Gamit安装ubuntu Linux操作系统.docx

Gamit安装ubuntu Linux操作系统Gamit 的安装 3502 gamit 安装步骤，这里以最新的gamit 10.4为例子。首先gamit 需要的运行环境为gfortran , gcc , libx11, csh, tcsh.而且在gamit的Makefile.config文件中也是需要知道操作系统的版本号的。因此步骤如下： 1) 按ctl+alt +t打开终端，输入uname -a 查看当前操作系统的版本号，如上图所示：操作系统的版本号是：3.0.0-12；但是在gamit中，只记录下操作系统版本号前4位，因此在这种情况下的版本号应记为：3001； 2）安装相关的运行环境，主要包括csh,gfortran,tcsh,gcc,libx11;具体命令如下： 在终端中输入:sudo -s,然后按提示输入密码；然后输入apt-get install gcc; apt-get install gfortran;这个会比较大一点，所以会慢一点，机房的网速只有十几kb每秒，听说比GPS中心的网速慢多了。 apt-get install csh; apt-get install tcsh; apt-get install libx11-dev,这个是为gamit提供图形支持的包，因此就比较大，耐心等待5分钟左右. 3）配置shell 首先输入echo $SHELL看下当前是什么类型的shell,一般情况下,ubuntu 默认的都是bash,虽然gamit是用csh写的，但是经过测试，即可以在csh中安装，也可以在bash中安装。诺想在csh中安装，则需要改变当前的shell，在终端输入chsh,按提示输入密码。然后输入shell的路径，以下操作是从bash改变为csh，因此输入路径为:/bin/csh，如下图所示： 但是上面步骤完成以后，我们输入echo $SHELL，再查看一下，发现shell仍然是bash，注意了，这里是改变登录时的默认shell，因此若想让以上改变生效，只需要注销下，重新登录下就可以啦。 下面介绍一下临时改变shell的简单方法，若是由bash改变为csh，只需要在终端输入csh即可，同理变回来只需输入bash。临时的改变shell只对当前的终端是有效的，但这对于gamit的安装已经足够了。 4）gamit软件的准备及安装 一般情况下都是需要先将gamit的源代码复制到/opt目录下，假设你的gamit源代码文件夹为gamit10.4，并且位于桌面上，那么只需要在终端输入:mv /桌面/gamit10.4 /opt ，即可将其移动到opt下，然后进入opt，输入 cd /opt/gamit10.4，继续输入ls -al，查看下gamit10.4文件夹下都有什么文件。找到一个叫install_software的文件，查看其权限，若没有可执行权限，则给他加上就可以了。然后在终端输入 ./install_software，则开始gamit的安装了。第一个直接输入Y就可以了，然后它会问你x11的目录是否正确，那么你需要找到gamit的配置文件并修改下，具体方法如下：按ctl+alt+t新开一个终端，进入到opt中的gamit10.4文件夹下，cd libraries；进入libraries文件夹中，sudo gedit Makefile.config；然后就会弹出一个该文件的编辑框，我们需要修改的地方主要有三个，第一个是x11的路径，将其修改成gamit自动搜索到的x11路径，如我的系统中是如下图所示： 这个common下的配置是按照不同的操作系统来配置的，每三行一组，我们的ubuntu是在一般操作系统中(Generic)；当然也有Sun，Solaris，HP，redhat等操作系统，貌似没有中科院计算所国产的红旗Linux哦！其实红旗的配置方法和ubuntu的一样，呵呵呵。 主要修改的就是x11LIBPATH和X11NCPATH。千万记得保存一下哦。 第二个需要修改的地方就是gamit的内部参数了，实际上就是写代码时声明的常量。分别是MAXSIT(最大测站数)、MAXSAT(最大卫星颗数)、MAXATM(最大的天顶延迟)、MAXEPC; 在这里，我们只需要将MAXATM改为25即可。其实，在这里不改也是可以的，以后我们用到的时候再改也不迟，这些常量的定义分别位于/gamit/include/dimpar.h 、makex.h头文件中，稍微懂一点fortran语言的话，改起来就是a piece of cake哦。 第三个需要修改的地方就是操作系统的版本号啦，再往下拉，就可以看到OS dependent blocks字样。