水稻根际及内生细菌群落结构多样性研究.doc

水稻根际及内生细菌群落结构多样性研究摘要：为探讨水稻根际细菌和内生细菌群落结构多样性及与水稻的关系。2008年7月从5个品种水稻根际土和茎部分离根际细菌和内生细菌，并进行脂肪酸鉴定。结果表明，分离得到的根际细菌有13个种，隶属于10属，内生细菌有13个种，隶属于9个属，两群落的优势菌均为蜡状芽孢杆菌（Bacillus cereus）。以各菌株在根际土和茎部出现与否为指标，用类平均法对数据进行系统聚类分析，当=0.80时，可分为4个大类群。对根际细菌、内生细菌和水稻生物学特征参数进行相关分析得到，根际细菌和内生细菌与水稻与千粒重，穗粒数，亩产存在正相关，但与有效穗呈负相关。关键词：水稻，根际细菌，内生细菌，群落多样性Study on the diversity of the rhizosphere bacteria and endophytic bacteria of riceGuiping Hu1,2, Bo Liu1*, Xuefang Zheng1, Yingzhi Lin1, Huai Shi1, Minsheng You 2( 1Agricultural Biological Resource Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou 350003, China; 2 Institute of Applied Ecology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China)Abstract：The research aimed to study the relationship between the diversity of rhizosphere bacteria and endophytic bacteria and rice. We isolated and cultured rhizosphere bacteria and rhizosphere bacteria from the rhizosphere and stem of rice. fatty-acid identification showed that rhizosphere bacteria were clustered into 10 genera which obtained 13 species and rhizosphere bacteria were clustered into 9 genera which obtained 13 species, The dominant bacteria is Bacillus cereus. The cluster analysis results showed that the bacteria could be separated into 4 groups. The correlation analysis indicated the relationgship between bacteria andSeed setting percentage、1000-grain weight and plant productiong were positively correlated Whereas the relationship between bacteria and effective spikes was negatively correlated.Key words：rice, Rhizosphere bacteria, Endophytic bacteria, Diversity of community植物内生细菌（Endophytic bacteria）是指能够定殖在植物的各种组织和器官的细胞间隙或细胞内，并与植物建立了和谐联合关系的一类微生物(Kleopper JW et al, 1992)。植物内生细菌具有丰富的生物多样性。大量的研究表明，不但不同植物种类之间内生细菌的类群存在一定的差异，而且同一植物的不同器官、不同生育期、不同生长地区和环境以及不同品种之间也存在明显差异。内生细菌长期生活在宿主体内的特殊环境中，并与宿主协同进化，在演化过程中形成了共生的关系，一方面内生细菌可以从宿主吸收营养供自己生长的需要，另一方面内生细菌在宿主的生长发育和系统演化过程中起重要的作用。感染内生细菌的宿主往往具有生长速度快(何红等，2002)、增加产量（高增贵等，2004；徐进等，2004），抗逆境（张颖等，2007）、抗病害（傅正擎等, 1999）等优势。植物根际是一个复杂的生态系统，在这一系统中栖息着各种各样的微生物，其中，细菌是这些微生物中的组要组成成员（赵之伟等，1992），细菌的组成及其生命活动对于植物的生长，产量以及整个生态系统的物质转化和能量流动均有着重要的作用（Watanabe I and Rogor P A, 1984）。研究表明大量的根际有益微生物具有固氮、解磷、产生植物激素等促进植物生长和防治病害的能力，对植物的益处主要表现在，提高根、茎、叶、穗等氮的含量，增加分蘖数、根长、根面积；提前孕穗期及开花期；增加穗粒数及粒重；提高叶绿素含量及种子萌发率等，提高作物产量等作用。 