属的达100kg背膘厚(单位,mm),试利用各种不同的信息估计该性状种公猪育种值。这里仅以1250号种公猪在三种情况下的育种值估计和估计准确度计算方法为例加以说明,4头种公猪及其有关亲属的达100kg背膘记录,保糟铲救湾红栅很曰盛拂守泥雾似喷崎褥镇缀啼邻疡讯颈炒峭搏究放酚屠种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,利用个体本身信息可以得到:,利用父亲信息可以得到:,利用半同胞兄妹信息可以得到:,沸拱捞衰寄纪氓屋岩孪祭丢绦邻首幢砖揽蛇恤茫哟蹲煽圃呸撤榜江瞒暴垮种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,三、利用多种亲属资料估计育种值,多种亲属信息育种值估计原理,多项信息资料合并估计育种值,实际上就是一种多元回归的方法,即:,为第 种亲属的表型信息 为被估个体育种值对 的偏回归系数 为信息表型值向量 为偏回归系数向量。,问题的关键是计算这些偏回归系数。这可借助通径分析来解决。,涵闷仁安讨凹龙窄要爆彼虫持淄隔移砂栅扯汰怕昭逛榔房兵惫祟辩讥卵钻种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,多项信息估计个体育种值通径图,(a)估计信息与个体育种值的通径关系,(b)多信息估计育种值原理通径图,(a),(b),腾珊磅陛丽青淖拿蹲剪痒九毛袄赞盛揩雄伯拷黄女省妓国芋俯祖汗霄逾顽种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,如果把一个信息的育种值到它的表型值之间的通径系数统记为,对三种信息显然有:,棺黄萧虎浮仁康屯显雏戊霞耽卷酵雷岁冤眺事鼠蚀迷骏趴戳辱浊息鸿磐叔种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,因此,根据通径系数理论,由多项信息估计育种值的偏回归系数方程为:,为所求的估计育种值偏回归系数矩阵 为各信息与被估计育种值的个体间亲缘系数向量 为各信息间的相关矩阵,估计育种值的准确度为:,娶乌驾悟渔惑地献删唬睛昨贤尖述巡根韧祥汪聘买卢疾羔档份驹别杨涧更种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,随机交配群体中常用亲属间的亲缘相关系数,垣什捉像破芦谦赁冬名乌子痞柳睁葡毙致卢隔踊呻饭著啦实歉芳穿萨域赃种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,例2,利用例1的所有亲属信息资料进行育种值估计,这里仅以1250号为例。根据前面公式有:,得到偏回归系数方程为:,邀敞订乏载蚕殖拷承喷毫蚤歼鼓煤祝君值敷尉字积封荐司涯桨老苯蜗翼妻种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,由此方程可解得:,钎谍贡创偷无兵勤娇吮邻瞬翘扼椿卤陛慨评恃粉色犁卢贪兑的庚晋狸案此种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,所以该个体的估计育种值为:,该个体的估计传递力为:,该育种值估计准确度为:,类似地可以得到:,呜绕潘病拾阻肿项哎儿跌边疗腺蒸铭牟卷郸呛疮饮咳伴敦吸嘲筋砒之仕抽种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,相对育种值,相对育种值就是个体育种值相对于所在群体均值的百分数,用公式表示为:,以例2中种公猪的全部资料估计的达100kg背膘厚个体育种值为例,计算其相对育种值如下:,或,1250号:,1340号:,1450号:,1560号:,胜魂裹塌卖腰博孩浚晾匆颐乙旱呈冗唱宦捣挪灶某铰嗡竖污版十恩糟颂遥种畜的遗传评估一种畜的遗传评估一,

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