这里也是按操作系统来分类的撒，可惜我们的ubuntu在最后几个哦，所以再往下拉，找到for linux from 0.0.1 to 3.0.0字样，然后我们修改下面的一行，OS_ID Linux 0001 3001，记住只修改最后的那四个数字为3001就好了。保存一下，关掉。 再返回安装linux的那个终端中，按Y继续安装就可以啦，到最后显示gblock installed(当然过程还是比较漫长的，尤其是fortran编译器在编译时，给人的感觉像死机了一样，连鼠标都动不了)。然后它问是否创建gg的链接文件，直接按Y就可以啦。 5）配置gamit的命令路径 到上面几步完成以后，会自动显示怎么配置路径的哦。如果路径配置不好，上面的都是白做了。路径的配置也是分为两块，如果是用csh安装gamit的，则配置路径如下：需要在主文件夹下新建一个空白文档，并重命名为.cshrc。注意这是一个隐藏文件，因此在这之前，应该按ctrl +H ,显示所有的隐藏文件。然后双击打开那个新建的.cshrc文件，复制一下内容到该文件中： # # This file is applicable to all C-shell users. # set prompt set prompt = "echo $cwd% " set history = 50 set gamitpath = /opt/gamit10.4 set path = (. /bin /sbin /ect /usr/bin /usr/sbin /usr/ucb /usr/bin/X11 /usr/X11R6/bin $path) set path = (. /usr/local/gmt/bin /usr/local/bin /usr/local/sbin /usr/local/lib /usr/lib $path) #set path = (. /usr/local/gmt/bin /usr/local/bin /usr/local/lib /usr/ucb/ nfs r0 soft0 0 $path) set path = (. $gamitpath/gamit/bin $gamitpath/kf/bin $gamitpath/com $path) setenv HELP_DIR $gamitpath/help/ setenv INSTITUTE SGG setenv PATH "/usr/sbin:/sbin:$PATH" setenv MANPATH /usr/local/gmt/man:/usr/local/man:/usr/X11R6/man setenv LIBPATH /usr/local/gmt/lib:/usr/lib:/usr/local/lib:/usr/i386-glibc21-linux/lib #set gcclib direction setenv LD_LIBRARY_PATH /usr/local/gcc-3.4.1/lib/ # set alias alias cd 'cd !*; set prompt = "echo $cwd% "' alias pwd 'echo $cwd' alias ls 'ls -classify' alias ll 'ls -l' alias la 'ls -a' alias rm 'rm -i' alias mv 'mv -i' 千万注意了，你自己在复制的时候一定要将set gamitpath = /opt/gamit10.4 改成你自己的gamit安装位置哦。然后保存下。 回到终端，输入source /.cshrc，对该配置文件进行下加载。那么这个路径就生效了。 若想验证下有没有配置成功，只需要在终端下输入 echo $PATH，看看path中有没有gamit的路径，若有的话就成功了。 然后新开一个终端，检验下gamit是否安装成功，输入命令sh_get_rinex；若显示command not foud，则安装失败，显示一大堆的帮助信息，则成功了。 以上为csh的路径配置，下面介绍下bash的路径配置，若有朋友是用默认的bash安装gamit 的，则只需要在终端输入sudo gedit /.bashrc，弹出一个文件编辑框，只需要在文件的最后添加以下代码即可： export PATH="$PATH:/opt/gamit10.4/gamin/bin:opt/gamit10.4/com:/opt/gamit10.4/kf/bin" export HELP_DIR=/opt/gamit10.4/help/ 保path to include /opt/Gamit10.4/gamit/bin and /opt/Gamit10.4/kf/bin存退出就可以啦，检验是否安装成功的方法同上。好了，开始体验gamit的神奇吧！ path to include /opt/Gamit10.4/gamit/bin and /opt/Gamit10.4/kf/bin