水稻是世界上最重要的谷类作物之一，是世界上50%以上的人口的粮食之源。目前，水稻的产量的提高主要依靠化肥和农药的大面积的施用，虽取得一定的效果，但是也产生了极大的环境问题，所以寻找另外一种新的环保的增产途径尤为重要，而内生菌和根际微生物及其分泌物具有促进生长、提高作物产量的能力，为水稻增产工作也提供新的思路。目前国内外主要是集中于某个植物内生细菌或根系细菌对作物固氮、抗病、促生等作用的研究，而对植物根际细菌和内生细菌相关性研究及两者与植物相互作用的研究甚少。本研究通过分离不同品种水稻根际细菌和内生细菌，了解它们的群落结构组成，并拟通过气象色谱技术快速、准确检测根际细菌和内生细菌的磷脂脂肪酸，利用全自动微生物鉴定系统进行鉴定，从而明确水稻植株内生细菌和根际细菌群落的组成，菌群密度，内生细菌和根际细菌之间的相互关系及其在水稻生长发育过程中所起的作用，为内生细菌和根际细菌资源的进一步研究和开发利用奠定理论基础，于进一步研究它们的作用机制，更加有效利用内生菌和根际微生物资源有重要的作用，也为水稻增产工作开辟新的思路和途径。1 材料与方法1.1 试验材料水稻由福建省农业科学院稻麦研究所提供，水稻处于孕穗期，水稻品种为：航1号，航2号，优航1号，优航2号，汕优63，品种生物学特性见表1，随机采样，每个品种采3株，连根带土掘出，将掘出的植株根际土壤部分严密的用塑料袋包裹，带回实验室。表1 水稻品种生物学特性Table 1 biological charateristics for rice varieties品种Variety全生育期（天）穗瘟()最高分蘖数（个）有效穗（粒）成穗率（%）穗粒数(个)结实率（%）千粒重（g）亩产(kg)株高(cm)航1号133.6731.1612.138.9173.44122.2978.5228.11485.44117.67航2号133.677.6614.409.3064.49126.6376.8128.23519.93116.67优航1号130.6784.2614.038.3059.51127.5583.2829.22564.80114.00优航2号130.6714.2112.278.4068.34139.5483.8929.17563.54115.67汕优63128.6730.3213.709.2867.99112.5779.1828.43495.06100.001.2 试验方法1.2.1根际细菌的分离抖掉与根际松散结合的土体，然后将与根际紧密结合土壤用刷子刷下来作为根际土壤。称取10g土样稀释在90ml无菌水中，震荡，稀释为10-2，10-3，10-4，各取200L稀释液涂布于NA平板上，处理后的NA平板倒置于30暗培养箱培养2天，并计数、纯化、保存分离得到的菌株。1.2.2 内生细菌的分离取水稻茎部（距根部10cm-15cm）1g，先用75酒精浸泡数秒，无菌水冲洗数次后，再用10次氯酸钠浸泡5min，无菌水冲洗数次后用无菌滤纸吸干表面水分，然后用无菌剪刀剪碎样品在无菌研钵中，充分研磨匀浆，稀释在9ml无菌水中。取200L稀释液涂布于NA平板上，处理后的NA平板倒置于30暗培养箱培养2天，并计数、纯化、保存分离得到的菌株。1.3.3细菌脂肪酸鉴定1.3.3.1 细菌脂肪酸的提取细菌培养条件：TSBA平板培养基，四线划线法，培养温度28±1 ，培养时间24±2 h。获菌：用接种环挑取35环（约40 mg湿重）的菌落置入一个干净、干燥的有螺旋盖的试管中（最佳的获菌区域为第3区）。皂化：加入1.0±0.1 mL皂化试剂，拧紧盖子，振荡510 s，放入95100 的沸水中5 min，室温冷却，振荡510 s，再水浴25 min，室温冷却。甲基化：开盖加入2.0±0.1 mL甲基化试剂，拧紧盖子，振荡510 s，80±1 水浴10 min，移开且快速用流动自来水冷却至室温。萃取：加入1.25±0.1 mL的萃取试剂，拧紧盖子，温和混合旋转10 min，打开管盖，利用干净的移液管取出每个样本的下层水相部份。基本洗涤：加入3.0±0.2 mL洗涤试剂，拧紧盖子，温和混合旋转5 min，打开管盖，利用干净的移液管移出约2/3体积的上层有机相到干净的气相色谱检体小瓶，用于气相检测。1.3.3.2 细菌脂肪酸的气相色谱检测在下述色谱条件下平行分析脂肪酸甲酯混合物标样和待检样本：二阶程序升高柱温，170 起始，5 ·min-1升至260 ，而后40 ·min-1升温至310 ，维持90 s；汽化室温度250 、检测器温度300 ；载气为氢气（2 mL·min-1）、尾吹气为氮气（30 mL·min-1）；柱前压10.0 psi（1psi=6.895 kPa）；进样量l L，进样分流比100:1。1.3.3.3 细菌脂肪酸鉴定系统根据各组分保留时间计算等链长（ECL）值确定目标组分的存在、采用峰面积归一化法计算各组分的相对含量，再将二者与系统谱库中的标准菌株数值匹配计算相似度（Similarity Index，SI），从而给出一种或几种可能的菌种鉴定结果。一般以最高SI的菌种名称作为鉴定结果，但当其报告的几个菌种的SI比较接近时，则根据色谱图特征及菌落生长特性进行综合判断。以脂肪酸混合标样校正保留时间。细菌鉴定仪对细菌的鉴定判别依赖于相似性指数（SI）：相似性指数大于0.500时，说明匹配性很高，为典型的菌种；大于0.300小于0.500时，说明匹配性较低，为非典型菌种；小于0.300时，说明数据库没有此菌种的数据，给出的是最接近的相关菌种。 1.4 数据处理根际细菌和内生细菌数量分析采用单因子方差分析（Fishers LSD test）；聚类分析则以分离到的内生菌菌株为样本，以各菌株在各部位出现与否为指标，组成“0-1”数据矩阵，将所得数据输入DPS数据处理系统，采用欧氏距离为聚类尺度，以类平均法对数据进行系统聚类分析；根际细菌和内生细菌与水稻生物学参数先做用单因子方差分析（Fishers LSD test），然后两组数据做相关分析（Pearson 2-tailed test），所用软件为SPSS12.0（SPSS Inc., Chicago, Illinois, USA）。2 结果与分析2.1 不同品种水稻根际细菌和内生细菌总量试验结果见表2，总体上看，不同品种根际细菌含量和内生细菌含量差异很大，根际细菌的含量远大于内生细菌含量。而不同品种水稻根际细菌之间差异很大，其中优航1号的根际细菌含量最高为，25.0×104cfu/g；其次为品种优航2号，根际细菌含量为25.0×104cfu/g；接下来依次为：汕优63，航1号，航2号，根际细菌含量分别为16.0×104cfu/g、12.0×104cfu/g、11.5×104cfu/g。不同品种水稻内生细菌含量也有差异，含量最高的为品种优航1号和优航2号，其次为品种汕优63，接下来为航1号和航2号。表2不同品种水稻根际细菌和内生细菌总量Table 2 the content of the rhizosphere bacteria and endophytic bacteria of rice品种Variety根际细菌(×104cfu/g)Rhizosphere Bacteria(×104cfu/g)内生细菌(×104cfu/g)Endophytic Bacteria(×104cfu/g)航1号 Hang 1hao12.0±1.73b0.25±0.09b航2号 Hang 2 hao11.5±1.26b0.21±0.06b优航1号youhang1hao25.5±2.25a0.67±0.03a优航2号youhang2hao25.0±4.36a0.67±0.14a汕优63 shanyou6316.0±1.53b0.31±0.09b注：表中数值为平均值±标准误，同一列中不同字母表示在5%水平上差异显著（Fishers LSD test）。Note: Values are mean±SE. Different letters in the same column indicate that means are significantly different at P<0.05(Fishers LSD test) .2.2 水稻根际细菌和内生细菌的脂肪酸鉴定2.2.1 内生细菌 从水稻茎部分离到的25株内生细菌中与MIDI数据库比较相似性指数大于0.500，可确定其菌种名称的有23株，属于13个种，隶属于10属（见表3）分别是：芽孢菌属（Bacillus spp）、假单胞菌属（Pseudomonas spp）、食酸菌属(Acidovorax spp)、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas spp）、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas spp)、微杆菌属(Microbacterium spp)、不动杆菌属(Acinetobacter spp)、克雷伯氏菌属（Klebsiella spp）、伯克霍尔德菌（Burkholderia spp）、肠杆菌属（Enterobacter spp）。其中，芽孢杆菌有4个种，其余9个属包含1个种。同时，芽孢杆菌属为优势菌属，占内生细菌总数的56.5%。2.2.2 根际细菌 33株根际细菌脂肪酸鉴定结果见表4，分别属于13个种，隶属于9个属，分别为芽孢杆菌属（Bacillus spp）、假单胞菌属（Pseudomonas spp）、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas spp）、光杆菌属(Photorhabdus spp)、肠杆菌属(Enterobacter spp)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas spp)、金黄杆菌属（Chryseobacterium spp）、（Zobellia-uliginosa）（？）。其中，芽孢杆菌属为优势菌属，占根际细菌总数的42.4%。表3 水稻茎部内生细菌Table 3 Endophytic bacteria come from the stems of rice编号number属名genus name种名Species name中文名Chinese name相似系数Similarity Index菌株数Strain number1芽孢杆菌属Bacillus cereus蜡状芽孢杆菌0.85492芽孢杆菌属Bacillus subtilis枯草芽孢杆菌0.88423芽孢杆菌属Bacillus atrophaeus萎缩芽孢杆菌0.76514芽孢杆菌属Bacillus megaterium巨大芽孢杆菌0.63725假单胞菌属Pseudomonas fluorescens荧光假单胞菌0.53216食酸菌属Acidovorax konjaci魔芋食酸菌0.76317寡养单胞菌属Stenotrophomonas maltophilia嗜麦芽糖寡养单胞菌0.64918鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas yanoikuyae矢野口鞘氨醇单胞菌0.62619微杆菌属Microbacterium barkeri微杆菌属（无中文名）0.538110不动杆菌属Acinetobacter calcoaceticus乙酸钙不动杆菌0.714111克雷伯氏菌属Klebsiella-pneumoniae pneumoniae肺炎克雷伯氏菌0.672112伯克霍尔德菌Burkholderia gladioli唐菖蒲伯克霍尔德菌0.678113肠杆菌属Enterobacter hormaechei霍氏肠杆菌0.6561注：微生物自动鉴定系统对细菌的鉴定判别依赖于相似性指数（Similarity Index），当相似性指数大于0.500，说明匹配性很高，为典型种；大于0.300小于0.500，说明匹配性较低，为非典型种；小于0.300：说明数据库没有此菌种的数据，给出的是最接近的种。表4 水稻根际细菌Table 4 the rhizosphere bacteria come from rice编码Number 属 Genus name种Species name 中文名Chinese name相似系数Similarity Index菌株数Strain number1芽孢杆菌属Bacillus cereus蜡状芽孢杆菌0.837112芽孢杆菌属Bacillus megaterium巨大芽孢杆菌0.71653芽孢杆菌属Bacillus sphaericus球形芽孢杆菌0.79344芽孢杆菌属Bacillus laevolacticus左旋乳酸芽孢杆菌0.12715芽孢杆菌属Bacillus subtilis枯草芽孢杆菌0.80626假单胞菌属Pseudomonas fluorescens荧光假单胞菌0.53227假单胞菌属Pseudomonas aeruginosa铜绿假单胞菌0.26818寡养单胞菌属Stenotrophomonas maltophilia嗜麦芽糖寡养单胞菌0.52939光杆菌属Photorhabdus luminescens luminescens发光光杆状菌0.518110肠杆菌属Enterobacter cloacae阴沟肠杆菌0.664111鞘氨醇单胞菌Sphingomonas yanoikuyae矢野口鞘氨醇单胞菌0.626112Zobellia uliginosa0.181113金黄杆菌属Chryseobacterium indologenes产吲哚金黄杆菌0.0111注：微生物自动鉴定系统对细菌的鉴定判别依赖于相似性指数（Similarity Index），当相似性指数大于0.500，说明匹配性很高，为典型种；大于0.300小于0.500，说明匹配性较低，为非典型种；小于0.300：说明数据库没有此菌种的数据，给出的是最接近的种。2.2 根际细菌和内生细菌在不同品种水稻的分布特性以分离到的20种细菌为样本以各菌株在水稻茎部和根际出现与否为指标，用类平均法对数据进行系统聚类分析，当=0.80时，可将20种内生细菌分为4个大类群（见表3，表4和图1）。类群包括4个菌株，分别是Microbacterium barkeri、Bacillus atrophaeus、Pseudomonas fluorescens、Pseudomonas aeruginosa，他们的共同特征为都分离自于品种航1号。类群包括6个菌株，可以分为2个亚群，亚群1有3个菌株，分别是：Sphingomonas yanoikuyae、Zobellia uliginosa、Chryseobacterium indologenes，他们都分离于品种优航1号根际土；亚群2有3个菌株，分别是Bacillus sphaericus、Bacillus laevolacticus、Bacillus megaterium，它们均分离于品种航2号根际土。类群包括4个菌株，分别是Stenotrophomonas maltophilia、Bacillus subtilis、Photorhabdus luminescens luminescens、Enterobacter cloacae，这四个菌株的特性为均分离于品种优航2号根际土。类群包括6个菌株，可以分为2个亚类群，类群1包括3个菌株，分别为Bacillus cereus、Acidovorax konjaci、Burkholderia gladioli，这3个菌共同特性为都分离于优航2号茎部；类群2包括3个菌株，分别为Acinetobacter calcoaceticus、Enterobacter hormaechei、Klebsiella pneumoniae pneumoniae，它们的共同特征为均分离于品种优航1号茎部。表5 根际细菌和内生细菌的分布特性Table 5 the distribution of the Rhizosphere Bacteria and Endophytic Bacteria of Rice编号number种名Species name品种 Variety航1号Hang1hao航2号Hang2hao优航1号youhang1hao优航2号youhang2hao汕优63Shanyou63AB ABAB ABAB1Microbacterium barkeri01000000002Pseudomonas fluorescens11000000003Bacillus atrophaeus01000000004Sphingomonas yanoikuyae00011000005Stenotrophomonas maltophilia00010110006Bacillus cereus01110101117Bacillus subtilis00000010018Acinetobacter calcoaceticus00000100019Enterobacter hormaechei000001000010Klebsiella pneumoniae pneumoniae000001000011Acidovorax konjaci000000010112Burkholderia gladioli000000010013Bacillus sphaericus001010000014Bacillus megaterium101010101115Zobellia uliginosa000010000016Chryseobacterium indologenes000010000017Photorhabdus luminescens luminescens000000100018Enterobacter cloacae000000100019Pseudomonas aeruginosa100000000020Bacillus laevolacticus0010000000注：0表示细菌在该部位不存在，1表示存在; A代表水稻根际，B代表水稻茎部Note: 0 stands for microbacteria dont exist on this site,1 stands for existion；A stands for rhizosphere of rice, B Stands for stem of rice 表6 聚类过程Table 6 Cluster analysisTIJ距离1311.00E-0921091.00E-09316151.00E-09418171.00E-095210.29296980.2929712110.292981540.292991770.29291020130.292911750.4791214130.5072131160.5438141340.6645151910.764316860.801117650.863918540.933519410.9731GroupGroupGroupGroup图1 细菌聚类图Fig1 cluster of microbacteria2.3 水稻根际细菌和内生细菌联系及其与水稻生物学特征的相关性细菌是生态环境中重要的生命物质之一，在很多对植物微生态系统的研究中，发现，植物的根际是微生物生存的特殊环境，根际细菌与植物之间存在着复杂的共栖关系，根际细菌的旺盛活动给植物的生长带来很大的益处。除此之外，植物体内还存在与植物的互惠共生的内生细菌。为了深入分析根际细菌和内生细菌相互关系及其与水稻生长的影响，对根际细菌和内生细菌与水稻生物学参数进行了相关分析。结果显示，根际细菌数量与内生细菌数量存在密切的关系，呈正相关（相关系数为0.992）。从根际细菌和内生细菌与水稻生长情况看，根际细菌和内生细菌与水稻有效穗存在负相关，与穗粒数，结实率，千粒重，理论亩产存在极显著正相关，但与水稻的株高，生育期，穗瘟相关不显著。表7 水稻根际细菌和内生细菌与水稻生物学特性间的相关系数Table7 Correlation coefficient between microbe groups and biological charateristics of rice微生物类群microbe groups生物学特征biological charateristics全生育期稻瘟最高分蘖数有效穗成穗率穗粒数结实率千粒重亩产株高根际细菌Rhizosphere Bacteria-0.5640.526-0.094-0.881*-0.5040.5670.980*0.993*0.880*0.002内生细菌Endophytic bacteria-0.4620.517-0.164-0.931*-0.4650.6410.987*0.986*0.894*0.122Pearson相关分析Pearson correlation analysis，* 和* * 分别表示在005和001水平上相关显著(双侧检验)indicate the corelation is significant at 005 and 001 level(2-tailed)3 讨论Fisher PJ等认为在植物内生微环境中，不同的微生物相互作用，并建立一种平衡，从而形成一种相对稳定的细菌菌群（Fisher PJ et al, 1992）。从分离出的内生细菌来看，有些菌的分离率较高，为优势菌，如芽孢杆菌属（Ballius spp），而有些菌相反，为稀有属。这种群落结构的特异性是内生菌与植物共同进化形成的，与植物的遗传，生理、代谢产物与微生物的营养要求和生理代谢等相互适应的结果。研究发现内生菌群落结构与植株品种，自身生长环境，营养条件，遗传背景有关（罗明等，2004；高增贵等，2006）。脂肪酸是细菌细胞结构的重要组成成分，细胞脂肪酸与DNA具有高度的同源性，各种细菌具有特异性的细胞脂肪酸指纹图谱（刘志辉等，2005）。因此可以利用脂肪酸的种类和含量差异不同作为细胞分类的重要依据。目前，该项技术已经广泛用于细菌的鉴定(朱育菁, 2008, 2009; 蓝江林, 2009)和多样性研究中(吴愉萍等, 2006；Ozbek A, 2003；蓝江林,2008)。微生物自动鉴定系统对细菌的鉴定判别依赖于相似性指数（Similarity Index），当相似性指数大于0.500，说明匹配性很高，为典型种；大于0.300小于0.500，说明匹配性较低，为非典型种；小于0.300，说明数据库没有此菌种的数据，给出的是最接近的种。本研究采用相似性指数高于0.5的细菌鉴定的结果，能可靠地反映细菌鉴定的种类。本试验中分离到的水稻内生优势菌为蜡状芽孢杆菌（Bacillus cereus），与刘云霞等（1999）从水稻（沈农319，中百4号）分离到的优势菌为巨大芽孢杆菌和杨海莲等（1999）从水稻（越富）分离得到的优势菌为成团肠杆菌（Enterobacter agglomerans）不同。同时比较内生细菌和根际细菌可以看出，从水稻茎部中分离到的内生细菌有很大一部分在根际微环境中也存在，但有的根际细菌在植物体内又不一定有，说明内生细菌和根际细菌之间存在紧密的联系。罗明等（2007）和孟颂东等（1998）分别从棉花和甜玉米两种植物的根部和茎部分离出的内生细菌，其大部分分类单位与土壤常见的细菌相同，且根中细菌数量大于茎中的细菌数量(罗明等，2007; 孟颂东等，1998)。可以假设，内生细菌是植物根际细菌在与植物长期适应过程中有选择性地进入到植物体内。同时也因此证明了这些内生细菌起源于根际，并由此进入植物组织内（Mclnory JA and Kleopper JW,1994）。研究发现这些内生细菌主要为兼性内生的土壤性细菌，最常见的优势种群有假单胞菌属（Pseudomonas）、芽孢杆菌属（Bacillus）、肠杆菌属（Enterobacter）、土壤杆菌属（Agrobacterium）（Zou WX et al, 1999）。本研究发现水稻根际细菌的种类相当丰富，33株分离物属于13个种，隶属于9个属。根际细菌生活在水稻根际中，经过长期自然选择，形成了一个相对稳定的微生态环境，细菌在水稻根际的生长繁殖一方面可以加快稻田的物质循环，增加土壤肥力，促进水稻生长，从而增加水稻产量。Laheurte F和Bcrtherin J (1998) 发现根际细菌Enteroba -cteragglanerans可利用和限制玉米根际分泌物，促进玉米生长，提高光合作用的效率，从而减少根际分泌物的分泌（Laheurte F and Bcrtherin J,1988）。其他研究发现根际微生物还可以利用根分泌的各种无机盐和有机物质合成一些生活活性物质，包括植物激素，如生长素，赤霉素和细胞分裂素等（孟颂东等,1998），它们可影响植物的生长。但在一定条件下，根际细菌的大量生长，水稻病原微生物的侵入，又会在根际土壤中与水稻形成对营养物质的竞争，甚至破坏水稻的正常生长而影响产量。因此，根际微生物群落结构达到一个什么样的状态才能最大限度的促进水稻生长，我们应该选择什么样的多样性参数作为控制水稻根际细菌乃至整个微生物群落的结构和繁殖的指标就成为水稻根际微生物群落多样性研究的核心问题。另外本实验通过相关分析得到水稻内生细菌和根际细菌与水稻生物学参数有效穗呈负相关，而与穗粒数，结实率都存在正相关，说明内生细菌和根际细菌在水稻生长发育过程中，尤其是产量形成上都起了非常重要的正效益，虽然大量资料表明内生细菌和根际细菌都有促进植物有机物物合成，提高植物光合效率，促进植物生长，提高植物产量等租用，但在植物生长过程中，两者如何与植物互作作用机理目前还不是很清楚，另外到底是内生细菌对植物生长促进作用更大，还是根际细菌的贡献更大，也值得进一步深入研究。 参考文献Kleopper JW, Schipper B, Bakker PAHM (1992). 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